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Técnicas inmunológicas y moleculares para la determinación de haplotipos HLA y transplantes en general Inmunología Aplicada 1065 Formación de profesores 2005 Carolina Hernández Supervisado por MD Lastra Microlinfocitotoxicidad Se distribuyen los linfocitos de los donadores potenciales y el receptor en una placa de microtitulación. Se añaden a los diferentes pozos anticuerpos específicos para diversos alelos MHC de las clases I y II. Se incuba y se adiciona complemento a los pozos y se valora la citotoxicidad según la captación o exclusión de colorante por las células. Si los leucocitos expresan el alelo MHC para el que es específico el anticuerpo, las células experimentan lisis al añadir complemento y estas células captan el colorante. Esta prueba puede indicar la presencia o ausencia de diversos alelos MHC Cultivo Mixto de Linfocitos Cuando se combinan los linfocitos de dos individuos con diferentes HLA en el cultivo de tejido, las células crecen, sintetizan DNA y proliferan, mientras que las células con HLA idéntico permanecen en reposo. La proliferación se desencadena principalmente por diferencias en los antígenos HLA clase II entre las dos poblaciones células por analizar. La reactividad en la prueba CML quizá refleja el paso inicial del reconocimiento inmunitario del rechazo a transplante in vivo. Mientras más inmunogénica sea la diferencia del locus D, mayor será la respuesta celular del CML y mayor posibilidad habrá de un rechazo al transplante. Normalmente ambas células proliferan y forman el CML de doble vía. Para evaluar la respuesta de una sola célula responsable, se inactiva la célula estimulante por medio de radiación o fármacos , que inhiben la síntesis de DNA. Por lo general se presenta una respuesta proliferativa después de incubar 6 días. Entonces, se aplica al cultivo un pulso de timidina tritiada de 5 a 12 horas para marcar al DNA recién sintetizado. Finalmente se cosechan las células, se libera la radioactividad no adherida y con un contador beta se da el resultado en CPM. Esta prueba se utiliza para confirmar la aparente identidad de HLA, en el caso de transplante de donador familiar. Revela incompatibilidades ocultas de clase II. LMC La exposición a antígenos no propios de clases I y II, puede dar como resultado la generación de linfocitos T citotóxicos (CTL). Los CTL matan a sus células blanco mediante contacto directo, quizá por la liberación de mediadores tóxicos que llevan a la lisis celular. Los CTL tipo CD4 y CD8, se pueden observar infiltrando los aloinjertos renales durante el rechazo y se considera que son efectores importantes en la pérdida del injerto. Se corre un CML primario con las células del donador como estimulantes inactivados. Se cosechan las células del paciente y se reexponen en cultivo a células frescas del donador, marcadas con Cr51. Por lo general, la células marcadas se preincuban con PHA durante 6 días (incorporan más cromo que los linfocitos en reposo). Las CTL y las células marcadas se colocan en relación de blanco a efector de 100:1, 50:1 y 10:1. Los pozos control incluyen blancos solos para medir la liberación espontánea de la marca y pozos de prueba que contienen células marcadas. Después de 4 horas de incubación se toma una muestra del sobrenadante de cada pozo de prueba y se cuenta. Las cuentas elevadas de 30 a 50% que exceden la actividad de fondo, son indicativas de actividad de linfocitos T citotóxicos. Esta prueba puede evaluar el rechazo posterior al trasplante de riñón y médula ósea. Pruebas cruzadas El propósito de las pruebas cruzadas es detectar la presencia de anticuerpos en el suero del paciente, dirigidos contra los antígenos HLA del presunto donador. En caso de estar presentes, los anticuerpos dan la señal al sistema inmune de que el receptor ha estado sensibilizado contra estos antígenos del donador y que por tanto, está preparado para rechazar de manera enérgica cualquier injerto que los posea. Linfocitotoxicidad manera preliminar se evalúa a donadores potenciales utilizando el método estándar de citotoxicidad usando como células blanco las células del donadores. En condiciones normales, los PBL son alrededor de 80% de células T que poseen sólo antígenos HLA clase De resto son células B y monocitos, que poseen ambas clases de HLA. Una prueba positiva por medio de citotoxicidad indica claramente la presencia de anticuerpos