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Tema 4
Análisis genético en
humanos
Análisis
Análisisde
depedigrí
pedigrí(puntuación
(puntuaciónlod)
lod)
Hibridación
Hibridaciónininsitu
situ(FISH)
(FISH)
Células
Célulashíbridas
híbridas(humano-ratón)
(humano-ratón)
Cartografiado
Cartografiadode
dehíbridos
híbridos
Pleiotropía
Cartílago anormal
Traquea estrecha
Costillas delgadas
Defectos en los
órganos del pecho
Alteraciones en los
conductos nasales
Otras anormalidades
Enfermedades de los
pulmones
Dificultades
repiratorias
Aumento del tamaño
del corazón
Fallos del corazón
Hemorragias
pulmonares
Muerte
Retraso en el
crecimiento
Dificulates en la
alimentación
Penetrancia de un genotipo: % de invividuos de un genotipo
determinado que muestran el fenotipo asociado
Expresividad: Nivel de expresión fenotìpico de un genotipo en
un individuo
Enfermedad de Huntington
(enfermedad monogénica)
Relacionada con la expansión de un trinucleótido en el gen HD
Personas sanas de 19 a 21 CAG. Personas enfermas 46 de media
Arbol de 10.000 personas
Ateroesclerosis, hipertensión, esquizofrenia
(enfermedad poligénica y multifactorial)
•Desequilibrio de ligamiento
•Influencia genética y ambiental..Suceptibilidad
Puntuación Lod en el análisis de
ligamiento en pedigríes
Puntuación Lod
Log Of Odds (logaritmo de probabilidades)
Probabilidad de obtener un conjunto de resultados en
una familia basándose en la existencia de segregación
independiente (por un lado) y en la de un grado
concreto de ligamiento, por otro.
Cociente entre las dos probabilidades…Log
Se pueden sumar
cruzamientos
los
resultados
Se admite ligamiento si Lod=> 3
Se admite no ligamiento si Lod=<-2
DIFICULTADES
- Repulsión a acoplamiento
- Penetrancia incompleta
- Multifactorialidad
de
varios
D: alelo dominante que determina una enfermedad
M: marcador molecular
DD M1M1 X ddM2M2
Dd M1M2
(DM1 / dM2)
FR
P
R
0,5
0,25
0,25
X
0,4
0,3
0,2
Dd M2M2
(dM2 / dM2)
0,3
0,35
0,15
0,2
0,4
0,1
Probabilidad de obtener los resultados si FR=20%
0,4 X 0,1 X 0,4 X 0,4 X 0,1 X 0,4 XB = 0,00026 x B
Probabilidad de obtener los resultados si FR=50%
0,25 X 0,25 X 0,25 X 0,25 X 0,25 X 0,25 XB = 0,00024 x B
Lod = log [(0,00026 x B) / (0,00024 x B)] = log 1.08 = 0,03
DD M1M1 X ddM2M2
Dd M1M2
(DM1 / dM2)
FR
Probabilidad
Cociente
Lod
0,5
0,00024
1,0
0
X
Dd M2M2
(dM2 / dM2)
0,4
0,3
0,2
0,00032 0,00034 0,00026
1,33
1,41
1,08
0,12
0,15
0,03
Puntuaciones Lod de 3 determinan un apoyo convincente de
ligamiento con una valor de FR concreto
AM1/aM2
aM2/aM3 aM2/aM4 AM1/aM4
AM1/aM2
aM1/aM3
aM2/aM4 AM2/aM4
AM1/aM2
aM1/aM3
aM2/aM4 AM1/aM4
aM3/aM4
aM2/aM4
aM2/aM3 AM1/aM3
aM3/aM4
aM2/aM4
aM1/aM3 AM1/aM3
aM3/aM4
aM2/aM4
aM2/aM3 AM1/aM3
Marcadores moleculares basados en
diferencias puntuales
SNPs (Single-nucleotide polymorphism)
RFLPs (Restriction fragment length polymorfism)
RAPD (Random amplified polymorfic)
SNPs (Single-nucleotide polymorphism)
Genoma humano……..
un nucleótido diferente cada
1000-3000 pb en secuencias codificantes
500-1000 pb en secuencias no codificantes
Existen ya 300.000 SNPs identificados en humanos
Fluorescence in situ hybridization (FISH)
Fibroblasto humana
Célula tumoral
de ratón
Virus sendai
Timidina kinasa
(TK)
Timina
A. timidílico
TK+
TK+
TK+
Linea A
TK+
Linea B
TK-
Linea C
TK-
Linea D
TK-