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Interacciones de los microorganismos con los ciclos de los nutrientes CICLOS BIOGEOQUÍMICOS •Los microorganismos tienen un papel clave en el reciclado de los elementos (nutrientes), especialmente carbono, azufre, nitrógeno y hierro. •Un ciclo biogeoquímico es el resultado del conjunto de los procesos biológicos y químicos durante el reciclado de estos elementos esenciales para los sistemas vivos. •Los nutrientes son transformados y reciclados normalmente mediante reacciones de óxido – reducción que pueden cambiar las características físicas y químicas de los mismos. CICLOS BIOGEOQUÍMICOS REACCIONES DE OXIDACIÓN-REDUCCIÓN (REDOX): Aquellas en las que se produce un transferencia de electrones desde un dador, el agente reductor (el que se oxida), a un aceptor de electrones, el agente oxidante (el que se reduce). Tipos de Metabolismo productor de energía. Fermentación Respiración Respiración anaeróbica Algunas bacterias son capaces de realizar su metabolismo respiratorio en condiciones completamente anaeróbicas, utilizando nitrato, sulfato o carbonato como aceptor inorgánico terminal de electrones. Utilización de nitrato como aceptor final de electrones. Estas bacterias reducen el NO3- pudiendo llevarlo a N2. Este fenómeno se denomina desnitrificación. Utilización de sulfatos y carbonatos como aceptores de electrones. Facultad restringida a pocos géneros de bacterias. Todas son anaeróbicas estrictas. Categorías nutricionales Una forma sencilla de clasificar los organismos se basa en la naturaleza de la fuente de energía y fuente principal de C. Con respecto a la fuente de energía: - fotótrofos: capaces de usar la luz como fuente de energía. - quimiótrofos: usan una fuente de energía química. Según la fuente de C: - autótrofos: utilizan CO2. - heterótrofos: utilizan una fuente orgánica de C. Las categorías nutricionales según estos criterios quedan organizadas así: * fotoautótrofos: incluye algunos microorganismos fotosintéticos; dentro de los cuales tenemos algas, bacterias fotosintéticas (Cianobacterias). * fotoheterótrofos: incluye algunas de las bacterias rojas y verdes (son fotosintéticas pero no productoras de O2). No ocupan CO2 sino compuestos orgánicos. * quimioautótrofos: oxidan compuestos inorgánicos (NH3 , NO2 , H2, SH2 , etc.) Por ej., las bacterias nitrificantes que transforman el NH3 a NO2- y luego a NO3-. En esta reacción se libera energía , que la bacteria utiliza para captar el CO2 como fuente carbonada. Dentro de bacterias nitrificantes tenemos: Nitrosomonas europea, Nitrobacter winogradsky. *quimioheterótrofos: en estos tanto la energía como el C pueden obtenerse del metabolismo de un mismo sustrato orgánico. Por ej., glucosa que aporta energía (ATP) y los esqueletos carbonados a partir de los intermediarios del ciclo de Krebs. Según la fuente de C también pueden ser: Mixótrofos. El término mixotrófico puede describir organismos (usualmente algas, bacterias), capaces de obtener energía metabólica tanto de la fotosíntesis, como de seres vivos. Esos organismos pueden utilizar la luz como una fuente de energía, o tomarla de compuestos orgánicos o inorgánicos. Pueden apropiarse de compuestos simples de manera osmótica o englobando las partículas (a través de fagocitosis). También se incluye en este grupo los procariontes que obtienen energía de la oxidación de compuestos inorgánicos pero que utilizan compuestos orgánicos como fuente de carbono. Son aquellas bacterias con metabolismo energético litotrofo (obtienen energía de compuestos inorgánicos), pero requieren sustancias orgánicas como nutrientes para su metabolismo biosintético. II. Según el punto de vista biosintético La forma en la que organismo obtiene los equivalentes reductores (transportados como NADH, FADH) para la conservación de energía o en las reacciones biosintéticas: • Litotrofo. Son