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4. Genética Mendeliana 4. Genética mendeliana • • • • • • 4.1 Leyes de Mendel 4.2 Interacciones génicas 4.4 Método mendeliano 4.4 Genealogías 4.5 Cálculo de probabilidad 4.6 Método CHI Cuadrado Introducción • La información que determina los rasgos heredados se encuentra en unidades discretas de ADN llamadas genes, los cuales se encuentran en los cromosomas • Los cromosomas de eucariotas superiores se encuentran generalmente en pares, por lo tanto también los genes. • Las formas alternas de un gen son los alelos. Están en pares en los cromosomas: uno proviene de la madre y el otro del padre. • Homocigoto: ambos alelos son idénticos para un gen. • Heterocigoto: posee alelos diferentes para un gen. • Genotipo: Es el conjunto de genes que contiene un organismo heredado de sus progenitores. En organismos diploides, la mitad de los genes se heredan del padre y la otra mitad de la madre. • Fenotipo: Es la manifestación externa del genotipo, es decir, la suma de los caracteres observables en un individuo. El fenotipo es el resultado de la interacción entre el genotipo y el medio ambiente. • Carácter: propiedad específica de un organismo; característica o rasgo. – Ej: Carácter: color de la flor, Fenotipo: púrpura o blanco F = G + A + (GA) Patrones de herencia • Existen diferentes patrones de herencia según las posibles localizaciones de un gen: – Herencia autosómica: basada en la variación de genes simples en cromosomas regulares o autosomas. – Herencia ligada al sexo: basada en la variación de genes simples en los cromosomas determinantes del sexo. – Herencia citoplasmática: basada en la variación de genes simples en cromosomas de organelas (herencia materna). Gregor Mendel • Publica sus ¨Experimentos de hibridización en plantas¨ en 1865 • Desconocía la presencia de cromosomas y genes. Habla de factores. • Su trabajo es reconocido 34 años después. (1822-1884) 4.1 Leyes de Mendel • Gregorio Mendel propone el concepto de gen en 1865 • Existía el concepto de herencia mezclada: la descendencia muestra normalmente características similares a las de ambos progenitores….pero, la descendencia no siempre es una mezcla intermedia entre las características de sus parentales. • Mendel propone la teoría de la herencia particulada: los caracteres están determinados por unidades genéticas discretas que se transmiten de forma intacta a través de las generaciones. Gregor Mendel Las 7 diferencias en un carácter estudiadas por Mendel Semilla lisa o rugosa Semilla amarilla o verde Vaina inmadura verde o amarilla Pétalos púrpuras o blancos Vaina hinchada o hendida Floración axial o terminal Tallo largo o corto Línea pura: población que produce descendencia homogénea para el carácter particular en estudio; todos los descendientes producidos por autopolinización o fecundación cruzada, dentro de la población, muestran el carácter de la misma forma. 1ª Ley de Mendel: Ley de la Uniformidad Ley de la uniformidad de los híbridos de la primera generación (F1): cuando se cruzan dos individuos de raza pura (ambos homocigotos) para un determinado carácter, todos los híbridos de la primera generación son iguales entre sí e iguales a uno de los progenitores. 