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Memorias del XXXIV Encuentro Nacional y III Congreso Internacional de la AMIDIQ 7 al 10 de mayo de 2013, Mazatlán, Sinaloa, México CLONACIÓN DEL GEN FACTOR DE ELONGACIÓN 1-α (EF-1α) DE LEISHMANIA MEXICANA Annete I. Apodaca-Medinaa, Zayda L. Piedra-Quinteroa, Paul E. Montes-Martíneza, José E. EncisoMonárreza, Evangelina Beltrán-Lópeza, Jeanett Chávez-Ontiverosa, Claudia R. León-Sicairosa, Vianney Ortiz-Navarreteb, Héctor S. López-Morenoa a Laboratorio de Biomedicina Molecular, CA Biotecnología Biomédica, Facultad de Ciencias Químico Biológicas, Universidad Autónoma de Sinaloa, Av. las Américas y Blvd. Universitarios S/N, Cd. Universitaria, Culiacán, Sinaloa, C.P. 80000, MÉXICO. hslmoreno@uas.edu.mx b Departamento de Biomedicina Molecular, CINVESTAV, Av. Instituto Politécnico Nacional 2508, San Pedro Zacatenco, Delegación Gustavo A. Madero, México DF, C.P. 07360, MÉXICO. Resumen Las Leishmaniasis son un grupo de enfermedades parasitarias causadas por protozoarios intracelulares del género Leishmania, transmitidos por la picadura de dípteros hematófagos del género Lutzomyia. En México, la Leishmaniasis Cutánea (LC) es endémica en varios estados incluyendo a Sinaloa. Recientemente nuestro grupo reportó cinco nuevos antígenos derivados de Leishmania mexicana (L. mexicana) detectados únicamente por sueros de pacientes con diagnóstico de certeza de LC; posteriormente se aisló y secuenció uno de dichos antígenos (p29), el análisis in silico mostró similaridad con el Factor de Elongación 1-alfa (EF-1α) de L. mexicana. El EF-1α de L. donovani, se une a la fosfatasa SHP-1 contribuyendo a la inhibición del macrófago, impidiendo la eliminación del parásito, además este factor ha sido evaluado como potencial blanco terapéutico contra la Leishmaniasis Visceral. En L. mexicana el EF-1α no ha sido estudiado y debido a su posible participación en la relación hospedero-parásito y a su potencial inmunodiagnóstico se considera de gran relevancia estudiarlo, por ello se planteó clonar el gen EF-1α empleando el DNA de L. mexicana cepa MHOM/MX/92/UAY68. Nuestros resultados permiten definir inmunoquímicamente a p29 como el EF-1α de este parásito. Asimismo, se logró clonar este gen y su secuencia nucleotídica presentó una identidad del 100% con el EF-1α, finalmente se registró en el GenBank con número de acceso JQ762448. Introducción Las Leishmaniasis son un grupo de enfermedades infecciosas causadas por parásitos intracelulares del género Leishmania que son transmitidos al ser humano y otros mamíferos mediante la picadura de la hembra hematófaga de insectos dípteros del género Lutzomyia en América [4]. En el ser humano, la infección por Leishmania puede afectar la piel y las mucosas o tejidos y órganos como la médula ósea, el hígado y el bazo, produciendo un espectro de enfermedades con diferentes formas clínicas que son la Leishmaniasis Cutánea (LC) que puede ser localizada (LCL) o difusa (LCD), Leishmaniasis Mucocutánea (LMC) y Leishmaniasis Visceral (LV) [6]. 1689 © 2013 Academia Mexicana de Investigación y Docencia en Ingeniería Química (AMIDIQ) ISBN: 978-607-95593-1-1 Memorias del XXXIV Encuentro Nacional y III Congreso Internacional de la AMIDIQ 7 al 10 de mayo de 2013, Mazatlán, Sinaloa, México La morbilidad global de esta parasitosis es de 2.4 millones de personas (946,000 para los hombres y 1, 410,000 para las mujeres) en 98 países incluido México y cuenta con una tasa de mortalidad de aproximadamente 60,000 habitantes por año [1]. Para el caso del estado de Sinaloa, hasta el 2012 se reportaron aproximadamente 120 casos de LC [7]. La respuesta inmune innata durante la Leishmaniasis es mediada principalmente por neutrófilos, macrófagos, células dendríticas (DC) y células asesinas naturales (NK) [1]. Sin embargo Leishmania ha logrado desarrollar diversas estrategias que le permiten evadir al sistema inmune del hospedero, principalmente mediante la inhibición de funciones críticas de los macrófagos, como la producción de especies