Download Enzimas

Enzimas
Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estereo especificidad)
COOC-H
H-C
Fumarato
(= ,trans)
COO-
COOC-H
C-H
COO-
+ N H3+
Aspartasa
COOH3+N-C-H
C-H2
COOL-Aspartato
COOH-C- NH3+
C-H2
COOD-Aspartato
Maleato
(= ,cis)
Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estereo especificidad)
• Aceleran reacciones específicas químicas(103-10 20)
• Actúan en disolución acuosa, a pH y temp. óptimos
Enzima
pH óptimo
Pepsina
1.5
Tripsina
7.7
Catalasa
7.6
Arginasa
9.7
Fumarasa
7.8
Ribonucleasa
7.8
Enzima
Temp. Ópt.
(oC)
Mamíferos
37
Bacterias y algas
aprox.
100
Bacterias Árticas
aprox.
0
Bacterias en muestra de hielo antigua
Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estéreo especificidad)
• Aceleran reacciones específicas químicas(103-10 20)
• Actúan en disolución acuosa, a pH y temp. Óptimos
• Son las unidades funcionales del metabolismo celular
Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estéreo especificidad)
• Aceleran reacciones específicas químicas(103-10 20)
• Actúan en disolución acuosa, a pH y temp. Óptimos
• Son las unidades funcionales del metabolismo celular
• Reacciones acopladas (catabolismo – anabolismo)
Enzimas
• Catalizadores biológicos. Proteínas de forma globular
• Específicas para un substrato particular (Estéreo especificidad)
• Aceleran reacciones específicas químicas(103-10 20)
• Actúan en disolución acuosa, a pH y temp. Óptimos
• Son las unidades funcionales del metabolismo celular
Reacciones acopladas (catabolismo – anabolismo)
• Reguladoras de rutas metabólicas (Oligoméricas)
Enzima
(gr).
: fermento
1800´s
fermentación del azúcar por levaduras
Vitalistas
Mecanicistas
1926, James B. Summer
1930´s
Ureasa
Pepsina
Tripsina
Quimotripsina
Carboxipeptidasa
Enzima Amarillo viejo (flavoproteína NADPH)
Medicina
Transaminasas
Industria
Química
Penicilina
Transformación
de Alimentos
Fermentaciones
Quesos
Vinos
Agricultura
Rhyzobium
Estructura
globular
 Hervir con HCl
 Tripsina
 Temperatura elevada
 pH extremo
Funcionalidad
Inactiva
S: PM 250, 0.8 nm Ø
Cofactor
E: PM 100000, 7 nm Ø
Inorgánico:
Fe2+, Mn2+, Zn2+,etc.
Orgánico:
Coenzimas
NAD,
FAD,
CoASH.
Grupo Prostético
Apoenzima
Holoenzima
Enzimas que requieren
elementos inorgánicos
Citocromo oxidasa
Catalasa, peroxidasa
Fe2+, Fe+,
Citocromo oxidasa
Cu2+
DNA polimerasa
Anhídrasa carbónica
Alcohol deshidrogensa
Zn2+
Hexoquinasa
Glucosa 6-fosfatasa
Mg2+
Arginasa
Mn2+
Piruvato quinasa
K+, Mg2+
Ureasa
Ni2+
Nitrato reductasa
Mo2+
Coenzimas: Actúan como transportadores eventuales de
átomos específicos o de grupos funcionales
Coenzimas
Entidad transferida
Pirofosfato de tiamina . Aldehídos
Dinucleótido de flavina y adenina. Átomos de hidrógeno
Ion hidruro (H-)
Coenzima A . Grupos acilo
Dinucleótido de nicotinamida y de adenina
Fosfato de Piridoxal . Grupos amino
5’-Desoxicobalamina (Coenzima B12) Átomos de H y grupos
alquilo
Biocitina . CO2
Tetrahidrofolato . Otros grupos
monocarbonados
Coenzimas
Adenosine Triphosphate (ATP)
Coenzyme A (CoA)
Nicotinamide Adenine
Dinucleotide (NAD+)
Nicotinamide Adenine Dinucleotide
Phosphate (NADP+)
Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
VITAMINAS
•C (ácido
ascórbico)
•B1 (tiamina)
•B2
(riboflavina)
•B3 (ácido
pantoténico)
FUNCIONES
•Coenzima de algunas peptidasas.
