Download ANÁLISIS MUTACIONAL DEL GEN vhl EN EL CARCINOMA DE
Document related concepts
Transcript
Urología Experimental e Investigación Arch. Esp. Urol., 57, 7 (671-677), 2004 ANÁLISIS MUTACIONAL DEL GEN vhl EN EL CARCINOMA DE CÉLULAS RENALES DE APARICIÓN ESPORÁDICA. José Miguel Giménez Bachs, Antonio Salinas Sánchez, Juan Lorenzo Romero, Francisco Sánchez Sánchez1, María José Donate Moreno, Dolores García Olmo2, Julio Escribano Martínez1 y Julio Virseda Rodríguez. Servicio de Urología. Complejo Hospitalario Universitario de Albacete. Albacete. Área de Genética1. Facultad de Medicina de Albacete. Universidad de Castilla-La Mancha. Unidad de Investigación2. Complejo Hospitalario Universitario de Albacete. España. Resumen.- OBJETIVO: Determinar mutaciones en el gen vhl y caracterizar las mismas en muestras de tejido tumoral de 30 pacientes intervenidos por carcinoma renal de células claras en nuestro servicio. MÉTODO: Estudio descriptivo observacional y analítico sobre 30 pacientes intervenidos por CCR, que analiza la secuencia del gen vhl del tejido tumoral y se usa como control tejido renal sano de los mismos pacientes. Los tejidos fueron sometidos a procesos de extracción de ADN, amplificación de los 3 exones que conforman el gen mediante PCR y posterior secuenciación automática de los exones amplificados entre cebadores intrónicos diseñados previamente. La secuencia se compara con la de los correspondientes exones incluidos en GenBank. Las alteraciones fueron corroboradas mediante secuenciación en dirección opuesta. RESULTADOS: Se han encontrado un total de 9 mutaciones (30%) en las distintas muestras tumorales analizadas. 7 de ellas fueron puntuales, siendo una de ellas intrónica; las otras dos mutaciones halladas consistieron en deleciones. Las mutaciones se repartieron entre los tres exones de la siguiente manera: 3 en exón 1, 4 en exón 2, 1 en exón 3 y 1 intrónica. En una misma muestra se hallaron 2 mutaciones. El tejido control está libre de alteraciones. CONCLUSIÓN: El CCR esporádico presenta mutaciones en el gen vhl, que aparecen fundamentalmente en el subtipo de células claras. Dichas alteraciones dan lugar a graves perturbaciones en la proteína, alterando su función supresora tumoral. Correspondencia Palabras clave: Carcinoma de células renales. Gen vhl. Mutación. José Miguel Giménez Bachs C/ Salamanca, 4. 5º dcha. 02001 Albacete. (España) e-mail: gbjosem@sescam.jccm.es Trabajo recibido: 1 de marzo 2004 Summary.- OBJECTIVES: To assess and characterize mutations in the vhl gene in tumor tissue samples from 30 patients undergoing surgery for renal cell carcinoma in our department. METHODS: Descriptive, observational and analytical study of 30 patients undergoing surgery for RCC, analyzing the vhl gene sequence in tumor tissue, and using healthy renal tissue from the same patients as controls. Tissues were processed by DNA extraction, PCR amplification of the three exons that conform the gene, and 672 J. M. Giménez Bachs, A. Salinas Sánchez, J. Lorenzo Romero y cols. ulterior automatic sequence analysis of the amplified exons between intronic primers previously designed. The sequence is compared with the corresponding exons included in the GeneBank. Alterations were checked by backwards sequence analysis. RESULTS: 9 mutations (30%) were found in the tumoral samples analyzed. 