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Genética del desarrollo Genética I 2013 Flávio Silva Junqueira de Souza Regulación de la expresión génica ¿ tienen las distintas células de un organismo el mismo genoma ? sí ¿cómo se genera la diversidad de células que componen un organismo complejo? Biología del desarrollo - la genética del desarrollo estudia la función de los genes involucrados en la embriogénesis y crecimiento de los organismos (especialmente los multicelulares) gametas fertilización cigota desarrollo embrionario crecimiento adulto Biología del desarrollo cigotas adultos C. elegans (nemátodo) Pisaster sp. (equinodermo) zebrafish (pez teleosteo) ratón (mamífero) Biología del desarrollo - organismos-modelo pollo (ave) ratón (mamífero) D. melanogaster (mosca) Xenopus (rana) C. elegans (nemátodo) Arabidopsis (angiosperma) S. purpuratus (erizo-de-mar) zebrafish (pez teleosteo) Biología del desarrollo: principios básicos - la construcción del embrión depende de 4 procesos celulares básicos. En general estos procesos ocurren de manera simultanea durante la embriogénesis - proliferación: producción de muchas células a partir de la cigota - especialización: producción de una variedad de tipos celulares en diferentes regiones del embrión - interacciones entre células: coordinación de comportamiento de una célula en relación a las células vecinas - movimiento celular: rearreglo de células para formar tejidos y órganos Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: principios básicos cigota clivaje blástula gástrula gastrulación (formación de las capas germinales) gástrula avanzada organogénesis embrión avanzado feto crecimiento eclosión nacimiento desarrollo de Xenopus laevis (rana) Biología del desarrollo: principios básicos - el cuerpo de la mayoría de los animales está formado por tejidos derivados de las tres capas germinales (ectodermo, mesodermo y endodermo). Esa división en tres capas ocurre durante la gastrulación gastrulación en el erizo-de-mar Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: principios básicos - el cuerpo de la mayoría de los animales está formado por tejidos derivados de las tres capas germinales (ectodermo, mesodermo y endodermo). Esa división en tres capas ocurre durante la gastrulación gastrulación en el erizo-de-mar Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: principios básicos - el cuerpo de la mayoría de los animales está formado por tejidos derivados de las tres capas germinales (ectodermo, mesodermo y endodermo). Esa división en tres capas ocurre durante la gastrulación - durante la gastrulación se organizan los ejes antero-posterior, dorso-ventral y derecho-izquierdo del embrión capas germinativas y ejes corporales antes y después de la gastrulación de Xenopus Biología del desarrollo: principios básicos - cada grupo (filo) de animales tiene un plan corporal particular (simetría, segmentación, disposición de órganos, apéndices etc) - algunos aspectos del plan son comunes a grupos lejanos de animales, otros son muy divergentes planes corporales genéricos de un insecto y un vertebrado (los ejes dorsoventrales son invertidos) Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: principios básicos - adentro de un mismo filo, los planes corporales son parecidos estadio filotípico establecimiento del plan corporal en vertebrados Biología del desarrollo: control génico - el parecido de los planes corporales en los animales refleja, en parte, genes comunes o parecidos. ~ 50% de los genes de C. elegans, Drosophila y humanos tienen homólogos reconocibles en las otras especies - a partir de un ancestral comun, los organismos cambiaron de forma y función cambiando el repertorio de genes y la regulación génica - los genes controladores del desarrollo son, en general, los que codifican factores de transcripción, proteinas señalizadoras y de cascadas de señalización y proteinas de adhesión celular, además de microRNAs levadura número de factores transcripción basic helix-loop-helix 7 C. elegans 41 Drosophila 84 humano 131 Biología del desarrollo: control génico - el parecido de los planes corporales en los animales refleja, en parte, genes comunes o parecidos. ~ 50% de los genes de C. elegans, Drosophila y humanos tienen homólogos reconocibles en las otras especies - a partir de un ancestral comun, los organismos cambiaron de forma y función cambiando el repertorio de genes y la regulación génica - los genes controladores del desarrollo son, en general, los que codifican factores de transcripción, proteinas señalizadoras y de cascadas de señalización y proteinas de adhesión celular, además de microRNAs evolución por cambio en la regulación génica Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: control génico - a pesar de las diferencias anatómicas, los reguladores génicos del desarrollo muchas veces funcionan de manera semejante en especies lejanas equivalencia funcional (rescate) entre Engrailed de