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GENÉTICA GENERAL - Tema 17 Biotecnologia del DNA: APLICACIONES 1.- IDENTIFICACIÓN GENÉTICA - En especies ganaderas - En el mantenimiento de la biodiversidad - En medicina forense - Tests de paternidad 2.- CONSTRUCCIÓN DE MAPAS DEL GENOMA - Genes que controlan enfermedades - Genes que controlan caracteres productivos (ETLs) 3.- DIAGNÓSTICO DE ENFERMEDADES - Genéticas - Infecciosas - Parasitarias 4.- DETECCIÓN DE SEXO Y FREEMARTINISMO - Zonas de copia única - Zonas altamente repetidas 5.- SEGURIDAD ALIMENTARIA Fraudes alimenticios Trazabilidad Alimentos transgénicos ¿Qué son? ¿Cómo se hacen? ¿Para que se hacen? 6.- ANIMALES TRANSGÉNICOS - ¿Qué? ¿Cómo? ¿Para qué? 7.- TERAPIA GÉNICA - “In vivo” - “ In vitro” 8.- CLONACIÓN SOMÁTICA 9.- CÉLULAS MADRE IDENTIFICACIÓN GENÉTICA EN ANIMALES DOMÉSTICOS EN VACUNO legalmente obligatorio G. S. + P.B. desde 1996 Incorporación de 9 microsatélites + rápido PCR + efectivo En otras especies: EN PERROS, EN CABALLOS se utilizan microsatélites ¿SNPs como metodo de identificación en un futuro próximo?? - Para control de libros genealógicos - Para la correcta aplicación de planes de mejora - Para la aplicación posterior de tests de paternidad - Aplicación al posible seguimiento y origen geográfico de los animales IDENTIFICACIÓN GENÉTICA PARA EL MANTENIMIENTO DE LA BIODIVERSIDAD Existe un gran número de especies en peligro de extinción. ALARMA MUNDIAL POR LA DESTRUCCIÓN DE LA BIODIVERSIDAD Aplicación de medidas que permitan un aumento de la variabilidad genética Bancos de embriones y semillas congelados En especies domésticas, se orienta hacía el mantenimiento y potenciación de razas autóctonas , asociadas en muchos casos al mantenimiento del medio rural. Caracterización genética mediante el uso de marcadores polimórficos (30 microsatélites recomendados por la FAO) - Interés económico en la mayoría de las ocasiones - Se realizan, generalmente, en especies de alto valor económico: vacas, caballos y perros. - Mediante el análisis de marcadores, principalmente microsatélites (en algunos casos grupos sanguíneos y otros marcadores, microsatélites...)... aplicación de SNPs en el futuro??. - La exclusión de paternidad se establece con el 100% de seguridad - La fiabilidad en la asignación de la paternidad depende de las características y el número de marcadores genéticos. MARCADORES GENÉTICOS EN MEDICINA LEGAL Y FORENSE - Aplicación a resolución de casos de paternidad e identificación de criminales. - Se plantean problemas éticos ante la falta de legislación respecto a la utilización de los datos de identificación genética de los individuos. - Fundamentalmente, las pruebas se realizan mediante el análisis de microsatélites. - La aplicación de la PCR es fundamental debido a su gran sensibilidad, ya que en muchas ocasiones el problema limitante es la poca cantidad y el origen de la muestra de la que se dispone. - Existen en la actualidad Proyectos Genoma para la especie humana y para gran parte de las especies domésticas Conocimiento de todos los genes y secuenciación completa del genoma PROYECTO GENOMA HUMANO (1990-2003) Localización : 30.000 - 80.000 genes ? Secuenciación : 3 x 109 b.p. EXISTEN APROX. 4000 ENFERMEDADES GENÉTICAS Conocimiento del gen Medicina predictiva Terapia génica PROYECTOS GENOMA DE ESPECIES DOMESTICAS OBJETIVO BÁSICO es semejante al de la especie humana : conocimiento de todos los genes y la secuenciación final de todo el genoma. Desde un punto de vista aplicativo el OBJETIVO FUNDAMENTAL es: BÚSQUEDA DE ETLs (economic trait loci) Localización de genes que controlan caracteres de interés económico. - caracteres productivos (QTLs) - caracteres de resistencia a enfernedades K-CASEINA QTL en ganado vacuno Influencia directa sobre el rdto. quesero Tipificación mediante P.C.R. A partir de cualquier muestra A edades tempranas Machos y hembras 437 p.b. Digestión con Hind-III K-Cn B 348 p.b. 89 p.b. K-Cn A 89 bp 348 bp 437 bp Amp. AA BB AB RFLPs K-Caseína en gel de agarosa BB - genotipo mas favorable para el rdto. quesero ENFERMEDADES GENÉTICAS DOS EJEMPLOS : - Fibrosis quística - Anemia falciforme - Identificación del gen responsable en 1989. Cromosoma 7 27 exones- 203 Kb - 1480 aa - Primera alteración detectada - delección de CTT en el exón 10 Pérdida de una fenilalanina en la posición 508 - Se han detectado más de 700 mutaciones ALGUNAS ENFERMEDADES HEREDITARIAS EN VETERINARIA BLAD (deficiencia de adhesión leucocitaria, gen CD18) Sindrome Weaver Gen letal A46 DUMPS (deficiencia de uridin monofosfato sintetasa) Pie de Mulo Citrulinemia ( mutación en el gen de la Arginino succinato sintetasa) SSP (Sindrome de hipertermia maligna,gen Ryr1) EXOSTOSIS MÚLTIPLE HEREDITARIA HYPP (Parálisis periódica) LAD (deficiencia de adhesión leucocitaria) Distrofia muscular (delección en el exon 7 de la distrofina) Nefritis Hemofilia B(mutación en el gen del factor IX de la coagulación) DIAGNÓSTICO DEL LAD bovino POR PCR - Alteración proteína CD18 : alteración del transporte de los leucocitos desde la sangre hasta los lugares de infección. Se produce la muerte entre las 7 semanas y 8 meses Fragmento amplificado 58 pb Alelo normal TCGACC Taq I Alelo mutado TCGGCC Taq I DETECCIÓN DE SEXO Y FREEMARTINISMO En mamíferos , la presencia del cromosoma Y determina el desarrollo de un individuo macho. Hembras freemartin: aquellas que provienen de un parto gemelar de macho y hembra. En un alto % resultan ser hembras estériles. DETECCIÓN MEDIANTE EL ANÁLISIS DEL DNA : - Zonas de copia única : ZFX/ZFY - Zonas de DNA repetido: BRY4a 1. Trazabilidad : supone el uso de marcadores genéticos polimórficos para establecer un sistema de control de origen geográfico y seguimiento de los animales, desde su nacimiento hasta su venta de sus partes en la carnicería. Mediante el uso de un panel de marcadores polimórficos del tipo microsatélites o SNPs 2. Detección de fraudes alimenticios : autentificación de alimentos para detectar la adulteración que supone la sustitución parcial o total de especies de mayor valor económico por especies más baratas: - pollo o cerdo / vaca - pescados congelados :fletán , lenguado, carpa , mero.... - grasa de origen animal Búsqueda de marcadores especie-específicos 3. Alimentos transgénicos - ¿Qué son? - ¿Cómo se hacen? - ¿Para qué se hacen? - Riesgos potenciales