7 of them were punctual (one of them intronic); the other two were deletions. Mutations were distributed among the three exons: 3 in exon 1, 4 in exon 2, 1 in exon 3 and 1 intronic. One of the samples showed 2 mutations. Control tissue was free of mutations. CONCLUSIONS: Sporadic RCC shows mutations in the vhl gene which mainly appear in the clear cell subtype. Such alterations result in severe disturbances in the protein, disturbing its tumor suppressing function. Keywords: Renal cell carcinoma. Vhl gene. Mutation INTRODUCCIÓN. El carcinoma de células renales (CCR) constituye el tumor maligno más frecuente del riñón en el adulto y supone aproximadamente un 3% de todos los tumores. En España, el carcinoma renal representa el 2,9% de los tumores del varón y el 1,7% en la mujer. Se diagnostican alrededor de 2.000 nuevos casos anuales, con una incidencia de 4,1 a 4,5 cada 100.000 habitantes / año. La tasa de incidencia estandarizada por edad es de 1,9-8,8 por 100.000 habitantes, para mujeres y hombres, respectivamente (1, 2). Al igual que se ha producido un incremento de la incidencia de cáncer renal, también lo ha hecho la mortalidad, de forma paulatina, en todos los grupos étnicos y por sexos. Aunque la proporción de diagnóstico de tumores avanzados ha decrecido, la tasa de mortalidad se ha visto afectada de forma negativa, quizá debido a un cambio en los factores de riesgo implicados, tales como el tabaco, dieta o exposición a diferentes carcinógenos (3, 4, 5). En España, una tasa de mortalidad según sexo de 1,1-2,8 por 100.000 habitantes hace que el carcinoma renal sea el responsable de más de 800 fallecimientos anuales (6). A pesar de diversos factores descritos como factores de riesgo de padecer CCR, la etiopatogenia de este tipo de tumores está todavía por establecerse, y en los últimos años se ha precisado de la ayuda de estudios a nivel molecular para clasificar los subtipos de CCR, así como su implicación pronóstica (7, 8). En el estudio genético del CCR se ha visto que el brazo corto del cromosoma 3 (3p) existen alteraciones con frecuencia. En esta localización se encuentra el gen vhl o gen del enfermedad de von Hippel-Lindau (síndrome hereditario caracterizado por la aparición de tumores y quistes en diversos órganos como riñón, páncreas, cerebro y retina) (9, 10). Dicho gen se estableció como gen supresor tumoral o antioncogen, al ver que seguía el modelo de “los dos golpes” propuesto por Knudson (11). Han sido descritas alteraciones genéticas del gen vhl en la enfermedad de von Hippel-Lindau y estudios recientes encuentran alteraciones a este nivel en los cánceres renales de aparición esporádica. El presente estudio pretende analizar el estado del gen vhl en tejido tumoral de pacientes sometidos a nefrectomía (parcial o radical) por CCR, y describir las mutaciones halladas en dicho gen, estimando la posible repercusión sobre la función de la proteína. MATERIAL Y MÉTODO. Estudio descriptivo, transversal y analítico sobre 30 pacientes sometidos a nefrectomía (parcial o radical) en nuestro Servicio por CCR. De los especímenes intraoperatorios, previo consentimiento informado, se obtuvo tejido tumoral en fresco para su procesamiento, así como tejido renal sano adyacente al tumor, que se utilizó como control. Hasta su análisis fueron congelados a –80ºC. Se obtuvieron de las historias clínicas los datos sociodemográficos y clínicos necesarios para completar el estudio. Extracción de ADN.- El ADN fue aislado de las muestras siguiendo las instrucciones del QIAmp®DNA MiniKit de QIAGEN® (Barcelona, España), previa digestión con proteinasa K. Amplificación mediante Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR).- El ADN extraído fue sometido a PCR para amplificar por separado cada uno de los 3 exones (o regiones codificantes) que forman el gen vhl. Para ello se utilizaron como cebadores unas secuencias de oligonucleótidos contenidas en los intrones para obtener la totalidad del exón (Tabla I). En el 673 ANÁLISIS MUTACIONAL DEL GEN vhl EN EL CARCINOMA DE CÉLULAS RENALES DE APARICIÓN ESPORÁDICA. Exón 1 Dirección Secuencia de nucleótidos Tª hibridación Tamaño del (ºC) exón (pb) 5’ ➝ 3’ CGTTCCATCCTCTACCGAGC 65,8 3’ ➝ 5’ CCTGCTATCGTGCCAGACTT 65,1 Intraexónico CTTCAGGGCGCTACTCTTCG 65,4 5’ ➝ 3’ CACCGGTGTGGCTCTTTAAC 64,3 3’ ➝ 5’ CCAACAACACCATTCATGTCC 58,4 5’ ➝ 3’ GACCCTAGTCTGTCACTGAGG 60,3 3’ ➝ 5’ CCATGACTACTCAGAACTAG 53,2 340 3’ ➝ 5’ 2 3 179 123 TABLA I. CEBADORES UTILIZADOS EN LA PCR. exón 1 se diseñó un cebador intraexónico, ya que la longitud de mismo no permitía la correcta secuenciación del exón completo. Una vez realizada la PCR y testada en un gel de agarosa tras electroforesis (Figura 1), se procedió a purificación de la misma, mediante un proceso de purificación por sales. Secuenciación automática.