Interviene en la síntesis de colágeno
•Coenzima de las descarboxilasas y de
las enzima que transfieren grupos
aldehídos
•Constituyente de los coenzimas FAD y
FMN
•Constituyente de la CoA
•B5 (niacina)
•Constituyente de las coenzimas NAD y
NADP
•B6
(piridoxina)
•Interviene en las reacciones de
transferencia de grupos aminos.
•B12
(cobalamina)
•Biotina
•Coenzima en la transferencia de grupos
metilo.
•Coenzima de las enzimas que
transfieren grupos carboxilo, en
metabolismo de aminoácidos.
Enfermedades
carenciales
•Escorbuto
•Beriberi
•Dermatitis y lesiones
en las mucosas
•Fatiga y trastornos del
sueño
•Pelagra
•Depresión, anemia
•Anemia perniciosa
•Fatiga, dermatitis
Substrato
Enzima
Urea
Ureasa
Arginina
Arginasa
Pepsina
Lis, Arg
Tripsina
Amilasa
Rec A
rec A
HSP70
Proteína de
choque térmico
gen
Caract.
Comité de la Unión Internacional de Bioq. y Biol. Mol. (IUBMB)
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
http://www.enzyme-database.org/
http://us.expasy.org/enzyme/
EC 1.1.1.2
+
Accepted alcohol dehydrogenase (NADP )
name:
+
+
Reaction: an alcohol + NADP = an aldehyde + NADPH + H
+
Other na aldehyde reductase (NADPH2); NADP-alcohol dehydrogenase; NADP +
me(s): aldehyde reductase; NADP -dependent aldehyde reductase; NADPHaldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific
succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low-Km aldehyde reductase;
+
high-Km aldehyde reductase; alcohol dehydrogenase (NADP )
+
Systematic name: alcohol:NADP oxidoreductase
Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary
alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical
with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33
[mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde
reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH.
Links to other da BRENDA, ERGO, EXPASY, IUBMB, KEGG, PDB, CAS registry
tabases: number: 9028-12-0
Clases de Enzimas:
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Liasas
5. Isomerasas
6. Ligasas
EC 1.1 Acting on the CH-OH group of donors
EC 1.1.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.1.1.1 alcohol dehydrogenase
EC 1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP+)
EC 1.1.1.3 homoserine dehydrogenase
EC 1.1.1.4 (R,R)-butanediol dehydrogenase
EC 1.1.1.5 acetoin dehydrogenase
EC 1.1.1.6 glycerol dehydrogenase
EC 1.1.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.1.2.1 now EC 1.1.99.5
EC 1.1.2.2 mannitol dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.1.3 With oxygen as acceptor
EC 1.1.3.1 deleted, included in EC 1.1.3.15
EC 1.1.3.2 now EC 1.13.12.4
EC 1.1.3.3 malate oxidase
EC 1.1.3.4 glucose oxidase
EC 1.1.4 With a disulfide as acceptor
EC 1.1.4.1 vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-sensitive)
EC 1.1.5 With a quinone or similar compound as acceptor
EC 1.1.5.1 Deleted, see EC 1.1.99.18 cellobiose dehydrogenase (acceptor)
EC 1.1.99 With other acceptors
EC 1.1.99.1 choline dehydrogenase
EC 1.1.99.2 2-hydroxyglutarate dehydrogenase
EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors
EC 1.2.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22
EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase
EC 1.2.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.2.3 With oxygen as acceptor
EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase
EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors
EC 1.3.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+)
EC 1.3.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2
EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3
EC 1.3.3 With oxygen as acceptor
EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase
EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6
Clases de Enzimas:
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Liasas
5. Isomerasas
6. Ligasas
Enzimas:
No.
1
Clase
Tipo de reacción
que catalizan
Oxidorreductasas De óxido reducción
(transferencia de e-)
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa
Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Reducción: ganancia de electrones (hidrógeno o pérdida de
oxígeno)
Oxidación: pérdida de electrones (hidrógeno o ganancia de
oxígeno).
La Oxidación y la Reducción son reacciones acopladas (REDOX)
1. Oxido-reductasas
( Reacciones de oxido-reducción).
Si una molécula se reduce, tiene que haber otra que se oxide
Enzimas:
No.
Clase
Tipo de reacción que
catalizan
1
Oxidorreductasas
De óxido reducción (transferencia de
e-)
2
Transferasas
Transferencia de grupos
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Kinasas
Transaminasas
2. Transferasas
(Transferencia de grupos funcionales)
•grupos aldehídos
•gupos acilos
Succinato Deshidrogenasa
•grupos glucosilos
Citocromo c oxidasa.
