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OpenStax-CNX module: m53382 1 Energía y metabolismo ∗ OpenStax Based on Energy and Metabolism† by OpenStax This work is produced by OpenStax-CNX and licensed under the Creative Commons Attribution License 4.0‡ Abstract Al nal de esta sección serás capaz de: Explicar qué son las rutas metabólicas. Formular la primera y la segunda ley de la termodinámica. Explicar las diferencias entre energía cinética y energía potencial. Describir las reacciones endergónicas y exergónicas. Discutir la función de las enzimas como catalizadores moleculares. • • • • • Los cientícos utilizan el término bioenergética para describir el concepto de ujo de energía en los sistemas vivos, como las células (Figure 1); los procesos celulares, tales como la formación y degradación de moléculas complejas, se llevan a cabo a través de reacciones químicas. son espontáneas y liberan energía, mientras que otras requieren de ésta. Algunas de estas reacciones Así como los seres vivos deben consumir alimentos para reponer el suministro de energía, las células deben reponer la energía utilizada en las reacciones químicas que llevan a cabo. El metabolismo celular es el conjunto de todas las reacciones químicas que ocurren dentro de la célula, incluyendo aquellas que consumen o generan energía. ∗ Version 1.10: May 18, 2016 3:07 pm -0500 † http://cnx.org/content/m45437/1.6/ ‡ http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 2 Figure 1: Una gran cantidad de organismos obtiene energía del sol. Las plantas capturan la energía solar para efectuar la fotosíntesis, y los herbívoros se alimentan de las plantas para obtener energía. Los carnívoros se comen a los herbívoros, y eventualmente la descomposición del material vegetal y animal contribuye al almacén de nutrientes. 1 Rutas metabólicas El metabolismo del azúcar es un ejemplo clásico de uno de tantos procesos celulares que consumen y producen energía; los seres vivos consumen azúcares como fuente principal de energía, ya que las moléculas de azúcar tienen una gran cantidad de energía almacenada en sus enlaces. Los principales productores de estos azúcares son los organismos fotosintetizadores, como las plantas. Durante la fotosíntesis, las plantas utilizan la energía proveniente del sol para transformar el dióxido de carbono (CO2 ) en moléculas de azúcar (como la glucosa C6 H12 O6 ). Las plantas consumen dióxido de carbono y liberan oxígeno como producto de desecho. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ La OpenStax-CNX module: m53382 3 reacción se expresa de la siguiente forma: 6CO2 + 6H2 O − − > C6 H12 O6 + 6O2 (1) Como el proceso de fotosíntesis involucra la síntesis de una molécula que almacena energía, este proceso también requiere de la entrada de energía para su desarrollo. Durante la fase luminosa de la fotosíntesis, la energía se obtiene a partir de una molécula llamada trifosfato de adenosina (ATP), la cual es la "moneda energética" de todas las células. Así como el peso se utiliza para comprar bienes y servicios, las células utilizan las moléculas de ATP como fuente de energía para realizar un trabajo inmediato. Por otro lado, las moléculas que guardan energía, como la glucosa, tienen que degradarse para poder hacer uso de la energía que contienen en sus enlaces. Si la reacción de "cosecha" de la energía almacenada en las moléculas de glucosa se lleva a cabo por células que requieren oxígeno para sobrevivir, es una reacción en la cual se consume oxígeno y se libera dióxido de carbono, como producto de desecho. La reacción se puede expresar de la siguiente forma: C6 H12 O6 + 6O2 − − > 6H2 O + 6CO2 (2) Los procesos de generación y degradación de moléculas de azúcar ilustran dos ejemplos de rutas metabólicas, y ambos siguen una serie de pasos; una ruta metabólica es una serie de reacciones químicas que modican una molécula dada, donde se genera una serie de compuestos intermedios para llegar a un producto nal. En el caso del metabolismo del azúcar, el primer paso es la síntesis de azúcar a partir de moléculas más pequeñas, y en la otra ruta es su degradación a moléculas más pequeñas. En el primer caso se requiere de energía y se conoce como proceso energía y se conoce como proceso anabólico (construcción de polímeros); en el segundo caso se produce catabólico (degradación de polímeros en monómeros). En resumen, el metabolismo se compone de un proceso de síntesis (anabolismo) y un proceso de degradación (catabolismo) (Figure 2). Es importante saber que las reacciones químicas en las rutas metabólicas no ocurren solas, pues cada paso en la reacción requiere de un agente o catalizador que facilite el proceso; este agente es una proteína llamada enzima, la cual cataliza todo tipo de reacciones biológicas, tanto aquellas que requieren de energía, como las que la liberan. Figure 2: Las rutas catabólicas son aquellas que generan energía a partir de la degradación de moléculas más grandes. Las rutas anabólicas son aquellas que requieren de energía para sintetizar moléculas de mayor tamaño. La célula requiere de ambas rutas para mantener el balance de energía. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 4 2 Energía La termodinámica es el estudio de la energía, y la transferencia de energía involucra materia; la materia relevante en un caso particular de energía se conoce como sistema; todo lo que está fuera de este sistema se llama ambiente. Por ejemplo, cuando calentamos una jarra con agua sobre la estufa, el sistema incluye el agua, la jarra y la estufa, y la energía se transere dentro del sistema (entre la estufa, la jarra y el agua). Existen dos tipos de sistemas: abierto y cerrado. En un sistema abierto la energía se puede intercambiar con el ambiente; el sistema de la estufa, la jarra y el agua es abierto, porque se puede perder calor al ambiente. En el caso de un sistema cerrado, no existe intercambio de energía con el ambiente. Los seres vivos son sistemas abiertos, puesto que la energía se intercambia entre éstos y el ambiente. Los seres vivos utilizan la energía del sol para realizar la fotosíntesis, consumen energía almacenada en las moléculas, o liberan energía al ambiente en forma de calor cuando realizan un trabajo. Como todas las cosas en el mundo físico, la energía está sujeta a las leyes de la física; las leyes de la termodinámica rigen la transferencia de energía dentro y entre todos los sistemas del universo. En general, la energía se dene como la capacidad para realizar un trabajo o para crear algún tipo de cambio; existen diferentes tipos de energía: energía eléctrica, energía luminosa y energía térmica. Es importante entender dos leyes de la física que gobiernan la energía, para poder entender el ujo de energía hacia el interior y hacia el exterior de los sistemas biológicos. 3 Termodinámica La primera ley de la termodinámica enuncia que la cantidad de energía en el universo es constante y se conserva, es decir, que hay y siempre habrá la misma cantidad de energía en el universo. Existen muchas formas diferentes de energía; de acuerdo con la primera ley de la termodinámica, la energía se puede transferir de un lugar a otro o transformar a formas diferentes de energía, pero no se puede crear o destruir. transformación y transferencia de energía se lleva a cabo constantemente a nuestro alrededor: La los focos transforman la energía eléctrica en energía luminosa y energía térmica; las estufas de gas transforman la energía química del gas natural en calor. Las plantas realizan una de las transformaciones de energía más exitosa sobre la Tierra: convierten la energía luminosa, proveniente del sol, en energía química, y la almacenan en moléculas orgánicas (Figure 1). En la Figure 3 se muestran algunos ejemplos de la transformación de energía. El reto para los organismos vivos es obtener energía de su ambiente en formas que éstos puedan transferir o transformar en energía útil para poder utilizarla en sus procesos metabólicos. Durante millones de años las células vivas han evolucionado para "cumplir" con este reto. La energía química almacenada en las moléculas orgánicas, tales como azúcares y grasas, se transere y transforma en energía dentro de las moléculas de ATP a través de una serie de reacciones químicas celulares. La energía almacenada en las moléculas de ATP se puede utilizar muy fácilmente para realizar cualquier trabajo. Algunos ejemplos del tipo de trabajo que realizan las células, utilizando moléculas de ATP son: síntesis de moléculas complejas, transporte de material, movimiento, y contracción de bras musculares. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 5 Figure 3: En esta gura se muestran algunos ejemplos de transferencia de energía de un sistema a otro, y transformación de energía de una forma a otra. El alimento que consumimos proporciona energía a nuestras células para realizar las funciones de nuestro organismo, tal como la luz proveniente del sol proporciona energía a las plantas para crear la energía química que éstas necesitan. (créditos: "helado" modicado del trabajo de D. Sharon Pruitt; "niños" modicado del trabajo de Max de Providence; "hoja" modicado del trabajo de Cory Zanker) La obtención, transformación y utilización de energía por las células vivas podría parecer simple; sin embargo, la segunda ley de la termodinámica explica por qué estas tareas son más complicadas de lo que parecen. La transferencia y transformación de energía nunca es completamente eciente: en cada paso de la transferencia de energía se pierde algo de ésta a una forma que no es utilizable; en muchos casos se pierde en forma de calor. Termodinámicamente la energía térmica se dene como la transferencia de energía, que no es trabajo, de un sistema a otro; por ejemplo, cuando prendemos un foco, una parte de la energía se transforma de energía eléctrica a energía luminosa, y algo de esta energía se pierde en forma de energía térmica. De la misma forma, cuando las células llevan a cabo diferentes reacciones metabólicas, algo de la energía se pierde en forma de calor. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 6 En la física de sistemas un concepto importante es el de orden y desorden: mientras más energía se pierde de un sistema a su ambiente, el sistema se vuelve menos ordenado y más aleatorio; a la medida del desorden o aleatoriedad de un sistema se le conoce como entropía. Un sistema con alto grado de entropía se reere a que tiene un alto grado de desorden y muy poca energía. Las moléculas y las reacciones químicas también presentan un cierto grado de entropía; por ejemplo, la entropía se incrementa cuando las moléculas se difunden y expanden de un lugar de alta concentración. La segunda ley de la termodinámica señala que cuando la energía se transere o transforma, siempre habrá pérdidas de energía en forma de calor. Los seres vivos son sumamente ordenados, y para mantenerse en un estado de baja entropía requieren de una entrada constante de energía. 4 Energía potencial y cinética Cuando un objeto está en movimiento existe energía asociada con ese objeto. Piensa en una bola de demolición; aun cuando se mueva a baja velocidad, ésta puede hacer un gran daño a cualquier objeto. La energía asociada con objetos en movimiento se llama energía cinética (Figure 4). Todos los fenómenos sigu- ientes poseen energía cinética: una bala en aceleración, una persona caminando, y las moléculas moviéndose rápidamente en el aire (las cuales producen calor). ¾Qué pasaría si ahora sí levantamos la bola de demolición, con una grúa, a una altura de dos pisos? Si la bola suspendida está inmóvil, ¾hay energía asociada a ésta? La respuesta es sí; la energía que se necesitó para levantarla no desaparece, sino que está almacenada en la bola de demolición, y esta energía está dada por la posición de la bola y la fuerza de gravedad que actúa sobre ésta; este tipo de energía se conoce como energía potencial (Figure 4). Si la bola cayera, la energía potencial se transformaría en energía cinética hasta que toda la energía potencial se terminara, una vez que la bola estuviera sobre el piso. Las bolas de demolición funcionan como péndulos, y con cada oscilación se produce un cambio constante de energía potencial a energía cinética (en la parte alta de la oscilación la energía potencial alcanza su máximo valor, y en la parte baja lo hace la energía cinética). Otro ejemplo de energía potencial es la energía del agua contenida por una presa o la energía de un paracaidista a punto de saltar de un avión. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 7 Figure 4: El agua en un embalse posee energía cinética, mientras que el agua en movimiento (como en una cascada o en un río), posee energía cinética. (créditos: "presa" modicado de "Pascal"/Flickr; "cascada" modicado de Frank Gualtieri) La energía potencial no está asociada únicamente con la posición de la materia, sino también con su estructura; un resorte sobre el suelo tiene energía potencial si está comprimido; cuando jalamos una liga, ésta también posee energía potencial. A nivel molecular los enlaces que mantienen unidos a los átomos y a las moléculas poseen una alta energía potencial. Recuerda que las rutas celulares anabólicas requieren de energía para sintetizar moléculas complejas a partir de aquellas de menor tamaño, y que las rutas catabólicas liberan energía cuando degradan moléculas complejas. El que se pueda liberar energía cuando se rompen ciertos enlaces indica que éstos tienen una alta energía potencial; de hecho, existe energía potencial almacenada en los enlaces de las moléculas que constituyen los alimentos que consumimos, misma que se puede aprovechar. El tipo de energía potencial que contienen los enlaces químicos y que se libera cuando estos enlaces se rompen, se conoce como energía química. La energía química es la responsable de proporcionar energía a las células, energía proveniente de los alimentos. La liberación de energía se da cuando se rompen los enlaces moleculares de los alimentos que consumimos. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 8 : Para entender mejor cómo la energía potencial cambia a energía cinética, visita http://openstaxcollege.org/l/simple_pend (selecciona "Pendulum" del menú "Trabajo y Energía"). 5 Energía libre de activación Después de aprender que las reacciones químicas liberan energía cuando se rompen sus enlaces, es importante saber cómo se cuantica y expresa la energía asociada a estas reacciones químicas, y cómo se puede comparar la energía de dos reacciones diferentes; para cuanticar estas transferencias de energía se utiliza la energía libre, la cual se reere, especícamente, a la energía disponible asociada con una reacción química una vez que se ha considerado toda la energía perdida (recordemos que la segunda ley de la termodinámica señala que toda transferencia de energía involucra la pérdida de cierta cantidad de energía en forma de calor); en otras palabras, la energía libre es aquella que se puede utilizar para realizar un trabajo. 