Drosophila y Engrailed-1 de ratón durante el desarrollo del cerebelo Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: control génico - a pesar de las diferencias anatómicas, los reguladores génicos del desarrollo muchas veces funcionan de manera semejante en especies lejanas ojo ectópico inducido por Pax6 de Drosophila en la pierna de Drosophila ojo ectópico inducido por Pax6 de calamar en la pierna de Drosophila ojo compuesto de Drosophila sobrexpresión de Pax6 de un molusco induce ojos en Drosophila como el Pax6 endógeno de la mosca Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - destino celular: el destino diferenciado final de una célula y sus descendientes de acuerdo a su posición en el embrión somitas análisis de destino celular de regiones del embrión de gallina con fluoróforos. Las células terminan siendo parte de los somitas (estructuras segmentadas que dan origen a los músculos) tiempo Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - determinación: el proceso por el cual una célula se "decide" por un destino celular. Una célula determinada no cambia de destino celular aun cuando es transplantada a outro lugar del embrión Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - determinación: el proceso por el cual una célula se "decide" por un destino celular. Una célula determinada no cambia de destino celular aun cuando es transplantada a outro lugar del embrión transplantación de tejido entre brotes de los miembros en el embrión de gallina. Al momento de la transplantación, el tejido de la futura pierna ya está parcialmente determinado (comprometido) a formar las patas y da origen a dedos con garras en las alas Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - determinación: el proceso por el cual una célula se "decide" por un destino celular. Una célula determinada no cambia de destino celular aun cuando es transplantada a outro lugar del embrión factores de transcripción (Tbx5, Tbx4, Pitx1) se expresan de manera diferencial en los brotes de alas y piernas y participan en la determinación del destino celular Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - inducción: el proceso por el cual un grupo de células envia una señal que produce un cambio o especificación de destino celular en un campo de células competentes. En general las señales inductoras son proteinas o otras moléculas extracelulares que son detectadas por proteinas receptoras específicas Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - 1924: Hilde Mangold & Hans Spemann descubren que el tejido alrrededor del punto de invaginación de la gástrula de anfíbios puede inducir un embrión duplicado en la parte ventral del embrión zona de invaginación de la gástrula - el tejido endomesodérmico de la zona de invaginación de la gástrula es conocido como organizador de Spemann (Nobel 1935) Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: conceptos y mecanismos - morfógenos: son moléculas inductoras que inducen varios destinos celulares de acuerdo a un gradiente de concentración expresión de Sonic hedgehog en la zona de polarización de las alas acción de Sonic hedgehog como morfógeno en la inducción de dedos en los miembros anteriores en gallina Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - Drosophila melanogaster: primer modelo de genética del desarrollo - desarrollo rápido (1 día de cigota a larva, 9 días hasta adultez), facil de mutagenizar Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - Drosophila melanogaster: primer modelo de genética del desarrollo - Edward Lewis, Christiane NüssleinVolhard y Eric Wieschaus ganaron el Nobel de 1995 por su trabajo con mutantes de desarrollo de Drosophila (décadas de 1970 y 1980) Biología del desarrollo: Drosophila - Drosophila melanogaster: al principio, los nucleos del embrión se dividen formando un sincício - los nucleos migran a la periferia y se celularizan formando el blastodermo (6000 células) Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - Drosophila melanogaster: destino celular del blastodermo en el embrión avanzado segmentos Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - Drosophila melanogaster: destino celular del blastodermo en la larva segmentos Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - análisis de mutantes de genes del sistema de polarización de huevo - mutantes afectan grandes porciones del cuerpo (abdomen, torax y cabeza, partes terminales) Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - durante la formación del oocito, las células del folículo (maternas) son las fuentes de señales de polarización del huevo - las células nodrizas (nurse cells) nutren al oocito Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - durante la formación del oocito, las células del folículo (maternas) son las fuentes de señales de polarización del huevo - las células foliculares transfieren al oocito los mRNAs de Nanos y Bicoid y activan los receptores Torso y Toll de una manera localizada - los