aquellas que solo requieren sustancias inorgánicas sencillas. Los equivalentes reductores se obtienen de compuestos inorgánicos. (SH2 SO, NH3, NO2-, Fe, etc.). • Organotrofo. Requieren compuestos orgánicos. Los equivalentes reductores se obtienen de compuestos orgánicos (hidratos de carbono, hidrocarburos, lípidos, proteínas, alcoholes). Anoxifotobacterias: ej. bacterias verdes del asufre: son microorganismos que utilizan como donadores de electrones SH2 y a veces SO4 2- (no el oxígeno del agua). La mayoría autótrofos. FASES DE LOS NUTRIENTES El bucle microbiano (microbian loop) es la denominación que se le da a la vía del detrito en los sistemas acuáticos (mares, lagos, océanos y ríos). Es una microcadena trófica que trabaja paralela a la cadena trófica convencional. Transformaciones de los nutrientes Físicas: disolución, precipitación, volatilización y fijación. Químicas: biosíntesis , biodegradación y biotransformaciones óxido - reductivas. •Pero, además de las combinaciones de cambios físicos y químicos, •Hay traslocación espacial de materiales. Los Microorganismos presentan: Ubicuidad, diversidad de capacidades metabólicas y altas velocidades metabólicas. DEFINICIONES Pools o reservorios: son aquellas partes del ciclo donde el compuesto químico se encuentra en grandes cantidades por largos períodos de tiempo. Fuentes (generan el compuesto) o sumideros (consumen el compuesto). Ciclos globales: también conocidos como ciclos gaseosos o atmosféricos, en los que participan elementos y compuestos que, en estado gaseoso, se mueven por todo el planeta gracias a las corrientes de aire de la atmósfera, depósito atmosférico. El agua, el carbono, el nitrógeno se mueven en estos ciclos. Relacionados con problemas ambientales a gran escala. Ciclos locales / edáficos o sedimentarios: en los que intervienen elementos que no pueden moverse a través de la atmósfera, sino que se acumulan principalmente en el suelo, depósito principal en la roca o en los sedimentos . Éste es el caso del calcio, fósforo y el potasio, entre otros. CICLO DEL CARBONO CARBONO: •Esqueleto de todas las moléculas orgánicas. •Elemento más prevalente en el material orgánico celular. •Forma inorgánica: CO2 (forma más oxidada). •Forma orgánica: CH2O (formas reducidas). •Autótrofos o productores primarios (plantas, algas, cianobacterias, litótrofos y metanógenos). •Heterótrofos: animales, microorganismos descomponedores. El Carbono en la Naturaleza •En la atmósfera: en forma de dióxido de carbono CO2 (reservorio atmosférico ,0.032% de la atmósfera, 700 billones de ton. de C). •En la corteza terrestre: formando carbonatos, como la caliza CaCO3. •En el interior de la corteza terrestre: en el petróleo, carbón y gas natural. •Formas inorgánicas de C disueltas (CO2 , H2CO3 , HCO3- y CO3-) en agua superficial en equilibrio con el CO2 atmosférico. En la materia viva animal y vegetal: es el componente esencial y forma parte de compuestos muy diversos: glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. En el cuerpo humano, por ejemplo, llega a representar el 18% de su masa. Biomasa viviente en ambientes terrestres y acuáticos (450 – 500 billones de ton´s de C). Es un ciclo biogeoquímico por el cual el carbono (C) se intercambia entre la biosfera, litosfera, hidrósferas y la atmósfera de la tierra. Depende tanto de la actividad de los microorganismos como de los macroorganismos y está estrechamente ligado con el ciclo del oxígeno. Ya que la fijación de CO2 por fotótrofos oxigénicos libera O2 y mucha de la materia orgánica es oxidada a CO2 a través de la respiración aerobia. El C puede presentarse en formas reducidas, como metano (CH4) y materia orgánica, y en formas más oxidadas como monóxido de carbono (CO) y dióxido de carbono (CO2 ). CICLO DEL CARBONO CICLO BIOLÓGICO (RÁPIDO): Comprende los intercambios de carbono (CO2) entre los seres vivos