1 http://openstaxcollege.org/l/simple_pendulu2 http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 9 Si durante una reacción química se libera energía, entonces el cambio en energía libre, expresada como ∆G (delta G), será un número negativo. Un cambio negativo en la energía libre también signica que los productos de la reacción tienen menos energía libre que los reactantes, debido a la liberación de energía durante la reacción. Las reacciones que tienen un cambio negativo en energía libre y consecuentemente liberan energía se llaman reacciones exergónicas; exergónico signica existente en el sistema". Estas reacciones también se conocen como reacciones espontáneas, y sus productos poseen menor energía que los reactantes; el que una reacción sea espontánea no signica que ocurra inmediatamente: la oxidación del hierro es una reacción espontánea que sucede lentamente a lo largo del tiempo. Si en balance una reacción química absorbe más energía de la que libera, entonces el valor de ∆G será positivo; en este caso los productos tendrán mayor energía libre que los reactantes, por lo tanto los productos de estas reacciones se consideran como moléculas almacenadoras de energía. Este tipo de reacciones químicas se llaman reacciones endergónicas, y no son reacciones espontáneas (una reacción endergónica no se llevará a cabo sin la adición de energía libre). : Figure 5: Esta ilustración muestra ejemplos de procesos endergónicos (aquellos que requieren energía) y procesos exergónicos (los que liberan energía). (créditos: (a) modicado del trabajo de Natalie Maynor; (b) modicado de USDA; (c) modicado del trabajo de Cory Zanker; (d) modicado del trabajo de Harry Malsch) http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 10 Observa cada uno de los procesos en la ilustración y decide si son endergónicos o exergónicos. Existe un concepto más que debemos revisar en relación con las reacciones endergónicas y exergónicas: antes de que las reacciones exergónicas puedan liberar energía, requieren de una pequeña cantidad de ésta para que ocurran. esta pequeña cantidad de energía se conoce como energía de activación. : En la siguiente liga encontrarás una animación sobre la transición entre la energía libre y la reacción: http://openstaxcollege.org/l/energy_reactio2 2 . 6 Enzimas Un catalizador es una sustancia que ayuda a que ocurra una reacción química y las moléculas que catalizan reacciones bioquímicas se llaman enzimas. 2 http://openstaxcollege.org/l/energy_reactio2 http://cnx.org/content/m53382/1.10/ La mayoría de las enzimas son proteínas y se encargan de OpenStax-CNX module: m53382 11 disminuir la energía de activación de las reacciones químicas que se desarrollan dentro de la célula. Muchas de las reacciones críticas para las células ocurren muy lentamente a temperaturas normales, por lo que no serían de utilidad para la célula; sin la presencia de enzimas que aceleran las reacciones, la vida no sería posible. Las enzimas aceleran las reacciones acoplándose a las moléculas de reactantes y sosteniéndolas de tal forma que provocan el rompimiento de los enlaces químicos, por lo que la reacción se desarrolla más fácilmente. Es importante recordar que las enzimas no cambian aunque la reacción en la que participan sea exergónica (espontánea) o endergónica; esto se debe a que las enzimas no cambian la energía libre de los reactantes o los productos, sino que únicamente reducen la energía de activación necesaria para que la reacción se lleve a cabo (Figure 6). En suma, una enzima no cambia debido a la reacción que cataliza y una vez que ha catalizado una reacción, ésta puede participar en otras reacciones. Figure 6: Las enzimas disminuyen la energía de activación necesaria para que se lleve a cabo una reacción, pero no disminuyen la energía libre de dicha reacción. Los sustratos son reactantes químicos a los cuales se unen las enzimas; éstas pueden unirse a más de un sustrato dependiendo del tipo de reacción química de que se trate. En algunas reacciones un solo sustrato reactante se degrada en múltiples productos, mientras que en otras, dos sustratos se pueden combinar para producir una molécula de mayor tamaño. También pueden intervenir dos reactantes en una reacción dando origen a dos productos. El lugar dentro de la enzima que se une con el sustrato se llama sitio activo, éste es el lugar donde ocurre la "acción". Debido a que las enzimas son proteínas, existe solamente una combinación de aminoácidos en las cadenas laterales dentro del sitio activo; estas cadenas pueden ser grandes o pequeñas; ligeramente ácidas o básicas; hidrólas o hidrófobas; con carga positiva o negativa e incluso pueden ser neutras. La combinación de todas estas características en las cadenas laterales les conere un ambiente químico particular en el sitio activo, que es el adecuado para ensamblarse con un sustrato o sustratos único y especíco. Los sitios activos están sujetos a la inuencia del ambiente, cuando se incrementa la temperatura ambiente, generalmente se incrementa la velocidad de la reacción. En