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BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR TALLER No 2: AND RECOMBINANTE 1. Escriba el organismo de origen y las secuencias de reconocimiento de las enzimas de restricción EcoRI, BamHI, HindIII, PstI, PvuI, BglIII, SmaI. 2. En la siguiente secuencia sencilla de ADN encuentre y señale todas las potenciales secuencias de reconocimiento de enzimas de restricción, en la forma de doble hélice de ADN. 5’ TAGAATTCGACGGATCCGGGGCATGCAGATCATTCGCGTTAAGGCCTT 3’ 3. Se pretende inserta un gen Z (humano) de 700 pb dentro de un plásmido PU19. Dicho plásmido tiene 6.5 Kb de tamaño, presenta un sitio de reconocimiento para la enzima BamHI en 1 pb; de la misma forma presenta un sitio de reconocimiento para la enzima BseRI a 500 pb del sitio 1 pb BamHI. El nuevo plásmido recombinante se obtuvo haciendo un corte con la enzima de restricción BamHI en el sitio 1 pb, en donde se inserta el gen Z. Con la información anterior: a) Dibuje el plásmido recombinante, especificando sus características y diga tu tamaño. b) Si se cortara el plásmido recombinante con una enzima X, que generara dos cortes, uno a 800pb del sitio 1 pb BamHI y otro a 1.5 kb del sitio de reconocimiento de BseRI. Cuantos fragmentos se generarían y de qué tamaño serían. Dibuje el plásmido. 4. Como se observaría la electroforesis de la digestión del este plásmido si se cortara con: a) b) c) d) e) BamHI Pvu I Bam HI + Pst I Hind III + Bam HI Con las cuatro enzimas. 1500 Bam HI Pvu I 420 Pst I 1250 710 Hind III 2030 Bam HI 5. usted corre una electroforesis, la cual se ve a continuación, para chequear el mapa de restricción del plásmido pVU1 que se encuentra a la derecha. Desafortunadamente usted olvido anotar el orden de ubicación de las muestras. Utilice el mapa de restricción para decidir que fue sembrado en cada pozo. 1 2 3 4 5 6 Hind III 5681 pb 4781 pb 3806 pb 3545 pb 3111 pb 1875 pb 1236 pb Pst I 1875 pb PVU1 5681 pb 900 pb 1670 pb 1236 pb Pst I 900 pb BamHI 1670 pb Pozo 1 2 3 4 5 6 Enzimas utilizadas en cada pozo 6. La enzima de restricción EcoRI corta el ADN en la secuencia GTTAAC, y HaeIII en la secuencia GGCC. Como media (o promedio) ¿con que frecuencia corta cada enzima a una molécula de ADN de doble cadena? Es decir, ¿Cuál sería la distancia media entre los sitios de restricción? 7. Un investigador ha purificado una molécula de ADN lineal y desea localizar a lo largo de ella sitios de corte de enzimas de restricción. Para realizar su experimento tomo el ADN problema y decide utilizar dos enzimas de restricción BamHI y PvuI. Toma el fragmento y tras la digestión con BamHI, obtiene cuatro fragmentos uno de 800 pb, otro de 1600 pb, otro de 1000 pb y uno de 400 pb. Tras la digestión de cada uno de ellos con PvuI observa que el fragmento 3 produce dos subfragmentos 600 pb (31) y 400 pb (32) y el fragmento 2, tres 800 (21), 200 (22) y 600 (23). Se percata que ha cometido un error y por consiguiente decide realizar el experimento de nuevo pero ahora invierte el orden de las enzimas de restricción. Tras la digestión de la molécula de DNA completa primero con PvuI, obtiene cuatro fragmentos: A, B, C y D. Cuando éstos se tratan con BamHI, el trozo D produce los fragmentos 1 y 31, el trozo A produce 32 y 21, y el trozo B produce23 y 4. El trozo C es idéntico a 22. Dibuje un mapa de restricción corregido de este ADN indicando el tamaño de cada fragmento, el orden correcto del fragmento y el error que cometió el investigador.