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Tipo de documento FORMULARIO DE SOLICITUD Ubicación PROTEOMICA, GENOMICA, BIOINFORMATICA, METABOLOMICA Centro de Investigación Médica Aplicada Planta 0-1 Avda. Pío XII 55, Edificio CIMA 31008 Pamplona (Navarra) D. Fernando Corrales Izquierdo Navarrabiomed Planta 2 C/ Irunlarrea 3, Edificio CIB 31008 Pamplona (Navarra) D. Joaquin Fernández Irigoyen 948.194.700, Ext. 4006 fjcorrales@unav.es Joaquin.fernandez.irigoyen@navarra.es 848 428.540 948.194.700, Ext. 5032 vsegura@unav.es 848.422.186 dguerres@navarra.es Lourdes Ortiz Hernández D. Alberto Labarga Gutiérrez 948.194.700, Ext. 5028 lortiz@unav.es 848.421.556 alabargg@navarra.es D. Victor Segura Ruiz Contacto D. David Guerrero Setas genomica@unav.es ubioinformat@unav.es (se ruega prioricen el contacto a través de estas cuentas) Instrucciones: El solicitante deberá cumplimentar el presente formulario, y enviarlo a la dirección de contacto indicada en la parte superior del presente documento. 1. Datos del solicitante Nombre y Apellidos Entidad Calle Población 2. Teléfono CP Provincia País Provincia País Datos de facturación Entidad CIF Departamento/Persona de contacto Calle Población CP Proyecto/referencia/partida de gasto 3. email Departamento/Servicio Datos de envío de factura (en caso de que no coincida con la dirección de facturación) Entidad Departamento/Persona de contacto Calle Población CP El solicitante declara que pertenece a IDISNA: Provincia País SI – NO (táchese lo que no proceda) Fecha de solicitud Firma A rellenar por la plataforma Nº Registro Fecha recepción Presupuesto Importe Los datos aquí recogidos se encuentran en un fichero para uso interno y prestación de servicios de esta institución, que se hace responsable de dicho fichero adoptando los niveles de seguridad adecuados para garantizar la correcta utilización de los datos. Las personas legitimadas podrán ejercer los derechos de acceso, rectificación, cancelación y oposición regulados por LOPD 15/1999, dirigiéndose a la dirección: FUNDACIÓN INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN SANITARIA DE NAVARRA. Recinto de Complejo Hospitalario de Navarra. C/Irunlarrea, 3. C.P 31008 Pamplona. Teléfono: 848 42 87 00. Correo electrónico: info@idisna.es www.idisna.es FUNDACIÓN INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN SANITARIA DE NAVARRA Recinto del Complejo Hospitalario de Navarra_Calle Irunlarrea 3_Pamplona 31008 Plataforma Tipo de documento FORMULARIO DE SOLICITUD SERVICIOS SOLICITADOS Tipo Servicio 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. Suma Unidades €/ud Suma Observaciones 0 0 0 0 Indicar si las muestras deben enviarse a alguna dirección concreta. Este servicio se facturará a parte. ANEXO Genómica Proteómica Extracción de ADN y ARN a partir de células en cultivo, PBL´s, sangre y tejido. Análisis de la calidad del ARN. Experion/Bioanalyzer. Cuantificación de ácidos nucleicos mediante fluorometría (Qubit 2.0, Life Tecnologies). Genotipado para el análisis de Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Reacciones de secuenciación sobre distinto material genético. Resolución y lectura de reacciones de secuenciación en sistema multicapilar. Resolución por tamaño de productos de PCR previamente marcados, como microsatélites. Identificación de líneas celulares humanas mediante STR. Análisis de perfiles de expresión génica (genoma completo o específicos, diseñados a la carta). Estudios de citogenética (CGH). Identificación de alteraciones cromosómicas (Plataforma de Microarrays de Agilent y Affymetrix). Estudios de procesamiento alternativo. Genotipado. Secuenciación Masiva (PGM, Ion Torrent) de pequeños organismos, amplicones y Chip Seq: (Preparación de librerías y secuenciación) Paneles de Genes para la detreminación de mutaciones mediante Secuenciacion Masiva(PGM, Ion Torrent): 1. Hot Spot Cancer: Determinación de mutaciones en 50 genes asociados con cáncer 2. BRCA: Secuenciacion