reactivas de oxígeno (ROS) y los productos intermediarios de nitrógeno (NO). Esta inhibición de la activación de los macrófagos es provocada por una serie de factores de virulencia derivados de Leishmania, así como por la secreción de un gran repertorio de moléculas [2]. En Leishmania se han reportado diversos antígenos relevantes, uno de ellos es el Factor de Elongación 1 alfa (EF1α), el cual desempeña un papel central en la biosíntesis de proteínas, además de participar en una gran variedad de procesos celulares. En L. donovani, el EF-1α funciona como un factor de virulencia mediante la activación de la fosfatasa SHP-1 en los macrófagos infectados, lo cual permite la regulación negativa de la síntesis de productos intermediarios de nitrógeno, es decir tiene la capacidad de desactivar el fenotipo efector de estas células [2]. El EF-1α en todas las células tiene una naturaleza altamente conservada, sin embargo se ha demostrado que existe una deleción de 12 aminoácidos en la proteína de Leishmania comparada con la secuencia proteica en mamíferos, lo que sugiere que las diferencias en las propiedades de éstos dos factores se debe al distinto plegamiento de la proteína, pero además esta ausencia de 12 aminoácidos expone una región del EF-1α que se propone como un potencial blanco farmacológico contra Leishmania [3]. Para el caso de L. mexicana el EF-1α no ha sido estudiado, sin embargo recientemente nuestro grupo de investigación reportó un set de cinco nuevos antígenos derivados de L. mexicana evidenciados mediante western blot de doble dimensión empleando como antígeno un extracto crudo de L. mexicana (ECLm) y sueros de pacientes con diagnóstico de certeza de LC [5]. La secuencia de aminoácidos del más prominente de ellos, llamado p29, permitió identificarlo in silico como el EF-1α, por lo que en este trabajo se plateó confirmar su naturaleza inmunoquímica y clonar el gen EF-1α de L. mexicana empleando iniciadores específicos y secuenciar el amplicón resultante para verificar la identidad de este factor. Metodología Para identificar la naturaleza inmunoquímica de p29 se realizó un Western blot 2D con anti-EF-1α comercial (SIGMA) así como suero de un paciente con diagnóstico de LC y 1690 © 2013 Academia Mexicana de Investigación y Docencia en Ingeniería Química (AMIDIQ) ISBN: 978-607-95593-1-1 Memorias del XXXIV Encuentro Nacional y III Congreso Internacional de la AMIDIQ 7 al 10 de mayo de 2013, Mazatlán, Sinaloa, México utilizando como antígeno extracto crudo de L. mexicana de la cepa MHOM/MX/92/UAY68. Para el diseño de los iniciadores específicos (Z-EF1a-F y Z-EF1aR) se utilizó el programa OLIGO® versión 7 y la secuencia del genoma completo de L. mexicana cepa MHOM/GT/2001/U1103 (GenBank: FR799570.1). Se estandarizó una PCR empleando los iniciadores Z-EF1a-F y Z-EF1a-R y como DNA templado DNA genómico de L. mexicana aislado mediante el kit comercial PureLink Genomic DNA (Invitrogen). El amplicón de 1300 pares de bases (pb) fue purificado con el kit de extracción QIAQUICK GEL (QIAGEN). El producto de PCR purificado fue enviado para su secuenciación al Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad (LANGEBIO) en Irapuato, Guanajuato. Resultados El Western blot 2D reveló la naturaleza inmunoquímica de p29 como el EF-1α (Fig.1). Se diseñaron los iniciadores específicos Z-EF1a-R (5´ ATGGGCAAGGATAAGTG-3´) y Z-EF1a-F (5´-TTACTTCTTCGCAGCCTT-3´). Con estos iniciadores y DNA de L. mexicana se realizo PCR obteniendo un producto con un peso molecular de aproximadamente 1300 pb (Fig. 2) el cual fue purificado y enviado a secuenciación. La secuencia obtenida mostró un tamaño de 1261 pb (Fig. 3) y se registró en GenBank con número de acceso JQ762448. Esta secuencia se sometió a un análisis BLAST el cual mostró que el fragmento amplificado tiene una identidad del 100% con el Factor de Elongación 1-α de L. mexicana (Fig. 4). Figura 1. p29 es el EF-1α de Leishmania mexicana. A) Reactividad del suero de un paciente con LC empleando como antígeno ECLm. B) p27 y p29 evidenciados con un antiEF-1α comercial (Sigma) empleando como antígeno ECLm, confirmando con estos datos que p29 es el EF-1α de L. mexicana. 