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U UN NIIV VE ER RS SIID DA AD DD DE EC CO OLLIIM MA A Facultad de Medicina. Centro Universitario de Investigaciones Biomédicas ANÁLISIS DE LOS POLIMORFISMOS -675 4G/5G DEL GEN DE PAI-1 Y C936T DEL GEN DE VEGF VINCULADOS AL SISTEMA RENINA ANGIOTENSINA, EN CÁNCER CÉRVICOUTERINO EN UNA POBLACIÓN DE COLIMA Tesis que para obtener el grado de: Maestro en Ciencias Médicas Presenta: Hugo Christian Ramos Flores Médico Cirujano y Partero Director de Tesis: D. en C. Laura Leticia Valdez Velázquez Asesor de Tesis: D. en C. Luz Margarita Baltazar Rodríguez Colima, Colima. Enero de 2011 APORTACIONES Los resultados parciales de esta tesis fueron presentados en el siguiente congreso: XXXV Congreso Nacional De Genética Humana. Organizado por la Asociación Mexicana de Genética Humana, con fecha del 17 al 20 de noviembre, en el Centro de Convenciones William O. Jenkins Puebla, Puebla Se enviará a una revista indizada el manuscrito: Analysis of -675 4G/5G polymorphism of PAI-1 gene, VEGF gene C936T and G-800A TGF β1 gene linked to renin-angiotensin system in cervical cancer in a population of Colima, Mexico. Hugo Ramos MD, Teresa Romero Q, Victor Montaño, Irma Enriquez MD, Jorge Delgado MD, Roberto Chaparro MD, Joaquin Chávez, Verónica Rauda, Laura Valdez PhD. En preparación. AGRADECIMIENTOS Agradecimiento al Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología por la beca otorgada para la realización de estudios de la Maestría en Ciencias Médicas con número de registro CVU 292145. Gracias por haberme dado la oportunidad de ser becario. Todo mi esfuerzo y conciencia social en retribución. Agradecimiento a la Universidad de Colima, por haberme formado orgullosamente en ella desde la preparatoria. “Hecho en casa”. Agradecimiento al PROMEP, por haber apoyado con financiamiento para concluir esta tesis. Clave: PTC120: “Asociación de polimorfismos génicos del Sistema Renina Angiotensina en CaCu” Agradecimiento a mis Asesores y Maestros, por haberme formado. DEDICATORIA Te agradezco Dios y Jesús por tu amor y tu fuerza. A mi madre: Evangelina Flores, por su amor y apoyo incondicional. Sigo tu ejemplo “mom”. A mi padre: Hugo Ramos, por sus invaluables consejos. Siempre con palabras de aliento. Gracias “papá”. A mis hermanas, Jennifer Ramos y Nancy Ramos, a mi pequeña sobrina Romina Orozco Ramos. A Fernando Orozco. Gracias “familia”. A Perla Gutiérrez, gracias por tu amor, apoyo y confianza. A mi Director de Tesis: Dra. Laura Valdez, gracias por la oportunidad y confianza en mí para cursar la Maestría. A mi Asesor de Tesis: Dra. Luz Baltazar, por su apoyo. A la QFB. Teresa Romero. Por su gran apoyo en esta investigación. Al Dr. Roberto Chaparro, por su apoyo. Al Dr. Jorge Eduardo Delgado, por su participación para el logro del trabajo. Al personal del Laboratorio de Anatomía Patológica del Hospital Regional Universitario: la Dra. Gabriel Enríquez, y el Tec. Víctor Montaño por su invaluable participación. Al personal de enseñanza del Centro Estatal de Cancerología, por su aceptación del trabajo. A mis profesores de Seminario: Dr. Oscar Uribarren, Dr. Oscar Newton, Dr. Miguel Huerta. Por su ayuda en las revisiones de esta tesis. A mis compañeros del Laboratorio: Verónica Rauda, Joaquín Chávez, por su ayuda y participación. A mis amigos: Toño, Paul, Andy, Omar, Lalo, Pancho, Ericka, Sandra, Christian, Ana, Ángel por su amistad. Instituciones donde se realizó el proyecto: Hospital Regional Universitario Colima, Colima. Centro Estatal de Cancerología Colima, Colima. Centro de Salud Urbano de Colima Jurisdicción Sanitaria SILOS 1 Laboratorio de Productos Biológicos. Facultad de Ciencias Químicas. Universidad de Colima Coquimatlán, Colima. ÍNDICE 1.- Resumen…………………...…………………..……….…………………………..…………...1 2.- Abstract……......………...……………………….…….…………………………..…………...2 3.- Introducción………….…...………………………..….…………………………..…………...3 4.- Marco teórico…………..………...………………………………………..…….…………..….4 4.1- Consideraciones generales.....…………………….………...…………….........…4 4.2.- Cáncer cervicouterino. Perfil y diagnóstico……………..………….............…4 4.3.- Factores genéticos relacionados con cáncer………………..…...……………..7 4.4.- Polimorfismos y su estudio……………….………..………………...……...…..7 4.5.- Polimorfismos relacionados a CaCu y con el sistema renina angiotensina……………………………………………………….…………………..…………….9 4.6.- Receptor 1 de la angiotensina II (AGTR1 o AT-1)…………….……………...10 4.7.- Factores relacionados (PAI-1 y VEGF)……………………...…….……………11 4.8.- Inhibidor del activador del plasminógeno (PAI-1)…..……........……………12 4.9.- Factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF)…………..……….……..13 4.10.- Conocimiento actual referente……………………….…………..………..…..15 5.- Justificación……………..………………………………………………………….………….16 6.- Planteamiento del problema……………………………….……………………………..…18 6.1.- Pregunta de investigación……………………………..……..…….…...……..…18 7.- Objetivos…….…………………………………………………....…………………………....18 8.- Hipótesis………………..…………………………………….………………………………...19 9.- Material y métodos……..…..…………………………………….……………………….....20 9.1.- Tipo de estudio e investigación…………...………….……..….……..………..20 9.2.- Selección de la muestra………………………..……………………………….…20 9.3.- Variables y escalas de medición...…….…………….……..………..……....…21 9.4.- Metodología…………….…………………………………..….………………….….24 9.5.- Análisis estadístico……………………..……..……………………………….…..26 10.- Aspectos éticos…………………..………………………..……...…………..……………..28 11.- Resultados y discusión...……………………..……………………………………………29 12.- Conclusiones….….…...……………………..………...……………………………………44 13.- Perspectivas……….……………………………..……………………………………………44 14.- Referencias………….……….…………….………..………………...………….………....45 15.- Anexos...……………………………………………………..……………………………......55 15.1.- Instrumentos de recolección……………….…………..………….…………...56 15.2.- Carta de consentimiento informado………...…………..…………….....…..66 15.3.- Glosario…………………………….……………..………………………………...69 15.4.- Oficios……….……………………………………….……….……………………..73 ÍNDICE DE FIGURAS Figura 1. Clasificación del Cáncer Cervicouterino (CaCu)……….................……..…...5 Figura 2. Factores de Riesgo para CaCu……………….…………………........…………….6 Figura 3. Fases del Sistema Renina Angiotensina (SRA)…………………..…………….10 Figura 4. Efecto de AT-1 (receptor 1 de la angiotensina II)…………..……..………..…11 Figura 5. Estructura del gen que codifica al PAI-1……………………..……..………….13 Figura 6. Estructura del gen de VEGF…………………………………………..…………..14 Figura 7.- Diagrama de flujo de prueba piloto………………………………….……...…..24 Figura 8. Diagrama de flujo…………………………………...…………….……..……...…..25 Figura 9. Geles de poliacrilamida que representan ambos polimorfismos............…26 Figura 10. Muestras de ambos grupos…………….…………….…………………..………26 Figura 11. Frecuencias genéticas polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G……………...…..34 Figura 12. Frecuencias genéticas polimorfismo VEGF C936T………………….……...37 Figura 13. Ejemplo de amplificado……………………...……….………………….…….….62 Figura 14. Oficio del Comité de Ética. HRU Colima……………….…………………..….73 Figura 15. Oficio de Aprobación. Lab. de Anatomía Patológica……….………...……..74 Figura 16. Oficio de Aprobación. Centro Estatal de Cancerología……….………....…75 ÍNDICE DE TABLAS Tabla 1. Variables…………...……………………..………………….………………………….21 Tablas 2.1 a 2.9. Estadística descriptiva variables clínicas controles……....…29 - 31 Tablas 3.1 a 3.4. Estadística descriptiva variables clínicas casos……...……….32 - 33 Tabla 4. Frecuencias genéticas polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G……..……………….33 Tabla 5. Tabla de 2X2 para el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G……..…………………35 Tabla 6. Frecuencias genotípicas de PAI-1 -675 4G/5G en otras poblaciones……..36 Tabla 7. Frecuencias genéticas polimorfismo VEGF C936T…………………...........…36 Tabla 8. Tabla de 2X2 para el polimorfismo VEGF C936T.…………………...……...…38 Tabla 9. Frecuencias del polimorfismo VEGF C936T en dos poblaciones………...…38 Tabla 10. Frecuencias génicas de VEGF C936T en dos grupos…….…………..…...…39 Tabla 11. Frecuencias haplotípicas en controles y casos……………….……………….40 Tabla 12. Frecuencias observadas y esperadas de los haplotipos………….….…..….40 ABREVIATURAS 1.-CaCu. Cáncer cérvicouterino 2.- SRA. Sistema renina angiotensina 3.- NIC. Neoplasia Intraepitelial Cervical 4.- VPH. Virus del Papiloma Humano 5.-PAI-1. Inhibidor del Activador del Plasminógeno 1 6.-VEGF. Factor de Crecimiento Endotelial Vascular. 1.- RESUMEN Ramos Flores HC, Baltazar Rodríguez LM, Valdez Velázquez LL. INTRODUCCIÓN: El cáncer cervicouterino (CaCu) representa un problema de salud pública. La angiotensina II está involucrada en cáncer al fomentar la expresión del PAI-1 y del VEGF. OBJETIVO: Investigar la asociación de los polimorfismos -675 4G/5G del gen de PAI-1 y C936T del gen de VEGF en tejido cervical con cáncer cervicouterino y normal. MATERIAL Y MÉTODOS: Casos y controles: 100 mujeres sanas y 100 pacientes con CaCu, determinándose el perfil génico por PCR-SSP. RESULTADOS: PAI-1 -675 4G/5G: Riesgo (OR) = 1.66: IC 0.90-3.07. VEGF C9356T. No presentó significancia estadística (p<0.05). Análisis haplotipico: No presentó significancia estadística (p<0.05). CONCLUSIONES: No se encontró asociación entre el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G y el polimorfismo VEGF C936T con el CaCu en una población de Colima. 1|Página 2.- ABSTRACT HC Ramos Flores, Baltazar Rodriguez LM, Velazquez Valdez LL. INTRODUCTION: Cervical cancer (CaCu) is a public health problem. Angiotensin II is involved in cancer by promoting the expression of PAI-1 and VEGF. OBJECTIVE: To investigate the association of the -675 4G/5G polymorphism of PAI-1 gene and VEGF gene C936T in cervical tissue with cervical cancer and normal. MATERIAL AND METHODS: Cases and controls: 100 healthy women and 100 patients with uterine cervical cancer, determining the genetic profile by PCR-SSP. RESULTS: PAI-1 -675 4G/5G: Risk (OR) = 1.66, CI 0.90-3.07. VEGF C9356T. Not statistically significant (p <0.05). Haplotype analysis: not statistically significant (p <0.05). CONCLUSIONS: No association between polymorphism PAI-1 -675 4G/5G and VEGF C936T polymorphism with uterine cervical cancer in a population of Colima. 2|Página 3.- INTRODUCCIÓN El cáncer es un trastorno caracterizado por la proliferación celular descontrolada debida a alteraciones en los genes relacionados con el ciclo celular, ocurriendo tres procesos: inmortalización, transformación y metástasis; esta enfermedad se encuentra entre las tres primeras causas de muerte en la población mundial (Frías y cols., 2005). El cáncer cervicouterino (CaCu) es una mutación celular de la unión escamo columnar en el epitelio del cuello uterino, la cual inicia como una lesión (displasia) que puede ser leve, moderada o severa, y evoluciona a carcinoma in situ y posteriormente a cáncer invasor (Rodríguez y cols., 2006). El CaCu es la segunda causa de muerte en la mujer en el mundo. El 80% de los casos (500,000) corresponde a países en vías de desarrollo. La tasa de defunción ajustada por edad en los Estados Unidos es de 2.4 por 100,000 habitantes comparada con 14.0 por 100,000 habitantes en México (Castellanos, 2006). En Colima, se registraron 49 casos de CaCu en el 2007. En cuanto a las defunciones, se tuvo un registro de 32. (www.salud.col.gob.mx 2007). En el 2008, Colima presentó 17 casos en el rango de edad 25 a 44 años, 8 de 45 a 49, 6 de 50 a 59, 6 de 65 y más, para un total de 37 casos. A nivel nacional, en el 2008 se reportaron 7628 casos nuevos de esta patología. (www.cenave.gob.mx 2010). Existen algunos marcadores polimórficos vinculados en la ruta metabólica del sistema renina angiotensina (SRA) que han sido asociados a cánceres orales, colon, mama, entre otros. En el cáncer cervicouterino hay un solo reporte acerca de la relación mencionada, este estudio es con relación a la expresión génica (Liao y cols., 2007). Esto es un motivo para abundar en el conocimiento genético del papel que juega el sistema renina angiotensina en la fisiopatología del cáncer cervicouterino. 3|Página 4.- MARCO TEÓRICO 4.1.