Download Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas
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Cursos y Tópicos Semestre 2016-2 1. Título del curso o tópico Técnicas Selectas de Biología Molecular 2. Tutor responsable Nombre del Tutor TORRES QUIROZ JOSE FRANCISCO Entidad Instituto de Fisiología Celular Teléfono (55) 56225628 Correo electrónico ftq@ifc.unam.mx 3. Integrantes Integrante Rol TORRES QUIROZ JOSE FRANCISCO Tutor responsable DRA. LAURA ONGAY-LARIOS Profesor invitado (Externo) DRA. PAOLA MORENO ÁLVAREZ Profesor invitado (Externo) DR. JORGE RAMIREZ Profesor invitado (Externo) M. EN C. GERARDO COELLO Profesor invitado (Externo) CORIA ORTEGA ROBERTO Profesor invitado (MDCBQ) Horas GONZÁLEZ PEDRAJO BERTHA MARÍA J. Profesor invitado (MDCBQ) RECILLAS TARGA FELIX Profesor invitado (MDCBQ) VACA DOMÍNGUEZ LUIS ALFONSO Profesor invitado (MDCBQ) LICONA LIMÓN PAULA Profesor invitado (MDCBQ) 4. Observaciones del Coordinador del curso o tópico Dr. José Francisco Torres Quiroz 5622 5628 ftq@ifc.unam.mx Para inscribirse al curso comunicarse con el Dr. José Francisco Torres Quiroz. Para llevar el curso es requisito haber tomado un curso de biología molecular y que los alumnos trabajen aspectosde biología molecular en sus respectivos proyectos. No se aceptan alumnos que no hayan sido aceptados previamente por el coordinador. No se aceptan oyentes. 5. Características para impartir el curso o tópico Lugar en donde se realizará el tópico Aula B del Instituto de Fisiología Celular, UNAM. Horario en que se realizará el tópico Viernes de 9am a 12pm Número de sesiones 16 Máximo de alumnos que puede aceptar 15 6. Métodos de evaluación Método Porcentaje Cantidad Participación en clase 10 % 16 Presentación de un proyecto 50 % 1 Trabajo escrito 40 % 1 7. Introducción / justificación del curso o tópico Actualmente las técnicas de biología molecular son empleadas en laboratorios de investigación de diversas áreas, sin embargo, algunas veces el usuario no comprende del todo cuales son los fundamentos. Por otro lado muchos de los estudiantes que se incorporan al postgrado solamente conocen las técnicas empleadas en sus laboratorios y les es difícil entender otras técnicas que se incluyen en artículos o se revisan en libros y que son necesarias para poder tener una formación integral. Recientemente se han desarrollado nuevas técnicas de biología molecular que se basan en técnicas ya conocidas y es necesario tener este conocimiento para aplicarlas de la mejor manera. 8. Objetivos El objetivo de este curso es revisar los fundamentos teóricos en los cuales se basan las técnicas clásicas de Biología Molecular. Con esto se pretende que el alumno sea capaz no sólo de entender como se han desarrollado estas técnicas sino también poder modificarlas para algún aprovechamiento particular. Un claro ejemplo de esto es el uso de “kits” comerciales para diferente aspectos de biología molecular. 9. Temario del curso o tópico Viernes 5 de Febrero de 2016. 1. Presentación del curso. Dr. Francisco Torres 2. Electroforesis. a) Principios de la electroforésis. b) Geles de Agarosa. c) Aplicaciones de la electroforésis. Viernes 12 de Febrero de 2016. 3. Extracción de Ácidos Nucleicos. Dr. Roberto Coria. a) Extracción de DNA cromosomal. b) Extracción de DNA extracromosomal. c) Extracción de RNA. Viernes 19 de Febrero de 2016. 4. Técnicas de DNA Recombinante. Dr. Francisco Torres a) Restricción b) Ligación c) Software para análisis de DNA Viernes 26 de Febrero de 2016. 5. Hibridación de Ácidos Nucleicos. Dr. Roberto Coria. a) Soportes de retención de ácidos nucleicos. b) Hibridación tipo Southern. c) Hibridación tipo Northern. d) Marcaje de sondas. Viernes 4 de Marzo de 2016. 6. Amplificación de DNA. Dra. Laura Ongay Larios. a) Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). b) RT-PCR. Viernes 11 de Marzo de 2016. 6. Amplificación de DNA. Dra. Laura Ongay Larios. a) PCR en tiempo real. Viernes 18 de Marzo de 2016. 7. Secuenciación de DNA. Dra. Laura Ongay Larios a) Método químico. b) Método enzimático. Viernes 1 de Abril de 2016. 8. Interacciones Proteína-DNA. Dr. Felix Recillas Targa. a) Digestiones con DNAsa. b) Inmunoprecipitación de la cromatina. c) Footprinting Viernes 8 de Abril de 2016. 9. Sistemas de expresión en eucariontes. Dra. Paola Moreno Álvarez a) Métodos de transfección. b) Transfecciones estables. c) Transfecciones transitorias. d) Vectores de expresión. Viernes 15 de Abril de 2016. 10. Generacion y tipos de modelos geneticos en vertebrados. Dra. Paula Licona a) Clasificación: transgénicos/knock in/knock out. b) Sistema CRISPR/Cas9. Viernes 22 de Abril de 2016. 11. RNAi. Dr. Luis Vaca Domínguez. a) Antecedentes del RNAi. b) Principios del RNAi. c) Aplicaciones. Viernes 29 de Abril de 2016. 12. Transformación y Sistemas de expresión en procariontes. Dra. Bertha Gónzalez Pedrajo. a) Métodos e transformación. b) Vectores de expresión. c) Genes reporteros. Viernes 6 de Mayo de 2016. 13. Sistemas de interacción proteína-proteína. Dr. Roberto Coria. a) Sistema de doble-híbrido. b) Sistema de un solo híbrido. c) Ensayo de complementación de fragmentos de proteína Viernes 13 de Mayo de 2016. 14. Microarreglos. Dr. Jorge Ramírez Salcedo. a) Principios de los microarreglos. b) Microarreglos con DNA-DNA. c) Microarreglos con DNA-RNA. Viernes 20 Mayo de 2016. 15. Bioinformática. M. en C. Gerardo Coello a) Bases de datos de genomas y proteínas b) Análisis e interpretación de microarreglos. Viernes 27 Mayo de 2016. 16. Presentación de trabajos finales. 10. Bibliografía El curso se basará en las revisiones de artículos y protocolos especializados de las técnicas que conforman el programa con el apoyo de la siguiente bibliografía general: - Bloom, Freyer Miicklos. Laboratory DNA Science. 1996. Benjamin/Cummings Plubishing Company, INC. - Sambrook and Rusell. Molecular Cloning. 2001. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Circuito de Posgrado, Ciudad Universitaria Delegación Coyoacán, C.P. 04510, México D.F. Tel: (55) 5623•7006 ntrejo@posgrado.unam.mx