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Unidad N° 3: Enzimas Curso Bioquímica y Fitoquímica Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales UNLP Prof. Titular Sonia Z. Viña Enzimas Definición de metabolismo: conjunto de numerosas reacciones químicas catalizadas por enzimas, que se llevan a cabo en las células vivas. ¿Cómo definimos a las enzimas? ¿Cómo definimos a los sustratos? Características de las enzimas: A excepción de algunas moléculas de ácido ribonucleico (ARN) catalítico, la mayoría de las enzimas son proteínas. Características de las enzimas: Las enzimas son catalizadores verdaderos: producen cambios químicos en los sustratos pero no sufren modificaciones en su propia estructura. E + S ES E + P E = enzima S = sustrato P = producto Características de las enzimas: En general, las enzimas altamente específicos. son catalizadores Fuente: Taiz y Zeiger, 2010. Características de las enzimas: Las enzimas incrementan las velocidades de reacción varios miles o aún millones de veces con respecto a la reacción no catalizada. catalasa Ejemplo: 2 H2O2 2H2O + O2 Características de las enzimas: Las enzimas no afectan la constante de equilibrio (Keq) de las reacciones. v1 = k1 [S] k1 S P v-1 = k-1 [P] k-1 En el equilibrio: v1 = v-1 k1 [S] = k-1 [P] Si k1 = 10-4 s-1 y k-1 = 10-6 s-1 : Keq k1 [P] 102 k-1 [S] Estructura de las enzimas: Las enzimas son macromoléculas con Mr comprendida entre 12.000 y 1.000.000. Son, en consecuencia, mucho mayores si se comparan con los sustratos o grupos funcionales sobre los que actúan. El sustrato se une a la enzima en el denominado SITIO ACTIVO. Los residuos de aminoácidos que conforman el sitio activo son llamados GRUPOS CATALÍTICOS. Interacciones débiles, no covalentes Fuente: Voet et al., 1999 Estructura de las enzimas: Definiciones: COFACTOR. COENZIMAS (O CO-SUSTRATOS). Ej.: NADH, NADPH. GRUPO PROSTÉTICO. Ej.: FADH2 en las flavoproteínas (enzimas óxido-reductasas). HOLOENZIMAS. APOENZIMAS (O APOPROTEÍNAS). Cofactores orgánicos Mecanismo de acción de las enzimas: El ambiente celular normal se caracteriza por: 1) Medio acuoso 2) pH neutro 3) Temperatura moderada En estas condiciones las reacciones no catalizadas tienden a ser muy lentas Mecanismo de acción de las enzimas: En una reacción química, un valor de ΔG0´ negativo no indica que la conversión S P sea rápida. La velocidad de reacción es dependiente de un parámetro diferente: la ENERGÍA DE ACTIVACIÓN (Ea). Ea Ea Fuente: Nelson y Cox, 2005 Modo de acción de las enzimas: ENERGÍA DE ACTIVACIÓN (Ea): es la diferencia entre los niveles energéticos del estado basal y del estado de transición. Cuanto mayor es el valor de Ea, menor es la velocidad de reacción (la reacción es más lenta). Un catalizador actúa disminuyendo la Ea del sistema. Ejemplo: oxidación de la glucosa a expensas de O2, para producir CO2 y H2O a nivel celular glucólisis y ciclo de Krebs. Mecanismo de acción de las enzimas: Múltiples interacciones débiles, no covalentes, que se establecen entre el sustrato y la enzima. Energía de fijación ESPECIFICIDAD y CATÁLISIS Relaciones entre la enzima y el sustrato: - Emil Fisher, 1894. Teoría de la llave - cerradura. Fuente: Mathews, Van Holde y Ahern, 1999 Relaciones entre la enzima y el sustrato: Fuente: Nelson y Cox, 2005 Relaciones entre la enzima y el sustrato: - Daniel Koshland, 1958. Teoría del ajuste inducido. Fuente: Mathews, Van Holde y Ahern, 1999 Factores que afectan la velocidad de las reacciones enzimáticas Definición de Cinética Química 1°) Concentración de sustrato Dado que la [S] cambia durante el transcurso de la reacción, es necesario realizar el estudio de la velocidad inicial de reacción (v0), cuando la [S] es generalmente mayor que la [E]. Vmáx Vmáx/2 Fuente: Boyer, 2000 Km Cinética del estado estacionario La teoría general de la acción enzimática fue formulada hacia 1913 por Leonor Michaelis y Maud Menten. Ecuación de Michaelis – Menten: V0 Vmáx [S] Km + [S] Propiedades cinéticas de la enzima RubisCO a 25°C Fuente: Heldt, 2005 2°) Concentración de enzima - Bajo circunstancias normales y cuando la [S] no es un factor limitante, la velocidad inicial de reacción es directamente proporcional a la concentración de enzima presente. - Es posible determinar o estimar la concentración de una enzima a través de la medida de la velocidad inicial de reacción. 3°) Temperatura 4°) pH Las enzimas están sujetas a mecanismos de regulación y son susceptibles a la inhibición Metil naftilcarbamato Insecticida Carbamato Marca comercial: Clartex BB, Enigma, Sevin 85S, Sevin XLR Plus Lagarta rosada Gusano del brote del duraznero Aplicación de enzimas como aditivos en alimentación animal Fuente: Mc Donald et al., 2002 Aplicaciones de las enzimas en Agro-foresto-industrias : producción de etanol a partir de biomasa vegetal https://web.extension.illinois.edu/ethanol/cellulosic.cfm Bibliografía: - Berg, J. 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