Download enzimas - IHMC Public Cmaps (2)
Document related concepts
Transcript
ENZIMAS Las enzimas son proteínas Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo. E + S ESEP E + P E E E E La enzima disminuye la energía de activación Sin enzima Con enzima • La Ea de la hidrólisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la acción de las enzimas, acelerando la reacción 1014 x E+S E+P Tiempo de la reacción • El aumento de temperatura necesario para producir la reacción no catalizada seria de 529ºC Enzima - Catalizador Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reacción química. Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen • • • Especificidad por el sustrato Se inactivan por desnaturación Pueden ser reguladas Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energía de activación Cada enzima tiene una forma única con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato Después de la reacción, enzimas y productos se separan. Las moléculas enzimáticas no han cambiado después de participar en la reacción Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a: • Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato • Transformación catalítica del mismo En ambas funciones participan: • Cadenas laterales de los aminoácidos • Grupos o moléculas no proteicas: Grupos prostéticos Iones metálicos Cofactores Los siguientes hechos: Especificidad de la reacción enzimática Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la molécula de enzima, capaz de: Fijar específicamente al substrato Transformarlo catalíticamente. Enzima Sustrato Sitio activo La unión del sustrato es muy específica Complementariedad geométrica Complementariedad iónicas Modelos: de Encaje inducido Llave – cerradura. Estado de transición cargas, uniones Teorías de la acción enzimática, 1 Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos de la inhibición enzimática Teorías de la acción enzimática, 2 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento. Teorías de la acción enzimática, 3 Estabilización del Estado de Transición La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad definiendo la acción enzimática como Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transición entre ambos. Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo Clasificación y nomenclatura de enzimas Clasificación y nomenclatura Nombre sistemático: Grupo transferido ATP: hexosa fosfotransferasa Donador Aceptor Tipo de reacción catalizada Grupos químicos Número Enzyme Commission: Enzyme Comission EC 2.7.1.1 Grupo Enzimas Subgrupo Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa Clasificación y nomenclatura Clasificación de enzimas por Grupos EC 1.x Oxidorreductasas EC 2.x Transferasas EC 3.x Hidrolasas EC 4.x Liasas EC 5.x Isomerasas EC 6.x Ligasas Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas: Ared + Box Aox + Bred AH2 + B A + BH2 En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrónico. Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa Dador EC 1.1.3.4 Aceptor Nombre común: Glucosa oxidasa Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1.1.x EC 1.2.x EC 1.3.x EC 1.4.x EC 1.5.x EC 1.6.x etc. Deshidrogenasas Oxidasas Peroxidasas Oxigenasas Hidroxilasas Reductasas Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa Deslignificación ó Bioblanqueamiento Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos entre moléculas: A-X + B A + B-X Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa Nombre común: hexokinasa EC 2.7.1.1 Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Clasificación de subgrupo de las transferasas: EC 2.1.x EC 2.2.x EC 2.3.x EC 2.4.x EC 2.5.x EC 2.6.x EC 2.7.x EC 2.8.x EC 2.9.x - Grupos monocarbonados Grupos aldehido o ceto Aciltransferasas Glicosiltransferasas Alquil- o Ariltransferasas Grupos nitrogenados Grupos fosfato Grupos sulfato Grupos selenio Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática: A-B + H2O A-OH + H-B No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4. Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Clasificación de las hidrolasas: 3.1.-.3.2.-.3.3.-.3.4.-.3.5.-.etc. Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) Glicosidasas Éter hidrolasas Péptido hidrolasas Acil anhídrido hidrolasas Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos Proteasas → Fabrico de quesos Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los vinos; aplicaciones textiles Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Caso particular Péptido hidrolasas: clasificación común (no sistemática) I. Según la situación del enlace atacado: - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas) - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas) II. Según el mecanismo catalítico: - Serin proteinasas - Tiol proteinasas - Aspartil proteinasas - Metaloproteinasas Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas): A-B Ejemplo Nombre sistemático: Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3) Nombre común: Histidasa A+B Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Clasificación de las liasas: 