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La era de la ecología y la demografía a gran escala
En la última década hemos visto la publicación en linea de datos
genéticos (GenBank), anatómicos y fisiológicos (TRY, BIEN), y
climáticos (FetchClimate), entre otros, ampliando los límites para
hacernos preguntas biológicas a escalas muy amplias, globales.
La demografía, el estudio de la dinámica de poblaciones y sus
determinantes, es clave para responder preguntas tales como ¿por
qué algunas especies se extinguen localmente mientras que otras
se transforman en pestes invasoras? ¿Cómo podemos garantizar la
seguridad alimentaria de paises en desarrollo? ¿Cómo responden
las especies a los cambios globales? ¿Por qué algunas especies
senecen mientras otras no? Sin embargo, la disponibilidad limitada
de datos demográficos de muchas especies ha restringido nuestra
habilidad para buscar respuestas a estas preguntas. Estas bases
de datos contribuyen a resolver estas limitaciones.
www.compadre-db.org
www.comadre-db.org
Introducimos ahora las bases de datos COMPADRE y COMADRE ahora matrices de datos de plantas y
de animales respectivamente
1200
1400
Fig. 1a
COMPADRE v. 3.0
1200
1000
Trabajo,de,campo,
COMPADRE v. 2.0
800
600
Cummulative
number
of animal
studies
Número
total de
estudios
de animales
1400
Inves&gador,
Número
total de
estudios
de studies
plantas
Cummulative
number
of plant
Estas bases de datos con acceso abierto serán publicadas en linea en el verano del 2014 (COMPADRE) y a comienzos del 2015 (COMADRE), auspiciados por
el Instituto Max Planck de Investigaciones Demográficas (Rostock, Alemania). Actualmente COMPADRE y COMADRE contienen matrices de proyección de
más de 900 especies vegetales y más de 1300 especies animales, con un total de más de 12000 matrices con variados tratamientos, condiciones anuales y
poblaciones. Además, contienen información de covariantes (taxonómicos, biogeográficos, y de geolocalización) que ayudarán a los investigadores en la
interpretación de los resultados. Los métodos demográficos actuales hacen posible la estimación de muchas variables en el análisis de estas matrices, que
pueden ser directamente interpretadas biológicamente (por ej. Sensibilidades, esperanza de vida, tasas de crecimiento poblacional, etc.) .
Publicación de Leslie
400
COMPADRE v. 1.0
200
0
1945
1950
1955
1960
1965
1970
1975
1980
1985
1990
1995
2000
2005
2010
Construcción,del,modelo,matricial,poblacional,
2015
COMADRE v. 2.0
Fig. 1b
1000
COMADRE v. 1.0
800
600
Publicación de Leslie
400
200
0
1945
1950
1955
1960
Yearpublicación
of publication
Año de
Number of matrices in COMPADRE
n = 6730
5
10
50
100
500
1000
1500
2500
Inves&gadores,,
Maestros,,
Estudiantes,,
Agencias,,etc,
Number of population
Número dematrix
matricesmodels
por país per country
Equipo,de,COMPADRE,&,COMADRE,,
Fig. 2a
1
1970
1975
1980
1985
1990
1995
2000
2005
2010
2015
Year
publication
Año
deofpublicación
Number of matrices in COMADRE
Publicación,
0
1965
Fig. 3a
Magnoliopsida
Comunicación,personal,
Búsquedas,periódicas,
Digitalización,de,datos,
Fig. 2b
Versión,de,trabajo,de(COMPADRE,
Versión,de,trabajo,de,COMADRE,
,
Corrección,de,errores,
Versión,en,línea,de(COMPADRE,
Versión,en,línea,de(COMADRE,
n = 2942
0
1
5
10
50
100
500
1000
1500
2500
Number of population
matrixpormodels
per country
Número de matrices
país
Fig. 3b
Mammalia
Aves
Del terreno al consumidor!