- El producto de PCR fue sometido a una reacción de secuenciación, utilizando el kit de secuenciación BigDye® Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit. Tras la reacción se procede a un proceso de precipitado, y, tras resuspensión en formamida, se coloca en el secuenciador automático FIGURA 1. Gel de agarosa donde se muestra el producto de PCR de cada uno de los exones del gen vhl. Abi Prism®310 Genetic Analyzer de Applied Byosistems®, realizándose la secuenciación según el método de electroforesis capilar. Tras el análisis de la muestra por el secuenciador, obtenemos un electroforetograma, es decir, la secuencia del ADN problema según ha detectado el secuenciador. Los electroforetogramas son analizados y comparados con el de una muestra control y con la secuencia original del gen obtenida en GenBank. Las mutaciones encontradas fueron secuenciadas tanto en sentido 5’ como 3’ del exón para la corroboración de su existencia. Para considerar una alteración encontrada en un electroforetograma como mutación debía estar presente en las dos direcciones. RESULTADOS. La edad media de los pacientes fue de 62,4 años (DE: 9,57, Rango: 34-79), de los cuales el 60% (18/30) eran varones y el 40% mujeres. Todos ellos fueron diagnosticados de tumor renal y sometidos a cirugía exerética de la masa renal, bien realizándose nefrectomía radical (56,7%), cirugía conservadora de parénquima renal (40%) y en un caso (3,3%) laparotomía exploradora de una masa renal irresecable de la que únicamente se tomó biopsia para caracterización histológica del tumor. Las características anatomopatológicas de los tumores se exponen en la Figura 2, siendo la mayoría CCR subtipo de células claras, y el resto se repartió entre CCR papilar (uno de ellos con patrón mixto con 674 J. M. Giménez Bachs, A. Salinas Sánchez, J. Lorenzo Romero y cols. presentaron ninguna alteración en la secuenciación realizada como control. En la Figura 4 se muestra un electroforetograma con una de las mutaciones encontradas y el electroforetograma de la muestra control. FIGURA 2. Anatomía patológica de las muestras estudiadas. En la Tabla II se muestran las mutaciones junto con algunas de las características clínicas del tumor y del paciente. DISCUSIÓN. células claras), cromófobo y con diferenciación sarcomatoide. El grado nuclear de los tumores fue clasificado siguiendo el sistema de graduación de Fuhrman (12), encontrándose un 6,7% grado 1, un 56,7% de tumores grado 2, un 23,3% grado 3, y un 13,3% grado 4. El tamaño tumoral fue menor de 4cm. en el 30% de los casos, entre 4 y 7 cm. en el 40% y mayor de 7 cm. en el 30% restante. El estadio patológico según la clasificación TNM (13) se especifica en la Figura 3. Se encontraron un total de 9 mutaciones (30%) en las distintas muestras tumorales analizadas. 