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Desarrollo de nuevas variedades como elemento dinamizador de la Horticultura Prof. Dr. Manuel Jamilena JORNADAS INNOWA La Universidad de Almería Una Universidad que mira al mar y a la Horticultura intensiva bajo plástico UAL - Anecoop - Bital - CeiA3 Sumario 1. La semilla, lo primero 2. El negocio de la semilla de hortícolas 3. Mejora genética como motor dinamizador del sector hortícola • • • • El poder de las plantas transgénicas Mejora de las resistencias a plagas y enfermedades Variedades con mayor calidad de fruta Variedades para la Horticultura sostenible y AE 4. Importancia de las OMICAS: genómica, transcriptóma, proteómica, metabolómica, fenómica… Concentración de la producción en AL Almería concentra 27.000 ha de invernadero para producción hortícola Es el área más importante de producción de hortalizas fuera de temporada en la EU Producción de hortalizas Almería (Ton) 800.000 756.000 Producción total (2013): 3. 051.027 tons Valor (2013): 1.594,4 million Euros 700.000 600.000 529.500 500.000 400.000 315.000 300.000 297.160 212.430 200.000 182.700 106.792 100.000 43.000 V. Ju di a tro s O M eló n ba cín Ca la pi no Pe Sa nd ía to Pi m ien To m at e 0 Producción hortícola Almería/ España 2.500.000 2.000.000 1.500.000 1.000.000 500.000 0 Spain Almería Tecnologías asociadas al modelo AL 1. Manejo eficiente de la fertilización y riego 2. Nuevas estructuras de invernadero 3. Manejo integrado de enfermedades y plagas 4. Utilización de polinizadores 5. Lucha biológica contra plagas y enfermedades 6. Injertos en vegetales 7. Desarrollo de nuevos productos: IV y V gama 8. Desarrollo de nuevas variedades hortícolas La semilla, lo primero 1. La semilla, la variedad, es el factor más importante para mantener y mejorar la producción hortofrutícola 2. El uso de semillas de alta calidad, mejoradas genéticamente, es una manera de generar y vehiculizar innovación y valor añadido a la cadena alimentaria. 3. Las semillas son un sector estratégico para controlar el mercado de alimentos en el mundo. Las empresas multinacionales más grandes se comen a las pequeñas. ¿Cómo podemos desarrollar estas nuevas variedades? Mejora genética vegetal El objetivo principal de la mejora genética es aumentar la producción, la calidad y la diversidad de las especies cultivadas mediante el desarrollo de nuevas variedades que estén mejor adaptadas a las necesidades del hombre. Recursos Fitogenéticos disponibles Genética Tecnología alimentos Fitopatología Plant breeding Genómica Fisiología Vegetal Nuevas variedades mejoradas Las empresas de mejora y biotecnología Pasos en la mejora genética de plantas 1. 2. 3. 4. 5. Formulation de los objetivos de mejora Generación de la variación genética Selección Desarrollo y evaluación de nuevas variedades Producción y venta de la semilla Investigación fundamental Investigación biotenológica aplicada Mejora genética (desarrollo nueva variedad) Producción de semilla y material de siembra Marketing y venta 1. Empresas venden semilla 2. Empresas de semillas pequeñas 3. Empresas de semillas grandes 4. OPIs y Empresas BIO 5. Empresas de semilla pre-comercial El negocio de las semillas hortícolas Volumen de negocio anual del mercado de semillas hortícolas: 2,5 billion EUR Incremento anual del mercado de semillas hortícolas: 5-7% Las inversiones en I+D de las principales empresas en este sector es muy alta: 15-25 % Global seed market El mercado está en manos de muy pocas empresas Volumen de exportación de semilla EU (mill EUR) ¿Qué nos pueden ofrecer estas nuevas variedades? Variedades convencionales/ transgénicas Variedades tradicionales Combinación de genes de la propia especie o especies relacionadas Variedades transgénicas Combinación de genes de cualquier especie Cultivo mundial transgénicos 2012 En verde, países que siembran >100.000 ha Ej. Tomates transgénicos morados Tomates transgénicos con alto contenido en antocianinas/antioxidantes. Sobreexpresan dos genes que intervienen en la biosíntesis de antocianinas de la planta A. majus % frutos firmes Botrytis DNA Firmeza Tñ lesiones Botrytis Current Biology 23, 1094–1100, June 17, 2013 Brócolis transgénicos larga vida + 10 ppm etileno Brócolis transgénicos que retrasan el amarilleo en poscosecha. Sobreexpresan el gen de la enzima Isopentenyl transferase (ipt) bacteriana. GMOs WT Variedades hortícolas transgénicas Species Commercial varieties out of EU Essays Trait EU Others Tomato 6 75 652 Virus resistance / Shelf life Squash 2 6 60 Virus resistance Melon 1 10 137 Virus resistance /Shelf life Watermelon Virus résistance /seedless Broccoli 0 1 14 Insect resistance /male sterility / shelf life Cucumber 0 1 28 Virus résistance / salt tolerance Lettuce 0 8 79 Herbicide resistance / shelf life Mejora convencional Domesticación y mejora tradicional Diversificación de tomate mediante mejora genética clásica Variedades residuos = 0 Horticultura química Uso indiscriminado de pesticidas Horticultura sostenible Control integrado/biológico de plagas y enfermedades con plantas resitentes Importancia de las virosis Leonardo Velasco. 