otros casos para que la reacción ocurra a una velocidad adecuada las enzimas tienen que intervenir como catalizadores. Sin embargo, existe un rango óptimo de temperatura y fuera de éste se reduce la tasa a la cual la enzima cataliza la reacción. Las altas temperaturas pueden eventualmente desnaturalizar las enzimas ocasionando cambios irreversibles en su estructura tridimensional, y por lo tanto, comprometiendo la función enzimática. Las enzimas también requieren de un intervalo de pH dentro del cual pueden funcionar de manera adecuada; un pH o salinidad extremos pueden desnaturalizarlas. Durante muchos años los cientícos pensaban que la unión enzima-sustrato ocurría de forma simple como lo explica el modelo de la llave y la cerradura. Dicho modelo proponía que la enzima y el sustrato encajaban perfectamente y que la unión ocurría en un solo paso instantáneo. Sin embargo, investigaciones recientes sustentan el modelo de ajuste inducido (Figure 7). Este modelo va más allá del modelo de llave-cerradura y describe una forma más dinámica de unión entre la enzima y el sustrato. Tan pronto como la enzima y el sustrato se ponen en contacto, su interacción produce un ligero cambio en la estructura de la enzima, que forma entonces un arreglo ideal en la unión enzima-sustrato. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 12 : Haz clic en la siguiente liga para observar una animación del modelo de ajuste inducido: http://openstaxcollege.org/l/hexo . Cuando una enzima se une a un sustrato se forma un complejo enzima-sustrato; este complejo disminuye la energía de activación de la reacción y promueve su rápido desarrollo en una de las múltiples formas posibles. En un nivel básico, las enzimas promueven las reacciones químicas que involucran más de un sustrato, orientando los sustratos de tal forma que las condiciones de la reacción sean las óptimas. Otra forma en la que las enzimas contribuyen para que las reacciones de sus sustratos se lleven a cabo, es por medio de la creación de un ambiente adecuado dentro de los sitios activos. La creación de un ambiente perfecto para que el sustrato especíco de una enzima reaccione se puede lograr a través de arreglos particulares de los grupos R de los aminoácidos, ya que a partir de estos arreglos emergen ciertas propiedades químicas. El complejo enzima-sustrato también puede disminuir la energía de activación comprometiendo la estructura de los enlaces, de tal forma que se puedan romper más fácilmente. Por último, las enzimas también pueden disminuir la energía de activación participando en la reacción química; en estos casos, es importante 3 http://openstaxcollege.org/l/hexokinase2 http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 13 recordar que las enzimas siempre regresarán a su estado original una vez que la reacción termine. Una de las propiedades especiales de las enzimas es que éstas permanecen sin cambios a pesar de las reacciones que catalizan; después de que una enzima cataliza una reacción, libera los productos y puede catalizar otra reacción. Figure 7: . El modelo del ajuste inducido es una variación del modelo de llave-cerradura, y explica la forma en la que las enzimas y sus sustratos sostienen modicaciones dinámicas durante el estado de transición que incrementa la anidad del sustrato por el sitio activo. El escenario ideal sería aquel en el que todas las enzimas de un organismo existieran en abundancia y funcionaran de manera óptima en condiciones celulares todo el tiempo; sin embargo, existe una variedad de mecanismos que asegura que esto no suceda, ya que las necesidades y condiciones cambian de célula a célula, incluso las condiciones de una misma célula cambian con el tiempo. Las enzimas que requieren las células estomacales son diferentes a aquellas que poseen las células que almacenan grasas, las células de la piel, las células nerviosas y los glóbulos rojos. Además, las células del sistema digestivo trabajan mucho más arduamente inmediatamente después de una comida, para procesar y degradar nutrientes. Debido a que las demandas y condiciones de estas células cambian, también lo debe hacer el número y funcionalidad de las enzimas. La energía de activación controla la velocidad de las reacciones bioquímicas y las enzimas disminuyen y determinan esta energía de activación. Finalmente, la cantidad y variedad de enzimas dentro de una célula es lo que determina qué reacciones se llevan a cabo y a qué velocidad. En ciertos ambientes celulares, la actividad enzimática está regulada por agentes ambientales como pH, temperatura, concentración de sales y, en algunos casos, cofactores o coenzimas. Las enzimas también pueden promover o reducir la actividad enzimática; existen muchos tipos de moléculas que poseen esta cualidad y diferentes formas en las que inhiben o promueven la función de las enzimas. En el caso de la inhibición enzimática, la molécula inhibidora posee una estructura similar al sustrato, por lo que puede unirse al sitio activo y bloquearlo. Cuando esto ocurre, se