Download Metagenómica de DNA de virus en regiones polares

Proyecto Master
Diversidad genética de virus DNA de pequeño tamaño en regiones polares
Estudios metagenómicos de la comunidad de virus en lagos de la Antártida y del Ártico
realizados en nuestro laboratorio han mostrado una abundancia de virus pequeños
ssDNA (circulares, cadena sencilla) en estos ambientes extremos (1,2) y hemos
descrito cientos de nuevos ssDNA virus que replican en estos ecosistemas. Se ha
propuesto que los ssDNA virus sufren una gran tasa de mutación y generan
poblaciones de virus variantes similares a las quasiespecies descritas en virus RNA
(3). Sin embargo, la diversidad genética de ssDNA virus en comunidades complejas
presentes en ecosistemas naturales no se ha estudiado.
El proyecto consistirá en un análisis informático detallado de la diversidad genética de
ssDNA virus presentes en ecosistemas naturales extremos (Antártida y Ártico). La
evolución de virus a lo largo de los años se estudiará en muestras recogidas en
diferentes campañas polares. El proyecto establecerá nuevos conceptos en diversidad
genética y evolución de ssDNA virus en ambientes naturales.
Referencias
A. López-Bueno, J. Tamames, D. Velazquez, A. Moya, A. Quesada and A. Alcami.
2009. High diversity of the viral community from an Antarctic lake. Science 326:858861.
D. Aguirre de Cárcer, A. López-Bueno, D. Pearce and A. Alcami. 2015. Biodiversity
and distribution of Polar freshwater viruses. Science Advances 1, e1400127.
A. López-Bueno, A. Rastrojo, R. Peiró, M. Arenas and A. Alcami*. 2015. Ecological
connectivity shapes quasispecies structure of RNA viruses in an Antarctic lake.
Molecular Evolution 24:4812-4825.
Laboratorio Antonio Alcami
Direccion del proyecto: Alberto Rastrojo y Antonio Alcami
Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM)
http://www.cbm.uam.es/antonio.alcami