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Tema 16 INHIBICIÓN ENZIMÁTICA II 1. Inhibición pseudoirreversibles 2. Inhibición irreversible 2.1 Inhibidores irreversibles o venenos catalíticos 2.2 Análisis de la velocidad de inactivación enzimática 2.3. Tipos de mecanismos de inhibición irreversible 1.-Inhibición irreversible simple. 2. Inhibición irreversible simple en presencia de Sustrato. 3.-Inhibición irreversible simple tiempo dependiente 4.-Inhibición irreversible simple tiempo dependiente en presencia de Sustrato. 1. Inhibición Pseudoirreversible Inhibidores [I] no es >>> [E] Inhiben a concentraciones parecidas a la enzima Ki <<<<< Ki de Inhibidores reversibles Orden 10-12 a 10-14 Unión fuerte a los enzimas Pseudoirreversible el equilibrio está completamente desplazado hacia la formación del complejo [EI] [EI] no es despreciable E +I EI a razón de velocidades máximas en Io= I + EI Eo=E + EI presencia y ausencia de inhibidor vi kcatE E a vo kcatE0 E 0 E aE0 EI = Eo – E E aE0 EI = Eo – aEo Io= I + EI EI = Eo (1-a) Eo=E + EI EI I Ki E Eo(1 a) (1 a) Io Ki Eo(1 a ) Ki Eo(1 a) aEo a Dividiendo los dos miembros por (1-a) Io 1 Ki Eo (1 a) a Io (1 a ) m=Ki Eo Ki Io ( Ki Io Eo) 2 4 E 0 Ki a 2 Eo Eo a valores experimentales 1/a Representación de Willian y Morrison: Inhibición pseudoirreversible Io=0 vo Io=1,5nM Io=3,0 nM Io=4,5nM 1,5 3,0 4,5 Eo nM Inhibidor titula a la enzima 2. Inhibidores irreversibles 2.1 Venenos Catalíticos Inhibidor irreversible une a la enzima por un proceso irreversible* (constante de disociación 10-9 mol l-1) Inhibidores se unen por enlaces covalentes a centro activo de la enzima Inhibición suele ser progresiva. Depende del tiempo * Los inhibidores irreversibles o venenos catalíticos son sustancias que se unen a la enzima de manera tal que reducen su actividad prácticamente a cero. - Esto es de particular importancia en los procesos de purificación de enzimas: * Muchas enzimas son “envenenadas” por trazas de metales pesados, y por esta razón, es una práctica común utilizar sustancias complejantes, p. ej., EDTA, en los tampones de ensayo, para secuestrar estos metales pesados. -La aspirina inhibe la formación de Protaglandina-G2, gracias a la metilación de la subunidad o dominio responsable de la actividad ciclooxigenasa, de la Prostaglandina-H-sintetasa. Penicilina La enzima modificada por la penicilina no puede unir el puente de poli-Gly 2.2. Análisis de la velocidad de la inhibición irreversible E +I EI* Se forma este complejo que es inactivo Cinética [I]>>>[E] El I esta en exceso no cambia durante la inhibición [I] =[Io] La cinética de la inhibición irreversible puede ser modelada usando un modelo de primer orden de la forma [EI]* mM [EI]*=[ET] (1-exp-k`T) K`(s-1) tendrá un significado diferente dependiendo del mecanismo exacto de inhibición Tiempo (s) 2.3. Tipos de mecanismos de inhibición irreversible 1.-Inhibición irreversible simple. E+I EI* 2.-Inhibición irreversible simple en presencia de Sustrato. E+I EI* E+S ES 3.- IInhibición irreversible simple tiempo dependiente E+I EI EI* 4.- Inhibición irreversible simple tiempo dependiente en presencia de Sustrato. E+I EI E+S ES EI* 1.