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UNIVERSIDAD DE SALAMANCA CENTRO HISPANO-LUSO DE INVESTAGACIONES AGRARIAS DEPARTAMENTO DE FISIOLOGÍA VEGETAL Papel del ácido salicílico en la interacción entre el hongo beneficioso Trichoderma harzianum y la planta modelo Arabidopsis thaliana Jorge Poveda Arias Trabajo Fin de Grado. Curso 2012-2013 ABREVIATURAS ABA Ácido abscísico MQ Mili-Q BA Ácido benzoico MTI Inmunidad activada por MAMP BA2H Ácido benzoico 2-hidrolasa ORF Fase de lectura abierta BRs Brasinoesteroides PAL Fenilalanina amonio liasa BSMT1 BA/SA carboxilo metiltransferasa 1 PCR Reacción en cadena de la polimerasa cDNA DNA complementario PDA Patata dextrosa agar CKs Citoquininas PDB Caldo de patata dextrosa CM Corismato mutasa PGPRs Rizobacterias promotoras del CP crossing points CTAB Bromuro de hexadeciltrimetilamonio DEPC Dietil pirocarbonato DNA Ácido desoxirribonucleico dNTPs Desoxirribonocleótidos trifosfato EDTA Ácido etilendiamino-tetracético EE.UU. Estados Unidos ET Etileno FAA Formalin-acetato-alcohol GAs Giberelinas GFP Proteína verde florescente HR Respuesta hipersensible ICS Isocorismato sintasa IPL Isocorismato piruvato liasa ISR Respuesta sistémica inducida JA Ácido jasmónico M Molar MAMPs Patrones moleculares asociados a crecimiento Phe Fenilalanina PR Relacionadas con la patogénesis RNA Ácido ribonucleico ROS Especies reactivas de oxígeno SA Ácido salicílico SAG 2-O-β-D-glucosidasa SAR Respuesta sistémica adquirida SDS Dodecil sulfato sódico TBS Tampón tris salino (Tris Buffered Saline) microorganismos t-CA Ácido trans-cinámico Tris Tris-(hidroximetil)-aminometano UGT UDP-glucosiltransferasa UV Ultravioleta v/v Volumen/Volumen w/v Peso/Volumen ÍNDICE INTRODUCCIÓN ....................................................................................................... 1 1.- CONTROL BIOLÓGICO. .............................................................................................................. 1 2.- EL GÉNERO Trichoderma.............................................................................................................. 1 2.1.- Trichoderma como agente de control biológico. ...............................................................2 2.1.1.- Micoparasitismo. ..........................................................................................................2 2.1.2.- Antibiosis. .....................................................................................................................3 2.1.3.- Competición con el patógeno. .....................................................................................3 2.1.4.- Promoción del crecimiento de la planta. ....................................................................3 2.1.5.- Incremento de la tolerancia de la planta a estreses abióticos. .................................4 2.2.6.- Inducción de las defensas de la planta frente a patógenos. ......................................4 3.-EL ÁCIDO SALICÍLICO (SA). ...................................................................................................... 4 3.1.- Relación del SA con otras hormonas. ...............................................................................6 3.2.- Papel del SA frente a la colonización por hongos. ...........................................................7 4.- HIPÓTESIS DE PARTIDA Y OBJETIVOS. ............................................................................. 9 5.- JUSTIFICACIÓN DEL TRABAJO............................................................................................ 10 MATERIALES Y MÉTODOS................................................................................. 11 1.- MATERIAL BIOLÓGICO UTILIZADO. ................................................................................ 11 1.1.- Semillas. .............................................................................................................................11 1.2.- Microorganismos. .............................................................................................................11 2.- CONDICIONES DE GERMINACIÓN...................................................................................... 11 2.1.- Siembra de semillas. .........................................................................................................11 2.2.-Obtención de plántulas. .....................................................................................................11 3.-MANIPULACIÓN DE Trichoderma harzianum. ...................................................................... 12 3.1.- Medios de cultivo. .............................................................................................................12 3.2.- Cultivo de Trichoderma harzianum. ................................................................................12 3.2.1.- Recogida de esporas.......................................................................................................12 3.2.2.- Cultivo para la obtención de micelio. ................................................................................. 12 4.- CONSERVACIÓN DE CEPAS.................................................................................................... 13 4.1.- Hongos filamentosos. ........................................................................................................13 4.2.- Plantas................................................................................................................................13 i 5.- INOCULACIÓN E INFECCIÓN DE PLANTAS CON Trichoderma harzianum............ 13 6.- ANÁLISIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS. .................................................................................... 13 6.1.- Extracción de DNA genómico. .........................................................................................13 6.2.- Extracción de RNA total. .................................................................................................13 6.3.-Cuantificación de ácidos nucleicos. ..................................................................................14 6.4.- Obtención de cDNA: Transcriptasa inversa. .................................................................14 6.5.- Electroforesis de ácidos nucleicos. ..................................................................................14 6.6.- Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). .................................................................14 6.6.1.- PCR a tiempo real (Real-time PCR). .......................................................................14 6.6.3.- Oligonucleótidos utilizados. ......................................................................................15 6.6.4.- Diseño de oligonucleótidos. .......................................................................................15 7.- OBRTENCIÓN DE MUTANTES DE T-DNA. ........................................................................ 15 8.- MICROSCOPÍA CONFOCAL DE BARRIDO. ...................................................................... 16 9.- LOCALIZACIÓN DE CALOSA EN CORTES HISTOLÓGICOS. ................................... 16 10.- ANÁLISIS Y PRESENTACIÓN DE DATOS. ....................................................................... 16 10.1.