y la atmósfera, es decir, la fotosíntesis, proceso mediante el cual el carbono queda retenido en las plantas y la respiración que lo devuelve a la atmósfera. CICLO BIOGEOQUÍMICO (LARGO): Regula la transferencia de carbono entre la hidrósfera, la atmósfera y la litósfera (océanos y suelo). DESCOMPOSICIÓN El C fijado fotosintéticamente es degradado finalmente por varios organismos. En la degradación se observan dos estados principales de oxidación del C: METANO (CH4) Y DIOXIDO DE CARBONO (CO2). •METANO: por acción de metanógenos. •CO2: acción de diversos quimiorganótrofos mediante fermentación, por respiración aeróbica o respiración anaeróbica. El ser humano ha alterado enormemente el ciclo del carbono, ya que al quemar los combustibles fósiles se han liberado a la atmósfera excesivas cantidades de dióxido de carbono. Esta condición es la principal responsable del calentamiento global ya que el CO2 presente en grandes cantidades en la atmósfera impide que el calor del sol escape de la tierra al espacio. CICLO DEL NITRÓGENO Formas de nitrógeno presentes en el suelo (1m de profundidad). N2: dinitrógeno, nitrógeno gaseoso: poros del suelo. N orgánico: tejidos animales y vegetales, células microbianas, organismos del suelo, materia orgánica (aminoácidos, proteínas, polímeros de la pared celular, aminoazúcares, ácidos nucleicos, vitaminas, antibióticos, intermediarios metabólicos). NH4+: amonio. solución acuosa NO3-: nitrato: solución acuosa Transformaciones de nitrógeno: procesos microbianos. Reducción del nitrato Oxidación El ciclo del nitrógeno puede ser dividido en tres subciclos: Elemental: enfatiza las reacciones biológicas de oxidaciónreducción. Interconversión del nitrógeno y N2 en varias formas químicas. Fototrófico: toma del nitrógeno por la planta (autótrofos), el nitrógeno inorgánico (NH4+, NO3-) es convertido a formas orgánicas (constituyentes celulares). Heterotrófico: vinculado a los procesos de descomposición. Los seres vivos cuentan con una gran proporción de nitrógeno en su composición química. El nitrógeno oxidado que reciben como nitrato (NO3–) es transformado a grupos aminoácidos (asimilación). Para volver a contar con nitrato hacen falta que los descomponedores lo extraigan de la biomasa dejándolo en la forma reducida de ion amonio (NH4+), proceso que se llama amonificación; y que luego el amonio sea oxidado a nitrato, proceso llamado nitrificación. Así parece que se cierra el ciclo biológico esencial. Pero el amonio y el nitrato son sustancias extremadamente solubles, que son arrastradas fácilmente por la escorrentía y la infiltración, lo que tiende a llevarlas al mar. Al final todo el nitrógeno atmosférico habría terminado, tras su conversión, disuelto en el mar. Los océanos serían ricos en nitrógeno, pero los continentes estarían prácticamente desprovistos de él, convertidos en desiertos biológicos, si no existieran otros dos procesos, mutuamente simétricos, en los que está implicado el nitrógeno atmosférico (N2). Se trata de la fijación de nitrógeno, que origina compuestos solubles a partir del N2, y la desnitrificación, una forma de respiración anaerobia que devuelve N2 a la atmósfera. De esta manera se mantiene un importante depósito de nitrógeno en el aire (donde representa un 78 % en volumen). Anammox, acrónimo de oxidación anaerobia del ion amonio (ANaerobic AMMonium OXidation), es un proceso biológico que forma parte del ciclo del nitrógeno. En este proceso biológico, nitrito y amonio se convierten directamente en gas nitrógeno. Un alto porcentaje de la conversión de nitrógeno en los océanos se realiza mediante este proceso. La reacción catabólica total es:1 NH4+ + NO2- → N2 + 2H2O. Las bacterias que realizan el proceso anammox pertenecen al orden Planctomycetes y corresponden a los géneros Brocadia, Kuenenia, Jettenia, Anammoxoglobus (todos de agua dulce), y Scalindua (marinos).