- CONSIDERACIONES GENERALES La mucosa ectocervical está constituida por un epitelio plano, escamoso, estratificado, no queratinizado que presenta una maduración ininterrumpida desde las células basales a las más maduras y diferenciadas de la superficie. La adquisición de un fenotipo invasivo que permite la diseminación de células cancerosas representa hoy en día una de las principales causas de mortalidad en los pacientes oncológicos (Tapia y cols., 1999). La capacidad metastásica del tumor es el principal problema para su erradicación, y se asocia al 90% de las muertes por cáncer (Frías y cols., 2005). 4.2.- CÁNCER CERVICOUTERINO. PERFIL Y DIAGNÓSTICO. El cáncer cervicouterino (CaCu) se manifiesta inicialmente a través de lesiones precursoras de lenta y progresiva evolución, producidas en etapas de displasia leve, moderada y severa; evolucionan a cáncer in situ, en grado variable, cuando ésta se circunscribe a la superficie epitelial, luego a microinvasor y posteriormente a invasor cuando el compromiso traspasa la membrana basal (Ministerio de Salud, Chile, 2004). MANIFESTACIONES CLÍNICAS. En el cáncer cervicouterino se presenta hemorragia uterina anormal, secreciones vaginales, dolor pélvico o abdominal. La lesión cervical puede ser visible a la inspección como tumor o ulceración. La citología vaginal suele ser positiva, y debe confirmarse con biopsia. La tomografía computarizada o la resonancia magnética de abdomen y de la pelvis examinados bajo anestesia son útiles para la determinación de etapas, que son descritas en la figura 1(Disaia y cols., 2002). 4|Página CLASIFICACIÓN Figura 1. Se muestran las etapas como se clasifica el CaCu (Disaia y cols., 2002). PERFIL DE RIESGO. Es la mujer con edad de 25 a 64 años, con vida sexual activa o antecedente de haber tenido vida sexual, que no se ha realizado estudios previos de citología cervical y presenta cuadros repetitivos de infecciones transmitidas sexualmente (NOM-014-SSA2-1994 CaCu). FACTORES DE RIESGO. En un estudio de casos y controles en participantes del Programa de Prevención y Control del Cáncer Cervicouterino en el estado de Zacatecas, se identificaron los factores de riesgo para dicha patología, encontrando: el número aumentado de gestaciones, de los partos, el inicio de las relaciones sexuales en edad temprana y el uso de anticonceptivos hormonales (Castañeda y cols., 1998) (ver figura 2). Además, el virus de papiloma humano (VPH) es un importante factor de riesgo en esta patología. El Dr. Harald Zur Hausen fue el primero en demostrar en 1975, por medio de experimentos de hibridación, que las verrugas genitales y los tejidos de cáncer de cérvix contienen genomas del virus del papiloma humano, de los subtipos 16 y 18 (López y cols., 2006). El riesgo de contraer un VPH genital está influenciado por la actividad sexual, por lo que el CaCu sigue un patrón típico de enfermedades transmitidas 5|Página sexualmente. Con respecto a la promiscuidad, hay una fuerte asociación entre el número de parejas que han tenido tanto la mujer como su compañero a lo largo de su vida y la adquisición del VPH y por consecuente, un riesgo considerable para padecer el cáncer en el cuello uterino (López y cols., 2006). Figura 2. Tabla donde se exponen los factores de riesgo vinculados (Intervenciones de enfermería para la prevención del cáncer cervicouterino, 2007). DIAGNÓSTICO: Se requiere la presencia de células de aspecto maligno en el estudio citológico, imágenes de apariencia maligna en la colposcopía y la confirmación por el estudio histopatológico (NOM-014-SSA2-1994 CaCu). El estudio citológico es descriptivo. Se informa de la siguiente manera: a.- Negativo a cáncer. b.- Negativo con proceso inflamatorio. c.- Displasia leve (NIC 1). d.- Displasia moderada (NIC 2). e.- Displasia grave (NIC 3). f.- Cáncer del cuello del útero in situ (NIC 3). g.- Cáncer microinvasor e invasor. h.- Adenocarcinoma. i.- Maligno no especificado. 6|Página Tomado de http://www.salud.gob.mx/unidades/cdi/nom/m014ssa24.html. NOM-014-SSA2-1994, Para la prevención, detección, diagnóstico, tratamiento, control y vigilancia epidemiológica del cáncer cérvico uterino. 4.3.- FACTORES GENÉTICOS RELACIONADOS CON CÁNCER El conocimiento sobre la genética del cáncer se ha expandido, con implicancias en la prevención, el estudio y el tratamiento de dicho trastorno. Definimos a una mutación como el cambio en la secuencia usual del ADN de un gen particular y puede tener efectos dañinos, beneficiosos o neutros; puede ser heredado como rasgo autosómico dominante, recesivo, ligado al sexo, o ser espontáneo. Las mutaciones comunes (polimorfismos) pueden favorecer a una predisposición al cáncer (Castillo, 2003). La historia familiar puede identificar personas con un riesgo aumentado de cáncer, en ellos pueden detectarse polimorfismos que influencian esta susceptibilidad mediante diversos mecanismos como cambios en la tasa de metabolización de procarcinógenos o catabolismo de carcinógenos, o efectos en la reparación del ADN o en la regulación de la división celular (Castillo, 2003). En algunos casos, exámenes de ADN pueden ser utilizados para confirmar una mutación específica como causa de este riesgo heredado y permiten determinar qué individuos portan la mutación (Castillo, 2003). 4.4.- POLIMORFISMOS Y SU ESTUDIO Un polimorfismo se caracteriza porque diferentes individuos presentan distintos nucleótidos en una posición concreta del genoma, que se denomina locus. A cada posible variante se le denomina alelo. Si se trata de un SNP, o polimorfismo de nucleótido simple, por sus siglas en inglés (es una variación en la secuencia de DNA que afecta a un solo nucleótido), normalmente serán 2 los posibles alelos en un locus: por ejemplo, el cambio de T por C (T > C). Si el locus corresponde a un cromosoma autosómico (del 1 al 22), cada individuo es portador de 2 alelos, uno en cada copia del cromosoma, que se heredan del padre y madre de manera independiente. La pareja de alelos observada en un individuo se denomina genotipo y, para el locus T > C del ejemplo, las 3 posibilidades de parejas de alelos son: TT, 7|Página TC y CC. Los individuos con los 2 alelos idénticos, sean TT o CC, se denominan homocigotos y los que tienen diferentes alelos (TC), heterocigotos. En general se considera variante al alelo menos frecuente, pero esto puede diferir de una población a otra (Iniesta y cols., 2005). La mayoría de los polimorfismos son del tipo SNP, y son consecuencia de variaciones en la secuencia de ADN que afectan a un solo nucleótido del genoma. Los SNP’s constituyen cerca del 90% de las variaciones genéticas humanas y para poder ser considerado un SNP, se debe dar la variación genética en al menos 1% de la población mundial. Estas mutaciones pueden tener como resultado un aumento ó disminución en la actividad proteínica, incluida la pérdida total de la actividad (Iniesta y cols., 2005). La descripción estadística de un polimorfismo consiste, en primer lugar, en estimar la prevalencia en la población de cada alelo y de cada genotipo posible, lo que en nomenclatura genética se denomina estimar las frecuencias alélicas y genotípicas, respectivamente. Las frecuencias genotípicas se estiman directamente calculando la proporción de individuos con cada genotipo. Para estimar las frecuencias alélicas simplemente se duplica la muestra tomando como unidad de observación el cromosoma (cada individuo contribuye con 2 cromosomas) y se calcula la proporción de cada alelo. Por ejemplo, si en una muestra de 200 individuos hay los siguientes genotipos: 110 TT, 75 TC y 15 CC. Las frecuencias genotípicas serán: 0.55 TT, 0.38 TC y 0.07 CC, las frecuencias alélicas serán: 0.74 T y 0.26 C. 0.74 = [110(2)+75)/(2002)] (Iniesta y cols., 2005). Con frecuencia son varios los polimorfismos que se analizan simultáneamente. En este caso, el desequilibrio de ligamiento es muy útil, pues permite localizar polimorfismos relacionados con la enfermedad. Si aparece una mutación que genera un polimorfismo responsable de la enfermedad, es posible que otros polimorfismos cercanos también estén asociados con ella. Para ello, se identifica el grupo de alelos que se transmiten conjuntamente en cada cromosoma, de esta manera sería más fácil identificar el polimorfismo causal. A este conjunto de alelos que se transmiten conjuntamente se le denomina 8|Página haplotipo. Un individuo, para un conjunto de loci cercanos, posee 2 haplotipos, cada uno en un cromosoma (Iniesta y cols., 2005). Los polimorfismos pueden ser provocados por diversos mecanismos como: mutaciones puntuales, eliminación de bases simples, adición de bases simples, rearreglo de genes y eliminación del gen completo. 4.5.- POLIMORFISMOS RELACIONADOS A CaCu Y CON EL SISTEMA RENINA ANGIOTENSINA En investigaciones actuales, se ha mencionado el riesgo entre ser portador de algún polimorfismo y el cáncer cervicouterino (Suárez y cols., 2002). Cabe destacar que dentro de los marcadores moleculares del sistema conocido como renina angiotensina (SRA), relacionados a cáncer cervicouterino, solamente existe una publicación al respecto (Liao y cols., 2007). Definimos al SRA como una cascada proteolítica, en el que la renina escinde la angiotensina I (AGTI) del angiotensinógeno. El AGTI es transformado a angiotensina II (AGTII) por la enzima convertidora de angiotensina (ECA) (ver figura no. 1). La AGTII actúa uniéndose a los receptores de AGTII tipo 1, 2 y 4 (AT1, AT2, AT4) (Oparil y cols., 2004). Muchos tejidos, como vasos sanguíneos, riñón, corazón y cerebro son capaces de generar en forma local AGTII a través de vías alternas a la ECA (Barrios y cols., 2002) (ver figura 3). 9|Página Figura 3. Fases del Sistema Renina Angiotensina (SRA) (Santeliz y cols., 2008). 4.6.- RECEPTOR 1 DE LA ANGIOTENSINA II (AGTR1 Ó AT-1) Es un receptor acoplado a proteína G. Su gen está ubicado en el brazo largo del cromosoma 3 en 3q21-q25, es largo (45 kilobases), y contiene 5 exones. Este receptor se localiza en las glándulas suprarrenales, el músculo liso vascular, el riñón y el corazón. La estimulación del receptor AT-1 por la AGTII fomenta la vasoconstricción y la contracción muscular e induce la expresión de otros factores, como el inhibidor del activador del plasminógeno tipo 1 (PAI-1), al aumentar la transcripción del ácido ribonucleico mensajero (RNAm) del PAI-1, e induce la expresión del ARNm del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), entre otros (Santeliz y cols., 2008). (ver figura 4). 10 | P á g i n a ANGIOTENSINA II AT - 4 AT - 1 Expresión del PAI -1 Factor de Crecimiento Endotelial Vascular (VEGF) Inhibición del sistema fibrinolítico Aumenta la expresión del COX - 2 Angiogénesis Remodelamiento vascular Tromboxano A2 Prostaglandinas Figura 4. Efecto de AT-1 (receptor 1 de la angiotensina II) y AT-4 en la remodelación vascular, la respuesta inflamatoria y fibrinolítica (Santeliz y cols., 2008). Se ha considerado que la angiotensina II podría estar involucrada en la regulación de la angiogénesis del tumor en algunos cánceres, como en el de mama, el carcinoma de ovario, vía el AT-1, al activarlo en su unión (Herr y cols., 2008; Ino y cols.,2006). Por ello, la terapia de bloqueo de este receptor se ha empezado a considerar una estrategia prometedora en el tratamiento de los trastornos oncológicos. Se ha estudiado la expresión del receptor AT1 de AGTII en tejido y líneas celulares de carcinoma cervical escamoso, encontrándose que la AGTII está involucrada en su progresión, aumentando la actividad de la proliferación de células cancerosas y causando un aumento de la angiogénesis en tumores (Liao y cols., 2007). 4.7.- FACTORES RELACIONADOS (PAI-1 y VEGF) Dentro de este sistema, se han estudiado factores relacionados a algunos tipos de cáncer, entre ellos el inhibidor del activador del plasminógeno tipo 1 (PAI-1) y el 11 | P á g i n a factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) y las posibles implicaciones de ciertos polimorfismos. En el caso del PAI-1, una de estas mutaciones (-675 4G/5G) eleva los niveles séricos de esta proteína (Eroglu y cols., 2006), sobreexpresándose. En el caso del VEGF, otra de estas variantes (C936T) comprobó estar relacionada, al encontrar los niveles séricos elevados en pacientes con patología inflamatoria (Kamoun y cols., 2008), al haber esta elevación incrementaría también su expresión en el organismo. Esto se efectúa tras la activación del receptor 1 de la angiotensina II (AGTR1 ó AT-1). Se ha fundamentado que algunos elementos de este sistema fomentan el desarrollo de células cancerosas mediante ciertos mecanismos proliferativos. 4.8.