- Análisis informático. .......................................................................................................16 10.2.- Presentación de datos. ....................................................................................................17 RESULTADOS .......................................................................................................... 18 1.- COLONIZACIÓN DE LA RAÍZ POR Trichoderma harzianum. ........................................ 18 2.- EXRESIÓN DE LOS GENES DE DEFENSA .......................................................................... 21 3.- EFECTO DE Trichoderma harzianum GFP22 EN EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DE Arabidopsis................................................................................................... 22 DISCUSIÓN ............................................................................................................... 23 CONCLUSIONES ..................................................................................................... 26 BIBLIOGRAFÍA ....................................................................................................... 27 ii INTRODUCCIÓN INTRODUCCIÓN 1.- CONTROL BIOLÓGICO. Se conoce como Control Biológico a la utilización de organismos naturales o modificados, genes o productos génicos, para reducir los efectos de organismos y productos indeseables y para favorecer el desarrollo de organismos útiles para el hombre, tales como cultivos, árboles, animales y organismos beneficiosos (Hjeljord & Tronsmo, 1998). Las enfermedades de las plantas, a menudo provocadas por diferentes patógenos así como diferentes situaciones de estrés abiótico, provocan grandes pérdidas en la agricultura tanto a nivel de producción como de calidad. El objetivo principal del Control Biológico, el cual actúa de forma menos agresiva para el medio ambiente que los métodos químicos, es reducir las enfermedades y plagas de las plantas y se caracteriza por: No elimina la enfermedad sino que mantiene al patógeno dentro del equilibrio natural. Al contrario, los fungicidas químicos, matan al patógeno y a sus enemigos naturales, de modo que si reaparece el patógeno, el daño que causa es mucho mayor. Cada relación planta-patógeno es absolutamente única, producto de su coevolución en el tiempo, por lo que sus posibilidades son limitadas. Si se realiza adecuadamente, los efectos perjudiciales para organismos beneficiosos son prácticamente nulos. Es un procedimiento duradero, barato e inocuo para la vida en general, por lo que a largo plazo resulta más económico que los métodos hasta ahora utilizados, y enlaza perfectamente con el concepto de desarrollo sostenible. 2.- EL GÉNERO Trichoderma. El género Trichoderma agrupa hongos filamentosos pertenecientes a la División Deuteromicota (Gams et al., 1987), en la cual se incluyen los hongos de los que sólo se conoce su reproducción asexual (formación de conidios), careciendo de reproducción sexual o estado teleomórfico, y dentro de ésta, a la clase de los Hifomicetos, ya que producen los conidios a partir de células desnudas (Webster, 1980). Las cepas más utilizadas como agentes de control biológico en agricultura pertenecen a cuatro especies: T. harzianum, T. atroviridae, T. virens y T. asperellum (Monte, 2001; Lorito et al., 2010; Montero-Barrientos et al., 2011). 1 INTRODUCCIÓN Comprende un grupo de hongos de rápido crecimiento que son habituales en suelos forestales, agrícolas y pastizales, y se han aislado en todos los continentes (Hermosa et al., 2004; Sadfi-Zouaoui et al., 2009). En general, hablamos de unos microorganismos con gran capacidad adaptativa a distintos ambientes y sustratos, lo cual daría a Trichoderma ventaja sobre otros muchos hongos filamentosos durante la colonización de los suelos cuando se utiliza en formulados para el control de hongos fitopatógenos. 2.1.- Trichoderma como agente de control biológico. Fue Weindlig en 1932 quién describió por primera vez la capacidad antagonista de Trichoderma lignorum (hoy T. viridae) sobre el patógeno Rhizoctonia solani. Actualmente T. harzianum, sola o en combinación con otras especies de Trichoderma, está siendo utilizada en preparaciones comerciales como TUSAL ® para el control de numerosas enfermedades de plantas producidas por hongos (Cook, 1997; Grondona et al., 2001). Los mecanismos de acción de Trichoderma spp. como agente de biocontrol son mostrados a continuación: 2.1.1.- Micoparasitismo. Relación en la que Trichoderma (hongo parásito) se beneficia del hongo hospedador, del que obtiene nutrientes sin aportarle nada a cambio, causándole estrés o incluso la muerte. Cuando ocurre esto último se habla de parasitismo necrotrofo para diferenciarlo del parasitismo biotrofo, en el que se mantiene relación entre células vivas durante largos períodos de tiempo. A B C Figura 1: Vista a microscopio electrónico de barrido del micoparasitismo ejercido por Trichoderma sp. sobre Rhizoctonia solani. (A) Hifa de Trichoderma (T) enroscándose en una hifa de R. solani (R). (B) Apresorios formados en la interacción Trichoderma-Rhizoctonia (la barra equivale a 10 µm). (C) Hifa de R. solani (de la que se ha retirado la hifa de Trichoderma) con los poros provocados por el micoparásito. (Adaptado de Harman et al., 2004). El micoparasitismo se entiende como un proceso secuencial. En primer lugar, Trichoderma localiza al patógeno y comienza a crecer por quimiotropismo hacia él (Lu et al., 2004). Una vez que 2 INTRODUCCIÓN los hongos entran en contacto, Trichoderma puede enroscarse alrededor de su presa y formar estructuras especializadas de tipo apresorio, con las que podrá penetrar en el interior de las hifas del patógeno (Inbar & Chet, 1996; Rocha-Ramírez et al., 2002; Harman et al., 2004). Finalmente Trichoderma entra al interior del micelio hospedador y digiere el contenido intracelular del hongo (Benhamou & Chet, 1996). (Figura 1). 2.1.2.- Antibiosis. La antibiosis consiste en la inhibición del crecimiento de un organismo por el producto metabólico de otro, sin que medie contacto físico entre ellos. Este proceso ocurre cuando se producen interacciones entre antibióticos secretados por Trichoderma, de modo que se inhibe el crecimiento de otros microorganismos. 2.1.3.- Competición con el patógeno. Se entiende por competición el desigual comportamiento de dos o más organismos ante un mismo requerimiento o recurso, de manera que la utilización de éste por uno de ellos reduce la cantidad disponible para los demás. La ubicuidad de Trichoderma en suelos de todo el mundo demuestra que es un buen competidor por el espacio y por los nutrientes disponibles (Hermosa et al., 2004). A pesar de todo, es difícil determinar hasta qué punto Trichoderma es capaz de ejercer su acción antagonista sólo a través de la competición, o si otros mecanismos, como el micoparasitismo o la antibiosis, preparan el escenario para que la competición se lleve a cabo de una forma eficaz (Harman, 2006). 2.1.4.