7 de ellas fueron puntuales, siendo una de ellas intrónica; las otras dos mutaciones halladas consistieron en deleciones. Las mutaciones se repartieron entre los tres exones de la siguiente manera: 3 en exón 1, 4 en exón 2 y 1 en exón 3. La mutación restante se halló en la porción intrónica contenida en los fragmentos de amplificación del exón 2. En una misma muestra se hallaron 2 mutaciones. Se realizó secuenciación de los exones en ambas direcciones para la comprobación de la alteración encontrada. Las muestras control no FIGURA 3. TNM. Dentro de los genes implicados en la genética del cáncer, el gen vhl está considerado como gen supresor tumoral. (14). Se localiza en el brazo corto del cromosoma 3, en el locus 3p25-26 del genoma humano, contiene tres exones (o secuencias codificantes de ADN), y codifica una proteína de 213 aminoácidos con un peso molecular de 28-30 kDa (15, 16). Entre las funciones que ejerce la proteína VHL, reside el control de la elongación trancripcional al unirse a otras proteínas conocidas como elonginas (17); regulación de la producción de ciertos péptidos relacionados con la neoangiogénesis (factor de crecimiento del endotelio vascular y eritropoyetina) (18); formación de matriz extracelular adecuada para diversas funciones celulares, para lo que se une a la fibronectina; y, regulación de otros factores de crecimiento tumoral (19). La aparición de alteraciones del gen vhl en la enfermedad de von Hippel-Lindau es un hecho descri- FIGURA 4. Electroforetogramas de una muestra mutada y de su control donde se muestra el cambio de aminoácido producido. 675 ANÁLISIS MUTACIONAL DEL GEN vhl EN EL CARCINOMA DE CÉLULAS RENALES DE APARICIÓN ESPORÁDICA. to y que acontece en prácticamente el 100% de las familias afectadas por esta enfermedad (20). En los últimos años, y con el objeto de llegar a una aproximación de las características moleculares del CCR, se ha estudiado la aparición de alteraciones genéticas del gen vhl a nivel de los tumores renales de aparición esporádica. Así se han encontrado con frecuencia alteraciones tales como la pérdida de heterocigosidad y la hipermetilación de dicho gen en los CCR esporádicos (21). La presencia de mutaciones en el gen vhl en los tumores renales esporádicos es otra de las posibilidades patogénicas a nivel molecular. Las alteraciones a nivel del gen van a traducirse en una proteina defectuosa, de manera que las funciones alteradas de la proteina VHL permiten, entre otras cosas, la neoangiogénesis, aun en condiciones subóptimas de oxígeno, lo que da lugar al crecimiento de masas tumorales ricas en vascularización, característica frecuente en el cáncer renal (17, 18, 19). En el presente estudio encontramos 9 mutaciones del gen vhl, todas ellas sobre CCR de células claras, excepto en un caso con histología mixta (células claras y papilar). Parece demostrado que la aparición de eventos mutacionales del gen vhl es exclusivo de los subtipos histológicos no papilares (22), sin embargo, algunos tumores tienen morfología papilar pero con un componente celular de células claras (23), por lo que se puede comprender la aparición de mutaciones en estos tumores. Las mutaciones se suelen agrupar en los exones 2 y 3 y en la última porción del exón 1 (24). En nuestro estudio ocurre algo similar, las alteraciones halladas se han localizado en exon 2 prioritariamente y de las 3 encontradas en el exón 1, 2 se localizaron al final de dicho exón, excepto una que se presentó en la parte media del mismo. La mutación intrónica constituye un hallazgo casual, al tener los fragmentos de PCR pequeñas porciones intrónicas. Probablemente se trate de un polimorfismo, aunque en cualquier caso no genera cambios funcionales en el producto proteico. La frecuencia de aparición de mutaciones en el gen vhl ronda el 50% en la literatura consultada (21, 22, 25). En el presente estudio no encontramos con un porcentaje algo menor (30%), y quizá el hecho de confirmar las mutaciones encontradas mediante secuenciación en el sentido opuesto, hace que, los posibles errores del secuenciador sean detectados al examinar la secuencia complementaria, rechazando lo que en un principio podían parecernos mutaciones. Además sólo se ha hecho análisis mutacional, ya que la aparición de otras alteraciones genéticas parecen ser más frecuentes y avalar la implicación de este gen en la carcinogénesis renal. TABLA II. CARACTERIZACIÓN DE LAS MUTACIONES. Muestra Sexo Mutaciones Edad Exón Tipo Codón Cambio A.P Estadio Fuhrman 1 / 61 1 del 16 nts. 90 Trunc. CC I 2 3 ? 