completa y simultánea de los genes BRCA 1 y 2 3. TP53: Secuenciacion completa 4. AML: Determinación de Mutaciones en 19 genes implicados en la Leucemia mieloide aguda. PCR convencional y PCR específica de metilación. Pirosecuenciación. Estudios de expresión génica y de microARNs mediante PCR cuantitativa y Plataforma de arrays de Affymetrix y Agilent. Asesoramiento. - Asesoramiento científico y tecnológico para la definición de proyectos de Proteómica. - Diseño experimental de ensayos de Proteómica diferencial. - Asesoramiento en la Interpretación Biológica de los resultados obtenidos. Preparación de la Muestra. - Extracción de proteínas a partir de tejidos, cultivos celulares y fluidos biológicos. - Lavado y concentrado de extractos proteicos mediante métodos de precipitación. - Determinación de la concentración de proteínas. - Proteolisis de mezclas de proteínas para su análisis mediante espectrometría de masas. Análisis por espectrometría de masas. 1 Caracterización de proteínas y proteomas. - Identificación y caracterización de Proteínas. Los datos aquí recogidos se encuentran en un fichero para uso interno y prestación de servicios de esta institución, que se hace responsable de dicho fichero adoptando los niveles de seguridad adecuados para garantizar la correcta utilización de los datos. Las personas legitimadas podrán ejercer los derechos de acceso, rectificación, cancelación y oposición regulados por LOPD 15/1999, dirigiéndose a la dirección: FUNDACIÓN INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN SANITARIA DE NAVARRA. Recinto de Complejo Hospitalario de Navarra. C/Irunlarrea, 3. C.P 31008 Pamplona. Teléfono: 848 42 87 00. Correo electrónico: info@idisna.es www.idisna.es Tipo de documento FORMULARIO DE SOLICITUD - Identificación de proteínas a partir de geles 2DE o SDS-PAGE, incluyendo la tripsinización. en gel y extracción de péptidos. - Identificación de proteínas en solución, incluyendo el proceso de tripsinizado. - Identificación masiva de Proteínas en mezclas complejas. 2 Proteómica diferencial. - Marcaje isobárico de péptidos (iTRAQ). - Análisis Bioinformático para la identificación y cuantificación de los datos obtenidos mediante LC-MS/MS. 3 MRM (Multiple Reaction Monitoring). - Diseño y optimización de métodos de MRM para cuantificación relativa y absoluta de péptidos y proteínas de interés. - Verificación de métodos de MRM en muestras complejas. 4. Interpretación biológica. - Análisis funcionales de proteínas. - Análisis de los Procesos Biológicos implicados en experimentos de Proteómica diferencial. Bioinformática Diseño experimental. Asesoramiento para decidir el tamaño muestral, el diseño del estudio y la planificación de la metodología. Análisis de datos. Procesado bioinformático de los datos obtenidos en diversas plataformas tecnológicas de alto rendimiento empleadas en el ámbito de la genómica y la proteómica (microarrays, secuenciación, PCR, etc). En estos análisis se incluye la normalización, el análisis estadístico y la representación de los resultados. Ayuda a la interpretación de resultados. DATOS ENTREGA (a cumplimentar por la Plataforma en el momento de la entrega) Retirado por: Firma: Nombre y Apellidos: Email: Tfno contacto Lab/Dpto. Entregado por: Nombre y Apellidos: Fecha: Observaciones: Los datos aquí recogidos se encuentran en un fichero para uso interno y prestación de servicios de esta institución, que se hace responsable de dicho fichero adoptando los niveles de seguridad adecuados para garantizar la correcta utilización de los datos. Las personas legitimadas podrán ejercer los derechos de acceso, rectificación, cancelación y oposición regulados por LOPD 15/1999, dirigiéndose a la dirección: FUNDACIÓN INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN SANITARIA DE NAVARRA. Recinto de Complejo Hospitalario de Navarra. C/Irunlarrea, 3. C.P 31008 Pamplona. Teléfono: 848 42 87 00. Correo electrónico: info@idisna.es www.idisna.es