- Promoción del crecimiento de la planta. Algunas cepas pertenecientes a especies como T. harzianum, T. atroviride y T. virens han mostrado capacidad para promover el crecimiento y el desarrollo de las raíces de las plantas (Chang et al., 1986; Yedidia et al., 2001), lo cual implica un incremento de la productividad en los cultivos (Harman et al., 2004). Para explicar este hecho se habían sugerido varios mecanismos como son la producción de factores de crecimiento y vitaminas, el control de patógenos menores, o la conversión de material no utilizable (metales como zinc, manganeso, hierro, cobre) en formas que puedan ser asimiladas por las plantas (Altomare et al., 1999). En los últimos años, varios trabajos que incluyen mutantes de plantas y transformantes de Trichoderma han demostrado que algunas cepas de este hongo pueden producir ácido indol acético (IAA), la auxina vegetal, regulando los niveles de esta hormona en la rizosfera (Contreras-Cornejo et al., 2009), incrementar la capacidad fotosintética (Vargas et al., 2009), o modificar la arquitectura de la raíz, aumentando el número de raíces secundarias y pelos radicales, favoreciendo así la toma 3 INTRODUCCIÓN de nutrientes (Samolski et al., 2012). Además, su capacidad para reducir la disponibilidad de etileno en las plantas, disminuyendo los niveles de su molécula precursora, promueve el crecimiento de las mismas (Viterbo et al., 2010). 2.1.5.- Incremento de la tolerancia de la planta a estreses abióticos. Son bien conocidos los efectos beneficiosos de Trichoderma en plantas, si bien muchos de los múltiples mecanismos por los que ejerce estos beneficios son todavía desconocidos. Recientemente se ha demostrado que ese incremento de tolerancia es debido, al menos en parte, a que T. harzianum reduce la acumulación de ROS (especies reactivas de oxígeno) en las plantas y también a que aminora los daños provocados por estreses como sequía, salinidad, frío y calor (Mastouri et al., 2010). 2.2.6.- Inducción de las defensas de la planta frente a patógenos. Se ha demostrado que, al colonizar las raíces, Trichoderma estimula los mecanismos de defensa de la planta, lo que conlleva un incremento de su resistencia frente a varios microorganismos (Harman et al., 2004). La respuesta de la planta incluye la secreción de peroxidasas, síntesis de fitoalexinas (Howell et al., 2000), expresión de genes que codifican proteínas PR (relacionadas con la patogénesis: proteínas producidas por la planta como respuesta a patógenos y heridas), biosíntesis de compuestos terpénicos (Howell, 2006), o la modificación de los niveles de ácido jasmónico, etileno y ácido salicílico (Shoresh et al., 2005; Djonovic et al., 2007; Segarra et al., 2007; Morán-Diez et al., 2012). Además, varios trabajos han demostrado el “priming” de Trichoderma en ausencia de patógeno, es decir, estimular a la planta para responder de forma más rápida y más intensa frente al ataque de un patógeno (Conrath et al., 2002; Tucci et al., 2011; Malmierca et al., 2012). 3.-EL ÁCIDO SALICÍLICO (SA). El ácido salicílico es una molécula señal que induce mecanismos de defensa en las plantas frente a gran variedad de patógenos (Yalpani & Raskin, 1993; Klessig et al., 2000; Shah, 2003; Halim et al., 2006; Vlot et al., 2009). Este compuesto se sintetiza a partir del corismato, un producto final de la ruta del shikimato, a través de dos rutas diferentes (Dempsey et al., 2011) (Figura 2): 1. Ruta PAL: El corismato pasa a ácido prefénico a través de la enzima corismato mutasa (CM) para posteriormente transformarse en fenilalanina (Phe), que se convertirá en ácido trans-cinámico (t-CA) por la acción de la fenilalanina amonio liasa (PAL). A partir de este punto la ruta puede 4 INTRODUCCIÓN seguir cuatro caminos diferentes, dependientes de cada especie de planta, que culminarán con la formación del SA (Chong J, 2001; Tamaoki M, 2008; Dempsey et al., 2011; Hara 2012). 2. Ruta IC: Esta ruta ocurre en los cloroplastos de las plantas. En ella, el corismato se transforma en isocorismato a través de la enzima isocorismato sintasa (ICS) (Dempsey et al., 2011). La ICS1 se une con una gran afinidad al corismato, activándose para, posteriormente, ser importada al estroma del cloroplasto (Strawn et al., 2007). Esta afinidad es suficiente para permitir a ICS1 competir con otras enzimas inducidas por patógenos que también utilizan el corismato como sustrato. Por último, el isocorismato a través de la isocorismato piruvato liasa (IPL), se convertirá en SA y piruvato (Dempsey et al., 2011; Hara 2012). Figura 2: Ruta biosintética del ácido salicílico en plantas. CM, corismato mutasa; BA2H, ácido benzoico 2-hidrolasa; ICS, isocorismato sintasa; IPL, isocorismato piruvato liasa. (Adaptado de Dempsey et al., 2011). 5 INTRODUCCIÓN El SA, al igual que otras hormonas, va a sufrir modificaciones como glucosilación, metilación o conjugación con aminoácidos, procesos que van a controlar tanto espacial como temporalmente la disponibilidad de la forma activa de la hormona. El papel del SA como hormona de defensa es totalmente necesario en la respuesta de la planta frente a diferentes estreses (abióticos y bióticos). Es crucial para desencadenar la muerte celular producida por la respuesta hipersensible (HR), lo cual frecuentemente va acompañado de la inducción en la planta de la respuesta sistémica adquirida (SAR). Además, la aplicación exógena de la hormona es capaz de inducir la expresión de genes que codifican proteínas PR (Chen, 1995). 3.1.- Relación del SA con otras hormonas. Las hormonas vegetales tienen un papel fundamental en el crecimiento y desarrollo de la planta, teniendo efectos en su fisiología, incluso en los tejidos diferenciados. La resistencia de la planta frente a patógenos está controlado por dos rutas principales, que al mismo tiempo son antagonistas; mientras que el SA promueve la resistencia frente a patógenos biotrofos, el ácido jasmónico (JA) junto con el etileno (ET) lo hace frente a patógenos necrotrofos. Se sabe que, las auxinas y citoquininas inducen la ruta de resistencia frente a patógenos necrotrofos (JA/ET), mientras que, las giberelinas (GAs) realizan el efecto contrario, induciendo la ruta de resistencia frente a patógenos biotrofos (SA) (Robert-Seilaniantz et al., 2007) (Figura 3). Adicionalmente, las GAs, inducen la síntesis de SA durante las primeras horas del crecimiento post germinativo, teniendo un papel muy importante en la respuesta de las plantas a diferentes situaciones de estrés abiótico (Alonso-Ramírez et al., 2009). El papel del ABA en este sentido es más complicado, ya que parece que actúa como regulador negativo de las rutas de defensa de la planta, sin embargo, es muy importante en la respuesta frente a estreses abióticos. Lo que parece indicar, que la planta prioriza su respuesta hacia los estreses abióticos (Robert-Seilaniantz et al., 2007) (Figura 3). Por último, los brasinoesteroides, parece que promueven la resistencia frente a patógenos biotrofos de un modo independiente de SA (Robert-Seilaniantz et al., 2007) (Figura 3). 6 INTRODUCCIÓN Figura 3: Posible modelo de interacción entre las diferentes rutas de señalización hormonal. SA, ácido salicílico; JA, ácido jasmónico; ET, etileno; CKs, citoquininas; GAs, giberelinas; ABA, ácido abscísico; BRs, brasinoesteroides. (Adaptado de Robert-Seilaniantz et al., 2007). 3.2.