•grupos fosfatos (kinasas)
Enzimas:
No.
Clase
1
Oxidorreductasas
2
Transferasas
3
Hidrolasas
Tipo de reacción que
catalizan
De óxido reducción (transferencia de e-)
Transferencia de grupos
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Kinasas
Transaminasas
Hidrólisis, con transferencia Pirofosfatasa
de grupos funcionales del
Tripsina
agua
Aldolasa
3. Hidrolasas
(Reacciones de hidrólisis)
Transforman polímeros en monómeros.
Actúan sobre:
•enlace éster
•enlace glucosídico
•enlace peptídico
•enlace C-N
Enzimas:
No. Clase
1
Oxidorreductasas
2
Transferasas
3
Hidrolasas
4
Liasas
Tipo de reacción que
catalizan
De óxido reducción (transferencia de e-)
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Transferencia de grupos
Kinasas
Transaminasas
Hidrólisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
Lisis de un substrato,
(Sintasas)
generando un doble enlace, o
Adición de un substrato a un
Descarboxilasa
doble enlace de un 2o.
pirúvica
substrato
4. Liasas
(Adición a los dobles enlaces)
•Entre C y C
•Entre C y O
•Entre C y N
Enzimas:
No.
Clase
1
Oxidorreductasas
2
Transferasas
3
Hidrolasas
4
Liasas
5
Isomerasas
Tipo de reacción que
catalizan
De óxido reducción (transferencia de e-)
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Transferencia de grupos
Kinasas
Transaminasas
Hidrólisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
Lisis de un substrato, generando un
doble enlace, o
Adición de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)
(Sintasas)
Descarboxilasa
pirúvica
Transferencia de grupos en
el interior de las moléculas
para dar formas isómeras
Mutasas
Epimerasas
Racemasas
5. Isomerasas
(Reacciones de isomerización)
Enzimas:
No.
Clase
Tipo de reacción que
catalizan
De óxido reducción (transferencia de e-)
Ejemplo
Deshidrogenasas
Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
Kinasas
Transaminasas
Pirofosfatasa
Tripsina
Aldolasa
(Sintasas)
Descarboxilasa pirúvica
1
Oxidorreductasas
2
Transferasas
3
Hidrolasas
4
Liasas
5
Isomerasas
Transferencia de grupos en el
interior de las moléculas para
dar formas isómeras
Mutasas
Epimerasas
Racemasas
6
Ligasas
Formación de enlaces C-C,
C-S, C-O y C-N. Mediante
reacciones de condensación,
acopladas a la ruptura del ATP
Sintetasas
Transferencia de grupos
Hidrólisis, con transferencia de grupos
funcionales del agua
Lisis de un substrato, generando un
doble enlace, o
Adición de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)
6. Ligasas
(Formación de enlaces, con aporte de ATP)
•Entre C y O
•Entre C y S
•Entre C y N
•Entre C y C
E + S
SE
E + P
¿Cómo detectar una enzima?
1.
Actuación global de la reacción catalizada.
2.
Utilizar un procedimiento analítico para la determinación de S
que desaparece o los productos de la reacción que aparecen.
3.
Si la enzima requiere cofactores (iónes metálicos o
coenzimas).
4.
La dependencia de la actividad enzimática con la [S] o sea KM
del S.
5.
El pH óptimo.
6.
Un intervalo de temperatura en la que la enzima es estable y
muestra actividad elevada.
1.0 Unidad de Actividad Enzimática
Es la cantidad que transforma 1.0 mM (10-6 M) de S /min
a 25oC, en las condiciones de medida óptima.
La Actividad Específica
Es el no. de U de enzima / mg de proteína.
Es una medida de la pureza de la enzima.
Catalasa de
Aspergillius niger
4000-8000 U/mg de prot.
100 mg $ 209.80 USD.
Catalasa de
Hígado de bisonte
2000-5000 U/mg de prot.
1 g $ 768.50 USD.
El Número de Recambio de una Enzima
Es el no. de moléculas de S transformadas / unidad de tiempo,
por una molécula de enzima
(o por un sólo sitio catalítico, cuando la E, es el limitante).
Enzima.
Moles de S, transf./ min.
a 20-38 oC.
Anhidrasa carbónica
b-Amilasa
b-Galactosidasa
Fosfoglucomutasa
36 000 000
1 000 000
12 000
1 240