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UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS (Universidad del Perú, Decana de América) FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA “Carrera acreditada Internacionalmente” DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE BIOLOGÍA CELULAR Y GENÉTICA SYLLABUS SEMESTRE ACADÉMICO : 2015-II I. DATOS GENERALES 1.1. NOMBRE DEL CURSO 1.2. CÓDIGO DEL CURSO 1.3. NÚMERO DE CRÉDITOS 1.4. DURACIÓN DEL SEMESTRE 1.5. AÑO DE ESTUDIOS 1.6. NÚMERO DE HORAS 1.6.1 TEÓRICAS 1.6.2. PRÁCTICAS 1.6.3. SEMINARIOS 1.7. PRE-REQUISITO : Transferencia Genética Horizontal : B02061 : 03 : 17 SEMANAS : 5to. año 1.8. PROFESOR RESPONSABLE : Mg. Dan Erick Vivas Ruiz PROFESOR COLABORADOR 1.9. HORARIOS Y AMBIENTES : 02 horas : --: 02 horas : Ingeniería Genética : Mg. Gustavo Adolfo Sandoval Peña : Teoría Lunes 11 am - 01 pm) Aula 308 Seminario (Miércoles 10:00 a 12:00 Horas) Aula 409 II. SUMILLA: El curso nos permitirá conocer acerca de la revisión sobre mecanismos de transferencia génica, la transferencia genética horizontal entre especies no relacionadas o aún entre reinos. Papel de la transferencia genética horizontal en la evolución de los Procariontes y Eucariontes. Transferencia entre compartimientos (cloroplastos, mitocondrias y núcleo). 1 III. OBJETIVOS 3.1. GENERAL Dar a conocer al alumno las repercusiones que tiene la transferencia horizontal del material genético sobre la modificación y la evolución de los genomas procariontes y eucariontes. 3.2. ESPECÍFICOS Al término del curso, el alumno estará capacitado para: Discriminar a los diferentes elementos genéticos móviles presentes en los procariotas y eucariotas Comprender los diversos mecanismos por los cuales se da la transferencia horizontal de genes de procariota a procariota y de procariota a eucariota. Entender la formación y evolución de vías metabólicas a partir de la adquisición no vertical de genes. Conocer las herramientas que permiten evidenciar procesos de transferencia horizontal de genes. Determinar el grado de impacto que da la transferencia genética horizontal en los análisis filogenéticos. IV. EVALUACIONES: Teoría: Comprende dos exámenes teóricos cancelatorios y la realización de una revisión científica literaria acerca de un tópico específico tocado en clase o relacionado a ella, serán evaluados de la siguiente manera: Primera Evaluación: Octava Semana Segunda Evaluación: Decimo Sexta Semana Examen Sustitutorio: Decimo Sétima Semana Revisión: Décimo quinta semana Promedio de Teoría: (Examen 1 + Examen 2+ Revisión científica)/3 Seminario: Comprende 2 exposiciones de artículos científicos de manera individual y dos exámenes que serán evaluados de la siguiente manera: Primera Evaluación: Octava Semana Segunda Evaluación: Decimo Sexta Semana Examen Sustitutorio: no aplica 2 Promedio de Seminario: (Exp1 + Exp 2/2)x 0.6 +(Exam. 1+ Exam 2/2)x0.4 Promedio Final del Curso: (Promedio de Teoría + Promedio de Seminario )/2 En la Teoría, el alumno sólo tendrá derecho a sustituir una de las dos evaluaciones teóricas por el único examen sustitutorio que se tomará, correspondiente a todo el curso. La asistencia a las sesiones seminario (clases prácticas) es obligatoria por parte de alumno. Las inasistencias que superen el 30% de las clases programadas, hacen que el alumno desapruebe el curso, correspondiéndole la nota de CERO de acuerdo al reglamento vigente. V. METODOLOGÍA. El desarrollo del curso comprenderá clases teóricas y sesiones de seminario. Clases teóricas: Serán expositivas, utilizando como material didáctico auxiliar la pizarra y equipos multimedia. Se abordarán los distintos temas propuestos en el curso, impulsando la participación activa de los alumnos. Sesiones de seminario: Se profundizará temas tratados en algunas clases teóricas, así como otros temas no comprendidos en ellas. Los temas de seminario serán entregados con la debida anticipación para que el alumno prepare una exposición en donde sintetice de manera clara y ordenada los tópicos tratados en los artículos; así mismo una semana después de la exposición el alumno presentará por escrito la síntesis en no más de tres páginas del seminario dado con las correcciones hechas para que los demás alumnos puedan prepararse para el examen. Revisión científica: El alumno motivado por un tema desarrollado en clase o relacionado a ella, realizará una revisión con todas las exigencias dadas en la redacción científica, el cual estará elaborado con un mínimo de 15 artículos científicos con ello preparará un manuscrito no menos de entre 10 y 15 páginas. El trabajo también será expuesto en las últimas semanas del curso. 