- Papel del SA frente a la colonización por hongos. Como ya se ha comentado anteriormente, la interacción del hongo Trichoderma con las raíces de la planta provoca en ésta una serie de cambios metabólicos que estimularán el crecimiento y desarrollo, las defensas frente a patógenos y la tolerancia a estreses abióticos (Harman et al., 2004; Shoresh et al., 2010; Lorito et al., 2010). La penetración de las hifas del hongo en la raíz alcanzan únicamente las capas externas de ésta sin llegar a penetrar en el haz vascular. Además de la única presencia del hongo en la epidermis, cabe destacar que la penetración del hongo se limita al apoplasto, como consecuencia de la deposición de lignina y/o de glucano (Yedidia et al., 2000; Chacón et al., 2007) (Figura 4). 7 INTRODUCCIÓN Figura 4: Vista a microscopio confocal de la colonización de raíces de tomate por T. harzianum GFP22. La fluorescencia en verde causada por la expresión de GFP indica la presencia del hongo, mientras que la fluorescencia roja causada por el yoduro de propidio muestra las células vegetales. (A) Las hifas han entrado en las raíces y colonizado el espacio intercelular de la epidermis 10 horas después de la inoculación del hongo en plantas de 3 semanas. (B) Las hifas han crecido entre las células de la epidermis y están rodeadas por paredes celulares de la planta. (C) En algunos casos, las hifas mostraban en su extremo una punta hinchada, que fue identificada como una vesícula no septada. (D) Tras 24 horas de la inoculación se observa una amplia colonización de la superficie de la raíz por parte del hongo. (Adaptado de Chacón et al., 2007). El reconocimiento entre la planta y sus invasores implica numerosas respuestas moleculares. Un estudio pionero demostró que la colonización de la raíz de la planta por parte de Trichoderma iba a acompañada de la elicitación de respuestas sistémicas (De Meyer et al., 1998); posteriormente estas respuestas se relacionaron con la inducción de genes de defensa a través de las rutas del ácido jasmónico (JA) y del etileno (Yedidia et al., 2003; Shoresh et al., 2005; Korolev et al., 2008). Numerosos estudios han puesto de manifiesto que este hongo beneficioso es capaz de activar las defensas tanto a nivel local (Brotman et al., 2008) como sistémico (Van Wees et al., 2008; MoránDiez et al., 2009; Soresh et al., 2010), incluso durante periodos de tiempo relativamente largos (Tucci et al., 2011), lo que sugiere que se puede producir tanto un retraso como un solapamiento en la expresión de genes relacionados con las diferentes rutas defensivas de la planta (Salas-Marina et al., 2011). Por tanto, parece que Trichoderma sería percibido como hostil por parte de la planta y la activación de las defensas de la planta limitaría la penetración del hongo a las capas celulares más externas de la raíz. Recientes estudios transcriptómicos (Morán-Diez et al., 2012; Brotman et al., 2013) han demostrado que durante las primeras horas de interacción entre el hongo y la planta se produce una amplia reprogramación genética, precedida por un descenso transitorio de la respuesta inmune de la planta, lo que probablemente permite la colonización de la raíz. 8 INTRODUCCIÓN También hay evidencias de que por parte de microorganismos beneficiosos es necesario evadir, al menos parcialmente, las respuestas defensivas de la planta para establecer una asociación mutualista, de manera similar a lo que ocurre cuando los patógenos atacan a sus hospedadores (Zamioudis & Pieterse, 2012). El SA juega un papel fundamental en las respuestas de las plantas frente a patógenos biotrofos, que normalmente viven en los espacios intercelulares (Glazebrook, 2005), aunque se necesita una acumulación transitoria durante las primeras fases de la colonización de la raíz por parte del microorganismo beneficioso (Herrera-Medina et al., 2003). Por ejemplo, se ha comprobado que para que ocurra la asociación entre micorrizas y plantas se necesita una supresión de la respuestas dependientes de SA (Pozo & Azcón-Aguilar, 2007; López-Ráez et al., 2010). Resultados similares también se han descrito durante la interacción entre Piriformospora indica y Arabidopsis (Jacobs et al., 2011), asi como para asociación entre Rhizobium y leguminosas (Peleg-Grossman et al., 2009; Stacey et al., 2006). 4.- HIPÓTESIS DE PARTIDA Y OBJETIVOS. La interacción entre el hongo beneficioso Trichoderma harzianum y la planta implica el reconocimiento molecular de los dos individuos a través de la interacción entre diferentes rutas de señalización. Este proceso conlleva la capacidad del hongo para adherirse a la raíz y penetrar en el interior de sus células, además de ser capaz de resistir la toxicidad de diferentes metabolitos defensivos producidos por la planta en respuesta a esta invasión. Los organismos beneficiosos tienen que ser capaces de minimizar la estimulación de las respuestas defensivas de las plantas para establecer esta asociación mutualista. Por su parte, la planta tiene que reconocer al microorganismo invasor, bien para limitar su penetración o bien para permitir esta asociación. Aunque Trichoderma no es un organismo patógeno para las plantas, debe sintetizar moléculas señalizadoras, que, al menos en parte, deben ser similares a las producidas por microorganismos patógenos, lo que explicaría por qué en ambos casos las respuestas iniciales son similares, aunque la respuesta final es completamente diferente, provocando en un caso la respuesta inmune de la planta y en el otro la simbiosis. En un análisis transcriptómico previo realizado por nuestro grupo de investigación se observó que durante las primeras horas de la interacción se produce un descenso en las defensas mediadas por ácido salicílico (SA), una de las hormonas claves en las respuestas defensivas de las plantas, que a tiempos más largos se restablecían. Estos datos sugieren que esta bajada de defensas permitiría y limitaría la penetración del hongo en la capa de células más externas de la raíz. Para confirmar esta hipótesis, en este trabajo hemos realizado un análisis al microscopio confocal de la interacción de un transformante de este hongo que sobreexpresa el gen de la proteína 9 INTRODUCCIÓN verde fluorescente (GFP) con una variedad mutante de Arabidopsis (mutante sid2) incapaz de sintetizar SA. Al mismo tiempo hemos observado al microscopio óptico la deposición de calosa, que es una de las primeras y principales barreras defensivas de la planta así como el grado de colonización de la raíz por parte del hongo y también hemos analizado los niveles de expresión de diferentes genes de defensa de la planta. 5.- JUSTIFICACIÓN DEL TRABAJO. Desde un punto de vista de la agricultura sostenible es necesario el uso de estrategias más respetuosas con el medio ambiente con el objetivo de reducir el uso de pesticidas. Por ello, el uso de agentes de control biológico como rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal o especies fúngicas como micorrizas o Trichoderma spp se ha convertido en una excelente aproximación para conseguir estos objetivos. Trichoderma es un género fúngico que incluye especies con un gran impacto en la agricultura debido a su capacidad para antagonizar otros hongos (biocontrol) y producir otra serie de efectos beneficiosos para las plantas, los cuales se producen tras la colonización de la raíz de manera endofítica por este hongo beneficioso en los tejidos más externos de las células de la raíz; sin embargo, se sabe muy poco sobre cómo se produce esta interacción. El entendimiento de cómo se produce esta interacción permitirá seguir profundizando en el conocimiento de por qué este hongo produce respuestas beneficiosas para las plantas con sus posibles aplicaciones en el campo de la agricultura. 