- INHIBIDOR DEL ACTIVADOR DEL PLASMINÓGENO (PAI-1) El gen del PAI-1 se localiza en la región q21.3-q22 del cromosoma 7, con 9 exones y 8 intrones. El PAI- 1 es un factor que bloquea la activación del plasminógeno a plasmina. Ésta se produce por acción de los activadores del plasminógeno (t-PA, urokinasa), inhibiendo la fibrinólisis, o disolución de coágulos sanguíneos. Altos niveles de PAI-1 se han asociado con un mal pronóstico en pacientes con cáncer (Almholt y cols., 2003). PAI-1 Y CÁNCER. El incremento en la expresión del PAI-1 en pacientes con cáncer está asociado con un resultado desfavorable, la razón de esta paradoja no está bien comprendida (Laug y cols., 2001). Previamente se han reportado niveles elevados de PAI-1 en algunos tipos de tumores primarios avanzados (neuroblastomas). Se ha demostrado que el PAI-1 es expresado junto con el marcador angiogénico avB3, presente en los vasos sanguíneos de los tumores citados, sugiriendo que PAI-1 desempeña un papel en la angiogénesis patológica (Laug y cols., 2001). Para este factor, uno de los polimorfismos estudiados ha sido el PAI-1 -675 4G/5G, ubicado en la región promotora del gen que lo codifica (ver figura 5), se ha sugerido que podría ser un factor que ayude a determinar el pronóstico clínico de los pacientes con cáncer de mama en población caucásica (Lei y cols., 2008). Incluso, se sugiere que este polimorfismo puede contribuir a una predisposición etiopatogénica para el desarrollo de este cáncer en población asiática (Eroglu y cols., 2006). 12 | P á g i n a En el cáncer oral, se ha analizado el PAI-1 -675 4G/5G, sugiriendo además que el alelo 4G, eleva la expresión de PAI-1 y por consiguiente los niveles séricos de la proteína, es un factor contribuyente en etapas tempranas de dicha carcinogénesis (Vairaktaris y cols., 2006). Un estudio referente al cáncer colorectal, consideró al PAI-1, relacionado a otro polimorfismo (1334G/A). Los resultados sostienen que dicho polimorfismo puede estar asociado con la incidencia de cáncer colorectal en población asiática (Smolarz y cols., 2003). Además, el polimorfismo -675 4G/5G en el promotor del gen fue determinado en población mestiza y étnica del Occidente de México, La frecuencia alélica reportada en literatura previa es de 33.4% para el alelo 4G (el cual es el asociado al factor de riesgo), siendo la primera investigación en su tipo realizada en México, la cual dio pie a posteriores estudios de asociación que determinen el impacto de este polimorfismo (Nuño y cols., 2004). Figura 5. Estructura del gen que codifica al PAI-1, y sitio del polimorfismo (Bosma y cols., 1998) 4.9.- FACTOR DE CRECIMIENTO ENDOTELIAL VASCULAR (VEGF) Es una glucoproteína homodimérica de 34-46 kiloDaltons (kDa). Su gen está localizado en el cromosoma 6p21.3 y está organizado en 8 exones, separado por 7 intrones. Este factor actúa sobre las células endoteliales vasculares, contribuyendo a su vez a la inducción de la angiogénesis por diversos mecanismos (Ferrara y cols., 2003): Crecimiento, proliferación y migración de células endoteliales vasculares. Supervivencia de células endoteliales inmaduras (prevención de la apoptosis). Aumento de la permeabilidad vascular de los capilares VEGF Y CÁNCER. En el caso del cáncer, se sabe que la sobreexpresión del VEGF por las células tumorales estimula la angiogénesis que permite que el tumor 13 | P á g i n a reciba nutrientes y se disemine escapando a los mecanismos de control del organismo (Ferrara y cols., 2003). Conviene enfatizar que la angiotensina II puede inducir la secreción de VEGF por la unión con el AGTR1, y causar el aumento de la vascularización tumoral (Liao y cols., 2007). Para el gen VEGF, uno de los polimorfismos estudiado es el C936T, ubicado en la región 3´ no traducida (3´-UTR) del gen de VEGF (ver figura 6). Chae y cols., reportó en el 2008 que dicho polimorfismo puede estar asociado a la susceptibilidad para padecer cáncer colorrectal. En otro estudio realizado en el mismo año por Lurge y cols. en población asiática, reporta que el polimorfismo C936T está relacionado con una recurrencia del tumor en cáncer colorectal, por lo tanto sugieren que el análisis de los genes relacionados con estos polimorfismos puede ayudar a identificar grupos de pacientes con alto riesgo de recurrencia del tumor. Se ha sugerido además que el polimorfismo C936T puede ser determinante genéticamente para cáncer de colon, en personas coreanas (Bae y cols., 2008), y en un estudio Taiwanés, se sugirió que el alelo C936T está asociado con una invasión de tipo vascular, sobre-expresando al VEGF, en carcinoma oral de células escamosas (Cheng y cols., 2008). Este polimorfismo (C936T del VEGF) tiene una frecuencia 16% (Kim y cols., 2003) en población sana, dato documentado en un estudio realizado en población asiática. El alelo considerado como factor de riesgo es el T. Figura 6. Estructura del gen de VEGF, el cual muestra el sitio del polimorfismo C936T (Kim S y cols., 2008) 14 | P á g i n a 4.10.- CONOCIMIENTO ACTUAL REFERENTE De acuerdo a la revisión de la literatura, el concepto fisiopatológico de los polimorfismos con el desarrollo del cáncer, está basado en la angiogénesis tumoral por el incremento en sus expresiones. Si bien los mecanismos precisos y puntuales son inciertos, los estudios que aquí se han mostrado avalan a estos polimorfismos ya sea como marcadores pronósticos de la enfermedad, o bien asociados directamente a ella, es decir, riesgo establecido al cáncer. Lo que es necesario puntualizar, es que con respecto a lo expuesto, no se ha descrito hasta el momento una relación directa entre la presencia de estos polimorfismos y el desarrollo del cáncer cervicouterino, especialmente en nuestra población. 15 | P á g i n a 5.- JUSTIFICACIÓN El cáncer cervicouterino representa un problema de salud pública. Dicho cáncer se encuentra dentro de los primeros lugares de morbimortalidad nacional e internacional (Greenlee y cols., 2001). Existe un trabajo previo del 2007, que asocia este cáncer con la expresión del receptor a la angiotensina II (Liao y cols., 2007), que refleja la progresión del mismo. En relación con el cáncer cervicouterino, Santeliz y cols., 2008, nos señalan algo interesante, basado en numerosos trabajos (Watanabe y cols., 2005, Tamarat y cols., 2002, Page y cols., 1997, Nishimura y cols., 1997), que el receptor a la angiotensina II aumenta la expresión del inhibidor del activador del plasminógeno tipo 1 (PAI-1), al aumentar su transcripción del ARN mensajero, y aumenta además la expresión del factor de crecimiento endotelial vascular (VEFG, factor implicado en la angiogénesis). Se ha estudiado la contribución del sistema renina angiotensina en la producción de factores que fomentan la proliferación de las células tumorales de diversos cánceres, mediante diversos mecanismos, como la angiogénesis de los tumores. Dichos cánceres son el de mama, próstata, colon, ovárico, entre otros (en población caucásica y asiática: Akihiko y cols., 2002; Almholt y cols., 2003; Bae y cols., 2008; Chae y cols., 2008). Sin embargo, en cáncer cervicouterino los estudios están en sus inicios, siendo una investigación realizada, ya mencionada en el trabajo (Liao y cols., 2007), y fue desarrollada en población asiática, de características genéticas más homogéneas, diferente al de la raza mestiza. Éste es un término que se aplica a toda persona que comparte las ascendencias europea y amerindia, sean cualquiera las proporciones de éstas, es característico de México (González y cols., 2000). Por ende, se dificulta la aplicabilidad total de dicha investigación, por la genética de poblaciones, debido a que la frecuencia de un determinado polimorfismo suele variar en las diferentes razas humanas (Kim y cols., 2003). No existen investigaciones sistemáticas en México acerca de estudios de frecuencias de polimorfismos, propios de la población de nuestro país. El conocer con certeza la frecuencia de los polimorfismos propuestos en el trabajo, permitirá hacer estudios exactos (si son frecuentes), en la búsqueda de asociaciones con 16 | P á g i n a diversas patologías, aportando mayor información de las rutas moleculares de la carcinogénesis. Lo que se pretende demostrar con esta investigación es que, si se encontrara elevada la frecuencia de los polimorfismos en el tejido con cáncer, se podría establecer una asociación entre el ser portador de dicho polimorfismo, y padecer el cáncer cervicouterino, en términos de una susceptibilidad a dicha malignidad. El presente trabajo posee una importancia real al tener como objetivo pacientes del Occidente de México. Recientemente se ha reportado la diversidad genómica en las poblaciones mestizas mexicanas, por lo tanto, los hallazgos genéticos pueden variar de una población a otra (Silva y cols., 2009). Por último, se acentúa que los resultados de este estudio se aplicarían al encontrar un polimorfismo genético o combinaciones de estos polimorfismos más frecuentes en este trastorno, apoyando en la prevención, diagnóstico y pronóstico del cáncer cervicouterino. 17 | P á g i n a 6.- PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA En este trabajo nos planteamos determinar la posible asociación de los marcadores polimórficos de genes implicados o relacionados funcionalmente en la ruta molecular del sistema renina angiotensina, en el cáncer cervicouterino. 6.1.- PREGUNTA DE INVESTIGACION ¿Existe asociación de los polimorfismos -675 4G/5G del gen de PAI-1 y C936T del gen de VEGF en la proliferación del cáncer cervicouterino? 7.- OBJETIVOS GENERAL ∎Investigar la asociación de los marcadores polimórficos de PAI-1 -675 4G/5G y VEGF C936T, relacionados en la ruta molecular del SRA en muestras de tejido con cáncer cervicouterino y tejido negativo a cáncer. ESPECÍFICOS ∎Determinar el perfil génico: frecuencias alélicas, frecuencias genotípicas, frecuencias fenotípicas y las frecuencias haplotípicas de los marcadores polimórficos -675 4G/5G del gen de PAI-1 y C936T del gen de VEGF en tejido con cáncer cervicouterino y tejido normal. ∎Realizar las comparaciones del perfil génico y determinar la razón de momios donde se haya encontrado diferencia estadísticamente significativa (p<0.05). ∎Evaluar la interacción entre genes relacionados al sistema renina angiotensina, mediante la estimación de frecuencias haplotípicas bilocus y su significancia. ∎Estimar el desequilibrio de ligamiento entre los marcadores estudiados en cáncer cervicouterino y población control. 18 | P á g i n a 8.- HIPÓTESIS HIPÓTESIS CIENTÍFICA Se conoce que el inhibidor del activador del plasminógeno tipo 1 (PAI-1), y el factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) participan en la ruta molecular del sistema renina angiotensina (Santeliz y cols., 2008). Posiblemente, dos de los polimorfismos reportados en sus genes (-675 4G/5G del gen de PAI-1, y el C936T del gen de VEGF) estén asociados en cáncer cervicouterino. Además, se ha reportado que en mujeres asiáticas con cáncer cervicouterino, la angiotensina II está involucrada en la progresión de esta patología (Liao y cols., 2007), y se conoce que esta proteína participa en la regulación de la expresión de los factores PAI-1 y VEGF (Santeliz y cols., 2008), por lo tanto, por lo tanto nuestra hipótesis plantea que los dos polimorfismos estudiados en este trabajo estén en asociación al cáncer cervicouterino. HIPÓTESIS ALTERNA Los marcadores polimórficos -675 4G/5G del gen de PAI-1 y C936T del gen de VEGF, los cuales participan en la ruta molecular del sistema renina angiotensina, están asociados con cáncer cervicouterino. HIPÓTESIS NULA Los marcadores polimórficos -675 4G/5G del gen de PAI-1 y C936T del gen de VEGF, los cuales participan en la ruta molecular del sistema renina angiotensina, no están asociados con cáncer cervicouterino. 19 | P á g i n a 9.- MATERIAL Y MÉTODOS 9.1.- TIPO DE ESTUDIO E INVESTIGACIÓN El tipo de estudio: Casos y controles. 9.2.