Download + n° 13 - Septiembre 2008 - Sociedad Argentina de Genética

NOTICIERO GENETICO SEGEHU Nº 13 - Septiembre de 2008
La Sección de Genética Humana (SEGEHU) de la Sociedad Argentina de Genética vuelve a
dirigirse a los amigos y colegas dedicados a tareas vinculadas con Genética Humana,
ofreciendo este Noticiero Genético.
Invitamos a todos los colegas y amigos a enviar contribuciones, adjuntando un pequeño
comentario de la novedad y el PDF o documento correspondiente. Enfatizamos esta invitación
porque deseamos evitar un sesgo en la selección de temas que pueda depender de las
preferencias personales de los organizadores. Seguramente muchos de Uds tienen material de
buena calidad que sea de interés para toda la comunidad de genética humana.
Se encuentran disponibles, a pedido de los interesados, los PDF u otras fuentes electrónicas
de los artículos o documentos completos, que se pueden solicitar a Martín Roubicek
<roubicek@mdp.edu.ar> o a José E. Dipierri <dipierri@inbial.unju.edu.ar>
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Screening neonatal de fibrosis quística: evaluación costo-beneficio
El tema de las pruebas de tamizaje neonatal para enfermedades cuyo tratamiento precoz es
indispensable para prevenir alteraciones del sistema nervioso central y otras, no fue motivo de
grandes debates respecto de su justificación por parte de autoridades responsables de la Salud
Pública. En el caso de la fibrosis quística (CF), el tema ha sido más discutido por no estar tan
claros los argumentos a favor de una recomendación general para la población.
Un estudio detallado de autores de diversos centros del Reino Unido, estimó que desde el
punto de vista puramente económico, el beneficio en cuanto al costo de incluir un tamizaje para
CF - utilizando un protocolo de tripsinógeno inmunoreativo o el kit de ADN para 31 mutaciones resultó evidente en base a costos de la atención de pacientes en el Reino Unido.
Un comentario editorial de autores australianos apoya esta opinión.
Economic implications of newborn screening for cystic
fibrosis:
a cost of illness retrospective cohort study
Erika J Sims, Miranda Mugford, Allan Clark, David Aitken, Jonathan McCormick, Gita Mehta,
Anil Mehta, on behalf of the UK Cystic Fibrosis Database Steering Committee.
Lancet 2007; 369: 1187–95
Background Newborn screening for cystic fibrosis might not be introduced if implementation and running
costs are
perceived as prohibitive. Compared with clinical diagnosis, newborn screening is associated with clinical
benefit and
reduced treatment needs. We estimate the potential savings in treatment costs attributable to newborn
screening.
Methods Using the UK Cystic Fibrosis Database, we used a prevalence strategy to undertake a cost of
illness retrospective snapshot cohort study. We estimated yearly costs of long-term therapies and
intravenous antibiotics for 184 patients who were diagnosed as a result of screening as newborn babies,
and 950 patients who were clinically diagnosed aged 1–9 years in 2002. Costs of adding cystic fibrosis
screening to an established newborn screening service in Scotland were adjusted to 2002 prices and
applied to the UK as a whole. Costs were recalculated in US$.
Findings Cost of therapy for patients diagnosed by newborn screening was significantly lower than
equivalent therapies for clinically diagnosed patients: mean ($7228 vs $12 008, 95% CI of difference
−6736 to −2028, p<0·0001) and median ($352 vs $2442, −1916 to −180, p<0·0001). When we limited the
clinically diagnosed group to only those diagnosable with a 31 cystic fibrosis transmembrane regulator
mutation assay and assumed similar disease progression in the clinically diagnosed group as in the
newborn screening group, we showed that mean ($3 397 344) or median ($947 032) drug cost savings
could have offset the estimated cost of adding cystic fibrosis to a UK national newborn screening service
($2 971 551).