10 MATERIALES Y MÉTODOS MATERIALES Y MÉTODOS 1.- MATERIAL BIOLÓGICO UTILIZADO. 1.1.- Semillas. En la realización de este trabajo se han empleado semillas de la especie Arabidopsis thaliana ecotipo Columbia (Col-0), que forma parte de la colección Arabidopsis Information Service. 1.2.- Microorganismos. Para el presente trabajo se ha utilizado la cepa Trichoderma harzianum T34, CECT 2413 (Colección Española de Cultivos Tipo, Valencia, España). Para los análisis de microscopia confocal se utilizó una cepa de T. harzianum que expresaba el gen GFP (proteína verde fluorescente) de Aquarea victoria, cedida amablemente por la Dra. T. Benítez (Universidad de Sevilla), (Chacón et al., 2007). 2.- CONDICIONES DE GERMINACIÓN. 2.1.- Siembra de semillas. Las semillas de A. thaliana fueron esterilizadas y lavadas superficialmente, antes de ser sembradas en medio MS, tal y como describe Rubio et al. (2012), cuyo proceso se desarrolla más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. En los ensayos realizados tanto para la observación en el microscopio confocal (Apartado 8) como para los análisis de PCR a tiempo real (Apartado 6.6) la siembra se llevó a cabo en cajas Phytatray II (Sigma), en cuyo interior se colocó una lámina de acero inoxidable junto con una gasa estéril, se añadieron 50 ml de MS líquido y se depositaron 200 semillas. Finalmente, las cajas se precintaron con esparadrapo quirúrgico Micropore Scotch 3M, y se colocaron en agitación (90 rpm) en una cámara de luz con las mismas condiciones mencionadas anteriormente. 2.2.-Obtención de plántulas. Las plántulas de A. thaliana, que habían sido germinadas in vitro en medio sólido MS durante 10-12 días, se pasaron a alveolos para su crecimiento en suelo, que contenía tierra (Sustrato profesional, TREF) y vermiculita exfoliada (TERMITA) en la proporción 3:1. Las bandejas de alveolos estuvieron sometidas a irrigación continua para mantener un nivel de humedad adecuado. Cada alveolo se destinó al cultivo de una sola planta, que había sido 11 MATERIALES Y MÉTODOS trasplantada desde una placa Petri en la que había permanecido durante los primeros días de su ciclo de vida. Las plántulas completaron su desarrollo en invernadero, manteniéndose cubiertas con plástico durante los 3-4 primeros días con el fin de mantener niveles altos de humedad. 3.-MANIPULACIÓN DE Trichoderma harzianum. 3.1.- Medios de cultivo. Los distintos tipos de medios empleados en la propagación de las cepas de T. harzianum fueron los siguientes: Patata Dextrosa Agar (PDA): (Sigma). Presentación en polvo, se resuspendieron 39 g en 1 L de agua destilada. Caldo de Patata Dextrosa (Potato Dextrose Broth, PDB): (Sigma). Presentación en polvo, se resuspendieron 324 g en 1 L de agua destilada. Todos los medios se esterilizaron en autoclave a 121ºC y 1 atm, durante 15-20 min, manteniéndolos a 4ºC hasta su utilización. 3.2.- Cultivo de Trichoderma harzianum. 3.2.1.- Recogida de esporas. Para la obtención de esporas, Trichoderma se cultivó en medio PDA a 25-30ºC durante 7 días, tiempo suficiente para que la superficie de la placa estuviera cubierta de esporas. Éstas fueron recogidas añadiendo 5 ml de agua destilada estéril por placa y raspando la superficie de la misma con la propia punta de la pipeta. A continuación, se filtró la suspensión de esporas a través de un eppendorf con lana de vidrio para eliminar restos de micelio. Las esporas se almacenaron a 4ºC hasta su posterior uso. 3.2.2.- Cultivo para la obtención de micelio. Se utilizaron matraces de 1 litro que contenían 400 ml de medio PDB, inoculados con esporas de Trichoderma a una concentración final de 106 esporas/ml, que se incubaron a 28ºC durante 48 h y en agitación (250 rpm). La biomasa obtenida se recogió mediante filtración por vacío a través de papel de filtro. El micelio se lavó con agua destilada estéril y se utilizó inmediatamente (Apartado 6.1.2). 12 MATERIALES Y MÉTODOS 4.- CONSERVACIÓN DE CEPAS. 4.1.- Hongos filamentosos. La conservación de las cepas de T. harzianum se llevó a cabo con resiembras en placas Petri con medio PDA. Método descrito en mayor profundidad en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. 4.2.- Plantas. Las semillas de A. thaliana se mantuvieron a temperatura ambiente en tubos eppendorf, hasta su posterior uso. 5.- INOCULACIÓN E INFECCIÓN DE PLANTAS CON Trichoderma harzianum. Para la inoculación de las plantas con T. harzianum se midió la concentración de esporas obtenidas por conteo en cámara de Thoma. Cada planta de A. thaliana en tierra fue inoculada con 1 ml de solución de esporas a una concentración de 2×107 esporas/ml. La solución se inoculó introduciendo la pipeta en la tierra y procurando soltar las esporas lo más cerca posible de la raíz principal. Para la inoculación de las plántulas obtenidas en las cajas Phytatray II se utilizó micelio de T. harzianum (Apartado 3.2.1.2). 6.- ANÁLISIS DE ÁCIDOS NUCLEICOS. 6.1.- Extracción de DNA genómico. La obtención de DNA genómico de A. thaliana se realizó utilizando el kit “DNA from Plant Tissue (Mini)” (Quiagen) siguiendo el protocolo suministrado por el proveedor, tal y como describen Alonso-Ramírez et al. (2009), cuyo método se desarrolla más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. El material de partida fueron 100 mg de tejido vegetal que se homogeneizaron con nitrógeno líquido. 6.2.- Extracción de RNA total. Para la extracción de RNA de plántulas de A. thaliana se utilizó el preparado “TRI Reageant®” (Ambión), siguiendo las instrucciones del suministrador, de igual manera a lo descrito por Morán-Díaz et al., (2012), cuyo método se desarrolla más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. El material de partida para la extracción fueron plántulas crecidas durante 21 días en tierra e infectadas con Trichoderma 3 días antes de la recogida del 13 MATERIALES Y MÉTODOS material. Se utilizaron 100 mg de tejido congelado en nitrógeno líquido, que se disgregó en un tubo eppendorf utilizando una varilla estéril. 6.3.-Cuantificación de ácidos nucleicos. La determinación de las concentraciones de ácidos nucleicos presentes en las diferentes muestras se realizó utilizando un espectrómetro ultrasensible de medición de ácidos nucleicos (Nanodrop Technologies Inc.), que a través de un programa informático, proporciona los ng/μl de DNA o RNA presentes en la muestra. 6.4.- Obtención de cDNA: Transcriptasa inversa. Para la síntesis de la primera cadena de cDNA a partir de RNA se empleó el kit comercial de TAKARA PrimeScriptTM RT reagent Kit, tal y como describen Alonso-Ramírez et al. (2009), y cuyo método es descrito más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. 6.5.- Electroforesis de ácidos nucleicos. El análisis de los fragmentos de DNA y RNA obtenidos, se realizó por electroforesis en geles de agarosa a una concentración 1% (w/v). En la preparación de los geles y el desarrollo de las electroforesis se siguieron los procedimientos convencionales descritos por Sambrook & Russel (2001), los cuales se desarrollan con mayor profundidad en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. 6.6.- Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). 6.6.1.