- SELECCIÓN DE LA MUESTRA Universo de estudio: Constituido por dos grupos: Grupo control: Criterios de selección: Inclusión: Muestras de citología cervical de mujeres residentes del Estado de Colima que acudieron a los Departamentos de Ginecología de unidades del sector salud, voluntarias sanas con citología cervical previa negativa a cualquier displasia o malignidad (Anexo 2, apartados 15.2 y 15.4). Exclusión: Muestras de citología cervical de pacientes con alguna patología cervical. Eliminación: ADN insuficiente en calidad y cantidad (Anexo 3). Grupo de casos: Criterios de selección: Inclusión: Muestras de bloques de parafina del Departamento de Anatomía Patológica del Hospital Regional Universitario (HRU) enviadas desde 2007, con diagnóstico de CaCu, incluido el estadio de Neoplasia Intraepitelial Cervical (NIC) Grado III (Apartado 15.4). Exclusión: Muestras de los bloques de parafina con otra patología. Eliminación: ADN insuficiente en cantidad y calidad (Anexo3). 9.3.- VARIABLES Y ESCALAS DE MEDICIÓN Independiente: Presencia de cáncer y no cáncer cervicouterino. Clasificación de la variable; escala de medición: Cualitativa, nominal, dicotómica. Definición conceptual: Ausencia de cáncer fue representado por el resultado de una citología cervical previa negativa a cualquier displasia o malignidad. Cáncer fue representado por la presencia de células de la zona de transformación del cérvix, que indiquen malignidad, confirmado por el estudio histopatológico. 20 | P á g i n a Definición operacional: Para los controles: mujer con reporte negativo a cáncer o a displasia. Para los casos: Mujer con diagnóstico histopatológico de cáncer cérvico-uterino (incluyendo el estadio NIC 3 in situ, el carcinoma está ubicado en el epitelio cervical, en algunos casos incluyendo todo el grosor del revestimiento cervical), microinvasor o invasor. Dependiente: Genotipos (dos variables dependientes, una para cada polimorfismo): categórica politómica (3 valores), (dos homocigotos y un heterocigoto). PAI – 1 VEGF Variable dependiente Variable dependiente 4G / 4G T/T 4G / 5G T/C 5G / 5G (Festa y cols., 2003) C / C (Kim y cols., 2003) Tabla 1. Variables. Los alelos en negrita indican el alelo que está asociado a la enfermedad (es el polimorfismo) Clasificación de la variable; escala de medición: Cualitativa, nominal. Definición Conceptual: Genotipo: El código genético heredado de un organismo para un rasgo específico. Puede ser homocigoto o bien heterocigoto (Iniesta y cols., 2005). Definición operacional: Se realizó la determinación de los marcadores polimórficos, y se agrupó en el genotipo que resultara. Son tres las opciones (1 heterocigoto y 2 homocigotos). El polimorfismo lo identificamos de la siguiente manera: en PAI-1 -675 4G/5G, las muestras que tuvieron el alelo 4G, presentaron el polimorfismo. Si son heterocigotos, tuvieron 1 alelo que es el polimorfismo: 4G/5G. Si son homocigotos, tuvieron 2 alelos que son el polimorfismo: 4G/4G. Ambas muestras se incluyeron en la asociación, pero una con el 50% de genotipo y la otra con el 100%. Para el VEGF C936T, el alelo que es el polimorfismo es el T. El análisis equivalente que es correcto en estudios de polimorfismos es el modelo aditivo de genotipos (Iniesta y cols., 2005). 21 | P á g i n a TAMAÑO MUESTRAL Para este estudio, el tamaño de muestra fue reservado al resultado del estudio piloto que fue realizado para determinar la frecuencia de los polimorfismos en ambas poblaciones y realizar la comparación correspondiente. Dicho estudio comprende 100 casos, es decir, se analizaron 100 muestras, por cada marcador, y así se estableció el tamaño muestral. Este análisis fue realizado con el programa Epi Info Version 6 Statcalc, con base en la frecuencia del polimorfismo en población sana: 1. Frecuencia del polimorfismo -675 4G/5G del PAI-1: 18% (Dato de nuestros resultados). 2. Frecuencia del polimorfismo C936T del VEGF: 30% (Dato de nuestros resultados) De esta manera, se obtuvo el valor que hace falta para poder determinar el tamaño, pues ya se contaba con los demás datos (Pértegas y cols., 2001): Confianza: 95%. α=0.05. (1- α) Poder: 80%. β=0.2. (1- β) Relación entre pacientes sanos y enfermos: 1: 1 Frecuencia de exposición en el grupo de sanos: 18% y 16%. p2= 0.18 (PAI-1 675 4G/5G) y p2=0.30 (VEGF C936T) Odds Ratio (OR) = w: la cual se desconoce, el programa solicita su valor o bien el de la frecuencia en enfermos, que es el que se obtuvo. o Frecuencia de exposición entre los casos: Es la que fue obtenida (22.5%, 38.5%) (p1). o La frecuencia de la exposición en los controles p2, ya es conocida. Ambas frecuencias fueron necesarias para obtener el valor de p. (Anexo 6) EXPLICACIÓN DEL TAMAÑO DE LA MUESTRA El argumento en el cual nos hemos basado para la determinación del tamaño de la muestra es el siguiente: la literatura reporta un número de 100 muestras para un estudio piloto (Riegelman y cols., 1999). De esta manera, tipificamos 100 muestras de ambos grupos, y las cotejamos, con base en la frecuencia de los alelos enfermos en controles y en casos. Si el polimorfismo es muy frecuente, el tamaño de la muestra disminuye, y viceversa. De acuerdo a lo que obtuvimos con el 22 | P á g i n a polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G, se cotejaron 18% vs 22.5%, y el resultado fue 99 muestras por grupo. Y con el polimorfismo VEGF C936T, se cotejaron 30% vs 38.5%, y el resultado fue de 61 muestras por grupo. Así, se pudo hacer la búsqueda de la asociación con pruebas 2 con las muestras que ya se tenían tipificadas. A pesar de superar el número mínimo requerido, se incluyeron las 100 muestras de cada grupo para su análisis. Si la frecuencia del alelo hubiera sido mayor (32, 35 % etc.), el tamaño solicitado hubiera disminuido, y viceversa. Este estudio, está realizado en una sola población, originaria del estado de Colima. La configuración genética en otras poblaciones de nuestro país pudiera no ser la misma que la que se obtuvo en esta investigación. 23 | P á g i n a 9.4.- METODOLOGÍA DIAGRAMA DE FLUJO PARA LA PUEBA PILOTO DE LOS CASOS CASOS (100) Desparafinación* Cuantificación Espectrofotométrica 260/280 nm Extracción de ADN Método de Fenol – Cloroformo (Anexo 3) Determinación de pureza e integridad Tipificación por PCR de los polimorfismos: PAI-1 (-675 4G/5G) y C936T (VEGF) por PCR SSP (alelo de secuencia específica). (Anexo 4) Electroforesis con gel de acrilamida al 6% Tinción con plata Interpretación y análisis estadístico de la frecuencia observada para poder hacer el cálculo del tamaño muestral Figura 7.- Diagrama de flujo de prueba piloto. *Jiménez y cols., 2007 Se procedió a tipificar las muestras del grupo controles, para realizar la comparación de las frecuencias con el dato de nuestra población y no de otra, resultando el diagrama de flujo final de la siguiente manera: 24 | P á g i n a DIAGRAMA DE FLUJO PARA EL TRABAJO CONTROLES (100) CASOS (100) Muestras celulares (negativas a cáncer) obtenidas con citocepillo. Muestras tisulares (bloques parafinados) positivas a cáncer. Se sometieron a desparafinación. Cuantificación Espectrofotométrica 260/280 nm Extracción de ADN Método de Fenol – Cloroformo. (Anexo 3) Determinación de pureza e integridad Tipificación por PCR de los polimorfismos: PAI-1 (-675 4G/5G) y C936T (VEGF) por PCR SSP (alelo de secuencia específica). (Anexo 4) Electroforesis con gel de acrilamida al 6% Tinción con plata Interpretación y análisis estadístico Figura 8. Diagrama de flujo. 25 | P á g i n a EJEMPLOS DE LOS CORRIMIENTOS ELECTROFORÉTICOS Figura 9. A la izquierda, se muestra un gel en poliacrilamida con 5 controles para el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G. Se aprecian ambos fragmentos (136 y 257 pb) en la muestra 1. Las muestras 2 al 5 no presentan el alelo 4G (asociado a la enfermedad). A la derecha: polimorfismo VEGF C936T. Carril 1 con marcador de 100 pares de bases. Carriles 2 y 4 muestras con fragmento control (1 banda: 257 pb). Muestras 5, 6 y 7 con alelo T (2 bandas: 141 y 257 pb). Muestras 3 y 8 son controles negativos. REPRESENTACIÓN GRÁFICA DEL MUESTREO Figura 10. Muestreo en ambos grupos 26 | P á g i n a En relación con las pacientes controles, se realizó el muestreo de 100 mujeres sanas con citología cervical previa negativa a cualquier displasia o malignidad, de las cuales se hizo la extracción de ADN correspondiente y una posterior dilución del mismo y almacenaje de la muestra madre en congelación a -80 grados centígrados. En relación con el grupo casos, se realizó un muestreo con 100 bloques de parafina, de las cuales se hizo el proceso de desparafinación correspondiente, y la posterior extracción de ADN del tejido. 9.5.- ANÁLISIS ESTADÍSTICO Se contrastó la hipótesis de asociación mediante el test de x2 con una tabla de contingencia. Para calcular la magnitud de la asociación en caso de presentarse se calculó la odds ratio. Las distribuciones alélicas fueron comparadas con el Equilibrio de HardyWeinberg mediante pruebas exactas y 2 (chi cuadrada). Las comparaciones entre distribuciones alélica, genotípicas y fenotípicas intergrupales (grupo, CaCu y control) se realizaron mediante pruebas 2 y exactas. El cálculo de Odds ratio (razón de momios) se realizó para ambos marcadores polimórficos una vez determinando el valor de p (significativa cuando fue menor a 0.05). El análisis haplotipico bilocus para ver interacción génica y el de desequilibrio de ligamiento, se realizó http://anthro.unige.ch/arlequin, mediante basado en el el programa método Arlequin. de algoritmo 3.1, de maximización de expectaciones (EM). Las comparaciones de los haplotipos se realizó mediante pruebas exactas y 2. El desequilibrio de ligamiento (DL) se estimó por par de loci. 27 | P á g i n a 10.- ASPECTOS ÉTICOS Para las muestras tisulares parafinadas, se procedió con la Reglamentación correspondiente del Hospital Regional Universitario (trámite de autorizaciones), así como del Departamento de Enseñanza y el Laboratorio de Anatomía Patológica para el empleo de los bloques parafinados. Para la toma de muestras del grupo control se trabajó con cada participante, sólo bajo su consentimiento informado, proporcionando la libertad para abandonar el estudio si así lo dispusiera, de conformidad con la Declaración de Helsinki, con la aceptación por parte del investigador de cumplir con las recomendaciones éticas, así como por el Reglamento para investigación en Materia de Salud de la Ley General de Salud, SSA. De acuerdo a todo lo anterior se clasificó como un estudio con riesgo mínimo. 28 | P á g i n a 11.- RESULTADOS Y DISCUSIÓN VARIABLES CLÍNICAS VINCULADAS AL CÁNCER CERVICOUTERINO EN AMBOS GRUPOS Las siguientes tablas (2.1 a 2.9), muestran la estadística descriptiva de las variables clínicas más importantes que presentaron las pacientes del grupo controles en el interrogatorio. Se exponen las frecuencias y el porcentaje acumulado: Tabla 2.1.