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Revista Mexicana de Ciencias Farmacéuticas
ISSN: 1870-0195
rmcf@afmac.org.mx
Asociación Farmacéutica Mexicana, A.C.
México
Campos Aldrete, María Elena
¿Qué sabe Ud. acerca de ... métodos moleculares de diseño de fármacos?
Revista Mexicana de Ciencias Farmacéuticas, vol. 40, núm. 2, abril-junio, 2009, pp. 41-42
Asociación Farmacéutica Mexicana, A.C.
Distrito Federal, México
Disponible en: http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=57912942006
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¿Qué sabe Ud. acerca de …
métodos moleculares de diseño de fármacos?
What do you know about … molecular methods of drug design?
Dra. María Elena Campos Aldrete
Departamento de Química Orgánica
Escuela Nacional de Ciencias Biológicas
Preguntas
1. ¿En qué categorías se pueden clasificar los métodos de diseño de fármacos basados en la relación estructura-actividad?
2. ¿En qué aspecto teórico se fundamenta el acoplamiento molecular “Docking”?
3. ¿Qué tipos de ligandos existen?
4. ¿Puede realizarse el modelado molecular sin la estructura tridimensional de la enzima?
5. ¿A qué se refieren las siglas CAMD?
Respuestas
1. Los métodos que relacionan la estructura química con la actividad biológica pueden dividirse en dos grandes categorías: métodos topológicos/estadísticos y métodos de modelado molecular.
En la aproximación topológica sólo se tiene en cuenta la estructura química “plana” de la molécula y se utilizan técnicas estadísticas o de reconocimiento de patrones para encontrar las QSAR.
En los métodos de modelado, se consideran las propiedades de las moléculas en tres dimensiones y son importantes, entre
otros, el análisis conformacional, la mecánica cuántica, los campos de fuerzas, la termodinámica estadística, y los gráficos
moleculares interactivos. Permiten la representación y manipulación de las moléculas en tres dimensiones, lo que proporciona una información espacial que es esencial para comparar moléculas y para estudiar la interacción entre ligandos y receptores macromoleculares.
2. Considerando que para una enzima dada y un inhibidor, el objetivo del docking es predecir la estructura del complejo resultante de tal acoplamiento bajo condiciones de equilibrio, donde la constante termodinámica del proceso establece la factibilidad de la interacción ligando-receptor.
3. Ligandos rígidos, ligando flexibles y semiflexibles.
4. Si, puede realizarse la investigación de inhibidores de la enzima convertidora de angiotensina surgió a partir de una sustancia natural obtenida de una víbora venenosa del Brasil. Al momento de iniciarse los estudios, en la década de los setenta, no
se conocía la estructura tridimensional de esta enzima. Sin embargo, sí se conocía la estructura de una enzima parecida, la
carboxipeptidasa A de bovino. Utilizando a esta estructura como modelo y siguiendo una metodología que actualmente se
denomina “diseño de análogo activo”, investigadores de la compañía Squibb desarrollaron el captopril, aprobado en Estados
Unidos para su uso clínico en 1981. Aunque el captopril no se desarrolló utilizando cálculos computacionales se puede considerar como el primer ejemplo de un fármaco diseñado basado en la estructura del receptor.
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Volumen 40 • Número 2 • Abril - Junio 2009
5. Las siglas CAMD (Computer-Aided MolecularDesign) engloban a un número considerable de procedimientos, apoyados por
sistemas analógicos, encaminados a relacionar actividad con estructura molecular. Como su propio nombre indica, su fin último es utilizar estas relaciones para predecir compuestos con un determinado perfil de actividad.
Referencias
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