- PCR a tiempo real (Real-time PCR). La PCR a tiempo real de las muestras de DNA se llevó a cabo utilizando la química Brilliant SYBR Green QPCR Master Mix (Roche), y el equipo StepOne PlusTM (Applied Biosystems), tal y como describen Morán-Díez et al. (2012), y cuyo proceso se detalla más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. Las condiciones de amplificación consistieron en un ciclo inicial de desnaturalización a 95ºC durante 10 min, seguido de 40 ciclos que incluían: 15 seg a 95ºC (desnaturalización), 30 seg a la temperatura establecida empíricamente para cada par de oligonucleótidos (anillamiento). Se realizó una medida continua de la fluorescencia emitida en un rango de 60-95ºC aumentando la temperatura 0,2ºC por seg. Finalmente las muestras se mantuvieron a 4ºC. 14 MATERIALES Y MÉTODOS Se determinaron los crossing points (CP) para cada transcrito, la eficacia de la Real-time PCR y el nivel (ratio) de expresión relativa de los genes, tal y como describe Pfaffl (2001), cuyo método es descrito en mayor profundidad en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. 6.6.3.- Oligonucleótidos utilizados. Los oligonucleótidos utilizados en este trabajo fueron suministrados por Sigma Life Science, y se recogen en la Tabla 1. Nombre Secuencia Act-Ara-F CTCCCGCTATGTATGTCGCC Act-Ara-R TTGGCACAGTGTGAGACACAC Lox1-F GTAAGCTCTGATGTTACTGATTC Lox1-R CTGCGGTTAACGACGTGATTG CallS5-F CTTTGCTGGTTTCAACTCAACTC CallS5-R AATGTTTGCTCTCCGTTTCC Pr1-F GGCTAACTACAACTACGCTG Pr1-R GGCTCTGGTTCACATAATTC Ics1-F GATCTAGCTAACGAGAACGG Ics1-R CATTAAACTCAACCTGAGGGAC Act-Tri-F ATGGTATGGGTCAGAAGGA Act-Tri-R ATGTCAACACGAGCAATGG Tabla 1: Oligonucleótidos utilizados. 6.6.4.- Diseño de oligonucleótidos. El diseño de oligonucleótidos se llevó a cabo con el programa PearlPrimer. La búsqueda de marcos de lectura abierta (Open Reading Frames, ORFs) sobre las secuencias de DNA se realizó mediante el programa EditSeq, que forma parte del paquete informático Lasergene (DNASTAR INC., Madison, EE.UU.). 7.- OBRTENCIÓN DE MUTANTES DE DE T-DNA. Para evaluar el papel del gen Ics1 (Isocorismato sintasa 1) se utilizó el mutante de inserción de T-DNA, At1g74710 (SALK_088254), denominado sid2 (Salicylic Acid Induction Deficient 2), cedido amablemente por la Dra. García-Agustin (Universidad Jaime I, Castellón), que es incapaz de sintetizar ácido salicílico. 15 MATERIALES Y MÉTODOS Trabajos previos en el laboratorio chequearon el mutante con los oligonucleótidos específicos del gen. 8.- MICROSCOPÍA CONFOCAL DE BARRIDO. Las raíces de las plántulas de Arabidopsis que estuvieron en contacto con Trichoderma durante 3 días en las cajas Phytatray (Apartado 5.1) se visualizaron en el microscopio confocal Leica SP5. Para ello, se cortaron las raíces, se lavaron bien con agua destilada estéril para eliminar todo el hongo externo y se montaron en portaobjetos. Las muestras se guardaron a -20ºC hasta su uso. La longitud de onda de excitación utilizada fue de 488 nm (láser argón/criptón) y las longitudes de onda de emisión fueron de 500-550 nm. Las imágenes se visualizaron con un objetivo de 40x y fueron procesadas por el software de Leica LSM Image Browser. 9.- LOCALIZACIÓN DE CALOSA EN CORTES HISTOLÓGICOS. Para la localización de los depósitos de calosa, se realizaron cortes histológicos de raíces de plántulas de Arabidopsis, previamente fijados e incluidos en paraplast, tal y como describen Clay et al. (2009), y cuyo método se describe más exhaustivamente en el documento “Materiales y métodos” del Anexo. La tinción de los cortes histológicos se realizó cubriendo los portas con unas gotas de una solución de azul de anilina (Sigma) al 0,005% en H2O durante 2 min. A continuación se retiró el exceso de colorante, y se procedió a una deshidratación de los tejidos mediante dos lavados con etanol 70% y 90% durante 3 min, un lavado en etanol absoluto durante 4 min y un lavado en xilol 100% durante 5 min. Finalmente, los cortes se montaron utilizando la solución de montaje Entellan (Merck, Alemania), dejándose secar un par de horas antes de su visualización. Para la observación y fotografía de los cortes se utilizó un microscopio DMLS2 (Leica, Alemania), equipado con una cámara Canon Power Shot S50. 10.- ANÁLISIS Y PRESENTACIÓN DE DATOS. 10.1.- Análisis informático. Las secuencias de nucleótidos obtenidas fueron visualizadas mediante la aplicación EditView (ABI PRISM™; Perkin Elmer), y se analizaron por comparación con la base de datos GENEMBL (http://www2.ebi.ac.uk/fasta 3), que engloba a las bases de datos GenBank, EMBL 16 MATERIALES Y MÉTODOS (general) y EPLN (específica de plantas) y utiliza el programa FASTA (Pearson & Lipman, 1988) de comparación de secuencias. 10.2.- Presentación de datos. Las representaciones gráficas se han realizado, con las aplicaciones Cricket Graph 1.3.2 (Cricket Software) y Microsoft Excel XP para hojas de cálculo y realización de gráficas. En el CD adjunto al trabajo se han añadido dos versiones en pdf más detalladas, tanto de Materiales y Métodos como de la Bibliografía (Carpeta: Anexo), por supuesto junto con el pdf correspondiente al trabajo original presentado. A lo largo de toda la memoria, las referencias en el texto se ordenan cronológicamente, siguiéndose un orden alfabético para autores de artículos publicados en el mismo año. Las abreviaturas empleadas en esta memoria para referirse a unidades de medida se corresponden con las del Sistema Internacional. Se ha procurado aplicar la normativa de la IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) en lo referente a la formulación química y a las denominaciones de los compuestos empleados en este trabajo. 17 RESULTADOS RESULTADOS Uno de los principales objetivos de este trabajo es analizar el papel del SA en la interacción Trichoderma-raíz y tratar de averiguar por qué el hongo es incapaz de penetrar hasta el tejido vascular, limitándose a las capas más externas de la raíz. Para ello hemos utilizado un transformante de Trichoderma harzianum que expresa GFP y un mutante de A. thaliana (sid2), incapaz de sintetizar SA debido a un defecto en la enzima isocorismato sintasa 1. La observación de la interacción hongo-planta al microscopio confocal, el estudio de la acumulación de calosa, así como los cambios en la expresión de diferentes genes relacionados con defensa nos ayudaron a comprender el papel del SA en el proceso. 1.- COLONIZACIÓN DE LA RAÍZ POR Trichoderma harzianum. Figura 5: Análisis por microscopía confocal de raíces de plantas de Arabidopsis thaliana de 17 días en cultivo hidropónico 72 h tras la inoculación con Trichoderma harzianum GFP22. (A, B y C) Ecotipo Col-0. (D, E y F) Mutante sid2 deficiente en SA. (A y D) Microscopía confocal. (B y E) Campo claro. (C y F) Ambas microscopías superpuestas. La flecha señala al haz vascular. 