receptores Torso y Toll se localizan en toda la membrana del oocito; la activación es que es localizada Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - establecimiento del eje antero-posterior depende del mRNA de bicoid y nanos mRNA bicoid mRNA nanos proteina Bicoid proteina Nanos - proteinas Bicoid y Nanos son traducidas de sus mRNAs localizados y forman un gradiente de concentración antero-posterior en el embrión sincicial Biología del desarrollo: Drosophila - Bicoid activa la transcripción de hunchback; también se une al mRNA de caudal y reprime su traducción - Nanos se une al mRNA de hunchback y reprime su traducción Biología del desarrollo: Drosophila - los genes de efecto materno (proteinas o mRNAs provistos por células foliculares) exhiben fenotipo cuando la madre es mutante madre wt madre bicoid -/- - p. ej. si la madre es mutante nula de bicoid, el embrión no forma los segmentos de la cabeza y el torax Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - establecimiento del eje dorso-ventral: mesodermo, sistema nervioso, epidermis... mapa del destino celular a lo largo del eje dorso-ventral Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - señalización Spätzle-Toll-Dorsal Spätzle (ligando) Toll (receptor) reclutamiento de Pelle Pelle (receptor) fosforilación de Cactus Cactus degradación de Cactus Dorsal disociación de Pelle entrada al nucleo activación transcripcional Biología del desarrollo: Drosophila - establecimiento del eje dorso-ventral: entrada de Dorsal al nucleo gradiente dorso-ventral de proteina Dorsal nuclear Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - establecimiento del eje dorso-ventral: Dorsal es un morfógeno - Dorsal actua como morfógeno dorsoventral, se activan twist, sog y dpp de acuerdo a la concentración - las proteinas Dpp y Sog terminan de determinar los tejidos del eje dorsoventral Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - establecimiento del eje dorso-ventral: Twist marca el mesodermo proteina Twist durante la gastrulación, las células que expresan Twist se mueven al interior del embrión - internalización de las células que expresan Twist (factor de transcripción bHLH), que dan origen al mesodermo de Drosophila Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - jerarquía de genes durante el desarrollo del eje del cuerpo de Drosophila - los genes de efecto materno (bicoid, nanos etc) llevan a la activación de genes gap, pair-rule (regla de los pares), de polaridad segmental y genes homeoticos hunchback, krüppel, knirps fushi tarazu, even skipped engrailed, wingless, hedgehog Biología del desarrollo: Drosophila - genes gap, pair-rule y segment polarity fueron descubiertos con mutantes - en cada mutante las partes verdes no se forman Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - los productos de los genes de polaridad del huevo son maternos y establecen los ejes anteroposterior y dorsoventral - genes gap se expresan en amplias bandas del embrión. Controlan genes pair-rule - genes pair-rule se expresan en 14 parasegmentos. Cada gen pair-rule se expresa en parasegmentos alternados - cada gen de polaridad segmental se expresa o en la mitad anterior o posterior de los 14 segmentos. Biología del desarrollo: Drosophila - genes pair-rule se expresan en parasegmentos alternados - cada parasegmento corresponde a una mitad posterior de un segmento junto con la mitad anterior del segmento siguiente Biología del desarrollo: Drosophila expresión de reportero (lacZ) controlado por el stripe 2 enhancer de eve gen y enhancers de even-skipped (eve) expresión de eve endógeno Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - al enhancer del stripe 2 de eve se unen cuatro factores de transcripción en una combinación específica - Bicoid y Hunchback son activadores transcripcionales - Giant y Krüppel son represores transcriptionales Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo - Bicoid y Hunchback son activadores transcripcionales - Giant y Krüppel son represores transcriptionales - la combinación de los cuatro factores (activadores y represores) en el enhancer determinan la precisa expresión de eve en el stripe 2 del embrión Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: Drosophila - dominios de genes de polaridad segmental son el resultado de señalización entre células de dominio diferentes - en la parte posterior del parasegmento, células que expresan Engrailed también expresan el factor secretado Hedgehog - Hedgehog activa las células en la parte anterior del segmento, que expresan el receptor Patched - señalización de Patched activa la expresión de Wingless, un factor secretado - Wingless activa el receptor Frizzled en células vecinas y refuerza la expresión de Engrailed Biología del desarrollo: genes homeoticos - mutaciones homeoticas transforman una parte del cuerpo en otra (cambia la identidad de segmentos) - en la mutación Antennapedia se forman patas en lugar de antenas en la