Liliopsida
COMPADRE y COMADRE archivan modelos matriciales de
poblaciones publicados por investigadores en todo el
mundo. Nuestro equipo de digitalizadores (presentado
abajo) ha sido entrenado para extraer y verificar esta
información y para contactar los investigadores cuando se
requiera información adicional. Periódicamente se incorporan
nuevos datos a través de la página web de COMPADRECOMADRE, con excepción de aquellos datos con embargo
temporal.
Pinopsida
Cycadopsida
Pteridopsida
Polypodiopsida
Bryopsida
Rhodophyceae
Florideophyceae
Phaeophyceae
0
10
20
30
40
50
60
70
% del Taxón
en COMPADRE
% taxonomic
class
in COMPADRE
COMPADRE fue fundada por M. Franco y J. Silvertown. En su versión 1.0
contenía las matrices de control de cerca de 100 especies de plantas. Esfuerzos
paralelos extendieron la base de datos en los años siguientes (Y. Buckley, J.
Che-Castaldo, E. Crone, D. Hodgson, T. Knight, S. Ramula, R. Salguero-Gómez). R. Salguero-Gómez aumentó significativamente el tamaño de la base a más de
500 especies, añadiendo algunos covariantes (por ej. Tratamientos en v. 2.0).
COMPADRE 3.0 es actualmente dirigida por R. Salguero-Gómez y O.R. Jones y
además de contener covariantes importantes (p. ej. geolocalización, taxonomía,
forma de crecimiento) ha unificado los anteriores esfuerzos paralelos en un
repositorio único.
COMADRE v. 1.0 fue creada por R. Salguero-Gómez y O.R. Jones. En su versión
2.0 ha integrado conjuntos paralelos de datos demográficos (p. ej. D. Hodgson,
L.A. Velez-Espino, M. van de Kerk). Desde 2012, las bases de datos son
apoyadas por el Laboratorio de Demografía
Evolutiva y por el grupo de
investigación independiente Modelos de Evolución del Envejecimiento, en el
Instituto Max Planck de Investigaciones Demográficas (Rostock, Alemania).
Dado el incremento exponencial de las publicaciones (Fig.
1a, b), la recopilación de estos datos es un cometido tan
urgente como excitante. Los investigadores que están por
comenzar estudios demográficos deben considerar la fuerte
parcialización geográfica (Fig. 2a, b*) y taxonómica (Fig. 3a,
b) de las colecciones de datos. Tenemos la esperanza que
tanto investigadores y estudiantes, asi como agencias de
enseñanza y ambientales, entre otras, usarán estos recursos
para abordar oportunamente cuestiones demográficas.
*Noten que mucha de la información geográfica en COMADRE no ha sido digitalizada, por tanto esta figura
está siendo procesada.
Reptilia
Amphibia
Arachnida
Insecta
Maxillopoda
Malacostraca
Branchiopoda
Actinopterygii
Chondrichthyes
Polychaeta
Cephalaspidomorphi
Bivalvia
Gastropoda
Merostomata
Anthozoa
Other
0
10
20
30
40
50
60
70
% del Taxón
en COMADRE
% taxonomic
class
in COMADRE
Contacto: compadre-contact@demogr.mpg.de
Supervisores de bases de datos: Rob Salguero-Gómez y Owen Jones.
Comité Central: Yvonne Buckley, Judy Che-Castaldo, Hal Caswell, Dalia
Conde, Dave Hodgson, Rob Salguero-Gómez, Owen Jones, Alexander
Scheuerlein, y James Vaupel.
Digitisation team: Hendrik de Buhr, Alexander Hartmann, Anne Henning,
Claudia Farack, Fränce Gottschalk, Gesa Roemer, Tara Ruoff, Julia Wille, y
Stefan Zeh, con Ruth Archer (postdoc).
Equipo de Digitalización: Res Altwegg, Fernando Colchero, Ming Dong,
Miguel Franco, Hans de Kroon, Jean Dominique Lebreton, Jessica
Metcalf, Maile Neel, Ingrid Parker, Bernt-Erik Sæther, Juan Silva, Jonathan
Silvertown, Takenori Takada, Teresa Valverde, Luis Antonio Velez-Espino, y
Glenda Wardle.