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Clase 3 Diversidad genética Origen Biodiversidad ¨Genética¨ Dinámica Origen de la Diversidad Genética biosfera ecosistema comunidad especie población individual MUTACIÓN Procesos genéticos que generan diversidad 1. Diferencias en el mismo gen o en genes relacionados 2. Diversidad genotípica por el reordenamiento de genes preexistentes 3. Diversidad fenotípica por la regulación de la expresión génica Mutación La primera definición se debe a H. De Vries quien decía que cambios heredables repentinos son responsables de las variaciones heredadas Hoy sabemos que son cambios en el material hereditario que no se deben a recombinación No tienen causa conocida, se trata de errores de copia durante la replicación Propiedades de las mutaciones 1. Eventos raros con frecuencias de 1 cada 105 – 108 generaciones 2. Ocurren al azar es decir sin importar el efecto que causan sobre la capacidad adaptativa 3. Recurrentes 4. Reversibles Cambio de las frecuencias génicas por mutación A a pt = (1-)t po (p es la frecuencia de A) Lleva 70000 generaciones pasar de p = 1 a p= 0,5, considerando incluso valores de tasas de mutación relativamente altos Esto nos dice que hay otros procesos implicados en la generación/dinámica de la diversidad La amplia gama de mutaciones y sus efectos pueden ocurrir en secuencias regulatorias y en genes estructurales Las mutaciones en secuencias regulatorias se distinguen porque alteran la expresión génica sin cambiar la secuencia de la proteína DNA Content of Haploid Genomes of a Range of Phyla Flowering plants Birds Mammals Reptiles Amphibians Bony fish Cartilaginous fish Echinoderms Crustaceans Insects Molluscs Worms Fungi Algae Bacteria Mycoplasmas Viruses (Plasmids) 103 104 105 106 10 7 108 109 1010 1011 DNA content (base pairs) La paradoja del valor C • No existe una correlación perfecta entre la cantidad de ADN y la complejidad morfológica • La cantidad de ADN de copia única es pequeña • Muchas secuencias repetitivas ¿Cuántos genes hay en un genoma? • Tamaño del genoma 3 x 109 • Si cada gen tiene 5000 bp 6 x 105 genes (600.000) ¡Pero en el hombre todas las evidencias apuntan a una menor cantidad de genes! Según las ultimas evidencias recopiladas por el International Human Genome Sequencing Consortium entre 20000 y 25000 Evolución de la complejidad organísmica y número de genes Número de tipos celulares 1 2 3 4 7 11 30 50 120 120 Especies Mycoplasma genitalum Ricketsia prozawecki Haemophilus influenzae Escherichia coli Campylobacter jejuni Aquifex aeolicus (termofila) Neisseria meningitidis Archaoglobus fulgidus (Archaea) Methanococcus janaschii (Archaea) Sinechocystis sp (Cianobacteria) Bacillus subtilis Caulobacter crescentus Sacharomyces cerevisiae Volvos Ulva Hongos Esponjas y Cnidarios Arabidopsis thaliana Caenorhabditis elegans Drosophila melanogaster Pez Cebra Humano Número de genes 470 834 1709 4288 1654 1512 2121 2436 1738 3168 4100 6241 24000 18500 14000 >80000 20500 ¿Existe relación entre complejidad organísmica y complejidad genómica? • ...”Las tendencias evolutivas en la complejidad están relacionadas con la complejidad genómica, pero no con un aumento del número de genes, sino con la expansión en el número de elementos regulatorios que controla la expresión de los genes”... (Carroll, 2001) Diferencias entre genomas de Homo sapiens y Pan troglodytes 4% Diferencias entre genomas de individuos pertenecientes a la especie Homo sapiens 0.1 % El origen de diversidad genotípica Reordenamientos cromosómicos • Cambios en el número cromosómico • Cambios en el número cromosómico debidos a modificaciones estructurales (fusiones/fisiones) • Cambios estructurales que no alteran el número cromosómico (duplicaciones/deleciones/ inversiones/translocaciones) Drosophila subobscura: Un experimento natural Variación clinal de las inversiones El programa genómico de Islandia permitió detectar una inversión paracéntrica polimórfica que afecta el fitness de las mujeres portadoras, en promedio tienen mas descendientes Una inversión polimórfica en humanos con efectos sobre el fitness Stefansson et al Nat Genet 2005 EL número de diferencias fijadas entre H1 y H2 es enorme y la antigüedad estimada es de 3Ma. Esta inversión predata en origen de H. sapiens e incluso del genero Homo El origen de diversidad genotípica por Recombinación Procesos involucrados en la recombinación 1. Segregación de genes alélicos 2. Recombinación intracromosómica o entrecruzamiento durante la gametogenésis 3. Redistribución estocástica de los genes segregados en los gametos durante la fecundación Número de genotipos posibles GN = [(r (r + 1))/2]N N: número de loci independientes r: # de alelos por locus Por ejemplo tres loci independientes con 4 alelos c/u podrían combinarse en 1000 genotipos diferentes Variabilidad disponible por recombinación Si aceptamos que • en Drosophila el # de genes es 15000 • Todos los loci polimórficos tienen 2 alelos (r) • la heterocigosis promedio es 10% (ciertamente muy restrictivo) [N 1500] GN = [(r (r + 1))/2]N G = 3 1500 ??????? Un número mayor que el de todas las partículas elementales del universo PARA PENSAR ¿NO? Efectos de la recombinación “La recombinación de los genes tiene, desde el punto de vista de su importancia evolutiva, dos efectos antagónicos. Por un lado disminuye el valor adaptativo inmediato, pero a nivel poblacional provee plasticidad adaptativa” (Dobzhansky 1955) El sistema recombinacional (H.L. Carson) Sistemas de control de la variabilidad: 1) El papel del número cromosómico 2) El papel del crossing over 3) El papel del sistema de apareamiento 4) El papel del tiempo generacional GN = [(r (r + 1))/2]N El origen de diversidad fenotípica por expresión génica diferencial Expresión génica (EG) es la transcripción y la traducción de la información genética EG diferencial: los mismos genes se activan o reprimen en algunos tejidos y no en otros, en algún momento y no otro Control de la expresión génica en eucariotas • • • • • • • Estructura de la cromatina Transcripcional Procesamiento del ARN Transporte del ARN Estabilidad del ARN Iniciación de la traducción Modificación post-transcripcional Existe muchísima variación, son muchos los mecanismos responsables del origen de la variación a diferentes niveles. • ¿Cuánta variabilidad hay en poblaciones naturales? • ¿Cuánta variabilidad genética hay en poblaciones naturales? • ¿Diferentes poblaciones naturales de una dada especie presentan la misma variabilidad genética? • De corroborarse que distintas poblaciones exhiben diferencias de variabilidad genética: ¿dicha variabilidad afecta a los mismos o a distintos genes? Isogenización de cromosomas Curly (Cy) +i x Sternopleural (Sp) n +z x 1 x