dice que la enzima es inhibida por inhibición competitiva, activo. Por otro lado, en la puesto que la molécula inhibidora compite con el sustrato para unirse al sitio inhibición no-competitiva una molécula inhibidora se une a la enzima en un sitio que no es el sitio activo, llamado sitio alostérico, pero aun así evita que el sustrato se una al sitio activo de la enzima. Algunas moléculas inhibidoras se unen a las enzimas en sitios donde inducen un cambio http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 14 conformacional que reduce la anidad de la enzima por el sustrato; este tipo de inhibición se conoce como inhibición alostérica (Figure 8). Muchas enzimas reguladas de forma alostérica están constituidas por más de un polipéptido, lo que signica que tienen más de una subunidad de proteína. Cuando un inhibidor alostérico se une a una región de una enzima, todos los sitios activos cambian ligeramente en las subunidades de la proteína, de tal forma que las uniones con sus sustratos son menos ecientes. Así como hay inhibidores alostéricos, también existen activadores alostéricos, estos últimos se unen a las enzimas en zonas lejanas al sitio de activación, produciendo un cambio conformacional que incrementa la anidad del sitio o los sitios activo(s) de la enzima por su(s) sustrato(s) (Figure 8). Figure 8: La inhibición alostérica se produce cuando se da un cambio conformacional del sitio activo de la enzima, de tal manera que el sustrato no encaja. En el caso de la activación alostérica, la molécula activadora modica la forma del sitio activo para que el sustrato se una más fácilmente. : Investigación y desarrollo de nuevos medicamentos http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 15 Figure 9: ¾Alguna vez te has preguntado cómo se crean las medicinas? (créditos: Deborah Austin) Sabemos que las enzimas son elementos clave en las rutas metabólicas; entender la forma en la que éstas funcionan y regulan los diferentes procesos en los que intervienen ha sido de crucial importancia para el desarrollo de mucho de los fármacos que están a la venta hoy en día. Los biólogos colaboran con diferentes cientícos en el desarrollo de nuevos medicamentos (Figure 9). Las estatinas son el componente activo de los medicamentos utilizados para reducir los niveles de colesterol, éstas inhiben el funcionamiento de la enzima HMG-CoA reductasa, encargada de la síntesis del colesterol a partir de los lípidos en el organismo. se puede reducir la síntesis de colesterol en el organismo. Con la inhibición de esta enzima De la misma forma, el acetaminofén (popularmente conocido como Tylenol) inhibe la acción de la enzima ciclooxigenasa (COX) y ayuda a aliviar la ebre y los procesos inamatorios, aunque en realidad no se conoce la forma exacta en la que actúa. ¾Cómo se descubren los medicamentos? En la actualidad, no de los grandes retos para la ciencia farmacéutica es el descubrimiento de nuevos medicamentos o drogas blanco. Una droga blanco es la molécula objeto de la droga; por ejemplo, en el caso de las estatinas la droga blanco es la HMG-CoA reductasa. Para identicar drogas blanco se deben hacer investigaciones laboriosas y minuciosas en el laboratorio. Una vez que se identica una droga blanco, los cientícos tienen que indagar cómo actúa esta droga dentro de las células y qué reacciones se desvían en el caso de una enfermedad. Cuando se identica la ruta y el objetivo, se comienza con el diseño de la droga; http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 16 en este proceso, químicos y biólogos trabajan en conjunto para diseñar y sintetizar moléculas que puedan bloquear o activar una reacción especíca. Sin embargo, éste es únicamente el comienzo, pues aun cuando un prototipo de medicamento funcione, se debe someter a diversas pruebas, desde pruebas in vitro hasta pruebas clínicas, antes de que sea aprobado para su venta por la Food and Drug Administration de los Estados Unidos. Algunas enzimas necesitan estar unidas a moléculas especícas no proteicas para desempeñar sus funciones de forma óptima; las uniones pueden ser temporales, por medio de enlaces iónicos o enlaces de hidrógeno, o permanentes, por medio de enlaces covalentes. Estos enlaces promueven una mejor estructura y un mejor funcionamiento enzimático. Algunos ejemplos de estas moléculas son los cofactores y las coenzimas, el magnesio y el hierro son un ejemplo de cofactores inorgánicos. En el caso de las coenzimas, éstas son moléculas orgánicas cuya estructura atómica básica está constituida por carbono e hidrógeno; estas moléculas, al igual que las enzimas, participan en las reacciones sin que se altere su estructura, de tal forma que se pueden reciclar y reutilizar. Las vitaminas son fuente de coenzimas, algunas vitaminas son precursoras de coenzimas, mientras que otras son la coenzima misma. La vitamina C funciona como coenzima para una gran cantidad de enzimas que participan en la formación de tejido conectivo y de colágeno. La función enzimática está regulada por la presencia de cofactores y coenzimas, las cuales llegan al organismo por medio de los alimentos que consumimos, aunque en algunos casos el cuerpo los sintetiza. 