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EN INGLÉS VIROLOGÍA – CAPÍTULO UNO VIROLOGÍA BÁSICA: DEFINICIONES, CLASIFICACIÓN, MORFOLOGÍA Y QUÍMICA Traducido por : Sarah M. Castillo - Jorge, Clinica Corominas Santiago, Rep. Dominicana VIDEOCONFER ENCIA EN INGLÉS BUSCAR Lectura: Murray et al., Microbiología, 3ra Ed., Capitulo 6 GLOSARIO Los virus se componen de ácido nucleico (ADN o ARN) asociado a proteínas codificadas por dicho ácido nucleico. Los virus pueden también constar con una bicapa lipídica membranosa (o envoltura), OBJETIVOS pero esta es adquirida de las células huésped, usualmente por Una introducción a yemación a través de la membrana de dichas células. Si el virus posee membrana, también debe de tener una o más proteínas víricas que los virus, su actúen como ligando para los receptores en la membrana de la célula naturaleza, huésped. Muchos virus codifican proteínas estructurales (aquellas que estructura y forman una partícula vírica madura (o virión)) y quizás una enzima clasificación que participa en la replicación del genoma viral. Otros virus pueden codificar muchas más proteínas, de las cuales la mayoría no está presente en la partícula madura pero sí participan de alguna manera en la replicación viral. El herpes virus es uno de los más complejos y tiene 90 genes. Dado que muchos virus producen pocas o ninguna enzima, son dependientes de las enzimas del huésped para la replicación. De esta manera la composición vírica y la replicación son I fundamentalmente diferentes de aquellas en organismos celulares. La magen 1 dependencia de los virus en las células huésped en varios aspectos de Tamaño relativo su ciclo evolutivo ha complicado el desarrollo de medicamentos, de virus y puesto que la mayoría de los mismos inhibe el crecimiento celular y bacterias Adaptado la multiplicación viral (ya que se utilizan las mismas enzimas en de Koneman et al. Color Atlas and Textbook of ambos). Microbiology 5ta Ed. 1997 Virus imagen © Dr Linda Stannard, Universidad de Cape Town. Usado con autorización. Una de las principales razones para estudiar el metabolismo viral es para el desarrollo y descubrimiento de fármacos que selectivamente inhiban la replicación vírica, y es por esto que necesitamos saber cuándo los virus utilizan sus propias proteínas para su ciclo replicativo – podemos tratar de desarrollar drogas que inhiban Imagen 2. Tamaño específicamente proteínas virales (especialmente enzimas virales). En de los virus de contraste con los virus, las bacterias (imagen 1) llevan a cabo sus DNA y de RNA propios procesos metabólicos. Aún cuando están catalizando reacciones similares, las enzimas bacterianas difieren de sus Tamaño de virus de DNA Imagen © 1995 Dr Linda Stannard, Universidad de Cape Town y © 1994 División de Ciencias Veterinarias, Universidad de Queens, en Belfast homólogas eucarióticas y por ello pueden ser atacadas por antibióticos específicos. Al igual que los virus, algunas bacterias (como micoplasma, rickettsia y clamidia) pueden invadir al citoplasma de células eucarióticas y volverse parasíticas. Estas pequeñas bacterias sin embargo, proveen todas las enzimas necesarias para la replicación. Así, los mecanismos de control bacteriano, incluyendo bacterias con modos de vida de tipo parásitos, son más fácilmente desarrollados que los de los virus. Medidas de control para los virus incluyen: Divisi Presen Cultivo Presen ón cia Presenc Sensibili en cia de por conjunt ia de dad a los medio acido fisión a de riboso antibiótic artifici murámi binari ADN y mas os al co ARN Bacteria Si Si Si Si Si Si Mycoplas ma Si Si Si Si No Si No Si Si Si Si Si Chlamydi a No Si Si Si No Si Viruses No No No No No No Rickettsia * * La familia arenavirus (una familia de virus ARN) aparenta empacar ribosomas “accidentalmente”. Los ribosomas empacados parecen no tener ningún rol en la síntesis de proteínas virales. Tamaño de los virus RNA positivos Imagen © 1995 Dr Linda Stannard, University of Cape Town and © 1994 Veterinary Sciences Division, Queen's University Belfast Los virus infectan a la mayoría de los organismos: vertebrados, invertebrados, plantas, hongos, bacterias; pero algunos virus afectan a más organismos que otros, teniendo así un rango de infectividad más amplio; sin embargo, ninguno puede romper la barrera eucariota/procariota. Factores que afectan el rango de infectividad: i) Si pueden o no invadir la célula huésped ii) Si el virus puede invadir la célula, ¿es la maquinaria celular apropiada para la replicación viral? iii) Si el virus puede replicarse, ¿pueden las partículas víricas infecciosas salir de la célula y expandir la infección? Tamaño de los virus de RNA negativos Imagen © 1995 Dr Linda Stannard, University of Cape Town and © 1994 Veterinary Sciences Division, Queen's University Belfast WEB RESOURCES Principles of virus architecture Linda Stannard ESTRUCTURA VIRAL Los virus varían en tamaño en un rango desde menos de 100 nanómetros en diámetro a varios cientos de nanómetros en longitud en el caso de los filoviridae (Imagen 1 y 2). Todos los virus contienen un genoma de ácido nucleico (ARN o ADN) y una capa proteínica protectora (llamada cápside). Al conjunto del genoma y cápside se le llama nucleocápside y la misma puede tener forma icosaédrica, helicoide o compleja. Los virus pueden o no tener envoltura. Los virus envueltos obtienen sus envolturas por yemación a través de las membranas de las células huésped. En algunos casos, los virus atraviesan la membrana plasmática pero en otros casos, la envoltura puede provenir de otras membranas como del aparato de Golgi o el núcleo. Algunos virus, yeman a través de porciones especializadas de la membrana plasmática de la célula huésped; por ejemplo, el virus Ébola se asocia a partes lipídicas ricas en esfingomielina, colesterol y glicoproteínas. Los Poxvirus son excepcionales porque se envuelven en las membranas celulares del huésped utilizando mecanismos diferentes a los procesos de yemación usuales que usan otros virus. Los virus envueltos no necesariamente tienen que eliminar a la célula huésped para salir de ellas, puesto que pueden yemar y salir fuera de ellas – Platonic Solids y este proceso no es necesariamente letal – por tanto, algunos virus pueden University of Utah provocar infecciones persistentes. Triangulation Numbers J-Y Sgro Los virus envueltos son completamente infecciosos sólo si su envoltura está intacta (puesto que las proteínas de adhesión viral que reconocen receptores en las células huésped se encuentran en la envoltura). Por tanto, los agentes que destruyen la envoltura como los alcoholes y detergentes, disminuyen su virulencia e infectividad. ESTRUCTURAS DE LAS NUCLEOCÁPSIDES DE LOS VIRIONES A. Morfología icosaédrica Un icosaedro es un sólido platónico con 20 caras (imagen 3A) y una rotación simétrica de 5:3:2 (imagen 3B). Hay seis ejes de 5 dobleces de simetría a través de los cuales el icosaedro puede ser rotado pasando por sus vértices, diez ejes de 3 dobleces de simetría atravesando cada cara y quince ejes de 2 dobleces atravesando por los bordes (imagen 3B). Hay 12 ángulos o vértices y una simetría de 5 dobleces alrededor de los vértices (imagen 3C). La cápside esta hecha de repeticiones de subunidades de la proteína viral (Puede haber uno o varios tipos de subunidad(es) dependiendo del virus). Todas las caras de un icosaedro son idénticas El ácido nucleico está empacado dentro de la cápside, la cual lo protege del ambiente que le rodea (imagen 3D). Las proteínas se asocian en unidades estructurales (esto es lo que se ve en una microscopía de electrones o cuando se empieza a disociar la cápside), las unidades estructurales se conocen como capsómeros – un capsómero puede contener uno o varios tipos de cadenas de polipéptidos. Los capsómeros en las 12 esquinas del icosaedro tienen una simetría de 5 dobleces e interactúan con 5 capsómeros vecinos, por lo tanto, a esta interacción se le llama pentones o pentámeros (imagen 3E). Los virus más grandes contienen más capsómeros; cualquier capsómero extra se ubica en un arreglo regular en las caras de los icosaedros. Tienen seis partículas vecinas, y en conjunto se llaman hexones o hexámeros (figura 