2015. http://www.iprofesional.com/ Mejora de la resistencia a ToLCNDV Identificación de materiales resistentes a ToLCNDV en calabacín Estudio del control genético de las resistencias Desarrollo de protocolos de inoculación artificial con mosca blanca y mecánicos para estudio de poblaciones segregantes ToLCNDV Tomato Leaf Curl New Delhi Virus • Begomovirus trasmitido por mosca blanca B. tabaci • Afecta principalmente a cucurbitáceas, en especial a calabacín, pero también melón y pepino • No permite cultivar calabacín aire libre Screening resistenciaToLCNDV Cucurbita Screening de 261 accesiones del género Cucurbita en condiciones de campo con mosca blanca virulífera. C. pepo C. moschata C. maxima C. fraterna C. okeechobeensis C. argyrosperma C. lundelliana C. foetidissima C. spp. 176 accesioness 33 accesiones 19 accesiones 2 accesiones 2 accesiones 2 accesiones 2 accesiones 1 accesiones 27 accesiones Bancos de germoplasma: BSUAL (Almería), COMAV (Valencia), USDA (EEUU) y NYRC (Israel). Resultados screening 7 6 7 7 7 4 9 9 7 5 5 5 4 2 4 6 6 6 4 3 4 4 4 4 4 4 8 0 0 0 0 50 50 75 50 50 100 100 100 100 100 100 100 100 100 50 100 100 75 50 100 75 100 100 0 0 0 0 1 1 1 1 1,2 3 2,6 1,8 1,75 3 2,75 3 3 3 1,25 3 3 1,66667 3 3 1,75 2,75 3 7 4 7 6 7 6 5 5 6 5 5 5 4 2 4 6 6 6 4 3 4 4 4 4 4 4 4 0 0 0 0 0 0 50 0,5 75 1,5 100 1,5 83,333 1,833 100 1,6 100 1,5 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 3 100 2,75 PCR N 0 0 0 0 0 0 0,8 1 1 1,4 0,6 1 0,5 1 0,75 0,333 0,833 0,833 0 1,333 1,333 0,667 2,333 1 1,75 1,25 1,5 SEVERIDAD SEVERIDAD 0 0 0 0 0 0 75 100 100 60 40 60 50 50 50 33,3 66,7 50 0 100 75 50 100 50 75 50 50 INCIDENCIA INCIDENCIA 4 6 6 6 4 3 4 4 4 4 4 4 8 N 7 6 7 7 7 4 9 9 7 5 5 5 4 35 DDI SEVERIDAD MOSCHATA MOSCHATA MOSCHATA MOSCHATA PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO MOSCHATA PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO PEPO 28 DDI INCIDENCIA N ESPECIE 21 DDI NEGATIVA NEGATIVA POSITIVO POSITIVO POSITIVO POSITIVO POSITIVO POSITIVO POSITIVO POSITIVO Resultados del screening 2 accesiones de C. moschata no han mostrado síntomas de la enfermedad y están libres de virus en el ápice de la planta (PCR). 0.0 2 accesiones de C. moschata mostraron Retraso en la aparición de los síntomas Menor severidad de los síntomas 5 accesiones de C. pepo mostraron Menos síntomas, aunque más que las entradas de C. moschata. Retraso en la aparición de los síntomas Menor porcentaje de plantas afectadas 0.0 Mejora de la polinización natural calabacín La pérdida del cuajado de los frutos en invierno no solo se debe a la falta de actividad de los insectos polinizadores sino también a la falta de flores masculinas en las variedades comerciales actuales. Identificación de una línea de Cucurbita pepo con un alto porcentaje en flores masculinas Hemos utilizado dicha línea como planta polinizadora en un ensayo con otros tratamientos químicos y ecológicos Expresión sexual calabacín Campaña INVIERNO Fase femenina % flores Fase mixta 100 75 50 25 0 0 Fase masculina 3 6 9 12 15 18 21 24 27 Nudo Flores masculinas Flores femeninas Peñaranda et al. Journal of Horticultural Science & Biotechnology (2007) 82 (4) 579–584 Variedades polinizadoras en calabacín Manzano et al. J Plant Growth Regul (2010) 29:73–80 Manano et al. Plant Growth Regul (2011) 65:213–221 Veg produce más 90% flores masculinas Variedades polinizadoras en calabacín Variedades polinizadoras en calabacín Planta polinizadora Control Pérdida flor masculina Colmena abejas Variedades con mejor calidad de fruta Producción Variedades muy productivas Calidad de la fruta • Variedades residuos 0 • Mayor calidad postcosecha • Mejores cualidades organolépticas • Aumento contenido compuestos funcionales………………. Mejora de la partenocarpia Identificación de genotipos partenocárpicos bajo condiciones de cultivo de Almería Fuentes naturales: variedades tradicionales Inducción y selección de mutantes partenocárpicos Desarrollo de criterios para la selección de genotipos partenocárpicos en calabacín Planta (2014) 239:1201–1215 Identificación de marcadores fisiológicos y moleculares para la selección de genotipos partenocárpicos Fuentes de partenocarpia natural en calabacín Partenocarpia con flor pegada Partenocarpia sin flor pegada Martínez et al. 2013. BMC Plant Biology 13:139 Martínez et al., 2014. Euphytica Martínez et al., 2014. Planta 239:1201-1215 Partenocarpia de Cavili La partenocarpia de Cavili está asociada a una menor producción de etileno en el ovario a los 3 DPA Martínez et al. BMC Plant Biology 2013, 13:139 Correlación entre partenocarpia y etileno Las variedades más partenocárpicas producen mucho menos etileno a los 3 DPA que las no-partenocárpicas. La producción de etileno o la expresión de los genes de etileno a los 3 DPA puede usarse como marcador para seleccionar genotipos partenocárpicos. Euphytica (2014) 200:349–362 El calabacín es muy sensible daños frío Variedad Natura Variedad Sinatra Variedades tolerantes a frío en calabacín Genotipo tolerante a frío Palma et al. 2015. Postharves Biol Tech 99:131-140 Carvajal et al., 2014. Annals of Appl Biol 166:340-354 Megías et al., 2014. LWT Food Sci Tech 57:194-199 Palma et al., 2014. Plant Sciences 217-218 Palma et al., 2014. Plant Physiol Biochem 82:161-171. Tolerancia frigoconservacion /etileno Variedades sensible frío Variedades tolerantes frío Megías et al., 2014. LWT Food Sci Tech 57:194-199 Megías et al., 2015. PLOS ONE (in press) Variedades para la horticultura sostenible Abonos orgánicos Variedades que utilicen eficientemente el Nitrógeno y otros fertilizantes Abonos de síntesis Variedades que requieren altos contenidos de nitrógeno Variedades que usan N eficientemente Genotipos que sean capaces de establecer relaciones activas simbióticas con microorganismos beneficiosos de la rizosfera. Genotipos con mecanismos para mejorar la eficiencia en el uso de nutrientes: • sistemas radiculares vigorosos • mantenimiento de la actividad fotosintética bajo estrés de nutrientes • habilidad para establecer relaciones activas con las micorrizas • reducir pérdida de raíces por patógenos • incrementan la profundidad de raíces, etc. Las OMICs aceleran el proceso de mejora GENOMICS TRANSCRIPTOMICS PROTEOMICS METABOLOMICS PHENOMICS Generación de variabilidad por mutagénesis 10.000 semillas línea pura Muc16 EMS (Ethyl methanesulfonate) M1 Colección de 5.000 Familias mutantes M2 M2 Screening fenotípico Identificación de mutantes por sus fenotipos Datos de secuenciación del Genoma o Transcriptoma Screening DNA (TILLING) Identificación variantes alélicas en DNA Variante alélica para Genes ARFs Mutante: - Partenocárpico Tolerante frío rico licopeno… Mutante partenocárpico Screening directo colección mutantes EVALUACIÓN PLÁNTULAS: La calidad de la colección es muy elevada Albinas 3 cotiledones Gravitropismo negativo Deformacion cotiledones Enanismo Variegación Despigmetación Color naranja Insensible a etileno Total familias Tratamientos EMS T1 T2 0,54 1,15 1,39 1,04 0,05 1,26 1,07 3,4 0,96 2,19 0,36 1,21 1,94 1,75 0 0,05 0 0,21 929 1822 TOTAL 2751 Resultados del screening para insensibilidad etileno Triple respuesta a etileno: Identificación de 4 familias mutantes insensibles a etileno Fenotipos de interés agronómico: •Partenocarpia •Cambios expresión sexual •Vida comercial postcosecha •Tolerancia frigoconservación Otros screening directos rápidos • Identificación de mutantes tolerantes a estrés oxidativo, que puedan ser tolerantes a estreses abióticos • Identificación de mutantes con altos contenidos en compuestos bioactivos 1) Licopeno y otros carotenoides 2) Fibra de tomate 3) Enzimas y ácidos Conclusiones: presente y futuro programas mejora RECURSOS FITOGENÉTICOS CLÁSICOS NUEVAS PLATAFORMAS DE GENÓMICA Identificación del material vegetal / genes / marcadores / QTLs MEJORA GENÉTICA Nuevas variedades convencionales Nuevas variedades GMO DINAMIZACIÓN DEL SECTOR HORTOFRUTÍCOLA Grupo de investigación BIO-293 y colaboradores Dra. Susana Manzano Dra. Cecilia Martínez Zoraida Megías Alicia García Rafael Garrido Dr. Tarek Wardeh. Universidad Alepo, Siria Colaboradores: Dra. Belén Picó. UPV Dra. Dolores Garrido. UGR Dr. Abdel Bendahmane. INRA, Francia Juan Carlos Gázquez Encarna Aznar Dr. Harry Paris ARO. Volcani Center Dr. Manuel Jamilena Contribución de la mejora genética a la competitividad….