6.1 Retroalimentación negativa en las rutas metabólicas Las moléculas pueden regular la actividad enzimática de diferentes formas, pero ¾qué moléculas son éstas y de dónde provienen? Como sabemos, algunas de estas moléculas son los cofactores y las coenzimas. Sin embargo, existen otras moléculas que participan en la regulación enzimática celular, tales como la modulación alostérica y la inhibición competitiva y no competitiva, de las cuales sabemos muy poco o nada. Tal vez la fuente más importante de moléculas reguladoras, en relación con el metabolismo enzimático celular, son los mismos productos de las reacciones metabólicas celulares. Las células han evolucionado, de la forma más elegante y eciente, mecanismos para utilizar los productos de sus propias reacciones para inhibir la actividad enzimática. La retroalimentación negativa involucra el uso de los productos de una reacción para regular su propia producción (Figure 10). La célula responde a la abundancia de algún producto reduciendo la velocidad de producción durante las reacciones anabólicas o catabólicas. Los productos de tales reacciones pueden inhibir la actividad de las enzimas que catalizan su producción a través de los mecanismos descritos anteriormente. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 17 Figure 10: Las rutas metabólicas son una serie de reacciones catalizadas por una gran variedad de enzimas. La retroalimentación negativa, en la cual el producto nal de una ruta metabólica inhibe la producción continua del mismo producto, es un mecanismo muy importante de regulación en las células. La producción tanto de aminoácidos como de nucleótidos se controla por retroalimentación negativa; el ATP funciona como regulador alostérico de algunas enzimas involucradas en la degradación catabólica del azúcar, proceso que produce ATP. De esta forma, cuando hay ATP en abundancia la célula puede evitar su producción; por otro lado, el ADP funciona como un regulador alostérico positivo (un activador alostérico) para algunas de las mismas enzimas que son inhibidas por el ATP. Así, cuando los niveles de ADP son muy altos, en comparación con los de ATP, la célula dispara la producción de más ATP por medio del catabolismo de los azúcares. 7 Resumen de la sección Las células realizan las funciones que mantienen la vida a través de una serie de reacciones químicas. El metabolismo se reere a la combinación de las reacciones que tienen lugar dentro de las células. Las reacciones catabólicas degradan complejos químicos en sus componentes más simples, asociado a este proceso hay liberación de energía. Por otro lado, los procesos anabólicos sintetizan moléculas más complejas a partir de aquellas más simples y requieren de energía para hacerlo. El término sistema se reere al ambiente y la materia y involucrados en la transferencia de energía. Las leyes de la termodinámica son las leyes de la física que describen la transferencia de energía. La primera ley dice que la cantidad de energía en el universo es constante. La segunda ley de la termodinámica señala que en cada evento de transferencia de energía hay una pérdida de energía en forma de calor, que además no es aprovechable. Existen diferentes tipos de energía: cinética, potencial y libre. El cambio en la energía libre de una reacción puede ser negativo (se libera energía: reacción exergónica) o positivo (consume energía: reacción endergónica). Todas las reacciones requieren de una cierta cantidad de energía para que se lleven a cabo; esta energía se conoce como energía de activación. Las enzimas son catalizadores químicos que disminuyen la energía de activación, y por lo tanto la aceleran. Las enzimas poseen un sitio activo con una conformación y ambiente químico exclusivo que se ajusta a un reactante químico particular para dicha enzima, que se llama sustrato. Se cree que tanto las enzimas como los sustratos se enlazan de acuerdo con un modelo de ajuste inducido. La acción enzimática está regulada para conservar recursos y responder de forma óptima ante el ambiente. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 18 8 PREGUNTAS DE CONEXIÓN ARTÍSTICA Exercise 1 (Solution on p. 19.) Figure 5 Observa cada uno de los procesos que se muestran en esta gura y señala si son endergónicos o exergónicos. 9 PREGUNTAS DE REVISIÓN Exercise 2 (Solution on p. 19.) De los siguientes enunciados, menciona cuál no es un ejemplo de transformación de energía. a. Calentar la cena en un microondas b. Paneles solares trabajando c. Formación de energía eléctrica d. Ninguna de las anteriores Exercise 3 (Solution on p. 19.) ¾Cuál de los siguientes enunciados no es verdadero para las enzimas? a. Se consumen por las reacciones que catalizan b. Generalmente están formados por aminoácidos c. Reducen la energía de activación de las reacciones químicas d. Cada una es especíca de un sustrato(s) particular, al cual se unen 10 PREGUNTAS DE PENSAMIENTO CRÍTICO Exercise 4 (Solution on p. 19.) ¾El ejercicio físico que incrementa la masa muscular implica procesos anabólicos y/o catabólicos? Proporciona evidencias para tu respuesta. Exercise 5 (Solution on p. 19.) Explica en tus propios términos la diferencia entre una reacción espontánea y una que ocurre instantáneamente. Menciona sus diferencias. Exercise 6 (Solution on p. 19.) En relación con las enzimas ¾por qué son importantes las vitaminas y minerales para mantener una buena salud? Proporciona algunos ejemplos. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 19 Solutions to Exercises in this Module Solution to Exercise (p. 18) Figure 5 Una pila de composta en descomposición es un proceso exergónico. Un bebé en desarrollo, a partir de un huevo fertilizado, es un proceso endergónico. Una pelota rodando cuesta abajo es un proceso exergónico. to Exercise (p. 18) D to Exercise (p. 18) A to Exercise (p. 18) El ejercicio físico involucra tanto procesos anabólicos como catabólicos. Las células del cuerpo descomponen los azúcares para proporcionar el ATP necesario para realizar ejercicio, como las contracciones musculares, esto se conoce como catabolismo. Las células musculares deben reparar el tejido muscular dañado por el ejercicio construyendo nuevo músculo, esto se conoce como anabolismo. to Exercise (p. 18) Una reacción espontánea es aquella con un ∆G negativo y por lo tanto libera energía. Sin embargo, una reacción espontánea no necesariamente ocurre de forma rápida o repentinamente. La reacción puede ocurrir por periodos largos de tiempo debido a la gran cantidad de energía de activación, la cual evita que la reacción ocurra rápidamente. to Exercise (p. 18) La mayoría de las vitaminas y los minerales funcionan como cofactores y coenzimas para la actividad enzimática. Muchas enzimas requieren de la unión de ciertos cofactores o coenzimas para poder catalizar sus reacciones. Debido a que las enzimas catalizan muchas reacciones importantes, es vital obtener sucientes vitaminas y minerales de alimentos y suplementos. La vitamina C (ácido ascórbico) es una coenzima necesaria para que actúen las enzimas que producen colágeno. Glossary Denition 1: Energía de activación Cantidad de energía inicial necesaria para que proceda una reacción. Denition 2: Sitio activo Región especíca de una enzima en la cual se une el sustrato. Denition 3: Inhibición alostérica Mecanismo por el cual se inhibe la acción enzimática por medio de una molécula reguladora que se une a un segundo sitio (no el activo), produce un cambio conformacional en el sitio activo, y evita que se una el sustrato. Denition 4: Anabólico Describe una ruta que requiere de una entrada de energía neta para sintetizar moléculas complejas a partir de moléculas simples. Denition 5: Bioenergética Concepto de ujo de energía a través de sistemas vivos. Denition 6: Catabólico Describe una ruta en la cual moléculas complejas se degradan en unas más simples, generando energía adicional como producto de la reacción. Denition 7: Inhibición competitiva Mecanismo general de regulación de la actividad enzimática, en la cual una molécula, diferente al sustrato de la enzima, se une al sitio activo y evita que el sustrato correspondiente se una, con lo cual se inhibe la reacción de la enzima. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ OpenStax-CNX module: m53382 Denition 8: Endergónica Describe aquellas reacciones químicas en las que sus productos almacenan más energía potencial que la que poseen los reactantes. Denition 9: Enzima Molécula que cataliza reacciones bioquímicas. Denition 10: Exergónica Describe aquellas reacciones químicas cuyos productos tienen menor energía potencial que sus reactantes, y además liberan energía. Denition 11: Retroalimentación negativa Mecanismo de regulación enzimática en el que el producto, o producto nal de una reacción, en una serie de reacciones secuenciales, inhibe la actividad enzimática en los primeros pasos de la serie de reacciones. Denition 12: Energía térmica Energía que se transere de un sistema a otro y que no es trabajo. Denition 13: Energía cinética Tipo de energía asociada con los objetos en movimiento. Denition 14: Metabolismo Serie de reacciones químicas que tienen lugar dentro de la célula, incluyendo aquellas que consumen energía y las que la liberan. Denition 15: Inhibición no competitiva Mecanismo general que regula la actividad enzimática, en el cual la molécula reguladora se enlaza a un sitio diferente al sitio activo y evita que este último se una al sustrato; la molécula inhibidora no compite con el sustrato por el sitio activo. La inhibición alostérica es una forma de regulación no competitiva. Denition 16: Energía potencial Tipo de energía que se reere a la potencia para hacer un trabajo. Denition 17: Sustrato Molécula sobre la cual actúa una enzima. Denition 18: Termodinámica Ciencia que estudia la relación entre el calor y el trabajo. http://cnx.org/content/m53382/1.10/ 20