3F). El tamaño del icosaedro depende del número y tamaño de los capsómeros; siempre habrá 12 pentones (en cada vértice) pero el número de hexones aumenta con el tamaño (figura 3H). Un buen ejemplo de un virus icosaédrico es el adenovirus humano, el cual contiene los usuales 12 pentones más doscientos cuarenta hexones (figura 3G e I). La formación simétrica en los arreglos hexagonales en las caras del icosaedro puede darse en varias situaciones, por ejemplo, en el empacado de tubos de ensayo en un contenedor (figura 3J). También puede verse en el empacado de las subunidades del virus herpes, un virus icosaédrico cubierto. En la figura 3K, la membrana externa del virus herpes simplex ha sido removida para descubrir la nucleocápside. Aún cuando los icosaedros son de caras planas (como en la figura 3A), los virus icosaédricos generalmente son redondeados como se ve en la figura 3K. Un buen ejemplo de un virus icosaédrico pequeño es un balón de fútbol (figura 3L). Un icosaedro mayor es una cúpula geodésica (figura 3M). A Icosaedro: 20 caras triangulares B 5:3:2 de simetría rotacional C Cinco dobleces en los vértices Imagen 3 D El acido nucleico se empaca dentro de la cápside Imagen © Dr J.Y. Sgro – Usado con autorizacion E capsómeros en los 12 vértices tienen una simetría de 5 dobleces e interactúan con 5 capsómeros vecinos, y son, por lo tanto, llamados pentones (o pentámeros) F-i Los virus más grandes tienen más capsómeros, los capsómeros extras se organizan en un orden regular en las caras de los icosaedros, generalmente tienen 6 vecinos y, al conjunto, se les llama hexones F-ii La nucleocápside del Herpes, se muestra pentones en los vértices del icosaedro. Zhou et al. Baylor College of Medicine Reference: Z. H. Zhou, B.V.V Prasad, J. Jakana, F.R. Rixon, W. Chiu Baylor College of Medicine, Journal of Molecular Biology H Componentes de la cápside de un icosaedro J Empacado de objetos uniformes circulares con una morfología hexagonal K Organización de un Adenovirus I Adenovirus humano en tinción negativa © 1995 Dr Linda Stannard, University of Cape Town. Usado con autorizacion K Reconstrucción tridimensional de micrográficas crío - electrónicas de la cápside del virus herpes simplex. Imagen rotatoria. Instituto Nacional de la Salud L La forma icosaédrica de un balón de fútbol. Note que la pelota consiste de pentones (negros) y hexones (blanco) M Cúpula geodésica B. Simetría o Morfología helicoide Imagen 4 Las subunidades proteicas pueden interactuar entre sí y con el ácido nucleico para formar una estructura como hebras espirales. Los virus helicoides que mejor han sido estudiados son los virus no-envueltos del mosaico de las plantas de tabaco (Imagen 4 A-E). La naturaleza de hélice de este virus se puede apreciar claramente con una tinción negativa en una micrografía electrónica puesto que el virus forma una estructura rígida baciliforme. En virus helicoides envueltos (i.e. virus de la influenza, virus de la rabia), la cápside es más flexible (y más elongada) y aparece en las tinciones negativas como un cordón de teléfono. A La estructura del virus del mosaico de tabaco denota una estructura helicoide B Vista cercana de un único bastón del Virus del Mosaico del Tabaco. Imagen tomada de la base de datos del Comité Internacional de Taxonomía Viral. C Vista cercana de los bastones de virus del mosaico del tabaco © 1994 Estación Experimental de Rothamsted D Virus del Mosaico del Tabaco (TEM x207, 480) © Dennis Kunkel Microscopy, Inc. Usado con autorizacion E Virus del Mosaico del Tabaco (TEM x376, 200) © Dennis Kunkel Microscopy, Inc. Utilizado con autorizacion F Virus de la rabia Wadsworth Center, NY Dept o. de Salud G Virus de la Influenza © 1995 Dr Linda Stannard, Universidad de Cape Town. Usado con autorización C. Morfología compleja Estas son estructuras regulares, pero la naturaleza de la morfología no está aún completamente entendida. Ejemplo de virus con esta morfología: los poxvirus (Imagen 5). A Morfología compleja vista en los poxvirus Fenner and White Medical Virology 4 t2 Ed. 1994 Imagen 5 B Poxvirus visto con