18 RESULTADOS Como se observa en la figura 5, después de tres días de interacción, Trichoderma es capaz de penetrar en las capas más externas de la raíz de Arabidopsis, como ya habían descrito Yedidia et al., (1999). En el caso del ecotipo silvestre (Col-0), Trichoderma ha sufrido cambios morfológicos, pasando a formar estructuras levaduriformes, que se quedan en las capas más superficiales de la raíz (Figura 5). Sin embargo, en el mutante sid2 de Arabidopsis el hongo es capaz de penetrar en el tejido vascular (Figura 5). Para analizar con mayor profundidad la colonización de las raíces de Arabidopsis por parte de Trichoderma se hicieron ensayos de PCR a tiempo real, utilizando los genes endógenos de actina correspondientes para cada uno de los organismos. En la figura 6, se observa como en el mutante sid2 los niveles de actina de Trichoderma son 10 veces más elevados que en el control, lo cual nos indica que se está produciendo más colonización, y nos sugiere la importancia del SA en este proceso. Figura 6: Cuantificación de Trichoderma harzianum GFP22 en las raíces de Arabidopsis thaliana de Col-0 y mutante sid2 por PCR en tiempo real. Las barras representan desviaciones estándar de los valores medios de tres repeticiones biológicas. El asterisco indica diferencias significativas (p≤ 0.05) entre el ecotipo Silvestre y el mutante sid2. Para tener más información acerca del papel del SA en la colonización, se observó la acumulación de calosa, una de las primeras y principales barreras defensivas de la planta, tanto en el mutante sid2 como en el ecotipo silvestre después de la interacción con Trichoderma; para ello las raíces recogidas se incluyeron en parafina, y los cortes obtenidos se tiñeron con una solución de azul de anilina (Materiales y Métodos Apdo. 9). Se observó que mientras en el mutante sid2 la 19 RESULTADOS presencia de calosa es prácticamente indetectable, en el tipo silvestre podía observarse claramente tanto en células epidérmicas, como en la corteza y el haz vascular (Figura 7). Estos resultados indican que este proceso es dependiente de SA y, por lo tanto, muestran el papel crucial que tiene esta hormona en la interacción hongo-raíz. Figura 7: Localización de calosa en plantas de Arabidopsis thaliana de 17 días en cultivo hidropónico en Col-0 (A: sección transversal; C: sección longitudinal) y mutante sid2 (B: sección transversal; D: sección longitudinal) después de 72 h tras la inoculación con Trichoderma harianum GFP22. Ep: epidermis; p: parénquima; vt: tejido vascular; co: corteza. Barra = 200 µm. 20 RESULTADOS 2.- EXRESIÓN DE LOS GENES DE DEFENSA Una vez observado que T. harzianum era capaz de colonizar el tejido vascular de la raíz del mutante en sid2 de Arabidopsis, y que el nivel de penetración en las raíces fue significativamente mayor en comparación con las plantas del ecotipo silvestre, se analizaron en ambas interacciones los niveles de expresión de diferentes genes de defensa relacionados con las respuestas a JA o SA (Figura 8). De esta manera hemos podido observar que a los 3 días tras la inoculación de Col-0 con T. harzianum GFP22 ocurre una activación en las plantas de los genes Lox1, PR-1, Ics1 y Cals5, los cuales participan en la biosíntesis de JA, el mecanismo de acción del SA, la biosíntesis de SA y, la biosíntesis de calosa, respectivamente. Figura 8: RT-PCR de los genes Lox1, PR-1, Ics1 y Cals5 en raíces de Arabidopsis Col-0 y mutante sid2 colonizadas, o no, con Trichoderma harzianum GFP22. Los valores corresponden a las mediciones relativas frente a Arabidopsis sin T34 (2-CT = 1). Como gen de referencia interna se utilizó el gen de Actina de Arabidopsis. Las barras representan desviaciones estándar de los valores medios de tres repeticiones biológicas. El asterisco indica diferencias significativas (p≤ 0.05) entre el ecotipo Silvestre y el mutante sid2. En el caso del mutante deficiente en SA, tras la colonización de la raíz por T. harzianum, aumentó de forma más significativa la expresión de los genes Lox1 e Ics1. Dado que el mutante sid2 es incapaz de sintetizar SA este aumento en los niveles de expresión de Ics1 indican que la planta intenta producir SA en respuesta a la colonización de las raíces por Trichoderma, pero que finalmente, y debido a la mutación, la proteína correspondiente no se sintetiza y el SA no es 21 RESULTADOS producido. Por el contrario, se observó una inhibición en la expresión de PR-1 y Cals5, ambos, genes de respuesta al SA. 3.- EFECTO DE Trichoderma harzianum GFP22 EN EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DE Arabidopsis Los resultados del ensayo in vivo mostraron claramente que hay diferencias significativas entre las plantas de Arabidopsis Col-0 y sid2, tratadas o no con el hongo (Figura 9). La altura de las plantas del ecotipo silvestre Col-0 que habían sido tratadas con T. harzianum GFP22, era 10 veces mayor que el de su correspondiente control (6,58 ± 1,2 cm y 0,65 ± 0,19 cm, respectivamente). Además, el tratamiento con Trichoderma ejerce un efecto de precocidad en las plantas Col-0, acelerando la floración, como puede observarse en la figura 9C (primordios florales). Por el contrario, el tratamiento del mutante sid2 con GFP22 ejerce un efecto perjudicial en la altura de la planta (0,38 ± 0,09 cm y 0,23 ± 0,05 cm, respectivamente), llegando incluso a producir su muerte. A B C D Figura 9: Efecto del tratamiento de Arabidopsis Col-0 y sid2 con Trichoderma harzianum GFP22, en un ensayo in vivo. Las plantas de Arabidopsis fueron inoculadas con 17 días, con agua (A, Col-0; B, sid2) o con T. harzianum GFP22 (C, Col-0; D, sid2). Las fotografías fueron tomadas 7 días tras la inoculación. 22 DISCUSIÓN DISCUSIÓN El establecimiento de asociaciones beneficiosas entre plantas y microorganismos requiere el reconocimiento de ambos y un alto grado de coordinación entre ellos. Un estudio reciente ha puesto de manifiesto que el micoparasitismo fue el estilo de vida ancestral de este hongo (Kubicek et al., 2011), que posteriormente colonizó las raíces de las plantas terrestres (Druzhinina et al., 2011), debido a la gran cantidad de patógenos y de compuestos secretados por las raíces de las plantas, como monosacáridos y disacáridos, que permitían el crecimiento de este hongo en la rizosfera (Vargas et al., 2009; Rubio et al., 2012). Por tanto, el proceso de colonización requiere el reconocimiento y la capacidad para adherirse a las raíces, la penetración en la planta, y tolerar los metabolitos tóxicos que produce la planta en respuesta a la invasión (Hermosa et al., 2012). Trabajos recientes indican que para que se produzca esta interacción, es necesario que se produzca una supresión parcial de las defensas de la planta (Morán-Díez et al., 2012; Brotman et al., 2013), al igual que se ha observado en otras asociaciones beneficiosas entre plantas y microorganismos (Herrera-Medina et al., 2003; López-Ráez et al., 2010; Jacobs et al., 2011). Teniendo en cuenta estos antecedentes, así como resultados previos de nuestro grupo de investigación (Morán-Diez et al., 2012), que mostraban que se producía un descenso en los niveles de expresión de genes de defensa regulados por SA, tanto a nivel local como sistémico, el objetivo de este trabajo consistía en profundizar en el papel de esta hormona en la interacción Trichodermaplanta. Para ello hemos utilizado una cepa de Trichoderma (GFP22) que sobreexpresa la proteína verde fluorescente (GFP) y hemos analizado este proceso de interacción, en cultivo hidropónico, en plantas de Arabidopsis de tipo silvestre (ecotipo Col-0) y un mutante afectado en la síntesis de SA (sid2). Como era de esperar, la cepa GFP22 es capaz de penetrar en la capa de células más externas de la raíz (epidermis y cortex), de manera similar a lo observado en trabajos previos realizados en pepino y tomate (Yedidia et al., 1999; Chacón et al., 2007; Velázquez-Robledo et al., 2011), aunque no se observa ningún