4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C 4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O 4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N 4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S 4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-) 4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O 4.99.x - Otras liases Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring” Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerización moleculares A Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5) B Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Clasificación de las isomerasas: 5.1.x - Rasemasas y Epimerasas 5.2.x - cis-Trans-Isomerasas 5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular 5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5.5.x - Liasas Intramoleculares 5.99.x - Otras Isomerasas Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.). A + B + ATP A-B + ADP + Pi Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3) Nombre sistémico: G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Clasificación de las ligasas: 6.1.x 6.2.x 6.3.x 6.4.x 6.5.x 6.6.x - Forman enlaces C-O - Forman enlaces C-S - Forman enlaces C-N - Forman enlaces C-C - Forman enlaces ésteres fosfóricos - Actúan sobre enlaces N-metal Cinética Enzimática Cinética Enzimática La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada uno de los factores que intervienen en la actividad enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la reacción catalizada. Las variables más importantes son: • Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo inhibidores y/o activadores) • pH • Temperatura Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción: S E P Se tendrá: Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a: dp ds v dt dt Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la concentración del sustrato Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad Inhibición por el producto Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible Baja concentración de sustrato ALTA concentración de sustrato SATURACION Efecto de la concentración de substrato v . . . . . . . . [s] Concepto de velocidad inicial [ ] d[P] v = dt , t 0 p s t Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante: Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato; una vez que están ocupados todos, por mucho que aumente la concentración de substrato, la velocidad permanecerá constante tendiendo a un valor asintótico E+S k+1 k-1 ES k+2 E+P El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica del sistema E+S k+1 ES k+2 k-1 Sistema No admite solución analítica. - Simulaciones numéricas - Hipótesis que lo simplifiquen E+P Hipótesis de Michaelis - Menten E+S k+1 ES k+2 E+P k-1 - La primera parte del mecanismo, k+1 E+S ES k-1 Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda: ES k+2 E+P Hipótesis de Michaelis-Menten Equilibrio rápido e0 s x Km s v k 2 x k 2 e0 s v Km s k 2 e0 Vmax E S es e0 xs Km ES x x Vmax s v Km s Hipótesis de estado estacionario Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo relativamente prolongado en el curso de la reacción en el que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual a cero: dx/dt = k+1es - (k-1 + k+2) x = 0 A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una expresión que nos da la velocidad para la concentración de substrato dx 0 k 1es k 1 k 2 x dt k1es k1 e0 xs k1 k2 x e0 s e0 s x k 1 k 2 Km s s k 1 v k 2 x k 2 e0 Vmax Vmax s v Km s Hipótesis de estado estacionario A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y Estado estacionario, llegamos a la ecuación v= Vmax * s Km + s La única diferencia radica en el significado de Km: Km = k-1/k+1 en mecanismo de M.M. Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E.E. Significado de la constante Km 1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES (en condiciones de equilibrio rápido) 2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato (en condiciones de equilibrio rápido) 3. Mide la función de fijación (en cond.de equilibrio rápido) 4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la máxima (s0.5) 5. Se define para una pareja enzima-substrato 6. Se mide en unidades de concentración Significado de la constante Vmax = k+2 e0 1. Velocidad asintótica para s 2. Directamente proporcional a la concentración de enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima por k+2) 3. Mide función de transformación catalítica 4. Se expresa en unidades de velocidad Velocidad de la reacción (v) Vmax Relación entre Km y Vmax Michaelis y Menten Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] La Km es la concentración de sustrato donde se obtiene la mitad de la Vmax Velocidad de la reacción (v) Vmax Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato Representación directa v Vmax 100 80 60 v 40 Vmx s Km s 20 s 0 0 20 Km 40 60 80 100 Representación recíproca doble (Lineweaver - Burk) Representación Lineweaver-Burke 0.04 1/v 0.03 1/Vmax -1/Km 0.02 1 Km 1 1 v Vmx s Vmx 0.01 0.00 -0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6 1/s Representación