-Inhibición irreversible simple. ki E+I EI* Reacción de segundo orden ki constante de inhibición de segundo orden (M-1 s-1) Ecuación diferencial que describe la formación de complejo EI d EI * kiI E dt ET E EI * I =Io Ecuación diferencial de primer orden describe el cambio en la concentración de [EI] en el tiempo d EI * kiIo ET EI * k `ET EI * dt k`=ki [Io] Integración de la ecuación EI * o t d EI * k´ dt ET EI * 0 EI * ET (1 exp k `t ) [EI]* mM k`=ki [Io] Calcula k` k` ki Io Se obtiene una constante de inhibición de segundo orden Tiempo (s) 2. Inhibición irreversible simple en presencia de Sustrato. E+I E+S ki Ks EI* ES Substrato puede proteger a la enzima de la inhibición irreversible Ecuación diferencial que describe la formación de complejo EI* d EI * kiI E dt E S Km ES ET E EI * ES d EI * Et EI *Km kiIo dt Ks S d EI * k´ET EI * dt I = Io Et EI *Km E Km S Sustituyendo y despejando kiKm k ` Io Km S Integración de la ecuación EI * o t d EI * k´ dt ET EI * 0 [EI]* mM Calcula k` Tiempo (s) EI * ET (1 exp k `t ) kiKs k ` Io Ks S k`(s-1) Graficando k` frente a diferentes concentraciones de Inhibidor ki S y Ks constantes se pueden calcular idenpendientemente kiKs m Ks S Io mM 3.-Inhibición irreversible simple tiempo dependiente E+I Ki EI ki EI* Rápido equilibrio reversible entre E y el I seguida de una reacción lenta e irreversible de inactivación [EI]* Ecuación diferencial que describe la formación de complejo EI* d EI * kiEI dt E I Ki EI ET E EI * EI d EI * Et EI * ki dt 1 ki /Io d EI * k `ET EI * dt Et EI * EI 1 ki /Io ki k´ 1 ki /Io kiIo k ` Io Ki Integración de la ecuación EI * o t d EI * k´ dt ET EI * 0 EI * ET (1 exp k `t ) Graficando k` frente a diferentes concentraciones de Inhibidor [EI]* mM Calcula k` kiIo k ` Io Ki k`(s-1) Hipérbola rectangular Ki y ki Procedimientos de regresión no linear Io mM 4.-Inhibición irreversible simple tiempo dependiente en presencia de Sustrato. Ki ki E+I d EI * E+S kiEI dt E I Ki EI E S Ks ES ET E EI * EI ES d EI * dt Et EI * Ki S 1 1 Io Ks d EI * k `ET EI * dt EI Ks EI* ES Et EI * EI Ki S 1 1 Io Ks Sustituyendo y despejando ki k´ Ki S 1 1 Io Ks Integración de la ecuación EI * o t d EI * k´ dt ET EI * 0 EI * ET (1 exp k `t ) Graficando k` frente a diferentes concentraciones de Inhibidor [EI]* mM Calcula k` ki k´ Ki S 1 1 Io Ks k`(s-1) Hipérbola rectangular Ki y ki Procedimientos de regresión no linear Io mM Como distinguirías entre una Inhibición irreversible tiempo dependiente y otra Inhibición irreversible tiempo independiente k`(s-1) Io mM k`(s-1) Io mM RESUMEN ● Existen unos inhibidores denominados pseudoirreversibles que no cumplen todas las condiciones de Michaelis, puesto que la concentración inicial de inhibidor [Io] es efectiva al mismo orden de magnitud que la concentración inicial de enzima. En este tipo de inhibición la Ki presenta valores que van desde 10-8 -10-12. Se comportan como inhibidores pseudoirreversibles la gran mayoria de inhidores de naturaleza proteica, así como los anticuerpos obtenidos frente a las proteínas enzimáticas. El comportamiento cinético es diferente de los inhibidores reversibles. ● Los inhibidores suicidas son compuestos que son inactivos como inhibidores en ausencia de enzimas, se activan específicamente por la enzima a la que van a inhibir , uniéndose covalentemente a la proteína enzimática. ● Análisis de la velocidad de la inhibición irreversible. Muestra un comportamiento dependiente de la presencia de substrato y de la posibilidad que el parámetro tiempo influya en el proceso de unión covalente. Así se distinguen desde el punto de vista cinético: Inhibición irreversible simple Inhibición irreversible simple en presencia de Sustrato. Inhibición irreversible simple tiempo dependiente Inhibición irreversible simple tiempo dependiente en presencia de Sustrato