1691 © 2013 Academia Mexicana de Investigación y Docencia en Ingeniería Química (AMIDIQ) ISBN: 978-607-95593-1-1 Memorias del XXXIV Encuentro Nacional y III Congreso Internacional de la AMIDIQ 7 al 10 de mayo de 2013, Mazatlán, Sinaloa, México Figura 2. Amplificación del Gen EF-1α de L. mexicana. Línea 1) Marcador de peso molecular 1 Kb; 2-6) productos de PCR donde se evidencia un amplicón de aproximadamente 1300 pb; 7) DNA irrelevante de Salmonella Typhimurium; 8) Control negativo con H2O. TGTCGACGCCGGCAAGTCCACCGCCACTGGCCACTTGATCTACAAGTGCGGTGGCATCGACAAGCGCACGATCGAGAAGTTCGAG AAGGAGGCCGCCGAGATCGGCAAGGCGTCCTTCAAGTACGCGTGGGTGCTCGACAAGCTGAAGGCGGAGCGCGAGCGCGGCATCA CGATCGACATTGCGCTGTGGAAGTTCGAGTCGCCGAAGTCCGTGTTCACGATCATCGATGCGCCCGGCCACCGCGACTTCATCAA GAACATGATCACGGGCACGTCGCAGGCGGACGCGGCCATCCTGATGATCGACTCGACGCATGGTGGCTTCGAGGCTGGCATCTCG AAGGACGGCCAGACCCGCGAGCACGCGCTGCTTGCCTTCACTCTTGGCGTGAAGCAGATGGTGGTGTGCTGCAACAAGATGGACG ACAAGACGGTGATGTACGCGCAGTCGCGCTACGATGAGATCAGCAAGGAGGTGAGCGCGTACCTGAAGCGCGTGGGCTACAACCC GGAGAAGGTGCGCTTCATCCCGATCTCGGGGTGGCAGGGCGACAACATGATCGACAAGTCGGACAACATGCCGTGGTACAAGGGT CCCACGCTGCTGGACGCGCTCGACATGCTGGAGCCGCCGGTGCGCCCGGTGGACAAGCCGCTGCGCCTGCCCCTGCAGGACGTGT ACAAGATCGGCGGTATCGGGACGGTGCCCGTGGGCCGCGTGGAGACCGGGATCATGAAGCCGGGCGACGTGGTGACGTTCGCGCC CGCCAACGTGACGACTGAGGTGAAGTCGATCGAGATGCACCACGAGCAGCTGGCGGAGGCGCAGCCCGGCGACAACGTCGGCTTC AACGTGAAGAACGTGTCGGTGAAGGACATCCGCCGTGGTAACGTGTGCGGCAACTCGAAGAACGACCCGCCGAAGGAGGCGGCCG ACTTCACGGCGCAGGTGATCGTGCTGAACCACCCCGGCCAGATCAGCAACGGCTACGCGCCGGTGCTGGACTGCCACACGAGCCA CATCGCGTGCCGCTTCGCGGAGATCGAGTCCAAGATCGACCGCCGCTCCGGCAAGGAGCTGGAGAAGAACCCCAAGGCGATCAAG TCTGGCGACGCCGCGATCGTGAAGATGGTGCCGCAGAAGCCGATGTGCGTGGAGGTGTTCAACGACTACGCGCCGCTGGGCCGCT TTGCCGTGCGCGACATGCGGCAGACGGTCGCCGTGGGCATCATCAAGGGCGTGAACAAGAAGGAGAGCAGC Figura 3. Secuencia de p29 de L. mexicana. Secuencia nucleotídica de 1261 pb obtenida del amplicón de p29 de L. mexicana. Figura 4. Alineamiento BLAST. El alineamiento in silico de p29 mostró una similaridad del 100% con el EF-1α de L. mexicana. 1692 © 2013 Academia Mexicana de Investigación y Docencia en Ingeniería Química (AMIDIQ) ISBN: 978-607-95593-1-1 Memorias del XXXIV Encuentro Nacional y III Congreso Internacional de la AMIDIQ 7 al 10 de mayo de 2013, Mazatlán, Sinaloa, México Conclusiones 1. Se confirmó la naturaleza inmunoquímica de p29 como el Factor de Elongación 1alfa de L. mexicana. 2. Se obtuvo la secuencia parcial del gen Factor de Elongación 1 alfa de L. mexicana. 3. La secuencia génica del Factor de Elongación 1 alfa de L. mexicana se registró en GenBank con el número de acceso JQ762448. Referencias 1. Das A, Ali N, “Vaccine development against Leishmania donovani” Frontier in Immunology, Vol. 3, No. 1, p. 1-19, 2012. 2. Lambertz U, Maxwell J, Nandan D, Robert W, Clos J, Foster L, Reiner N, “Secreted virulence factors and immune evasion in visceral leishmaniasis”, Journal of leukocyte biology Vol. 1, No. 91, p. 887-899, 2012. 3. López M, Cherkasov A, Nandan D, “Molecular architecture of Leishmania EF-1α reveals a novel site that may modulate protein translation: A possible target for drug development”, Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol.1, No. 356, p. 886-892, 2007. 4. Ochoa-Díaz Y, López-Moreno C, Rendón-Maldonado J, López-Moreno H, “Molecular diagnosis of Leishmania mexicana in a cutaneous leishmaniasis case in Sinaloa México”, Vector borne and zoonotic diseases, Vol. 12, No. 1, p. 78-80, 2011. 5. Salazar-Mejía P, Tejada-Aguirre C, López-Moreno H, “Reacción de antígenos de Leishmania (Leishmania) Mexicana con sueros de pacientes con leishmaniasis cutánea de Sinaloa, México”, Salud Pública de México, Vol. 52, No. 2, p. 165-169, 2010. 6. Vélez I, Robledo S, “Leishmaniasis”, Revista Leprologie Fontilles, Vol. 27, No. 4, p. 367-396, 2010. 7. www.saludsinaloa.gob.mx 1693 © 2013 Academia Mexicana de Investigación y Docencia en Ingeniería Química (AMIDIQ) ISBN: 978-607-95593-1-1