s -s/v (Eadie - Hofstee) Representación Hanes 1.2 s/v 1.0 0.8 0.6 s 1 Km s v Vmx Vmx 0.4 -Km 0.2 0.0 -20 0 20 40 60 80 100 120 s Representación de Eadie-Hofstee Representación v/s - v (Wong - Hanes) Vmax v 100 v v Km Vmx s 80 60 40 20 v/s 0 0 2 4 6 8 10 12 14 16 Métodos de linealización para determinación parámetros cinéticos Método Eje Y Eje X Intercepto Eje Y Intercepto Eje x Pendiente LineweaverBurke 1/v 1/s 1/V -1/K K/V Hanes s/v s K/V -K 1/V EadieHofstee v v/s V V/K -K Definición Actividad Enzimática Es el número de moles de sustrato que reaccionan para formar producto, por mol de enzima y por unidad de tiempo. Esto supone que la enzima está plenamente saturada con sustrato y por tanto que la reacción se efectúa con su máxima rapidez El índice de recambio muestra la eficiencia impresionante de la catálisis enzimática A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son despreciables. Así, a vt 0 dp ds dt t 0 dt t 0 Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un proceso enzimático donde, debido a los elevados tiempos de operación, es razonable suponer que esos factores ejercerán su influencia. Cálculo de Actividad Enzimática La velocidad de reacción catalizada por 0,1ml de una dilución 1:100 de Fosfatasa Alcalina es 0,3umoles / min. de producto. ¿Cuál es su actividad enzimática? 0,1ml-------- 0,3umoles producto / min. 1,0ml------------3,0umoles producto / min. dil 1:100-------------300umoles producto / min. Respuesta: 300U/ml Número o Índice de Recambio Es útil definir una constante de velocidad más general, k cat , para describir la velocidad limitante de cualquier reacción enzimática a saturación kcat x Et= Vmáx V0 = k cat x Et x [S] / KM + [S]; Kcat es una constante de velocidad de 1er orden con unidades de tiempo-1, también llamada Número de Recambio Efecto del pH en la ENZIMA Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad El pH afecta las interacciones iónicas Efecto del pH 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo: - Grupos disociables de la enzima - Grupos disociables del substrato 2. Sobre la transformación catalítica del substrato 3. Sobre la estructura de la proteína enzimática En el efecto de la temperatura hay dos componentes: 1. Aceleración de la reacción según la ecuación de Arrhenius k = A exp (-Ea/RT) 2. Desnaturalización térmica de la proteína Efecto de la temperatura en la ENZIMA Aumento de la velocidad 15º Desnaturación por calor 40º 75º Temperatura Cada enzima tiene una temperatura óptima. ORGANISMOS TERMÓFILOS Son organismos que viven a altas tº y realizan sus reacciones enzimáticas a estas altas tº Ejemplos son los que viven en las aguas termales Es tema de investigación el aislamiento de las enzimas de estos organismos para desarrollar procesos industriales en condiciones más extremas Coenzimas Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a la enzima. Las coenzimas colaboran en la reacción enzimática recibiendo transitoriamente algún grupo químico: H+ , OH, CH3 . La enzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA El NAD es una coenzima aceptora de H Sustrato oxidado Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad Isoenzimas o Isozimas Son formas moleculares diferentes de una misma enzima Catalizan la misma reacción Ejemplo: Lactato deshidrogenasa Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH M4, M3H1, M2H2, M1H3 y H4 Se diferencian por su movilidad electroforética Usadas en clínica: sueros normales y sueros con alguna patología Así esta actividad corresponde al máximo potencial catalítico que las enzimas poseen para un determinado conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas deben ser consideradas en las expresiones matemáticas representativas del proceso enzimático. Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la velocidad inicial de reacción no es representativa del real potencial catalítico de la enzima. Se asume que la velocidad inicial de reacción es proporcional a la concentración de proteína enzimática. Inhibición enzimática Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos). Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores: I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática. Inhibición enzimática isostérica Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E+I EI ES + I ESI 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: E+I E’ Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva (b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición No Competitiva (c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce como Inhibición Anticompetitiva Inhibición Competitiva Inhibidores Competitivos Compiten con el sustrato por el sitio activo de la enzima Se une solo a la enzima libre V máx no se altera y K M cambia Inhibición competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y se forma producto S E ES E+P I EI Se define una constante de equilibrio de disociación del inhibidor: [E] [I] Ki = [EI] Características: - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - El inhibidor es tan específico como el substrato