- Media y desviación típica de las pacientes controles. Edad al Edad IVSA* tener el Menarca Menopausia # Cigarros Edad fumados inicio de al día fumar primer hijo Mujeres con la variable positiva Media Desviación estándar 100 100 88 100 15 16 16 37.00 18.97 20.31 12.88 47.67 3.19 25.63 14.41 5.29 5.23 1.88 4.30 2.25 12.29 Tabla 2.2. Número de parejas sexuales en su vida en pacientes controles. Número de parejas sexuales Frecuencia 0 2 1 57 2 20 3 13 4 4 5 1 6 1 Tabla 2.3. Antecedente familiar de CaCu en pacientes controles. Familiar Frecuencia Madre 6 Abuela materna 3 Tía materna 2 Otra 1 Otro tipo de cáncer 10 Ninguno 78 Total 100 29 | P á g i n a Tabla 2.4. Pacientes con padecimientos en grupo controles. Padecimientos Frecuencia Diabetes mellitus 2 1 Hiperlipidemia 2 Osteoartritis 1 Hipertensión arterial 5 Asma 1 Hipertensión y diabetes 2 Ninguna 88 Total 100 Tabla 2.5. Uso de anticonceptivos en grupo controles Método Frecuencia Hormonales 26 DIU 23 Condón 5 Quirúrgico 19 Ninguno 27 Total 100 Tabla 2.6. Enfermedades de transmisión sexual en grupo controles. Trastorno Frecuencia Candidiasis 2 Tricomoniasis 1 Gardnerella 1 Ninguna 96 Total 100 Tabla 2.7. Variable fuma en grupo controles. Frecuencia Si 16 No 84 Total 100 30 | P á g i n a Tabla 2.8. Número de cigarros fumados por día en grupo controles. Cigarros Frecuencia 1 4 2 2 3 5 4 2 5 2 10 1 Total 16 No fumadoras 84 Tabla 2.9. Fumadoras pasivas en grupo controles. Frecuencia Si 31 No 69 Total 100 DISCUSIÓN (DESCRIPCIÓN DE LAS TABLAS): Los resultados muestran que el grupo control si bien se encontraba en un riesgo por la presencia importante de las variables clínicas relacionadas con el cáncer, éstas no fueron tan incidentes. El inicio de vida sexual activa se promedió cercano a los 19 años. La mayoría de las pacientes presentaron una sola pareja sexual en toda su vida. Casi el 80% de las pacientes no han tenido familiares con CaCu. En ningún caso se tuvo una paciente infectada con el VPH, y sólo 16 pacientes presentaron el tabaquismo como hábito. En contraste, sólo 5 pacientes han empleado el condón como método anticonceptivo, y por ende, preventivo de infecciones. Las demás tablas complementan la información. A continuación se expone la estadística descriptiva de las variables clínicas (tablas 3.1 a 3.4) que presentaron las pacientes del grupo casos tras el diagnóstico de cáncer cervicouterino. Se muestran las frecuencias y el porcentaje acumulado: 31 | P á g i n a Tabla 3.1. Diagnóstico de cáncer en grupo casos. Frecuencia NIC 3 54 Carcinoma epidermoide invasor 43 Adenocarcinoma 3 Total 100 Tabla 3.2. Enfermedades asociadas en grupo casos. Frecuencia Ningún padecimiento agregado 94 VPH 6 Total 100 Tabla 3.3. Número de cápsulas en histopatología en grupo casos. Frecuencia 1 68 2 2 3 3 4 6 5 7 6 4 7 1 8 2 9 1 10 2 12 1 13 1 14 1 18 1 Total 100 32 | P á g i n a Tabla 3.4. Características del cáncer en grupo de casos. Frecuencia Extensión glandular 17 Sin extensión glandular 71 No queratinizante 6 No queratinizante con extensión glandular 5 Extensión vascular 1 Total 100 DISCUSIÓN (DESCRIPCIÓN DE LAS TABLAS): Los resultados muestran que el diagnóstico de cáncer predominante en el grupo de casos fue la neoplasia intracervical grado 3, con más de la mitad de las pacientes. En este grupo se presentaron 6 pacientes con el diagnóstico de VPH. En cuanto a variables de histopatología, la mayoría de los tejidos (68 muestras) se almacenaron en una sola cápsula, y se encontró la ausencia de extensión vascular como característica predominante en cáncer, con 71 muestras. Para enfatizar el análisis estadístico, una perspectiva fue realizar un análisis estratificado para descartar algún factor de confusión con estas variables posiblemente intervinientes. Sin embargo, como ninguna variable fue compartida en ambos grupos, fue prescindible su realización. RESULTADOS. POLIMORFISMO PAI-1 -675 4G/5G En el siguiente cuadro se exponen los resultados totales de los genotipos para este factor: Locus PAI-1 -675 4G/5G Grupo Genotipo Alelo 4G/4G 4G/5G 5G/5G Fenotipo 4G 5G 4G 5G 33 67 Controles 3 30 67 36 164 (N=100) (3%) (30%) (67%) (18%) (82%) Casos 0 45 55 45 155 (N=100) (0%) (45%) (55%) (22.5%) (33%) (67%) 45 55 (77.5%) (45%) (55%) Tabla 4. Frecuencias genéticas polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G. 33 | P á g i n a Se realizó la prueba del Equilibrio de Hardy Weinberg. Los hallazgos son los siguientes: n=100 (3;30;67). p = 1.0000… Chi cuadrada = 0.0264. Indica que nuestra población control no está en desequilibrio de ligamiento y puede ser comparada con la población de casos. Al realizar las comparaciones intergrupales estos fueron los resultados: 1.- Comparación de genotipos entre controles y casos: p = 0.015 2.- Comparación de frecuencias alélicas: p = 0.594 3.- Comparación de fenotipos: p = 0.102 En la siguiente gráfica se exponen las frecuencias genotípicas, alélicas y fenotípicas para este polimorfismo: Figura 11. Frecuencias genéticas polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G 34 | P á g i n a Se construyó el siguiente cuadro: Enfermedad + Polimorfismo + - 45 55 33 67 Tabla 5. Tabla de 2X2 para el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G. Resultados: Odds ratio de 1.66. (IC 0.90 – 3.07). DISCUSIÓN: ASOCIACIÓN DE GENOTIPOS DE PAI-1 CON CÁNCER Se tomó como referencia un estudio realizado en la ciudad de Guadalajara Jalisco, donde la frecuencia de este polimorfismo en población sana fue de 30% (Nuño y cols., 2004). Cabe destacar que nuestro hallazgo del 18% en este tipo de población fue menor al reportado en la referencia, a pesar de que ambos grupos de estudio son originarios del Occidente de México. En nuestra investigación no se encontró relación entre el polimorfismo -675 4G/5G y el cáncer cervicouterino en la población estudiada, de manera aislada. Sin embargo la literatura actual demuestra datos de interés. Se ha demostrado, que el PAI-1 es un factor que juega un papel en el cáncer por medio de la angiogénesis, ya que es coexpresado con marcadores angiogénicos de tipo integrinas. Este efecto se ha visto en neoplasias del sistema nervioso central (Isogai y cols., 2001) como el neuroblastoma. Ya se ha documentado el efecto sistémico que posee el polimorfismo -675 4G/5G: elevar los niveles séricos de la proteína PAI-1. (Eroglu y cols. 2006). Posiblemente, éste sea el mecanismo por el cual se le ha vinculado asociación con otros tipos de cáncer, como el de mama (Lei y cols., 2008), al estar incrementada su expresión y por tanto su vinculación angiogénica, que le permitiría al tumor su expansión. 35 | P á g i n a De hecho, el genotipo 5G, se le ha vinculado como factor de protección en diversos trastornos, como la diabetes mellitus postrasplante y la diabetes gestacional (Chang y cols., 2010) en población asiática. La influencia de este marcador está muy vinculada en la enfermedad de ovarios poliquísticos, mediante la hipofibrinólisis, siendo esto un factor de riesgo muy importante (Lin y cols., 2009). A continuación se exponen frecuencias genotípicas reportadas en otras poblaciones de este polimorfismo (Festa y cols., 2003): Caucásicos no hispanos 28% 47% 25% 4G/4G 4G/5G 5G/5G Hispanos 15% 47% 38% Negros 9% 39% 52% Tabla 6. Frecuencias genotípicas de PAI-1 -675 4G/5G en otras poblaciones. Los resultados contrastan bastante con los nuestros, ya que el genotipo 4G/4G fue encontrado con una frecuencia de 3%, y el genotipo 5G/5G, fue encontrado con una frecuencia de 67%. Esto podría deberse a la gran diversidad genética que caracteriza a nuestro país (Silva y cols., 2009). Por último, una posible hipótesis acerca de la no asociación en nuestro estudio, es el tipo de tejido que está originando el tumor. En el caso del cáncer cervicouterino, es de tipo epitelial, y la participación del polimorfismo ha sido reportada con mayor fuerza cuando el tumor proviene de tejido nervioso (Isogai y cols., 2001) o bien cuando está vinculado con el endotelio (Adamski y cols., 2009). Es evidente que será necesario realizar estudios prospectivos al respecto. RESULTADOS. POLIMORFISMO C936T DEL GEN DE VEGF: El siguiente cuadro muestra los genotipos para este factor: Locus Grupo Genotipo Alelo Fenotipo T/T C/T C/C T C T C Controles 11 39 50 61 139 50 50 VEGF (N=100) (11%) (30%) (70%) C936T Casos 21 77 123 (N=100) (21%) (39%) (50%) 35 44 (35%) (44%) (50%) (50%) 56 44 (38.5%) (61.5%) (56%) (44%) Tabla 7. Frecuencias genéticas polimorfismo VEGF C936T. 36 | P á g i n a Se realizó la prueba del Equilibrio de Hardy Weinberg. Los hallazgos son los siguientes: N=100 (11;39;50). p = 0.42. Chi cuadrada = 0.64. Indica que nuestra población control no está en desequilibrio de ligamiento y puede ser comparada con la población de casos. Al realizar las comparaciones intergrupales estos fueron los resultados: 1.- Comparación de genotipos entre controles y casos: p = 0.17 2.- Comparación de frecuencias alélicas: p = 0.13 3.- Comparación de fenotipos: p = 0.46 En la siguiente gráfica se exponen las frecuencias genotípicas, alélicas y fenotípicas para este polimorfismo: Figura 12. Frecuencias genéticas polimorfismo VEGF C936T 37 | P á g i n a Se construyó el siguiente cuadro: Enfermedad + Polimorfismo + - 56 50 44 50 Tabla 8. Tabla de 2X2 para el polimorfismo VEGF C936T. Resultados: Odds ratio de 1.27. (IC 0.70 – 2.31). ASOCIACIÓN DE GENOTIPOS DE VEGF CON CÁNCER: Se tomó como referencia un estudio realizado en población austriaca y asiática el cual muestra las siguientes frecuencias del polimorfismo: Población Austriacos Koreanos Individuos 123 207 Genotipo T/T 3.4% 3.9% Genotipo C/T 25.2% 28.5% GenotipoC/C 71.4% 67.6% Alelo C 84% 82% Alelo T 16% 18% Tabla 9. Frecuencias del polimorfismo VEGF C936T en dos poblaciones (Kim y cols., 2003). Cabe destacar que nuestro hallazgo del 30% en este tipo de población fue mayor al reportado en la referencia (en las dos poblaciones). Es un polimorfismo muy frecuente en mujeres del Occidente de México. En este estudio se encontró que no existe relación entre el polimorfismo C936T del VEGF y el cáncer cervicouterino, en la población estudiada. La posible asociación fue incluso menor al polimorfismo PAI-1 4G/5G. La literatura actual reporta información contrastante. Estas son las frecuencias de un estudio que lo asoció con el cáncer gástrico en población asiática: 38 | P á g i n a Genotipo Grupo Controles VEGF (N=229) C936T Casos (N=154) T/T C/T AleloT C/C 1.3% 24.9% 73.8% 13.8% 4.5% 37.7% 57.8% 23.4% Tabla 10. Frecuencias génicas de VEGF C936T en dos grupos (Bae y cols., 2008). Nuestro estudio reportó frecuencias más altas del polimorfismo: 30% para el grupo controles y 38.5% para el grupo casos, este último dato con una diferencia de más del 15% con respecto al estudio mencionado. Sin duda, es un contraste importante de dos poblaciones genéticamente diferentes: la mestiza de México y la asiática de Corea. Literatura reciente ubica al polimorfismo VEGF C936T como un factor de riesgo muy alto para padecer neoplasias de la glia en pacientes chinos ( Bao y cols., 2010). En esta población, ya se ha reportado el riesgo que implica este polimorfismo para el adenoma colorrectal, siendo este un posible tumor que antecede al cáncer colorrectal (Wu y cols., 2010). Paradójicamente, en el cáncer de mama se encuentran discrepancias. Debido a la trascendencia epidemiológica de este cáncer, se ha intentado asociar el polimorfismo C936T con dicha neoplasia, pero los hallazgos no lo encuentran asociado. Un estudio indica que el polimorfismo no afecta el riesgo de cáncer de mama en asiáticas (Yang y cols., 2010) y en un meta análisis de este año se concluyó lo mismo (Qiu y cols., 2010). En cáncer oral, ya se documentó su asociación en pacientes chinos (Xu y cols., 2010). En cuanto a enfermedades crónico – degenerativas, un estudio muy interesante, (Kim y cols., 2009) reportó que el C936T del gen VEGF puede ser un factor importante para determinar los niveles plasmáticos de dicho factor y que está relacionado con la retinopatía diabética. Al contrario de lo que se podría hipotetizar al analizar este dato, los niveles urinarios de VEGF no se asocian con los niveles plasmáticos de VEGF pero sí se asocian con la etapa de la nefropatía diabética. 39 | P á g i n a Esto refuerza los conocimientos que se tiene acerca de la repercusión sistémica del polimorfismo en el cáncer. Se sabe que este factor es sobreexpresado, y provee al tumor de los nutrientes necesarios, por medio de la angiogénesis (Ferrara y cols., 2003). En nuestro caso, no se encontró asociado al cáncer cérvicouterino. Podemos hipotetizar que las características de las células anaplásicas que surgen en la zona de transformación del cérvix uterino son morfológicamente diferentes a las de los otros tumores donde se ha asociado (como los gliomas, Bao y cols., 2010) y esto posiblemente sería un factor que interviniera en la no asociación. Sin embargo, los estudios prospectivos serán indispensables para aclarar estas afirmaciones. FRECUENCIAS HAPLOTÍPICAS Y DESQUILIBRIO DE LIGAMIENTO Se analizaron ambos polimorfismos en conjunto, mediante las frecuencias haplotípicas. Los resultados son los siguientes: CONTROLES (100) CASOS (100) HAPLOTIPOS -675G/936C 115 (57.5%) 108 (54%) -675G/936T 49 (24.5%) 47 (23.5%) -675A/936C 20 (10%) 16 (8%) -675A/936T 16 (8%) 29 (14.5%) Tabla 11. Frecuencias haplotípicas en controles y casos. Frecuencias Frecuencias X2 D’ p observadas esperadas CONTROLES N= 100 -675G/936C 115(57.5%) 110.7 -675G/936T 49(24.5%) 53.3 2.85 0.0911 0.17 -675A/936C 20(10%) 24.3 -675A/936T 16(8%) 11.7 CASOS N=100. -675G/936C 96.1 108(54%) -675G/936T 58.9 47(23.5%) 17.23 >0.001 0.42 -675A/936C 27.9 16(8%) -675A/936T 17.1 29(14.5%) Tabla 12. Frecuencias observadas y esperadas de los haplotipos. La comparación de los haplotipos Haplotipos entre ambos grupos fue no significativa. (p =0.22). D´= desequilibrio de ligamiento. 