cabeza. Biología del desarrollo: genes homeoticos - mutaciones homeoticas transforman una parte del cuerpo en otra (cambia la identidad de segmentos) - en la mutación Bithorax se forman alas en lugar de halterios en un segmento torácico (en tercer segmento se transforma en el segundo segmento torácico) Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc. Biología del desarrollo: genes homeoticos - las mutaciones son causadas por alteraciones en la expresión de genes homeoticos (genes Hox) - genes Hox están organizados en dos clusters de genes y codifican factores de transcripción con homeodominio (dominio de unión al DNA) Biología del desarrollo: genes homeoticos - los genes Hox se expresan a lo largo del cuerpo del embrión en el mismo orden en que están alineados en el cromosoma (colinearidad) Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc. Biología del desarrollo: genes homeoticos - los genes Hox se expresan a lo largo del cuerpo del embrión en el mismo orden en que están alineados en el cromosoma (colinearidad) hibridación in situ con sondas fluorescentes - los genes Hox determinan la identidad de los segmentos especificados antes por los genes de pair-rule y polaridad segmental - cuando más de un gen se expresa en un segmento, en gen más "posterior" en el locus en general domina y determina la identidad del segmento Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: genes homeoticos - mutación Bithorax inactiva el gen Ultrabithorax - cuando Ubx no está activo, Antennapedia determina el cambio homeotico del segmento torácico 3 al 2 Biología del desarrollo: genes homeoticos - clusters de genes Hox existen en todos los animales Swalla et al (2006) Heredity - el mecanismo de determinación de segmentos es muy primitivo (existe desde antes de la divergencia entre protostomados y deuterostomados) Biología del desarrollo: genes homeoticos - en vertebrados, los clusters de genes Hox están cuadruplicados (reflejo de la primitiva tetraploidización del ancestro de los vertebrados) - la expresión de los Hox en vertebrados va del cerebro posterior hasta la cola y determina la identidad de parte del tubo neural y del mesodermo Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: genes homeoticos - colinearidad de expresión de genes Hox también existe en vertebrados - HoxB2 está más "anterior" que HoxB4 y su patrón de expresión llega a un nivel más anterior en el embrión Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo: genes homeoticos - transformaciones homeoticas en el ratón wild-type wild-type HoxA10 ectópico deficiencia HoxA10, C10, D10 expresión ectópica de HoxA10 en niveles más anteriores. Las vértebras cervicales y torácicas se convierten en lumbares (sin costillas) eliminación de HoxA10, HoxC10 y HoxD10 causa la formación de vértebras torácicas en lugar de lumbares (con costillas) Biología del desarrollo: evo-devo - diferencias en el desarrollo determinan las diferencias anatómicas y fisiológicas de las especies pinzones de Darwin - Galápagos - evo-devo (evolution & development) es la rama de la biología que intenta entender los cambios en el desarrollo que contribuyen a la evolución de las espécies Biología del desarrollo: evo-devo Science (2004) 3 Sept - correlación entre forma del pico ancha y expresión de Bmp4 (proteina señalizadora secretada) en el mesénquima expresión de Bmp4 Biología del desarrollo: evo-devo Science (2004) 3 Sept control - sobreexpresión de Bmp4 con un virus en el mesodermo del futuro pico de embriones de pollo causa un ensanchamiento del pico exceso Bmp4 - expresión de noggin (inhibidor de Bmp4) causa subdesarrollo del pico inhibición Bmp4 Biología del desarrollo: plantas - Arabidopsis thaliana Arabidopsis posee muchos genes para factores de transcripción en relación a ciertos animales Biología del desarrollo: plantas Biología del desarrollo: plantas crecimiento a partir de meristemas (apical, radicular) Biología del desarrollo - Arabidopsis thaliana: mutantes de anatomia floral Apetala2: sépalos se convierten en carpelos y pétalos en estambres Apetala3: pétalos se convierten en sépalos y estambres en carpelos Biología del desarrollo - Arabidopsis thaliana: mutantes de anatomia floral Agamous: estambres se convierten en pétalos y carpelos en meristema floral Apetala2/Apetala3/Agamous (triple mutante): todos se convierten a hojas Molecular Biology of the Cell 5/e - Garland Science 2008 Biología del desarrollo - Arabidopsis thaliana: transformaciones homeóticas de la anatomia floral - la combinación de genes (Apetala2, Apetala3, Agamous) expresado en cada región (whorl) del meristema determina la identidad del compartimiento Biología del desarrollo - Arabidopsis thaliana: transformaciones homeóticas de la anatomia floral - el modelo de determinación de compartimentos florales es denominado ABC - los genes involucrados son factores de transcripción MADS-box (100 miembros en Arabidopsis) http://www.adonline.id.au/flowers/floral-identity/