tinción negativa © Stewart McNulty, 1994 Division de Ciencias Veterinarias, Queen's University Belfast C Virus Molluscum contagiosum - un Molluscipoxvirus © 1995 Dr Linda Stannard, Universidad de Cape Town. Usado con permiso LAS CINCO FORMAS ESTRUCTURAS BÁSICAS DE LOS VIRUS EN LA NATURALEZA I magen 6 Cinco tipos básicos de la morfología viral Icosaédrico desnudo (no envuelto) i.e. poliovirus, adenovirus, virus hepatitis A helicoide desnudo (no envuelto) i.e. virus del mosaico del tabaco, hasta ahora no se conoce ningún virus humano con estas características icosaédrico envuelto i.e. herpes virus, virus de la malaria, virus de la rubella helicoide envuelto i.e. rabdivirus, virus influenza, virus parainfluenza, virus de la parotiditis, virus del sarampión Complejo i.e. poxvirus (Imagen 6) AGENTES NO CONVENCIONALES Están los llamados ‘agente no convencionales’ o ‘virus no convencionales’ o ‘virus atípicos’ – los tipos principales que han sido estudiados son los viroides y los priones. VIROIDES Los viroides contiene únicamente ARN. Son pequeños (menos de 400 nucleótidos), de cadena sencilla, y ARNs circular. Los ARNs no son empacados, no aparentan codificar ninguna proteína, y hasta ahora solo han mostrado asociación con enfermedades en las plantas. Sin embargo, algunos autores sugieren que agentes similares posiblemente están asociados a enfermedades humanas. Hasta ahora, el único agente causante de patologías humanas que puede asemejarse a los viroides es el agente de la hepatitis delta. En muchas formas, el agente o virus de la hepatitis delta aparenta ser un intermedio entre los ‘virus clásicos’ y los viroides. Este agente tiene un genoma de ARN pequeño, aunque un poco más grande que los otros viroides pero en su estructura y secuencia de ácidos nucleicos es similar a los viroides. Se diferencia de los viroides, en que codifica algunas proteínas. Y difiere de los virus verdaderos en que no codifica su propia proteína de adhesión. Contrario a los viroides, está empacado – actúa como un parásito en el virus de la hepatitis B, y usa la envoltura del mismo con las proteínas de adhesión que tiene. PRIONES Los priones únicamente contienen proteínas (aunque este es un concepto aún controversial). Son pequeñas partículas proteináceas y existe controversia con respecto a si poseen ácido nucleico; pero, si en realidad hubiere ácido nucleico, muy poca si no ninguna parte del mismo codificara para proteínas. Ejemplos de patologías humanas causadas por priones: Kuru, Creutzfeld – Jacob y Gertsmann – Straussler. Los priones también causan el scrapie de las ovejas. ¿LOS VIRUS ESTÁN VIVOS O MUERTOS? Esto depende de la definición de vida. Para prevenir cualquier posible argumento, usualmente se refiere a si se han perdido o no algunos aspectos de las actividades biológicas más que referirse a virus vivos o muertos como tal. (Por tanto, se habla del número de partículas infecciosas, o número de partículas formadoras de placas en vez de número de partículas vivas. CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS El sistema internacional acordado para la clasificación de los virus está basado en la estructura/composición de la partícula viral (virión) (Imagen 7), en algunos casos, el modo de replicación es también importante en la clasificación. Los virus se clasifican en varias familias según estas bases. CLASIFICACIÓN INTERNACIONAL Imagen 7 Características primarias usadas en la clasificación Los virus se clasifican de acuerdo a la naturaleza de su genoma y su estructura Familias de los virus de DNA. Todas las familias mostradas son icosaédricas a excepción de los poxvirus CLASIFICACION VIRAL ARN o ADN Cadena sencilla o cadena doble Segmentados o nosegmentados Ácido nucleico Familias de los virus de RNA Modificado de Volk et al., Essentials of Medical Microbiology. 