2ª Ley de Mendel: Ley de la Segregación • Ley de segregación o disyunción de los alelos: un alelo que determina alguna característica que parecía haber desaparecido en la primera generación filial, vuelve a manifestarse en la segunda generación. • Esta ley establece que durante la formación de los gametos cada alelo de un par se separa del otro miembro para determinar la constitución genética del gameto filial. • Es muy habitual representar las posibilidades de hibridación mediante un Cuadro de Punnett. Fenotipo parental Cruza F1 F2 Relación en F2 Lisa Semilla lisa x rugosa Todas lisas 5474 lisas;1850 rugosas 2,96:1 Amarilla Semilla amarilla x verde Todas amarillas 6022 amarillas;2001 verdes 3,01:1 Púrpura Pétalos púpuras x blancos Todos púrpuras 705 púrpuras;224 blancos 3,15:1 Hinchada Vaina hinchada x hendida Todas hinchadas 882 hinchadas;299 hendidas 2,95:1 Verde Vaina verde x amarilla Todas verdes 428 verdes;152 amarillas 2,82: 1 Axial Flores axiales x terminales Todas axiales 651 axiales;207 terminales 3,14: 1 Largo Tallo largo x corto Todos largos 787 largos;277 cortos 2,84: 1 Resultados de todos los cruzamientos de Mendel en los que los parentales difieren en un solo carácter (autofecundación de F1) P Semillas F1 X Todas Autofecundación F2 3/4 ;11/4 (3:1) En la F2: • La proporción aparente es 3:1, pero es en realidad 1:2:1 • Frecuencia fenotípica: ¾, ¼ • Frecuencia genotípica: ¼, 2/4, ¼ Postulados de Mendel para explicar proporción 1:2:1 1- Existen determinantes hereditarios de naturaleza particulada: genes. 2- Cada planta adulta tiene 2 genes, una pareja génica. Las plantas de la F1 tienen genes dominantes (A) y recesivos (a). 3- Los miembros de cada pareja génica se distribuyen de manera igualitaria entre las gametas o células sexuales. 4- Cada gameta es portadora de un solo miembro de la pareja génica. 5- La unión de una gameta de cada parental para formar un nuevo descendiente se produce al azar. Esquema de la generaciones P, F1 y F2 en el sistema de Mendel que implica la diferencia en un carácter determinado por la diferencia de un gen. Mendel: Relación de caracteres en F2 siempre es 3:1 El fenotipo verde está completamente ausente en la F1, pero reaparece (en su forma original) en la cuarta parte de las plantas F2: difícil de explicar por herencia mezclada. La capacidad para producir tanto el fenotipo verde como el amarillo se mantiene y transmite a través de las generaciones sin modificaciones. Entonces…¿por qué no se expresa el fenotipo verde en la F1? `Propuso el concepto de dominancia: Fenotipo dominante: aquel que aparece en la F1, tras el cruzamiento de 2 líneas puras. Fenotipo amarillo es dominante sobre el verde Fenotipo verde es recesivo sobre el amarillo 3ª Ley de Mendel: Ley de la Segregación Independiente • Ley de segregación independiente de caracteres: diferentes rasgos son heredados independientemente unos de otros, no existe relación entre ellos, por tanto el patrón de herencia de un rasgo no afectará al patrón de herencia de otro. • Hace referencia al caso de que se contemplen dos caracteres distintos. • En ocasiones es descripta como la 2ª Ley. • Se cumple en aquellos genes que no están ligados (en diferentes cromosomas) o que están en regiones muy separadas del mismo cromosoma. • Siguen las proporciones 9:3:3:1. Ejercicios de Genética Mendeliana Ejercicio # 1 • 1. Cruce dos organismos heterocigotos: Aa x Aa Donde: A=Verde a=rojo a) muestre los resultados b) determine la frecuencia genotípica y fenotípica Resultados: Ejercicio # 1 Gametos A a A AA Aa a Aa aa Frecuencias fenotípicas Frecuencias genotípicas Verde: ¾ 2/4 heterocigoto ¼ homocigoto Rojo ¼ ¼ homocigoto Ejercicio # 2 • Cruce una planta con flores verdes heterocigotas (Aa) con otra de flores rojas homocigotas (aa) – Cuál sería la probabilidad de que su progenie salga con flores rojas? – Muestre los resultados – Determine frecuencia genotípica y fenotípica. Resultados: Ejercicio # 2 Gametos a a A Aa Aa a aa aa • Probabilidad de flores rojas:50% • Frecuencias: – Verde: 2/4 (heterocigoto) – rojo: 2/4 (homocigoto) Cruces Genéticos, Métodos Mendelianos • Cruce Monohíbrido: muestra como será la progenie de los parentales para una sola característica • Cruce Dihíbrido: muestra como será la progenie de los parentales para dos características Ejercicio # 3 • En un cruce de semillas provenientes de líneas puras, en donde: – Textura puede ser lisa dominate (B) o rugosa recesivo (b). – Color puede ser amarillo dominante (A) o color verde recesivo (a). • Cruce una semilla amarilla de textura lisa con una semilla verde de textura rugosa. – Qué fenotipos de semillas obtendrá? Resultados: Ejercicio # 3 • Frecuencias: 100% Amarillo-Liso Ejercicio #4: • Cruce dos semillas heterocigotas para color amarillo y textura lisa (AaBb ) • Muestre resultados y determine la frecuencia genotípica y fenotípica. Resultados: Ejercicio # 4 A con B; A con b; a con B; a con b • Podremos inferir el genotipo a partir del fenotipo? Haciendo cruces de prueba (cruce retrocruza) a partir de parentales para observar como estas características se manifiestan en la generación filial. Gametos a a A Aa Aa A Aa Aa ¿Cómo preparar un cruce genético? 1. Asignar los genotipos de los parentales: Se asignan letras a los alelos Letra mayúscula al alelo dominante Letra minúscula al alelo recesivo 2. Sorteo de alelos para formar los gametos: Separar los alelos y hacer las posibles combinaciones 3. Hacer un Cuadro de Punnett para hacer los cruces Cruce de homocigotos • Tenemos dos plantas puras, una de flores rojas y una de flores blancas. • La herencia del color de la flor muestra dominancia completa y el color rojo es dominante • ¿Cómo será la progenie de estas dos plantas? Cruce entre dos parentales homocigotos Gametos de la planta de flores blancas (aa) a Aa (25%) a Aa (25%) A Gametos de la planta de flores rojas (AA) Aa (25%) Aa (25%) Generación F1 A Frecuencia genotípica para F1: 100% Aa Frecuencia fenotípica para F1: 100% Plantas de flores rojas Cuadro de Punnet para predecir el resultado de un cruzamiento dihíbrido Por la primera Ley de Mendel: gametas Y = gametas y = 1/2 gametas R = gametas r = 1/2 p (RY) = 1/2 x 1/2 =1/4 p (Ry) = 1/2 x 1/2 =1/4 p (rY) = 1/2 x 1/2 =1/4 p (ry) = 1/2 x 1/2 =1/4 Machos Hembras 1/4DL 1/4Dl 1/4dL 1/4dl 1/4DL 1/16 DDLL 1/16 DDLl 1/16 DdLL 1/16 DdLl 1/4Dl 1/16 DDLl 1/16 DDll 1/16 DdLl 1/16 Ddll 1/4dL 1/16 DdLL 1/16 DdLl 1/16 ddLL 1/16 ddLl 1/4dl 1/16 DdLl 1/16 Ddll 1/16 ddLl 1/16 ddll Simulación de cruzamientos Leyes 1 y 2 Ley 3 Transmisión independiente y variación genética • La transmisión independiente da lugar a una gran variación genética – Los gametos son generalmente diferentes – 2n es el número de gametas distintas • n es el número haploide – Ejs.: • Una especie que tiene número haploide: 4 se generarán 24 , o sea 16 combinaciones • En el ser humano… n = 23, por tanto hay 223 combinaciones (~ 8 millones) Como cada individuo es la combinación de un gameto de cada padre, cada individuo tiene una particularidad muy especial… Leyes de probabilidad ayudan a explicar la genética • Las proporciones genéticas se