49 2 CxA 119 Phe x Leu Mixto I 2 4 ? 69 1 del 8 nts. 111 Trunc. 2 GxC 120 Arg x Thr CC III 4 6 ? 60 3 CxA 179 Asp x Glu CC I 2 8 ? 71 2 GxA 117 Trp x STOP CC IV 3 12 / 66 1 CxG 65 Ser x Trp CC I 1 16 ? 70 2 GxT 137 Val x Gly CC I 2 20 / 59 Intrón GxC nt 5355 - CC I 2 nts: nucleótidos; Trunc: proteina truncada; CC: células claras. 676 J. M. Giménez Bachs, A. Salinas Sánchez, J. Lorenzo Romero y cols. Las mutaciones que aparecen en el gen vhl en casos de carcinoma renal familiar (enfermedad VHL) son, habitualmente, puntuales (20). Sin embargo, en las alteraciones que aparecen en los tumores esporádicos, encontramos eventos más complejos, como deleciones e inserciones, además de mutaciones puntuales que pueden dar lugar a un codón de parada, con la consecuente aparición de una proteína truncada, es decir, sin funcionalismo. De igual forma, las deleciones cambian la pauta normal de lectura del gen en su codificación, dando lugar también a la formación de proteínas truncadas. En nuestro estudio hemos hallado dos deleciones y un cambio puntual que da lugar a un codón de parada, lo que supone que un tercio de las mutaciones encontradas dan lugar a una “catástrofe” molecular a nivel de la proteína. En el presente trabajo nos encontramos ante dos casos de mutaciones en tumores con alto grado nuclear y/o estadio patológico; además, en estos dos casos el resultado fue de proteina truncada, presentaron uno de ellos dos mutaciones. No obstante, no parece haber una relación directa entre la presencia de mutaciones y un estadio o grado nuclear más avanzado (26). Esto parece ser así también en nuestro estudio, ya que encontramos mutaciones tanto en tumores con estadios precoces y grado nuclear bajo como en otros tumores en fases avanzadas. Teniendo en cuenta esto, y sin pasar por alto que, en los últimos años, el diagnóstico de los tumores renales se produce de manera precoz y la mayoría de las veces incidentalmente (27), podemos considerar que las mutaciones que se producen en el gen vhl son un evento que se produce de manera precoz en la patogénesis del CCR, es decir, un primer paso en la transformación tisular de los tejidos normales en tumorales (26). En conclusión, la aparición de mutaciones en el gen vhl en el carcinoma de células renales de aparición esporádica es un hecho cada vez más comprobado, aunque no existen estudios concluyentes acerca del papel que estas mutaciones juegan en la génesis de este tipo de tumores. Sin embargo, se puede afirmar que son alteraciones que aparecen exclusivamente en el subtipo histológico no papilar, fundamentalmente en carcinomas de células claras, que no guardan relación con las características clínico-patológicas del tumor y que en ocasiones, la traducción de estas mutaciones generan cambios muy importantes en la proteína, alterando gravemente su función. BIBLIOGRAFIA y LECTURAS RECOMENDADAS (*lectura de interés y **lectura fundamental) 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. *9. *10. **11. 12. 13. *14. **15. **16. *17. ROBLES, J.E.; ROSELL, D.; ZUDAIRE, J.J. y cols.: “Epidemiología de los tumores del parénquima renal.” Rev. Med .Univ .Navarra. 43:68.1999. ANGLADA, F.J.; LEVA, M.; GÓMEZ, F.: “Epidemiología y etiopatogenia del carcinoma renal”. En: “Neoplasias renales: Diagnóstico y tratamiento.” Edit. Hospital Universitario Reina Sofía Córdoba, España, 2001. RODRIGUEZ, A.; PATARD, J.J.; LOBEL, B.: “Renal cell carcinoma in young adults: incidence, disease outcome and review of the literature.” Arch. Esp. Urol. 55: 969.2002. McLAUGHLIN, J.K.; LIPWORTH, L.: “Epidemiologic aspects of renal cell cancer.” Semin. Oncol. 