40 | P á g i n a ANÁLISIS DEL DESEQUILIBRIO DE LIGAMENTO Y DE LOS HAPLOTIPOS El desequilibrio de ligamiento (DL) es el fenómeno por el cual aquellos alelos que están suficientemente cercanos en el genoma (haplotipo) tienden a ser heredados juntos, y determinar su valor es de gran utilidad, pues permite localizar polimorfismos relacionados con una enfermedad en específico. Si aparece una mutación que genera un polimorfismo responsable de la enfermedad, es posible que otros polimorfismos cercanos estén asociados con ella a su vez. De ahí que estemos evaluando una interacción génica. El resultado se interpreta como interacción (es el valor D normalizado, y va desde -1 a +1, idéntico a una correlación lineal; la interacción es mayor mientras más cercanía haya hacia el 1) (Griffiths y cols., 2002). En este estudio, los dos sitios (PAI-1 y VEGF) están relacionados en su ruta metabólica. Sin embargo, no hubo evidencia de una posible interacción entre ellos, pues las proporciones de los distintos haplotipos entre pares de locus no se desviaron de las aquéllas predichas por ley mendeliana del surtido independiente para genes no ligados. Los valores observados y esperados dieron consistentemente diferencias no significativas. La combinación de los genes PAI-1/VEGF en el grupo de casos tiene el valor de DL más alto (42%, p>0.001). Es típico que en el grupo de casos el valor de DL sea diferente al de los controles, ya que se trata de una patología y puede estar distorsionando su valor (Valdez y cols., 2007). La literatura actual no reporta el análisis haplotípico de estos dos polimorfismos en alguna patología. Por ello se comparan y exponen los resultados de estudios donde se analizaron haplotipos de ambos genes de manera individual: PAI-1. Investigaciones recientes han tratado de vincular haplotipos del gen de PAI-1 (incluyendo el polimorfismo -675 4G/5G) a diversas patologías, entre ellas el infarto al miocardio, encontrando resultados contrastantes. En un estudio, no se encontró asociación en estas circunstancias en una población alemana (Koch y cols, 2010), donde estudiaron el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G junto con otros siete polimorfismos. Además, se ha reportado que diversos genotipos asociados con incremento en la expresión de PAI-1 (como en nuestro estudio, en su caso fueron el PAI4G/5G, PAI2846 y el PAI7343) se han asociado con una mayor susceptibilidad a neumonías en población geriátrica caucásica (Yende y cols, 2007). 41 | P á g i n a Paradójicamente, haplotipos relacionados a este marcador podrían ser benéficos en algunos trastornos (PAI-1 4G/5G y -844G/A), como el accidente cerebrovascular (Saidi y cols, 2007). El efecto protector del alelo 4G sugiere la participación del polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G en el ictus a través de un mecanismo no relacionado con la fibrinólisis, y esto es razonable. Si el inhibidor impide que se degraden coágulos sanguíneos, el haplotipo al encontrarse en una situación patológica podría permitir la degradación de dichos coágulos. Como se ha analizado, el alelo 4G se asocia con mayores niveles de PAI-1, pero un estudio no apoya una asociación de los polimorfismos del gen PAI (-675 4G/5G y otros seis polimorfismos del gen) con el riesgo de infarto de miocardio o accidente cerebrovascular (Ding y cols, 2006). En cuanto a estudios en población asiática, se ha demostrado que los haplotipos de este gen pueden interactuar con otras variables (-6754G/5G y A844G). Un análisis haplotípico indicó que los alelos A y el alelo 4G, ambos del PAI-1, pueden aumentar el riesgo de enfermedad coronaria entre los no fumadores en pacientes chinos (Su y cols, 2006). VEGF. Para este factor, los haplotipos involucrados con el polimorfismo C936T, se han vinculado significativamente con algunas patologías, como la nefropatía hipertensiva(C-2578A, G-1154A, C-460T y C936T), precisamente en pacientes hispanos (Yang y cols, 2010). Además, se han vinculado en cáncer colorrectal (C1498T y C936T), tanto de manera aislada como en los análisis haplotípicos (Wu y cols, 2010). Se ha visto relación de haplotipos de este gen (incluido el C936T) no sólo con enfermedades cancerícenas (cáncer gástrico con G+405C T-460C y C+936T, carcinoma hepatocelular con C-2578A C-1203T G-1190A A-1179T G-1154A C-634T C-7T y C+936T, y melanoma maligno con C-2578A, G-1154A, G+405C y C+936T (AlMoundhri y cols, 2009, Kong y cols, 2007, Howell y cols, 2002 respectivamente), sino también con otro tipo de trastornos como la atresia biliar (con A-2578C, G634C y C+936T) y la endometriosis (con A-2578C T-460C G+405C y C+936T) (Lee y cols, 2010; Zhao y cols, 2008, respectivamente), aunque es importante destacar, que en un estudio realizado en Japón, los haplotipos no incrementaron el riesgo de 42 | P á g i n a padecer carcinoma endometrial (C-460T, G+405C, y C+936T, Amano y cols, 2008). Sin embargo, ya se ha reportado su vinculación a enfermedades donde participa la atopia, como el asma (C+936T G-634C y -2549 -2567 deleción 18, Lachheb y cols, 2008). Su papel como factor protector se ha reportado en un menor número de investigaciones, destacando contra enfermedades como la artritis psoriásica (haplotipos de VEGF C936T, y polimorfismos de los genes del Factor de Crecimiento Epidérmico EGF, y de los Factores de Crecimiento Fibroblásticos 1 y 2, FGF1 y FGF2, Butt y cols, 2007). En nuestra investigación, no se encontró una interacción de estos haplotipos para el cáncer cervicouterino (p>0.05), con una D normalizada de .17 y .42 para controles y casos, respectivamente. Por lo tanto podemos afirmar que ambos polimorfismos no se asocian a dicho cáncer tanto en análisis genotípico como haplotípico (de manera aisalada y en conjunto). 43 | P á g i n a 12.- CONCLUSIONES 1. La frecuencia del alelo 4G fue mayor en mujeres con cáncer cervicouterino que en el grupo control. 2. No se corroboró la asociación entre el polimorfismo PAI-1 -675 4G/5G y el cáncer cérvicouterino. 3. Para el polimorfismo VEGF C936T, no se encontró asociación con cáncer cervicouterino. 4. El alelo 936T fue mucho más prevalente en nuestra investigación que en los estudios de referencia, esto en casos y en controles. 6. La concordancia de las proporciones haplotípicas bilocus indicó que los genes del PAI-1 y del VEGF estudiados segregan independientemente, por lo que no parece haber entre ellos interacción génica. 7. Los haplotipos en el grupo de casos presentan por sí mismos un leve desequilibrio de ligamiento con una alta significancia estadística. Esto debido a las diferencias para el haplotipo -675A/936T. Pero es un dato que puede esperarse por ser el grupo que presenta como variable de interés la patología en estudio. 13.- PERSPECTIVAS La investigación genética está en constante cambio. Los criterios de definición de polimorfismos se actualizan día con día. Con base en esta investigación, se recomienda realizar estudios prospectivos con un mayor número de pacientes y de controles, así como con otros polimorfismos ubicados en los genes que codifican las proteínas PAI-1 y el factor VEGF. 44 | P á g i n a 14.- REFERENCIAS - 1. Adamski MG, Turaj W, Slowik A, Wloch-Kopec D, Wolkow P, Szczudlik A. AG-4G haplotype of PAI-1 gene polymorphisms -844 G/A, HindIII G/C, and -675 4G/5G is associated with increased risk of ischemic stroke caused by small vessel disease. Acta Neurol Scand. 2009 Aug; 120(2):94-100. Epub 2008 Dec 22. - 2. Akihiko A, Kazunari S, Tomonori H, Lizhong W, Zhenhua L,.Single nucleotide polymorphism in the 3´untranslated region of vascular endothelial growth factor gene in japanese population with or without renal cell carcinoma. Tohoku J. Exp. Med. 2002; 198, 181-190. - 3. 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"Placas de tipificación de DNA Sistema Micro SSP™ 384" Página Web de la empresa de Productos de Tipificación de Ácido Desoxirribunicleico OneLambda. http://www.onelambda.com/pdffiles/productinserts/DNA_384_PI_ES.pdf. - 86. Intervenciones de enfermería para la prevención del cáncer cérvicouterino. Boletín de Información científica para el cuidado de enfermería. México. INSP. SSA. Junio 2007. 53 | P á g i n a SITIOS WEB UTILIZADOS EN EL TRABAJO DE TESIS: http://www.salud.col.gob.mx – http://www.wma.net/s/policy/b3.htm http://www.salud.gob.mx/unidades/cdi/nom/compi/rlgsmis.html. REGLAMENTO de la Ley General de Salud en Materia de Investigación para la Salud http://anthro.unige.ch/arlequin http://www.dicciomed.es/php/diccio.php http://www.glosario.net/ http://www.respyn.uanl.mx/especiales/2006/ee-052006/carteles/genetica_de_poblaciones.htm http://www.salud.gob.mx/unidades/cdi/nom/m014ssa24.html. NORMA OFICIAL MEXICANA NOM-014-SSA2-1994, PARA LA PREVENCIÓN, TRATAMIENTO Y CONTROL DE CÁNCER DEL CUELLO DEL ÚTERO Y DE LA MAMA EN LA ATENCIÓN PRIMARIA http://genome.csdb.cn/cgi-bin/hgPcr http://www.cenave.gob.mx http://www.salud.gob.mx/unidades/cdi/nom/168ssa18.html. NORMA OFICIAL MEXICANA NOM-168-SSA1-1998, DEL EXPEDIENTE CLINICO. 54 | P á g i n a 15.- ANEXOS 55 | P á g i n a 15.1.- INSTRUMENTOS DE RECOLECCIÓN (ANEXO 1) UNIVERSIDAD DE COLIMA. FACULTAD DE MEDICINA. MAESTRÍA EN CIENCIAS MÉDICAS ASOCIACIÓN DE POLIMORFISMOS DE GENES RELACIONADOS FUNCIONALMENTE EN LA RUTA MOLECULAR DEL SISTEMA RENINA ANGIOTENSINA, EN CÁNCER CERVICOUTERINO ENCUESTA. PACIENTE CASO: ______________ PACIENTE CONTROL: ____________ NOMBRE DEL ENCUESTADOR: ____________________________________________ FECHA: _________ I. NOMBRE DE LA PACIENTE: ______________________________________________ EDAD: _______ FACTORES DE RIESGO: 1.- ¿A QUE EDAD INICIÓ RELACIONES SEXUALES? ________ 2.- ¿CUÁNTAS PAREJAS SEXUALES HA TENIDO DURANTE TODA SU VIDA: ______ 3.- ¿CUÁNTAS PAREJAS SEXUALES HA TENIDO EL ÚLTIMO AÑO: _______ 4.- FUM _________ 5.- ANTECEDENTES OBSTÉTRICOS: G ___ P ___ A ____ C ___ EDAD PRIMER HIJO: ________ FUP _________ FUA ________ FUC _________ EDAD MENARCA: _______ EDAD MENOPAUSIA: _______ FUM _________ 6.- ¿PADECE ALGUNA ENFERMEDAD? ¿DESDE CUÁNDO?_________________________________ (HIPERTENSIÓN, DIABETES, HIPERTRIGLICERIDEMIA, PROBLEMAS TROMBÓTICOS ETC). 7.- EN CASO DE PADECERLA, ¿QUÉ TRATAMIENTO LLEVA A CABO?______________________ _________________________________________________________________________________________ 8.- ANTECEDENTES FAMILIARES CACU: 1) MADRE 2) ABUELA MATERNA 3) HERMANA 4) TÍA MATERNA 5) OTRA: _____ NO ( ) 9.- ¿SE HA REALIZADO CITOLOGÍAS ANTERIORES A ESTA? NO ( ) SI ( ) FUDOC ________ REPORTE: __________ ∎POLIMORFISMO -675 4G/5G DEL GEN DE PAI-1 _________________________________________ ∎POLIMORFISMO C936T DEL GEN DE VEGF _________________________________________ 56 | P á g i n a (ANEXO 2) TOMA DE LA MUESTRA. INSTRUMENTOS Y PROCEDIMIENTO 1. Espejo vaginal para toma de muestra de citología exfoliativa. 2. Citobrush 3. Guantes estériles de látex. 4. Bata. 5. Cubrebocas. 6. Mesa de exploración ginecológica con pierneras. 7. Bata para el paciente. Recolección de la muestra Con el previo consentimiento por escrito del paciente y una explicación del procedimiento, con total consideración de la Declaración de Helsinki, se procedió a realizar la toma de citología exfoliativa a la paciente, colocándola en posición ginecológica, empleando con cuidado el espejo vaginal sin lubricación. Al ubicar el orificio cervical, se inmovilizó el espejo con los tornillos auxiliares, y se procedió a emplear el citobrush, introduciéndolo en el orificio cervical, y retirándolo suavemente con un leve giro, procediendo a introducirlo dentro del tubo de 1.5 de PCR (reacción en cadena de la polimerasa) con 500 microlitros de la solución amortiguadora preservante de ADN*, se agitó vigorosamente, retirando el citobrush y tapando el tubo. Se guardaron en una hielera con 2 geles refrigerantes de 250 ml cada uno (proporcionan una temperatura de 2 a 8 grados centígrados por 6 - 8 horas). Se colocaron envueltos en una pequeña bolsa de plástico individual, en posición vertical, encima de los geles. Al final de la jornada se trasladaron las muestras al laboratorio para mantenerlos refrigerados. Se almacenaron por un tiempo aproximado de 24 meses, a una temperatura que oscila entre -6 y -12 grados centígrados, en el congelador del Laboratorio de Genética Molecular. *”Solución amortiguadora preservante de ADN”. Se prepara para 100 mililitros: 0.36 gramos de Na2HPO4. No. 53264 0.052 gramos de NaH2PO4 H2O 0.85 gramos de NaCl 57 | P á g i n a (ANEXO 3). EXTRACCIÓN DE ADN Método de Fenol – Cloroformo. Muestra de citocepillo: 1.- Centrifugar a 4°c por 25 minutos a 14,000 rev por minuto y quitar sobrenadante con cuidado de no tirar el botón. 2.