expresan como probabilidades: ej. ¾ semillas amarillas y ¼ verdes. • El rango de probabilidad va desde: – 0 (cero): cuando un evento no va a ocurrir – 1 (uno): cuando es seguro que va a ocurrir • Cuando dos o más sucesos ocurren de manera independiente, podemos calcular la probabilidad de que ocurran juntos: es igual al producto de las probabilidades de cada suceso • Ejemplo: Moneda de $ 1: puede ser ½ cara; ½ cruz Moneda de $2: puede ser ½ cara; ½ cruz Moneda 1 Moneda 2 a. P(ca) x P(ca) = ½ x ½ b. P(cr) x P(ca) = ½ x ½ c. P(ca) x P(cr) = ½ x ½ d. P(cr) x P(cr) = ½ x ½ = = = = ¼ ¼ ¼ ¼ • Un resultado que pueda producirse de más de una forma: se hace la suma de las probabilidades. – Ej. Que salga una cara y una cruz? P(ca + cr) + P(cr + ca)= ¼ + ¼ = ½ F1 Probabilidad condicional F2 Y y Y YY Yy y Yy yy • A veces quisiéramos calcular la probabilidad de un resultado que depende de una condición concreta relacionada con dicho resultado. – Ej. Probabilidad de que una planta de la F2 herede un alelo dominante y un alelo recesivo (heterocigota), en un fenotipo amarillo (dominante). En otras palabras, cuántas semillas son heterocigotas dentro de las amarillas? – P(a): P de que cualquier semilla F2 sea heterocigota = ½ – P(b): P de una semilla amarilla en una F2 = ¾ – Para calcular la probabilidad condicional se hace el cociente: P(c) = P(a) / P(b) = ½ / ¾ = ½ x 4/3 = 4/6 = 2/3 Teorema binomial • Aplicando el teorema del binomio o binomio de Newton, se puede calcular la probabilidad de cualquier serie de resultados entre un gran un número de sucesos potenciales. (a + b)n = 1 Triángulo de Pascal n Binomio Binomio expandido 1 (a + b)1 a2 2 (a + b)2 a2 + 2ab + b2 3 (a + b)3 a3 + 3a2b + 3ab2 + b3 4 (a + b)4 a4 + 4a3b + 6a2b2 + 4ab3 + b4 n (a + b)n an + an-1, an-2b2….bn Método CHI Cuadrado • Una pregunta importante que necesita responderse en cualquier experimento genético es cómo podemos decidir si nuestros datos están de acuerdo con las proporciones mendelianas. • Una prueba estadística que resulta muy útil es la prueba de hipótesis de Chi-cuadrado. • Fórmula de Chi-cuadrado: • En estadística y estadística aplicada se denomina prueba χ² (pronunciado como "ji-cuadrado" o "chi-cuadrado") a cualquier prueba en la que la estadística utilizada sigue una distribución χ² si la hipótesis nula es cierta. Ej. Ver si los siguientes datos de una F2 se ajustan a la proporción 9:3:3:1 Valor de Chi-cuadrado: Χ2 = 0,47 Número de clases: 4 Gl (grados de libertad): n-1= 4-1= 3 • • • Si se entra en la Tabla de Chi-cuadrado por tres grados de libertad, se observa que el valor de Chi-cuadrado encontrado se encuentra con una probabilidad mayor de 0,90. Quiere decir que la probabilidad de encontrar un valor de Chi-cuadrado como el calculado para nuestro experimento es mayor del 90%, que es lo mismo que decir que las diferencias entre los valores observados y calculados se deben al azar con una probabilidad mayor al 90%. Por convención estadística se utiliza el valor de 0.05 de probabilidad como el valor límite o crítico. Si el valor de Chi-cuadrado calculado para un experimento es mayor que el correspondiente al de la probabilidad del 5% se rechaza la hipótesis. En el caso del ejemplo anterior el valor calculado es menor que el valor encontrado en la tabla de Chi-cuadrado por lo que se acepta la hipótesis de que los datos se ajustan a una distribución 9:3:3:1. Árboles genealógicos Símbolos utilizados en análisis de pedigrí