4ta Ed linear o circular Si el genoma es de ARN de cadena sencilla, ¿puede funcionar como RNAm? Si el genoma es diploide (se encuentra en retrovirus) Morfología (icosaédrica, helicoide, compleja) Estructura del virión Envoltura o no Número de capsómeros Características secundarias Estrategia de replicación Algunas veces, en un grupo de virus que aparenta ser un grupo único según los criterios antes mencionados, se encuentran subgrupos de virus que fundamentalmente se diferencian en su estrategia de replicación – en este caso el grupo se divide basado en los modos de replicación. ALGUNOS VIRUS DE INTERÉS POTENCIAL I = MORFOLOGÍA ICOSAÉDRICA, H = MORFOLOGÍA HELICOIDE, C = MORFOLOGÍA COMPLEJA VIRUS DE ADN Morfolo gía PARVOVIRID AE HEPADNAVIR IDAE PAPILLOM AVIRIDAE * POLYOMAVIRIDAE * I I I I Envolt ura - + - - Tama ño Polimer asa de virión Incluye virus adenoasociados, parvovirus humano B19. 20nm 42nm 4060nm 4060nm Comentarios y ejemplos + ADN se replica mediante un intermediario ARN. Incluye virus hepatitis B el cual puede aumentar el riesgo de hepatocarcino ma. - Algunos causan verrugas, algunos se asocian a elevación del riesgo de cáncer cervical - SV40, algunos causan Leucoencefal opatía multifocal progresiva (LMP) ADENOVIRID AE I - 80nm - Más de 40 serotipos humanos HERPESVIRI I + 190n - Es común la DAE POXVIRIDAE m C + 200n mx 350n m latencia. Incluye herpes simplex tipos 1 y 2, virus varicella zoster, virus Epstein Barr (mononucleos is infecciosa), citomegaloviru s + Virus vaccinia, viruela, viruela vacuna Citoplásmicos , muy complejos * Anteriormente se agrupaban todos juntos como PAPOVAVIRIDAE LAS FAMILIAS DE VIRUS EN LA LISTA PRECEDENTE ESTAN ENUMERADOS EN ORDEN CRECIENTE DE ACUERDO AL TAMAÑO DEL GENOMA VIRUS ARN – DE SENTIDO POSITIVO Morfolo gía PICORNAVIRI DAE CALICIVIRID AE TOGAVIRIDA E I I I Envolt ura - - + Tama ño 30nm 35nm 6070nm Polimer asa de virión Comentarios y ejemplos - Incluye enterovirus, rhinovirus, virus coxsackie, poliovirus, virus hepatitis A - Gastroenteritis, agente Norwalk es probablemente incluido aquí - Alphavirus genus: incluye virus de encefalitis equina del oeste (WEE), encefalitis equina del este(EEE), encefalitis equina venezolana, virus Chikungunya, virus Sindbis, virus del bosque de Semliki Rubrivirus genus: alberga solo el virus rubella FLAVIVIRIDA E I + 4055nm - Incluye los virus de fiebre amarilla, dengue, encefalitis japonesa, encefalitis de San Louis, etc. Hasta hace poco se clasificaban con los Togaviridae CORONAVIRI DAE RETROVIRID AE H I + + 75160n m 100n m - Se estima que es responsable del 10 – 30% de los resfriados comunes + Tienen transcriptasa inversa, algunos son oncogénicos en animales. Incluye al VIH. Genoma diploide VIRUS ARN – DE SENTIDO NEGATIVO Morfolo gía RHABDOVIRIDA E H PARAMYXOVIRI DAE H ORTHOMYXOVIR IDAE BUNYAVIRIDAE H H Envolt ura + + + + Tama ño 60 x 180n m 150300n m 80120n m 95nm Polimer asa del virión Comentari os y ejemplos + Estos incluyen el virus de la rabia, virus de la estomatitis vesicular, virus Mogola, virus Duvenhage + Incluyen virus de la enfermeda d de Newcastle, virus parainfluen za, virus de la parotiditis, virus del sarampión, virus sincitial respiratorio + Virus de Influenza tipo A y B tienen genoma segmentad o. Adoptan capuchone s o capas de ARNm + Más de 86 miembros, la mayoría tiene vectores artrópodos. Incluyen encefalitis de California, encefalitis de LaCrosse, fiebre hemorrágic a del CrimeanCongo, y virus de la fiebre del valle Rift. Los miembros del genus hantavirus (incluyen agentes de la fiebre hemorrágic a de Corea, síndrome pulmonar en EEUU) parece tener vectores roedores. Genoma segmentad o. ARENAVIRIDAE H + 50300n m + Incluyen coriomenin gitis linfocítica, virus de Lassa, Junin (fiebre hemorrágic a argentina), y de Machupo (fiebre hemorrágic a boliviana). Genoma segmentad o FILOVIRIDAE H + 80nm x 800900n m + Virus Marburg, Ébola, y Reston RNA VIRUS ARN – DE CADENA DOBLE Morfolog ía Envoltu ra Tamañ o Polimera sa de virión Comentario sy ejemplos Los reoviridae incluyen los géneros reovirus, rotavirus y orbivirus. REOVIRIDA E Las infecciones humanas con reovirus son aparentemen te asintomática s. I - 75nm + Algunos que afectan humanos son el virus de la fiebre de garrapata de Colorado (orbivirus) y los rotavirus humanos (que pueden causar gastroenteriti s) Todos estos virus tienen genoma segmentado