- Agregar 250 microlitros de solución tampón de lisis (STL) y 45 microlitros de Proteinasa K 10mgf/ml y 10 microlitros de SDS 10%. 3.- Mezclar gentilmente e incubar a 55°c 3 a 5 horas. 4.- Inactivar la proteinasa K con vórtex 8 minutos. 5.- Agregar volumen igual de 250 microlitros de fenol cloroformo alcohol isoamílico 25:24:1. Mezclar bien con vórtex separar las dos fases por centrifugación a 14,000 (13.2) durante 10 minutos (13´). Tomar la fase acuosa cuidando de no tomar la interfase, transfiriendo a otro tubo (arriba). 6.- Agregar 2 volúmenes de absoluto frío y una décima de volumen de acetato de amonio (150 microlitros) 3M a un pH de 5.2 y permitir que el ADN precipite a -20°c durante al menos 1 hora. 7.- Centrifugar a 7000 rpm durante 10 minutos. Eliminar sobrenadante cuidando de no tirar el botón blanco. 8.- Lavar dos veces con etanol al 70% 500 microlitros, 10 minutos a 7000 rpm. 9.- Dejar secar. EXTRACCIÓN ADN BLOQUES DE PARAFINA (Desparafinación): El corte, de 10μm aproximadamente (con microtomo) se desparafina (dos veces) en 1ml de xilol por 30 minutos a 65°C; se centrifuga a 12 000g, 10 minutos, se descarta el sobrenadante. Se repite este paso. Después se agrega 1ml de etanol al 100%, se agita manualmente, se espera 30 minutos, se centrifuga y descarta el sobrenadante (se repite este paso) (Jiménez y cols., 2007). Técnica de extracción: Igualmente se agrega 1ml de etanol al 70%, y 1ml de PBS (dos veces). Se agrega 500μl de amortiguador de lisis (50μl Proteinasa K 20mg/ml; 10μl Tris- HCl 1M; 2μl EDTA 0,5M; 100μl SDS 10% y 838μl agua destilada) y se incuba toda la 58 | P á g i n a noche a 52°C en agitación continua. Se agrega 500μl de fenol l:cloroformo:isomilalcohol (25:24:1) (500 microlitros de fenol, 480 microlitros de cloroformo, y 20 microlitros de alcohol isoamílico), se agita con vórtex 10 minutos y se centrifuga a 12,000 rpm por 10 minutos. El sobrenadante se remueve a otro microtubo, se agrega 0,1 volumen de acetato de sodio 3M (50 microlitros) y se agita manualmente (50 veces). Se adicionó un volumen de isopropanol (550 microlitros) y se almacena toda la noche a -20°C. Se centrifuga a 12,000 rpm 10´, el sobrenadante se descarta y el precipitado se lava una vez con 1ml de etanol 70%, se centrifuga y descarta el sobrenadante. El ADN seco se disolve en 50μl de solución T.E. o bien agua bidestilada estéril y se almacena a -20°C (o bien en el ultracongelador) (Jiménez y cols., 2007). Preparación de la proteinasa K, TRIS y EDTA. 1.- 0.020 gramos en 1000 microlitros de proteinasa K. 2.- 0.121 gramos en 1000 microlitros de TRIS. 3.- 0.146 gramos en 1000 microlitros de EDTA. Diluciones: Para trabajar con las muestras, se requiere realizar la dilución respectiva para 100 microlitros de agua inyectable. Por lo tanto, dividimos 10,000 entre la cantidad que obtuvimos de ADN de una muestra. El resultado es la cantidad de microlitros que se emplearán de la muestra concentrada de T.E. (solución en la cual se conserva el ADN, concentración 1 ng/μl), y se agrega agua inyectable hasta completar 100 microlitros. Ejemplo: Muestra número 68 de controles: Se obtuvo en el cuantificador 1299 microgramos por mililitro: dividimos 10,000 entre esa cantidad y resulta 7.7. Son los microlitros de ADN. Agregamos 92.3 microlitros de agua inyectable y tenemos la dilución para 100 microlitros. 59 | P á g i n a (ANEXO 4) DESCRIPCIÓN DE LA TÉCNICA DE TIPIFICACIÓN DE LABORATORIO Determinación del polimorfismo inserción / deleción -675 4G/5G del gen de PAI-1. Este polimorfismo será evaluado por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), usando un alelo específico (SSP), (Festa y cols., 2003). Los oligonucleótidos utilizados serán los siguientes: - 5'-AAGCTTTTACCATGGTAACCCCTGGT-3'. - 5'-AGAGTCTGGACACGTGGGGA-3'. - 5'-AGAGTCTGGACACGTGGGGG-3'. - 5'-TGCAGCCAGCCACGTGATTGTCTAG-3'. Método de PCR SSP (sequence-specific primers = alelos de secuencia específica): Se basa en el principio de que los iniciadores completamente coincidentes se usan más eficazmente en la amplificación de una secuencia diana que un iniciador no coincidente por Taq polimerasa recombinante. Los pares de primers están diseñados para tener coincidencias perfectas sólo con un único alelo o grupo de alelos. En PCR, los pares de iniciadores coincidentes dan lugar a la amplificación de las secuencias diana (es decir, un resultado positivo), mientras que los pares de primers no coincidentes no provocan amplificación (es decir, un resultado negativo). La interpretación de los resultados de la PCR-SSP se basa en la presencia o ausencia de un fragmento específico de DNA amplificado (One Lambda, 2009). Condiciones para el polimorfismo 4G/5G del gen de PAI-1. Una vez extraído el ADN (anexo 3), las condiciones termocicladoras para el alelo 4G (32 ciclos) fueron: desnaturalización (94°C para 35 segundos), alineaminento (65°C para 35 segundos), y extensión (72°C para 70 segundos). Las condiciones termocicladoras para el alelo 5G fueron idénticas, excepto los últimos 22 ciclos, ya que fueron alineados a 58°C. Previa electroforesis, todos los amplificados se visualizaron por geles de acrilamida al 6%, teñidos con plata (Anexo 5). 60 | P á g i n a Técnica de PCR La reacción de alelo específico 4G (25 microlitros de volumen) contuvo 1 ng/microlitro de ADN, 0.4 microlitros de TAQ polimerasa, 0.8 mmol/L MgCl2, 50 mmol/L dNTP, 200 nmol/ del iniciador control, y 400 nmol/L de cada iniciador de alelo específico. La reacción de PCR de 5G fue idéntica excepto por 1.1 mmol/L de MgCl2. Estas condiciones fueron estandarizadas a nuestro laboratorio. Los fragmentos de pares de bases esperados: Homocigoto 4G/4G: 257 y 136 bp para la reacción 4G, y 257 para la reacción 5G. Heterocigoto 4G/5G: 257 y 136 bp para las dos reacciones. Homocigoto 5G/5G: 257 bp para la reacción 4G, y 257 y 136 bp para la reacción 5G. Determinación del polimorfismo C936T del gen de VEGF. El polimorfismo de VEGF C936T fue evaluado por PCR - SSP usando la siguiente secuencia de oligonucleótidos. Fue creada mediante el programa UCSC InSilico PCR, disponible en el sitio web http://genome.csdb.cn/cgi-bin/hgPcr: Iniciador 1: TAAATGTATGTATGTGGGTGGGTGTGTCTACAG Iniciador 2: GGGCGGGTGACCCAGCAc Iniciador 3: GGGCGGGTGACCCAGCAt Una vez extraído el ADN (anexo 3), las condiciones termocicladoras para la reacción del primer y segundo iniciador (32 ciclos) fueron: desnaturalización (94°C para 35 segundos), alineaminento (65°C para 35 segundos), y extensión (72°C para 70 segundos). Las condiciones termocicladoras para la reacción del primer y tercer iniciador fueron estandarizadas. Previa electroforesis, todos los amplificados se visualizaron por geles de acrilamida al 6%, teñidos con plata (Anexo 5). Técnica de PCR Contuvo 1 nanogramo/microlitro de ADN, 0.1 microlitro de dNTP´S 50 mmol, 0.7 mililitros de 1.8 mmol de MgCl2, 30 pmol de cada iniciador (0.5 microlitros), y 0.05 microlitros de Taq polimerasa. Previa electroforesis, todos los amplificados se visualizaron por geles de acrilamida al 6%, teñidos con plata (Anexo 5). Estas condiciones fueron estandarizadas a nuestro laboratorio. 61 | P á g i n a El fragmento de restricción para ambos alelos (C y T) fue de 141 pares de bases, esperando esos fragmentos en muestras homocigotos si solo aparecía una banda (en las dos PCR) y heterocigotos si aparecían ambas bandas. Como referencia para distinguir el peso molecular de todos los fragmentos, se utilizó una escalera, la cual pudo ser de 50 ó 100 pares de bases como marcador. EJEMPLO El siguiente amplificado, nos muestra cómo diferenciar entre una muestra homo o heterocigota, dependiendo del número de bandas que se presenten. Si aparecen dos bandas, la muestra es heterocigota, si aparece una banda es homocigota. La línea de 490 pares de bases es el alelo I, y la línea de 190 pares es el alelo D: Figura 13. El homocigoto I/I se observa en los carriles 2, 4, 5, 7,9 y 11; el homocigoto D/D en el carril 10; el heterocigoto en los carriles 1, 3 y 6. El marcador de talla molecular (MTM) de 50 pb se muestra en el carril 8. Imagen de un gel realizado en el Centro de Investigaciones Biomédicas de Occidente del IMSS. 62 | P á g i n a (ANEXO 5) CONDICIONES Y PREPARACIONES Limpiar bien las placas de vidrio con alcohol y una vez secas colocarlas en los armadores interponiendo los separadores correspondientes entre ambas. La placa de vidrio más grande es la posterior. Hay que vaciar la mezcla para preparar el gel: 1.- Para preparar el gel: 1.- Acrilamida biscarilamida al 6%: 25 ml. 2.- Persulfato: 400 microlitros. 3.- TEMED: 50 mililitros. (En este orden) Esperar 20 minutos tras la mezcla. 2.- Condiciones de electroforesis: 1.- 200 voltios. 2.- 400 miliamperes. Por 10 minutos inicialmente (para pre-correrlo) y finalmente 60 minutos. 3. -Tinción de gel: 1.- Solución fijadora 10 minutos. Se prepara aforando a 1000 mililitros: Etanol ABS al 10% 100 ml, y ácido acético 0.5% 5 ml. 2.- Nitrato de plata: 8 minutos. Se prepara 0.2 gramos de nitrato de plata aforando a 100 ml con solución fijadora. 3.- Enjuagar con agua destilada. 4.- Solución reveladora hasta que aparezcan las bandas. Aforar a 1000 ml, 30 gramos de hidróxido de sodio y 5 mililitros de formaldehido. Soluciones: Mezcla de persulfato para preparar el gel: 5 gramos persulfato y 50 mililitros de agua destilada. Mezcla para gel (Acrilamida): 63 | P á g i n a 100 mililitros de acrilamida. 50 mililitros de Buffer 5X Aforar a 500 mililitros de agua destilada. Acrilamida: 29 gramos de acrilamida. 1 gramo de bisacrilamida. 100 mililitros de agua destilada, aforar. Marcador de talla molecular: 10 microlitros de jugo azul. 82.5 microlitros de agua pura inyectable. 7.5 microlitros de marcador (25 ó 50 pares de bases). Preparación de Buffer 1X: 200 ml de buffer TBF 10 X aforar a 2000 mililitros. Preparación de buffer 0.5X: 100 mililitros buffer 10X Aforar con agua destilada 2000 mililitros. = 2 litros TBF 0.5X Preparación de buffer 1x: 400 mililitros de buffer TBF 5X 1600 mililitros de agua oxigenada. = 2000 mililitros de TBE 1.0 X ANEXO 6 FÓRMULA PARA CALCULAR EL TAMAÑO DE LA MUESTRA Fórmula general: Z1-α/2 = 1.96 Z1-β = 0.84 64 | P á g i n a Para calcular la relación entre las dos frecuencias. Para calcular frecuencia de exposición entre los casos. W=Odds ratio Referencia: (Pertegas y cols.,2002). 65 | P á g i n a 15.2.- CARTA DE CONSENTIMIENTO INFORMADO UNIVERSIDAD DE COLIMA. SECRETARÍA DE SALUD Facultad de Medicina. Facultad de Ciencias Químicas Km 9 carretera Colima –Coquimatlán, México Tel/FaxCarta 01 312 31 de 6 11 63 e-mail: lauravaldez@ucol.mx, hugo_ramos@ucol.mx Consentimiento Informado MCP Hugo Christian Ramos Flores, Médico Ginecoobstetra Roberto Chaparro Mejía, Dra. Luz Margarita Baltazar Rodríguez, Dra. Laura Leticia Valdez Velázquez. 1. Nombre del estudio: “Frecuencia de polimorfismos de genes relacionados funcionalmente en la ruta molecular del sistema renina angiotensina, en cáncer cervicouterino” 2. Propósito del estudio: La estamos invitando a participar en un estudio de investigación que se lleva a cabo en el Laboratorio de Genética Molecular de la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad de Colima, en conjunto con las Unidades de Ginecología y Obstetricia del sector salud de la ciudad de Colima. El estudio tiene como propósito evaluar una posible asociación de un marcador genético que probablemente predisponga a padecer cáncer cervicouterino. Usted ha sido invitada a participar en este estudio porque cumple con los criterios de inclusión establecidos. 3. Procedimientos: Si usted acepta participar ocurrirá lo siguiente: a) Se le pedirá que responda un cuestionario en el que le preguntaremos sobre: (edad, número de hijos, antecedentes familiares, antecedentes ginecoobstétricos). b) Toma de muestra de citología cervical. Para poder realizarle la toma de muestra de citología cervical no deberá encontrarse dentro de los días de su menstruación. Tomaremos una muestra de células de su cérvix, para realizarle algunos estudios de laboratorio. Deseamos estudiar si algunos de sus genes favorecen o disminuyen la presencia de cáncer cervicouterino. Nuestros genes son un código especial que todos heredamos de nuestros padres y es este código el que define el color de nuestra piel, ojos, pelo y 66 | P á g i n a de muchas otras características de cada quien. En el caso del cáncer cervicouterino, hay muchas cosas que puede hacer que se manifieste, y los genes aunque no es el único factor, sí puede ser uno de ellos. Por este motivo, nos gustaría saber más sobre sus genes. Estas mediciones nos pueden ayudar a entender las razones por las que algunas personas padecen dicho cáncer. 