En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el sistema de ecuaciones (e0 x y ) s Km x (e0 x y )i Ki y Que resuelto para x nos da e0 s x i Km 1 s Ki De donde Vmx s v i Km 1 s Ki Por tanto, en la inhibición competitiva, 1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki) 2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor 3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia del inhibidor competitivo. Sin inhibidor Con inhibidor El inhibidor competitivo aumenta la Km Km Km Sin con inhibidor inhibidor Inhibición competitiva - Representación recíproca doble 0.07 1/v 0.06 0.05 0.04 1/Vmax 0.03 0.02 -1/Km 0.01 1/s 0.00 -0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 -1/(Km(1 + i/Ki)) 0.4 0.5 0.6 Ejemplo Inhibidor Competitivo Ácido succínico + FAD == ácido fumárico + FADH2 El inhibidor competitivo es el ácido malónico Es un análogo estructuralmente parecido al ácido succínico Ácido Fólico y Sulfanilamida La sulfanilamida es un análogo estructural del ácido p - aminobenzoico (PABA) PABA es el punto de partida para la síntesis de ácido fólico en las bacterias El ácido fólico es una vitamina esencial para la proliferación (división) bacteriana Sulfanilamida se usa en el tratamiento algunas infecciones Metotrexato y Dihidrofolato El ácido fólico en sus formas de dihidro y tetrahidrofolato es coenzima de la reacción catalizada por la dihidrofolato reductasa Esta reacción es parte del metabolismo de los nucleótidos para la síntesis de DNA Metotrexato se usa en la terapia de algunos cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto Inhibición No Competitiva Inhibidor No Competitivo Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero el valor de Km no se altera Inhibición NO competitiva Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio activo S E ES I I Inhibición No Competitiva S EI E+P ESI El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI. Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km . Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm disminuye. Inhibidor Incompetitivo Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima Se une sólo al complejo enzima-sustrato Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y también el de Vmáx S E ES E+P I ESI Inhibición Anticompetitiva El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES; el complejo ESI no es productivo Determinación de parámetros cinéticos de inhibición Modelo Inh comp Inh no comp total Inh anticomp Kap Vap Km(1+i/Ki) Vm Km Vm/(1+i/Ki) Km/(1+i/Ki) Vm/(1+i/Ki) Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola covalentemente - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por una constante de velocidad ki: E+I E’ - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor. - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos. Inhibidores Irreversibles Producen inactivación permanente de la actividad enzimática Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía metabólica Ejemplos: p-cloromercuribenzoato, yodoacetato, diisopropilfluorfosfato Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos de metales 4. Metales pesados Inhibición enzimática alosterica Enzimas Alostéricas Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias subunidades No se rigen por la cinética de M - M Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación Sitio activo/sustratos; Sitio alostérico/moduladores o reguladores La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea Enzimas alostéricas Las enzimas alostéricas presentan estructura cuaternaria. Tienen diferentes sitios activos, unen mas de una molécula de sustrato La unión del sustrato es cooperativa la curva de velocidad presenta una forma sigmoidal Concepto de Cooperatividad La unión de los sustratos al sitio activo de una subunidad produce un cambio conformacional que por contacto físico se transmite a las subunidades vecinas, facilitando las interacciones Modelos de unión: secuencial y concertado Ejemplos: unión Hb-O2, enzimas alostéricas y sus sustratos Moduladores Alostéricos También reciben el nombre de efectores y pueden ser positivos o negativos Se unen al sitio alostérico que puede estar en la misma subunidad que tiene al sitio activo o en las subunidades regulatorias Su unión produce un cambio conformacional que afecta al sitio activo Aspartato Transcarbamilasa Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamilasp + Pi . Primera reacción en la síntesis de pirimidinas Efector positivo: CTP Efector negativo: ATP Tiene dos subunidades catalíticas para los sustratos y tres subunidades regulatorias para los efectores RESUMEN Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones biológicas Presentan especificidad por su sustrato Cada enzima presenta dos parámetros importantes Vmax (saturación de la enzima) y la Km (medida de la afinidad por el sustrato) RESUMEN La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos (similares al sustrato) o por inhibidores no competitivos. La temperatura y el pH afectan a la enzima en su actividad catalítica. Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o cofactores para su actividad.