Download Diana Marcela Higuita – Presentación Musalac ICA

Servicio de Diagnóstico Fitosanitario del ICA
Dirección técnica de Análisis y Diagnóstico Agrícola - LNDF
Mosquera, Cundinamarca
32 gerencias seccionales
32 gerencias seccionales
Expide las medidas sanitarias y fitosanitarias locales.
Negociación internacional, para facilitar el acceso a los mercados.
Evalúa riesgos asociados a las especies, productos, subproductos de importación.
32 gerencias seccionales
Puertos aéreos y marítimos y pasos fronterizos .
Ejerce el control técnico sobre las importaciones de animales, vegetales y sus productos, a fin de
prevenir la introducción de artrópodos plaga y enfermedades.
Realiza el control zoosanitario y fitosanitario de los medios de transporte que ingresen al país y aplica las
medidas de prevención o control.
32 gerencias seccionales
Expide y difunde las medidas para proteger y mejorar la productividad del sector agrícola del país.
Campañas para el control y erradicación de plagas de control oficial. Estatus fitosanitario del país.
Establece y mantiene las zonas libres y de baja prevalencia de plagas de control oficial.
Vigilancia epidemiológica.
Ejerce control técnico de los insumos agrícolas y la producción y liberación de semillas.
32 gerencias seccionales
Soporte de decisiones de otras dependencias. Diagnóstico de insectos plaga y patógenos
asociados a cultivos en el país, productos de importación y exportación.
Protocolos y técnicas analíticas actualizadas para atender las necesidades del servicio sanitario
y fitosanitario del país.
Red de Laboratorios de Diagnóstico Fitosanitario
Norte de Santander
Santander
Antioquia
Caldas
Cundinamarca
Tolima
Meta
Valle del Cauca
Nariño
Identificación, caracterización y confirmación de la presencia de agentes patógenos e
insectos plaga a partir de muestras recibidas de funcionarios ICA o de usuarios particulares.
Tipo de muestras analizadas
Verificación de requisitos para exportación o importación
Tipo de muestras analizadas
Muestras locales: Usuarios internos (ICA) y externos
Calidad de la muestra
http://www.ica.gov.co/Videos_2/Agricolas.aspx
http://www.ica.gov.co/Areas/laboratorios/Lab-Nacional-de-DiagnosticoFitosanitario.aspx
Diagnóstico entomológico
•
Identificación de plagas en cultivos
• Especímenes aislados o asociados a los órganos vegetales.
• Condiciones de preservación adecuadas
• Etapa de desarrollo.
• Características morfológicas.
Oncyderes sp. (Cerambycidae)
Glycaspis brimblecombei (Psyllidae)
Diagnóstico Fitopatológico
Micología
•
•
•
•
Cámaras húmedas
Aislamiento y caracterización morfológica
Identificación molecular
Pruebas inmunoenzimaticas
Bacteriología
•
•
•
•
•
Aislamiento y caracterización bioquímica.
Biolog
Detección e identificación PCR
Pruebas inmunoenzimaticas
Pruebas isotérmicas
Nematología
Virología
• Aislamiento y caracterización morfológica
•
•
•
•
Pruebas inmunoenzimaticas
PCR con iniciadores específicos
Virus tipo RNA: dsRNA
Virus tipo DNA: Rolling circle
Identificación de bacterias a través del sistema
semi-automatizado BIOLOG
• Basado en la capacidad de los
microorganismos para utilizar
diferentes fuentes de carbono
simultáneamente.
• Plato con 95 fuentes de carbono
diferentes
• Cambio de color de los pozos a
morado.
•
Patrón característico de cada
microorganismo. Evaluación por
espectrofotometria.
Amplificación isotérmica de
ácidos nucleicos
Separación del ADN y la amplificación a temperatura
constante.
Necesita una o más enzimas.
Puede requerir más de un par de cebadores.
Equipos
Tolerancia a inhibidores de PCR
Amplificación en 30 – 60 minutos
Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos
Métodos
Enzima individual:
Amplificación por círculo rodante (RCA = Rolling circle amplification).
Virus don genoma ADN
Amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP = Loop mediated
isothermal amplification)
Dos enzimas:
Amplificación dependiente de helicasas (HDA= helicase Dependent
Amplification)
Reacción de amplificación con enzimas de corte (NEAR).
Más de dos enzimas:
Amplificación basada en la secuencia del ácido nucleico (NASBA)
Amplificación por Recombinasa de Polimerasa (RPA).
Ralstonia solanacearum
Plátano, banano, heliconias.
Moko, maduraviche
Ralstonia solanacearum (Smith) Yabuuchi
A partir de tejido sintomático. Aislamientos
ImmunoStrip® AGDIA
1
2
SPOT CHECK-LF™ADGEN
3
Muestra positiva
Muestra positiva
Muestra negativa
1 y 2: Muestras positivas
3: Muestra negativa
Control negativo
Ralstonia solanacearum
PCR
1
2 3
4
5
6
7 8
9 10 11 12 13 14
Bio PCR
Iniciadores especie
específicos, no para
diferenciación de
razas.
1. Oli1-Oli2: Seal y
Elphistone (1994)
2. 759-760: Pina et
al., 1997
280 pb
1. Marcador de peso 100 pb
2-12 Muestras positivas
13. Control positivo
14. Control negativo
Dickeya chrysanthemi Burkholder
Pudrición acuosa del
pseudotallo.
Aislamiento
Purificación
Caracterización morfológica y bioquímica
BIOLOG
Banana streak virus (BSV)
1
2
3
4
5
600 pb
PCR, con iniciadores específicos
reportados por Harper et al., 2002
1.
2.
3.
4.
5.
Marcador de peso 100 pb
M1
M2
CP
Blanco
Nematodos
Caracterización morfológica
Meloidogyne sp.
Helicotylenchus sp
Fusarium oxysporum f.sp. cubense
Fusarium oxysporum f.sp. cubense
Caracterización morfológica hasta especie
Fusarium oxysporum f.sp. cubense
PCR
Iniciadores específicos para
R4T (Dita et al., 2010).
• FocTR4-F
• FocTR4-R
Agentes Fitopatógenos en Plátano y Banano
Diagnosticados en el LNDF en el año 2012
60
40
Banana streak virus
Chalara sp.
30
Dickeya chrysanthemi
Fusarium oxysporum
20
Helicotylenchus sp.
Pratylenchus sp.
Radopholus sp.
10
Ralstonia solanacearum
Tolima
Santander
Risaralda
Quindío
Quindio
Norte de Santander
Nariño
Meta
Magdalena
La Guajira
Cundinamarca
Córdoba
Cordoba
Casanare
Caquetá
Caldas
Atlántico
Arauca
0
Antioquia
Numero de casos
50
Gracias