Download Aplicaciones de la secuenciación masiva a los estudios evolutivos y

Aplicaciones de la secuenciación masiva a los estudios evolutivos y
ecológicos en eucariotas
Coordinación:
Dra. Mariana Cosse & Dr. Andrés Iriarte
Prof. Visitante:
Dr. Federico G. Hoffmann
Assistant Professor
Department of Biochemistry and Molecular Biology
Mississippi State University
Docentes participantes:
Colaboran:
Prof. Dr. Héctor Musto, Dr. Uriel Koziol
M.Sc. Natalia Mannise y M.Sc. Eugenio Jara
Contenido
La secuenciación masiva (SM) ha resultado en una revolución para diversas áreas de la biología.
Esta metodología genera una cantidad extraordinaria de información que sólo puede ser
analizada mediante herramientas bioinformáticas. Este tipo de datos permite plantearse
preguntas relacionadas a la dinámica y los procesos evolutivos que organizan y moldean el
genoma, así como la función de los distintos elementos genéticos en el mismo. Planteamos
introducir a los estudiantes en varios tópicos del área genómica comparativa y mostrar el
potencial de la SM para abordar problemas de distintas áreas como pueden ser la evolución y la
ecología.
Palabras claves: Genómica, bioinformática, familias multigénicas
PROGRAMA
Teóricos: (1 hora)
1. Introducción al Curso. Introducción a la Genómica y a los métodos de secuenciación
masiva. (a cargo de Dr. Iriarte)
2. Genómica evolutiva I, Introducción. (a cargo de Dr. Hoffmann)
3. Genómica evolutiva II, principales aplicaciones. (a cargo de Dr. Hoffmann)
4. Filogenia de Eucariotas. (a cargo de Dr. Koziol)
5. Propiedades básicas de los genomas de Eucariotas. (a cargo de Dr. Iriarte)
6. La organización del genoma eucariota. (a cargo del Prof. Dr. Musto)
7. Aplicaciones en estudios ecológicos I: Barcoding. (a cargo de Dra. Cosse)
8. Aplicaciones en estudios ecológicos II: Genómica poblacional. (a cargo de Dra. Cosse)
9. Aplicación a estudios evolutivos I: Estudio de familias multigénicas, Introducción. (a
cargo de Dr. Hoffmann)
10. Aplicación a estudios evolutivos II: Estudio de familias multigénicas, El rol de la selección
natural. (a cargo de Dr. Hoffmann)
Prácticos, Seminarios y Evaluación (3.5 horas)
1. Seminario: Discusión de artículos (2) sobre Secuenciación masiva. (Dirigido por Dres.
Cosse, Hoffmann & Iriarte)
2. Seminario abierto: Genómica evolutiva. (Dirigido por el Dr. Hoffmann)
3. Práctico: Herramientas para ensamblado y anotación de genomas eucariotas. (Dirigido
por Dr. Iriarte)
4. Práctico: Herramientas online para análisis comparativo de genomas. (Dirigido por Dres.
Hoffmann-Iriarte)
5. Seminario: Discusión de artículos (2) sobre procesos que moldean el genoma de
Eucariotas. (Dirigido por Dres. Koziol, Hoffmann & Iriarte)
6. Práctico: Análisis de secuencias de genomas. (Dirigido por Dr. Iriarte)
7. Práctico: Análisis de datos de secuenciación masiva para estudio de dieta. (Dirigido por
Dres. Cosse & Iriarte)
8. Seminario: Discusión de artículo sobre Genómica de la conservación. (Dirigido por Dra.
Cosse)
9. Práctico: Análisis filogenético y molecular de familias multigénicas, Parte I. (Dirigido por
Dres. Hoffmann, Cosse & Iriarte)
10. Práctico: Análisis filogenético y molecular de familias multigénicas, Parte II. // Cierre del
Curso. (Dirigido por Dres. Hoffmann, Cosse & Iriarte).
Evaluación: Examen escrito individual, con preguntas abiertas, 3 horas.
INCIO: 5 de diciembre
FINALIZACIÓN: 16 de diciembre
El curso será dictado en el IIBCE- sala Sáez.
Horario: 9:00 – 14:00 hs
Contacto: Mariana Cosse marianacosse@gmail.com