contra antígenos de clase I. El Pruebas cruzadas con células T Se realizan a 37 °C para evitar el enlace de anticuerpos frios, que se supone, son autorreactivos. Una prueba positiva células T por cualquier método contraindica el trasplante. Pruebas cruzadas con células B Las pruebas cruzadas para anticuerpos contra antígenos HLA clase II, requiere el uso de linfocitos B como células blanco. Una prueba cruzada positiva para células B puede provenir de anticuerpos que se enlazan a antígenos HLA clase I o II. Más aún, las células B son un indicador más sensible para anticuerpos débiles clase I, ya que llevan moléculas clase I en mayor densidad que las T. Pruebas cruzadas por citometría de flujo Se ha demostrado que las pruebas cruzadas mediante citometría de flujo (FCC) son hasta 100 veces más sensibles que los métodos serológicos visuales para la detección de anticuerpos HLA en los linfocitos Las células T se pueden separar de las B por medio de un anticuerpo fluoresceínado (anti-CD3) Los linfocitos del donador se incuban con el suero del paciente para permitir la fijación de cualquier anticuerpo antidonador. Los anticuerpos enlazados a la población de células T seleccionada, se detectan mediante IgG anti-humana específica antiFc del anticuerpo F(ab´)2y se marca con un fluorocromo distinto al que marca a las células T Métodos Moleculares para HLA Nombre Reactivos característicos Procesos característicos Polimorfismos detectados RFLP Endonucleasas de restricción bacteriana Southern blot Longitud del fragmento de restricción SSP Cebadores de PCR específicos a secuencia PCR/electroforésis en gel Genérico a antígenos HLA a nível de alelo SSOP Sondas de aligonucléotido específicas a secuencia PCR/hibridación de Alelos HLA sondas con producto de la PCR SBT Cebadores marcados/terminald ores de secuencia marcados PCR/establecimien Alelos a nivel de to de secuencia del secuencia exacta producto de la PCR Análisis heterodúplex DNA desnaturalizado de tira simple/generador UHG Reunión de tiras de DNA /electroforésis del DNA recombinado Complejos del DNA característicos de alelos Polimorfismo en la Longitud de los Fragmentos de Restricción (RFLP) El DNA genómico extraído de células se digiere con enzimas de restricción selectiva. Los digeridos se someten a una electroforesis en gel de agarosa, el DNA se desnaturaliza en tiras de una sola cadena y el patrón de los fragmentos se transfiere a una membrana de soporte, mediante Southern blot Los fragmentos de DNA, se hibridan con una sonda específica para el sitio HLA, marcado con material radioactivo (DRB1). Después de la autorradiografía los fragmentos de restricción que se han hibridado con la sonda, aparecen como patrones de bandas aisladas de tamaño específico (kB) Muchos alelos HLA tienen patrones característicos de formación de bandas (polimorfismo en la longitud del fragmento). Los productos amplificados son objeto de electroforésis y se tiñen con bromuro de etidio y se fotografía bajo luz UV. Si los cebadores hibridizan con la muestra de DNA, es visible una banda (la cual indica la presencia del alelo HLA particular). La falta de amplificación implica la ausencia de esa secuencia alélica particular en la muestra de DNA. Primers de secuencia específica (SSP) Se extrae el DNA de la muestra (células, tejidos) y se mezclan con cebadores que tienen especificidad para las secuencias características de cada uno de los alelos del sitio HLA clase II que se tipifican (DRB1,DRB3,etc.). Se colocan alícuotas de la muestra en tubos separados cada uno contiene un conjunto de cebador específico y se amplifica en un termociclador. Los productos amplificados son objeto de electroforésis y se tiñen con bromuro de etidio y se fotografía bajo luz UV. Si hibridizan con la muestra de DNA, se hace visible una banda (la cual indica la presencia del alelo HLA particular). La falta de amplificación implica la ausencia de esa secuencia alélica particular en la muestra de DNA. Todos los tubos contienen una plantilla de DNA adicional que híbrida con todos los primers para servir como un control en el éxito de la PCR. Sondas de oligonucleótidos especifìcas de secuencias (SSOP) Las sondas de oligonucleótido son segmentos cortos de DNA de tira simple, de 18 a 24 nucleótidos, cada uno de los cuales está constituido por una secuencia de nucleótido complementaria a un motivo de secuencia particular que se encuentra dentro de las regiones