3 VI. PROGRAMACIÓN CALENDARIZADA DEL CURSO FECHA Semana 1 Semana 2 Semana 3 Semana 4 Semana 5 Semana 6 Semana 7 PROFESOR RESPONSABLE TEMA T1. Clase introductoria. El Mobiloma definición y componentes. Formas de detección de la TGH. La TGH entre los tres dominios de la vida. T2. Los transposones: los retrotransposones LTR, retrotransposones no LTR y no virales. LINES, SINES (secuencias Alu), Transposones de DNA. Secuencias de inserción. T3. Plásmidos conjugativos. Mecanismos genéticos moleculares de persistencia: elementos accesorios, estabilidad plasmídica y rango de hospederos. S1.El origen de los genomas de ADN. S2. El Mobiloma Humano T4. El sistema integrón/ casetes génicos: el origen de los casetes génicos. Los sitios attC. Rol en la adquisición de la resistencia a antibióticos y principales casetes génicos de resistencia. S3. Potencial emergente de los transposones para la terapia génica y generación de las células madres pluripotenciales inducidas. S4. TGH de transposones en invertebrados y vertebrados T5. Parásitos moleculares de autoensamble: Intrones del grupo I y II. Las inteínas. Las endonucleasas Homing. S5. TGH en el tracto gastrointestinal humano. Dispersión potencial de la resistencia a los antibióticos. S6. TGH en patógenos humanos. T6. Virus y la TGH en procariotas y eucariotas: Tipos de Bacteriófagos, profagos. Los virus y la resistencia microbiana. El papel de los virus en la evolución del genoma eucariótico. S7.Diferencias dinámicas entre inteínas activas e inactivas S8. El VIH y procesos de HGT en el huésped. T7: El efecto del “Codon Usage” sobre el éxito de la TGH: Barreras relacionadas al “Codon Bias”. Asociación bidireccional entre la HGT y el “Codon Bias” S9: Evidencia de HGT de humano al genoma de HIV-1. S10:Regulación de la HGT en mamíferos por fragmentación del ADN T8. La TGH y la evolución de la fotosíntesis en eucariotas: Plastidios de origen primario, secundario y terciario. Plastidios y la endosimbiosis secundaria. S11. Evolución adaptativa de las vías metabólicas bacterianas por la TGH. S12. La HGT en la evolución de la actividad enzimática. D. Vivas D. Vivas/G. Sandoval D. Vivas D. Vivas D. Vivas D. Vivas D. Vivas Semana 8 PRIMER EXAMEN PARCIAL D. Vivas / G. Sandoval Semana 9 T9. Transferencia horizontal de genes entre Archea y Bacteria. Estudio de los transportadores ABC. S13: HGT entre bacterias: mecanismos y barreras S14: Eventos de transferencia génica inusuales en poblaciones bacterianas. D. Vivas 4 Semana 10 Semana 11 T10: Transferencia horizontal de genes entre Bacteria y Animalia. D. Vivas S15: TGH entre bacterias y células somáticas humanas. S16: TGH de proteínas anticongelantes T11: TGH en plantas: implicancias evolutivas. Adaptaciones adquiridas por transferencia horizontal: Fotosíntesis C4. Implicancias filogenéticas de la transferencia horizontal en plantas. D. Vivas S17: HGT de genomas plastídicos en plantas. S18: Progresión del cáncer mediado por HGT Semana 12 Semana 13 T12: Transferencia genética horizontal en hongos: Mecanismos y factores que facilitan la TGH, Potenciales casos de TGH en hongos D. Vivas S19: Herencia del ADN de transferido de parásitos en hospederos humanos. S20: HGT de microRNAs T13. El papel de la transferencia horizontal de genes en el parasitismo de eucariotas. Mecanismos implicados en los parásitos procarióticos y eucarióticos. D. Vivas Exposición de revisiones Semana 14 Semana 15 Semana 16 Semana 17 T14. La transferencia horizontal de genes y la nueva perspectiva del árbol de la vida. Impacto de la HGT en la clasificación de los microorganismos procarióticos y eucarioticos. Exposición de revisiones T15. Transferencia horizontal de Proteínas: Proteínas que participan en la transmisión de genes. Proteínas con cualidades génicas. Exposición de revisiones SEGUNDO EXAMEN PARCIAL EXAMEN SUSTITUTORIO Y ENTREGA DE NOTAS FINALES D. Vivas D. Vivas D.Vivas D. Vivas VII. BIBLIOGRAFÍA Libros de consulta Lateral DNA Transfer: Mechanism and consequences. 2002. Cols Spring Harbor Laboratory Press. Horizontal Gene Transfer 2002. Academic Press. Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux.2009. Humana Press Genes X. 2011. Jones and Bartlett Publishers Revistas de consulta Nature review Cell Journal of Genetics and Genomics Journal of Genetics and development Journal of protein a cell Journal of molecular genetics 5 Plasmid Journal of molecular genetics and metabolism Journal of molecular evolution 6