27: 115. 2000. CHOW, W.H.; DEVESA, S.S.; WARREN, J.L. y cols.:” Rising incidence of renal cell cancer in the United States.” JAMA.281: 1628.1999. GOLBANO, J.; CHICHARRO, G.J.; OTERO, I.; y cols.: “Epidemiología, etiología, clínica e historia natural del carcinoma de células renales”. En: “Oncología urológica.”: 311. 1ª Edición. Edit. Grupo Saned, Madrid, España, 2003. TAVANI, A.; LAVECCHIA, C.: “Epidemiology of renal-cell carcinoma.” J. Nephrol., 10: 93.1997. MOYAD, M.A.: “Review of potential risk factors for kidney (renal cell) cancer.” Semin. Urol. Oncol. 19: 280. 2001. ZBAR, B.; BRAUCH, H.; TALMADGE, C. y cols.: “Loss of alleles of loci on the short arm of chromosome 3 in renal cell carcinoma.” Nature. 327: 721.1987. LONG, J.P.; ANGLARD, P.; GNARRA, J.R. y cols.: “The use of molecular genetic analysis in the diagnosis of renal cell carcinoma.” World. J. Urol., 12: 69.1994. KNUDSON, A.G.: “Antioncogenes and human cancer.” Proc. Natl. Acad. Sci. 90: 109. 1993. FUHRMAN, S.A.; LASKY, L.C.; LIMAS, C.: “Prognostic significance of morphologic paramenters in renal cell carcinoma.” Am. J. Surg. Pathol. 6: 655.1982. GUINAN, P.; SOBIN, L.H.; ALGABA, F. y cols.: “TNM Staging of renal cell carcinoma. Workgroup Nº 3. Union Internationale contre le cancer (UICC) and the American Joint Committee on Cancer (AJCC).” Cancer. 80: 992.1997. MARSHALL, C.J.: “Tumor suppressor genes.” Cell. 64: 313.1991. LATIF, F.; TORY, K.; GNARRA, J. y cols.: “Identification of the von Hippel-Lindau disease tumor suppressor gene.” Science. 260: 1317.1993. KONDO, K.; KAELIN, W.G.: “The von HippelLindau tumor suppressor gene.” Exp. Cell. Res. 264: 117. 2001. KAELIN, W.G.; ILIOPOULOS, O.; LONERGAN, K.M. y cols.: “Functions of the von Hippel-Lindau suppressor protein.” J. Int. Med. 243: 535. 1998. 677 18. 19. *20. **21. **22. 23. *24. **25. *26. 27. IGARASHI, H.; ESUMI, M.; ISHIDA, H. y cols.: “Vascular endothelial growth factor overexpression is correlated with von Hippel-Lindau tumor suppressor gene inactivation in patients with sporadic renal cell carcinoma.” Cancer. 95: 47.2002. KNEBELMANN, B.; ANANTH, S.; COHEN, H.T. y cols: “Transforming growth factor alpha is a target for the von Hippel-Lindau tumor suppressor.” Cancer Res. 58: 226.1998. BÉROUD, C.; JOLY, D.; GALLOU, C. y cols.: “Software and database for the analysis of mutations in the VHL gene.” Nucl. Acids. Res. 26: 256, 1997. HAMANO, K.; IGARASHI, H.; CHINO, K. y cols.: “Biallelic inactivation of the von Hippel-Lindau tumor suppressor gene in sporadic renal cell carcinoma.” J. Urol. 167: 713.2002. KENCK, C.; WILHEM, M.; BUGERT, P. y cols.: “Mutation of the vhl gene is associated exclusively with the development of non-papillary renal cell carcinomas.” J. Pathol. 179: 157.1996. SALAMA, M.E.; WORSHAM, M.J.; DEPERALTAVENTURINA, M.: “Malignant papilar renal tumors with extensive clear cell change. A molecular analysis by microsatellite analysis and fluorescence in situ hybridisation.” Arch. Pathol. Lab. 127: 1176.2003. BAILLY, M.; BAIN, C.; FAVROT, M.C. y cols.: “Somatic mutations of von Hippel-Lindau tumor-suppressor gene in european kidney cancers.” Int. J. Cancer. 63: 660.1995. GNARRA, J.R.; TORY, K.; WENG, Y. y cols.: “Mutations of the VHL tumour suppressor gene in renal carcinoma.” Nat. Gen. 7: 85.1994. KONDO, K.; YAO, M.; YOSHIDA, M. y cols.: “Comprehensive mutational analyisis of the vhl gene in sporadic renal cell carcinoma: Relationship to clinicopathological parameters.” Genes, Chromosomes & Cancer. 34: 58. 2002. BEISLAND, C.; MEDBY, P.C.; BEISLAND, H.O.: “Renal cell carcinoma: gender difference in incidental detection and cancer-specific survival.” Scand. J. Urol. Nephrol. 36: 414. 2002.