invariables de los alelos HLA individuales. Estas sondas solo hibridan con sus secuencias exactamente complementarias en condiciones estrictas de hibridación. Aún la diferencia de un simple par de bases hace que las sondas se separen del pareado con el DNA blanco. Está propiedad de especificidad perfecta de secuencia brinda a este modelo de tipificación una mayor resolución de alelos del HLA Método SSOP Dot-Blot Se aplican las muestras de DNA (o RNA) directo en una membrana de soporte mediante el uso de una plantilla de hendidura (solt-blot). Los replicados de una sola muestra se colocan en una sola columna de hendiduras. Después de que se han dispersado las muestras, la membrana se corta en líneas horizontales. Se preparan sondas individuales especificas y diagnósticas para alelos individuales HLA, como DR1y DR2. Cada banda se hibrída con una sonda distinta de oligonucleótidos especifica de secuencia radiomarcado (SSOP). La membrana se reensambla y se revela por autorradiografía o colorimetricamente. Una banda indica la presencia en la muestra de la secuencia del alelo HLA correspondiente SSOP Dot-Blot reversa Un método más simple consiste en fijar las sondas específicas de secuencia a la membrana de soporte y se aplican gotas del DNA de la muestra en las sondas. Se permite que la muestra de DNA hibríde, se lava la membrana y se revelan las manchas de la sonda de hibridación con la muestra del DNA por métodos colorimétricos Tipificación basada en secuencia (SBT) Se aisla el DNA de una célula o tejido y se amplifica mediante la PCR con el uso de cebadores de sitio o especifícos a grupo. El producto amplificado se distribuye en cuatro tubos, cada uno de los cuales tiene polimerasa, dNTP y mezclas de establecimiento de secuencia . Cada una de estas mezclas esta marcada con un terminador de secuencia marcado con fluorescencia. El tubo 1 contiene citosina marcada;el tubo 2, guanina marcada; el tubo 3, timina marcada y el tubo 4, adenina marcada. El producto se amplifica mediante la PCR para incorporar los terminadores marcados. Los cuatro tubos de muestra se mezclan y se sujetan a electroforésis para formar una escalera de secuencia, la cual se rastrea por un láser para generar un electroferograma de secuencia del DNA. Con el uso de programas de computadora se compara la secuencia con la biblioteca de secuencias de antígenos HLA y se asignan los antígenos HLA Análisis heterodúplex Polimorfismo conformacional de tira única (PCR-SSCP) Método rápido que usa la propiedad que tienen las tiras desnaturalizadas del DNA para reunirse nuevamente en heterodúplex (formar la doble hélice). Sí los individuos son genéticamente distintos para alelos HLA, la desigualdad en las bases polimorfas modifica la desviación o aumenta el diámetro superhelicoide del DNA y causa retardo en la movilización electroforética. Cuando se mezcla DNA desnaturalizado de dos individuos diferentes se forman nuevos heterodúplex con generación de nuevos patrones de banda en la electroforesis. Puede evaluarse rápidamente la identidad genética entre dos indiciduos mezclandop DNA de la PCR de sus genes HLA. De manera alterna, puede agregarse DNA de referencia para un alelo simple o una molécula generadora heterodúplex universal sintética (UHG) a la muestra de la PCR. Esto forma complejos heterodúplex singulares para cada alelo y de esta manera se generan bandas características que ayudan al diagnóstico. Tipificación VNTR El genoma humano contiene trechos de secuencias sumamente repetitivas, que a menudo se presentan en agrupamientos. El numero de repeticiones en un agrupamiento varia entre individuos y da lugar a un número variable de duplicados colocados en tándem (VNTR). Este polimorfismo puede traducirse en fragmentos de amplitud variable para amplificación con la PCR mediante primers diseñados para amplificar la región de la repetición. Los VNTR tienen clásicamente una longitud de 10 a 50 bases, también se usan polimorfismos genéticos de secuencias cortas conocidas como duplicados cortos en hilera (STR) de 4 a 9 pb de longitud, para la determinación de “huellas digitales” de DNA. Los VNTR pueden analizarse con electroforesis del DNA ya sea genómico o amplificado por la PCR. Una aplicación de los VNTR es la vigilancia del establecimiento del injerto en receptores de transplante de médula ósea. Los análisis de VNTR se usan como un marcador genético con aplicaciones tanto clínicas como forenses.