4. Posibles beneficios que recibirá al participar en el estudio. No recibirá un pago por su participación en este estudio, ni implica gasto alguno para usted. Si bien los beneficios directos para usted pudieran no existir, los resultados del presente estudio contribuirán al avance en el conocimiento de la cadena causal del cáncer cervicouterino. 5. Participación o retiro. Su participación en este estudio es voluntaria. Si usted decide no participar, de cualquier manera recibirá la atención médica que suele recibir. Puede hacer las preguntas que desee. 6. Privacidad y confidencialidad. La información que nos proporcione que pudiera ser utilizada para identificarla/o (como su nombre, teléfono y dirección) será guardada de manera confidencial y por separado al igual que sus respuestas a los cuestionarios y los resultados de sus pruebas, para garantizar su privacidad. 7. Para el estudio de genes: por favor marque con una X una de las opciones cajas que se presentan abajo (únicamente debe indicar la opción que corresponda) [__] No autorizo que se tome la muestra para las pruebas genéticas [__] Sí autorizo que se tome la muestra para las pruebas genéticas de este estudio únicamente [__] Sí autorizo que se tome la muestra para las pruebas genéticas de este estudio y su empleo para estudios futuros Declaración de consentimiento informado Estoy de acuerdo en participar en los estudios que se me han descrito. 67 | P á g i n a ______________________________________ ____________________________________ Nombre y firma del Participante Fecha Firma del encargado de obtener el consentimiento informado ______________________________________ ____________________________________ Nombre y firma del encargado de obtener el CI Fecha Firma de los testigos ____________________________________ Firma del Testigo 1 ____________________________________ Firma del Testigo _______________ Fecha ________________ Fecha 68 | P á g i n a 15.3.- GLOSARIO Alelo. Cada uno de los genes de un par, que ocupan el mismo lugar en dos cromosomas homólogos. Ejercen una misma función sobre un carácter o rasgo de organización, v. gr.: color o forma, con efectos diversos. Angiotensina I. Decapéptido que resulta de la acción de la enzima proteolítica renina sobre la prohormona angiotensinógeno. Angiotensina 2. Agente circulante en la sangre con efecto vasoconstrictor, que actúa en diferentes lugares regulando la presión arterial entre otras funciones. Angiotensinógeno. Una globulina producida por el hígado que, por efecto de la renina, se transforma en angiotensina. Ácido ribonucleico mensajero (ARNm). Ácido ribonucleico que contiene la información genética procedente del ADN para utilizarse en la síntesis de proteínas Angiogénesis. Formación de vasos sanguíneos nuevos a partir de vasos preexistentes Apoptosis. Muerte celular programada; es parte integral del desarrollo de los tejidos tanto de plantas como de animales pluricelulares. Cuando una célula muere por apoptosis, empaqueta su contenido, lo que evita que se produzca la respuesta inflamatoria característica de la muerte accidental o necrosis. Citocina. Cualquier proteína inmunorreguladora como la interleuquina, el interferon, que segregan células del sistema inmunitario, generalmente fagocíticas. Chi cuadrada. Prueba no paramétrica que mide la discrepancia entre una distribución observada y otra teórica (bondad de ajuste), indicando en qué medida las diferencias existentes entre ambas, de haberlas, se deben al azar en el contraste de hipótesis. Digestión enzimática. Técnica que radica en el corte con endonucleasas de restricción de los productos amplificados por PCR. Si dos amplificados presentan una variación de la secuencia nucleotídica, en los sitios de reconocimientos de las enzimas de restricción, generarán distintos patrones de fragmentos. Desequilibrio de ligamiento. El cálculo del nivel de polimorfismo calculado según el número de alelos es inferior al que realmente se presenta en la población. Corresponde a la diferencia entre la frecuencia observada para una combinación 69 | P á g i n a particular de alelos y la esperada con base en las frecuencias de los mismos en los distintos individuales. Enzima convertidora de angiotensina. Dicarbopeptidasa que convierte la angiotensina I en su forma activa, la angiotensina II. Electroforesis. Migración de sustancias por la acción de un campo eléctrico. La técnica aplica el fenómeno con fines analíticos. Equilibrio de Hardy-Weinberg. Establece que la composición genética de una población permanece en equilibrio mientras no actúe la selección natural ni ningún otro factor y no se produzca ninguna mutación. Es decir, la herencia mendeliana, por sí misma, no engendra cambio evolutivo. Exón. Secuencia de polinucleótidos en un ácido nucleico que codifica información para la síntesis proteínica. Se copia y se divide junto con otras secuencias semejantes para formar el RNA mensajero. Fibrinólisis. Proceso de descomposición de los coágulos sanguíneos por descomposición de la fibrina que los forman. Frecuencias alélicas. Frecuencia alélica o frecuencia génica es la proporción que se observa de un alelo específico respecto al conjunto de los que pueden ocupar un locus determinado en la población. Frecuencias genotípicas. Es la frecuencia de cada uno de los genotipos posibles que aparecen en esa población mendeliana determinada. Frecuencias fenotípicas. Es la proporción o frecuencia de los distintos fenotipos en esa población. Frecuencias haplotípicas. Es la proporción o frecuencia de los distintos haplotipos en esa población. Frecuencias haplotípicas bilocus. Es la proporción o frecuencia de los distintos haplotipos con dos posiciones del gen en el cromosoma, en dicha población. Genotipo. Conjunto o parte de la constitución genética de un individuo. Haplotipo. Se define como la constitución genética de un cromosoma individual. Un haplotipo es una combinación de alelos ligados a múltiples locus que se transmiten juntos. 70 | P á g i n a Heterocigoto. También heterocigótico o híbrido, según la genética mendeliana, individuo que posee dos variantes o alelos distintos para un mismo gen, presenta alelos distintos en un locus determinado del mismo par cromosómico. Homocigoto. Célula o individuo con alelos idénticos en uno o más loci de cromosomas homólogos, posee alelos idénticos en un locus determinado del mismo par de cromosomas. Inserción/Deleción. Polimorfismo de inserción/delección (I/D) Involucra la presencia (alelo I), o la ausencia (alelo D) de una secuencia repetida de un determinado número de pares de bases en algún punto del gen. Intrón. Sección de ADN que no codifica información para la síntesis proteínica y que se elimina antes de pasar a ARN mensajero. Kilobase (kb). Unidad de tamaño de los ácidos nucleicos, igual a una longitud de 1000 nucleótidos. KiloDalton. Unidad de masa molecular equivalente a 1. 000 daltons Loci. Lugar que ocupan una serie de genes. Plural de locus. Locus. Es la posición relativa del gen en el cromosoma. Metástasis. Reproducción de un padecimiento en órganos distintos de aquel en que se presentó en principio. Método de Fenol – Cloroformo. Método estándar para eliminar proteínas de soluciones de ácidos nucleicos, (la finalidad es la extracción de ADN). Método de algoritmo de maximización de expectaciones. Se usa en estadística para encontrar estimadores de máxima verosimilitud de parámetros en modelos probabilísticos que dependen de variables no observables. Oncogene. Gen que contribuye a la conversión de una célula normal a una célula cancerosa. Oligonucleótido. Secuencia lineal de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster, habitualmente no mayor de 50 nucleótidos. Odds ratio (razón de momios). Es el cociente entre la probabilidad de que un evento suceda y la probabilidad de que no suceda. PCR SSP: Método que se basa en el principio de que los iniciadores de oligonucleótidos son más eficaces en la amplificación de una secuencia diana que un primer oligonucleótido no coincidente por polimerasa Taq recombinante. 71 | P á g i n a Pruebas exactas. Pruebas aplicadas para la solución de problemas de datos categóricos y no paramétricos, para conjuntos de datos pequeños. Entre ellas se encuentran las pruebas de una muestra, de dos muestras, pruebas de bondad de ajuste y pruebas sobre medidas de asociación. Proteína G. Las proteínas G forman una familia de proteínas caracterizadas por la fijación de GTP (Guanosín trifosfato) y su posterior hidrólisis a GDP (Guanosín difosfato) durante su ciclo funcional, a lo cual deben su nombre. Su utilidad en la fisiología celular es la de actuar como interruptores biológicos mediante la transducción de señales. Polimerasa. Enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos. Polimorfismo. Propiedad de los ácidos nucleicos y las proteínas que pueden presentarse bajo varias formas moleculares. Es un fenómeno importante en la genética y en la patología molecular. Plasminógeno. Es una glicoproteína sintetizada por el hígado, presente en el plasma sanguíneo y la mayor parte del fluido extracelular como el precursor inactivo de una enzima proteasa (plasmina). Urokinasa. Trombolítico que actúa sobre el sistema fibrinolítico endógeno para convertir el plasminógeno a plasmina rompiendo directamente el enlace argininavalina en el plasminógeno. Renina. Enzima proteolítica que segregan y almacenan los riñones; su función en la sangre es la de convertir el precursor de la angiotensina (angiotensinógeno) en angiotensina. Transcripción. Primer proceso de la expresión genética. Se transfiere la información contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de proteína utilizando diversos ARN como intermediarios. tPA. Factor que activa el plasminógeno en plasmina, en el sistema fibrinolítico. Fuente: Diccionario Médico – Biológico. http://www.dicciomed.es/php/diccio.php Glosario. Apartado de Genética, http://www.glosario.net/ 72 | P á g i n a 15.4.- OFICIOS Figura 14. Oficio de Aprobación del Comité de Ética e Investigación. Departamento de Enseñanza del Hospital Regional Universitario 73 | P á g i n a Figura 15. Oficio de Aprobación. Departamento de Enseñanza del Hospital Regional Universitario. Uso de bloques de parafina del Laboratorio de Anatomía Patológica. 74 | P á g i n a Figura 16. Oficio de Aprobación del Comité de Ética e Investigación. Departamento de Enseñanza del Centro Estatal de Cancerología. 75 | P á g i n a DR. JOSÉ SALAZAR AVIÑA SECRETARIO DE SALUD DEL ESTADO DE COLIMA AV. CALZADA GALVAN No.100, COL. CENTRO, COLIMA, COL. P R E S E N T E. Colima, Colima, 21 de mayo de 2009. AT¨N: DR. CARLOS CÉSAR ROMERO MORENO DIRECTOR DE SERVICIOS DE SALUD |Por medio de la presente, solicito a Usted, la autorización para realizar tomas de citología exfoliativa (papanicolaou) a pacientes dentro de los Sistemas Sanitarios de la Secretaría de Salud del Estado de Colima, con el fin de reunirlas para el proyecto de “Asociación de Polimorfismos de Genes relacionados Funcionalmente en la Ruta Molecular del sistema Renina Angiotensina, en Cáncer Cervico Uterino”, del Programa de la Maestría en Ciencias Médicas de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colima; en dicho programa me encuentro inscrito actualmente. De acuerdo con la Ley General de Salud y el Reglamento de Investigación en materia de salud, el Proyecto de investigación se clasifica como un estudio con Riesgo Mínimo, por implicar únicamente la toma de una muestra mediante un procedimiento no invasivo. Mi disponibilidad de horario es la siguiente: días miércoles, jueves y viernes, de 8:00 AM a 12:30 PM. Quedo en espera de sus indicaciones, de antemano agradezco su apoyo y su fina atención. Sin otro particular reciba un cordial saludo. ATENTAMENTE __________________________________________ Hugo Christian Ramos Flores Médico Cirujano y Partero Alumno de la Maestría en Ciencias Médicas Ccp. Dr. Antonio Fermín Torres del Toro. Subdirector de Prevención y Control de Enfermedades. Para su conocimiento. 76 | P á g i n a