Interpretation Including indirect costs savings, newborn screening for cystic fibrosis might have even
greater financial benefits to society than our estimate shows. Clinical, social, and now economic evidence
suggests that universal newborn screening programmes for cystic fibrosis should be adopted
internationally.
More evidence to favour newborn screening for cystic
fibrosis
Comment Lancet 2007; 369:1146-7
Bridget Wilcken, Kevin Gaskin
Children’s Hospital at Westmead, NSW 2145, and University of Sydney, Sydney, NSW 2006, Australia
bridgetw@chw.edu.au
Melanoma: no basta el sol
Las personas con una piel clara presentan mayor riesgo de desarrollar melanoma. La
exposición al sol puede determinar mutaciones del gen BRAF frecuentes en melanoma.
Las diferencias en el color de la piel o pigmentación se deben al gen del receptor de
melanocortina-1 (MC1R). Algunas variantes del gen MC1R son responsables de rasgos
tales como piel clara, pecas o cabello rojo. Pero además de estos efectos sobre la
pigmentación las variantes del gen MC1R parecen actuar como factor predisponerte
para melanomas en personas con escasa exposición al sol y con piel oscura. Debido a
que algunos melanomas en áreas de la piel con escaso signo de daño crónico inducido
por el sol se presentan en personas jóvenes y que estos melanomas exhiben
frecuentemente mutaciones en el gen BRAF se hipotetiza que existirían factores
genéticos que predispondrían al desarrollo de estos melanomas con mutaciones BRAF.
Este candidato parece ser el gen MC1R. En efecto, la secuenciación del gen MC1R en
células normales y del gen BRAF en células tumorales indican que las mutaciones
BRAF son más frecuentes en casos de melanoma no crónico inducido por el sol con
variantes genéticas del gen MC1R. Se han identificado también otros genes de
susceptibilidad a melanoma de alta penetrancia: cyclin-dependent kinase inhibitor
(CDKN2A) en 9p21 y cyclin-dependent kinase (CDK4) en 12q13. Estos trabajos
indican por lo tanto la estrecha asociación entre genes determinantes de la pigmentación
y sus variantes y el riesgo de desarrollar melanomas. Los tres trabajos que se adjuntan
se relacionan a esta temática. Sulem et al. (2008) identifican dos variantes en el gen
TPCN2 (encoding two-pore segment channel 2) asociadas al pelo rojo y una variante en
el locus ASIP (encoding agouti signaling protein) que se asocia fuertemente a
sensibilidad dérmica al sol, pecas y pelo color rojo características similares que se
encuentran en sujetos con mutaciones del MC1R. Por otra parte Brown et al., (2008)
identifican un nuevo locus para riesgo de melanoma de aparición temprana localizado
en 20q11.22. Finalmente, Gudbjartsson et al. en el mismo número de la revista,
informan sobre sus estudios de las variantes en genes ASIP y TYR y su asociación con
el melanoma cutáneo y el carcinoma basocelular. Una nota de comentario sobre los tres
trabajos, de Paul Pharoah en la sección News and Views, resume todos estos hallazgos.
Two newly identified genetic determinants of pigmentation in Europeans
Patrick Sulem1, Daniel F Gudbjartsson1, Simon N Stacey1, Agnar Helgason1, Thorunn Rafnar1, Margret
jakobsdottir1, Stacy Steinberg1, Sigurjon A Gudjonsson1, Arnar Palsson1, Gudmar Thorleifsson1,
Snæbjo¨rn Pa´lsson1, Bardur Sigurgeirsson2,3, Kristin Thorisdottir2–4, Rafn Ragnarsson4, Kristrun R
Benediktsdottir2,3, Katja K Aben5,6, Sita H Vermeulen6, Alisa M Goldstein7, Margaret A Tucker7,
Lambertus A Kiemeney5,6,8, Jon H Olafsson2,3, Jeffrey Gulcher1, Augustine Kong1, Unnur
Thorsteinsdottir1 & Kari Stefansson1
We present results from a genome-wide association study for variants associated with
human pigmentation characteristics among 5,130 Icelanders, with follow-up analyses in
2,116 Icelanders and 1,214 Dutch individuals. Two coding variants in TPCN2 are
associated with hair color, and a variant at the ASIP locus shows strong association with
skin sensitivity to sun, freckling and red hair, phenotypic characteristics similar to those
affected by well-known mutations in MC1R.