tipo de colonización en el tejido vascular. Sin embargo, sí que se producía colonización del tejido vascular en el mutante sid2 que, como hemos comentado anteriormente, es incapaz de sintetizar SA; dicha invasión masiva de Trichoderma tuvo un efecto negativo en el crecimiento de la planta y terminó por colapsarla (Figura 9). Esta diferencia en el grado de colonización puede ser debida a las diferencias que hemos observado en los niveles de deposición de calosa, la primera línea defensiva de la planta, lo que sugiere el importante papel que juega el SA en el proceso de refuerzo de la pared celular y en la limitación de la colonización de Trichoderma a las capas más externas de la raíz. Adicionalmente, cuando se utilizó una línea transgénica de 23 DISCUSIÓN Arabidopsis que presentaba niveles muy elevados de SA endógeno (Alonso-Ramírez et al., 2009), los depósitos de calosa eran evidentes incluso en ausencia del hongo (datos no mostrados) De una manera similar se ha descrito que líneas de Arabidopsis incapaces de sintetizar o acumular SA presentaban niveles muy bajos de calosa, lo que permitía la multiplicación de bacterias patógenas (DebRoy et al., 2008). También se ha demostrado que la síntesis de calosa es necesaria para incrementar la resistencia de las células vegetales al ataque de patógenos (Ellinger et al., 2013). Por tanto, parece claro que Trichoderma tiene que evadir las respuestas defensivas de la planta durante las primeras fases de la interacción, aunque posteriormente una activación de estas defensas limitará el crecimiento de este hongo impidiendo su acceso al sistema vascular. Esta hipótesis se ve reforzada por el hecho de que el grado de colonización de la raíz por este hongo beneficioso es mucho mayor en las líneas mutantes que en el tipo silvestre lo que apoya el importante papel del SA en esta interacción. Este resultado coincide con trabajos recientes donde se ha observado un grado de colonización mayor en el mutante FMO1 de Arabidopsis (afectado en el mecanismo de acción de esta hormona) que en el correspondiente tipo silvestre tras la colonización con T. asperelloides (Brotman et al., 2013), o en diferentes mutantes deficientes en SA tras la colonización con Piriformospora indica (Jacobs et al., 2011). Además de las barreras físicas, como la deposición de calosa, las plantas van a activar un complejo sistema inmune regulado por hormonas. Se sabe que Trichoderma es capaz de activar las rutas de señalización mediadas por JA/ET de una manera similar a la que promueven las rizobacterias promotoras del crecimiento (PGPRs) (Shoresh et al., 2010). Aunque se ha descrito que el SA y el JA son hormonas antagónicas (Thaler et al., 2012), se ha demostrado que este hongo es capaz también de incrementar la acumulación de SA (Velázquez-Robledo et al., 2011), así como de inducir respuestas defensivas en la planta dependientes tanto de JA como de SA (Woo et al., 2006; Salas-Marina et al., 2011). Nosotros, en este trabajo, hemos observado que GFP22 induce la expresión del gen Lox1, implicado en la biosíntesis de JA, así como del gen PR-1, implicado en el mecanismo de acción del SA, en raíces del tipo silvestre después de 72 h de la inoculación con el hongo. Aunque hay evidencias de que las respuestas defensivas son similares en las hojas y en las raíces (Jacobs et al., 2011), también se ha descrito que los patógenos activan respuestas específicas en la raíz (Millet et al., 2010), aunque se sabe muy poco sobre las respuestas inmunes de las plantas frente a microorganismos beneficiosos en la raíz (Zamioudis & Pieterse, 2012) y particularmente frente a Trichoderma (Brotman et al., 2013). Por tanto, en este trabajo, pretendemos incrementar el conocimiento en el papel del SA en las respuestas defensivas locales durante la interacción Trichoderma-planta. El incremento significativo en los niveles de expresión del gen Lox1 24 DISCUSIÓN inducidos por GFP22 en el mutante sid2, es coherente con su incapacidad para sintetizar SA. Por otra parte, y dado que Trichoderma es capaz también de inducir las defensas a través de la ruta del JA (Tucci et al., 2011), el considerable crecimiento del hongo que se detecta en el mutante sid2 puede también contribuir al incremento en genes implicados en la respuesta a esta hormona. De manera similar, en un trabajo reciente se ha comprobado que se produce un incremento en la expresión de este tipo de genes en plantas de Arabidopsis colonizadas por T. asperelloides (Brotman et al., 2013). También hemos observado que GFP22 induce la acumulación de calosa en raíces de plantas del tipo silvestre, aunque el conocimiento sobre este complejo mecanismo de defensa en respuesta al ataque de patógenos todavía es muy escaso (Luna et al., 2011). Se sabe que la síntesis de calosa regula negativamente la ruta de señalización del SA (Nishimura et al., 2003); sin embargo, nosotros hemos observado que tras 72 h de interacción entre GFP22 y plantas del tipo silvestre se produce una inducción en los niveles de expresión del gen Cals5, implicado en la biosíntesis de calosa, al mismo tiempo que se observa un incremento en los niveles de expresión de genes implicados tanto en la biosíntesis (Ics1) como en el mecanismo de acción del SA (PR-1). Estos datos sugieren que el SA desempeña un papel importante en la acumulación de calosa. La inducción del gen Ics1 en las raíces del mutante sid2 colonizadas por la cepa GFP22 indican que la planta necesitaría producir SA en respuesta a T. harzianum, como ocurre en el ecotipo Col-0. Sin embargo y debido a la inserción de T-DNA en este gen en la línea mutada, la proteína correspondiente no sería funcional y por lo tanto la hormona no se sintetizaría. 25 CONCLUSIONES CONCLUSIONES Teniendo en cuenta todos los resultados presentados en este trabajo, al igual que ha sido propuesto para otros microorganismos beneficiosos (Jacobs et al., 2011), indican que Trichoderma necesitaría suprimir, al menos parcialmente, el sistema inmune de la planta para colonizar la raíz, minimizando por tanto las defensas del hospedador. Posteriormente, se necesitaría una reactivación de las defensas mediadas por SA para evitar una invasión masiva de la raíz por parte del hongo, como hemos demostrado con los diferentes ensayos de colonización de la raíz en el mutante sid2. A pesar de que T. harzianum es un microorganismo beneficioso para la planta, es reconocido inicialmente como un agente invasor, y hemos comprobado que el SA juega un papel clave en esta interacción, ya que en su ausencia, la planta no es capaz de evitar la entrada del hongo en el tejido vascular, lo que provocaría la muerte posterior de la planta, comportándose como un patógeno. AGRADECIMIENTOS El presente Trabajo de Fin de Grado se engloba dentro de un proyecto de investigación financiado por la Junta de Castilla y León (SA260A11-2) y los proyectos nacionales españoles MICINN (AGL2009-13431-C02) y MINECO (AGL2012-40041-C02-01). 26 BIBLIOGRAFÍA BIBLIOGRAFÍA Alonso-Ramírez A, Rodríguez D, Reyes D et al. (2009). Plant Physiol 150: 1335-44. Altomare C, Norvell WA, Bjorkman T et al. (1999). Appl Environ Microbiol 65: 2926-2933. Benhamou N & Chet I (1996). Phytopathology 83: 1062-1071. Brotman Y, Briff E, Viterbo A et al. (2008). Plant Physiol 147: 779-789. 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