Nat Genet 2008;40(7):835-7.
C:\Eudora\Dipi\attach\ng.160.pdf;
Common sequence variants on 20q11.22 confer melanoma susceptibility
Kevin M Brown1,23, Stuart MacGregor2,23, Grant W Montgomery2, David W Craig3, Zhen Zhen
Zhao2, Kelly Iyadurai1, Anjali K Henders2, Nils Homer4, Megan J Campbell2, Mitchell Stark2, Shane
Thomas2, Helen Schmid5, Elizabeth A Holland5, Elizabeth M Gillanders6, David L Duffy2, Judith A
Maskiell7, Jodie Jetann8, Megan Ferguson8, Dietrich A Stephan3, Anne E Cust7, David Whiteman2,
Adele Green2, Ha°kan Olsson9,21,22, Susana Puig10,22, Paola Ghiorzo11,22, Johan Hansson12,22,
Florence Demenais13,22, Alisa M Goldstein14, Nelleke A Gruis15,22, David E Elder16,22, Julia Newton
Bishop17,22, Richard F Kefford5, Graham G Giles18, Bruce K Armstrong19, Joanne F Aitken8, John L
Hopper7, Nicholas G Martin2, Jeffrey M Trent20, Graham J Mann5 & Nicholas K Hayward2
We conducted a genome-wide association pooling study for cutaneous melanoma and
performed validation in samples totaling 2,019 cases and 2,105 controls. Using pooling,
we identified a new melanoma risk locus on chromosome 20 (rs910873 and rs1885120),
with replication in two further samples (combined P < 1 x 10-15). The per allele odds
ratio was 1.75 (1.53, 2.01), with evidence for stronger association in early-onset cases.
Nature Genetics 2008;40(7):838-840
c:\eudora\dipi\attach\melanoma_ch20_NG.pdf
ASIP and TYR pigmentation variants associated with cutaneous melanoma and
basal cell carcinoma.
Daniel B Gudbjartsson, Patrick Sulem, Simon N Stacey et al.
Fair color increases risk of cutaneous melanoma (CM) and basal cell carcinoma (BCC).
Recent genome-wide association studies have identified variants affecting hair, eye and
skin pigmentation in Europeans. Here, we asses the effct of these variants on risk of CM
and BCC in European populations comprising 2,121 individuals with CM, 2,163
individuals with BCC and over 40,000 controls. A haplotype near ASIP, known to
affect a similar spectrum of pigmentation traits as MC1R variants, conferred significant
risk of CM (odds ratio (OR) = 1.45, P = 1.2 x 10-9) and BCC (OR=1.33, P = 1.2 x 10-6).
The variant in TUR encoding the R402Q amino acid substitution, previously known to
affect eye color and tanning response, conferred risk of CM (OR = 1.21, P = 2.8 x 10-7)
and BCC (OR = 1.14, P = 6.1 x 10-4). An eye color variant in TYR1 was associanted
with risk of CM (OR 1.15, P = 4.6 x 10-4). The association of al three variants is robust
with respect to adjustment for the effect of pigmentation.
Nature Genetics 2008;40(7):886-891
Shedding light on skin cancer.
Paul DP Pharoah
(University of Cambridge, UK)
Pigmentation traits are known risk factors for skin cancer. Now, three new studies
provide insights into the genetic factors underlying these effects, and the results reveal a
surprisingly complex picture of the relationship between pigmentation traits and disease
risk.
Nature Genetics 2008;40(7):817-818