Download Diseño Informe KNC
Document related concepts
Transcript
TAAG Knowledge Center Caracterización molecular, serotipificación y casos estudio de Listeria monocytogenes en la industria de alimentos chilena. Equipo R&D, TAAG Genetics. Contacto: Mauricio Niklitschek, PhD. Mail: mniklitschek@taag-genetics.com Introducción: La listeriosis es una enfermedad infecciosa grave causada por la bacteria Listeria monocytogenes, siendo la principal fuente de contagio para el hombre el consumo de alimentos contaminados por esta bacteria. Esta enfermedad puede presentarse como casos esporádicos o epidemias, siendo una infección de carácter oportunista que afecta sobre todo a mujeres embarazadas, recién nacidos, ancianos y adultos inmunodeprimidos. Durante el año 2013, el Instituto de Salud Pública ha confirmado 74 casos de listeriosis provocados por alimentos, costando la vida de tres embarazadas y dos adultos mayores (1). Estudios en distintas cepas de L. monocytogenes han demostrado una Resultados: Principales fuentes de Listeria. En este estudio se analizaron muestras de materias primas, superficies y productos elaborados en búsqueda de L. monocytogenes, en igual proporción. De estos análisis, 36 muestras resultaron positivas para esta bacteria. Así, las muestras se distribuyeron de la siguiente manera de acuerdo a su origen: Figura 1: Origen de las muestras que presentaron crecimiento de L. monocytogenes. alta variabilidad en su virulencia relativa, identificándose y separándose 19% en 13 diferentes serogrupos (también denominados serotipos). Sin embargo, adicionalmente los avances en genómica bacteriana aplica- 36% da, han permitido ampliar estos grupos a más de 600 clones distintos 45% de esta bacteria. Estos clones, pueden presentar características distintas de hábitat, potencial patogénico, resistencia a sanitizantes y antibióticos, etc. La utilización de esta metodología ha sido muy útil para identificar y caracterizar los brotes epidémicos, establecer potenciales fuentes de origen de la contaminación (trazabilidad microbiológica) e implementar planes de control dirigido a las contaminaciones originadas durante la producción y distribución de alimentos. Objetivo: Este trabajo tiene como objetivo aislar e identificar los clones de L. monocytogenes presentes en superficies y alimentos de diferentes industrias chilenas de alimentos. Los resultados obtenidos permitirán determinar el real riesgo asociado con un resultado positivo para L. monocytogenes, de modo de tomar acciones correctivas más eficientes. Su p e r f ic ie s Pro d u c t o s e la b o r a d o s M ater ias p r im as Estos resultados nos indican que la principal fuente potencial de contaminación de alimentos por listeria corresponde a las superficies de trabajo y manipulación de los alimentos, siendo esto concordante con otros estudios internacionales aplicados a diferentes industrias (2). Caracterización molecular, serotipificación y casos estudio de Listeria monocytogenes en la industria de alimentos chilena KNOWLEDGE CENTER Identificación de distintos serotipos de Listeria. de listeriosis (Figura 2). La prevalencia de cada uno de los serotipos La serotipificación de L. monocytogenes permite agrupar y diferenciar Tabla 2: Porcentaje de prevalencia de serotipos de L. monocytogenes v/s matriz dependiendo de la matriz analizada se detalla en la Tabla 2. los distintos aislados de esta bacteria y correlacionarlos de acuerdo a su grado de patogenicidad y virulencia. Así, se han descrito 5 grupos Serotipo Producto terminado Materia prima Superficies moleculares, IIA, IIB, IIC, IVA y IVB, siendo este último el principal causante de los casos de listeriosis por consumo de alimentos contami- IVB 47% 12% 18% nados. IIB 29% 12% 41% IIA 18% 29% 18% IIC 6% 0% 0% IVA 0% 0% 6% Tabla 1: Potencial patogénico de los distintos serotipos de L. monocytogenes (3). Serotipo Incidencia IlA Serotipo comúnmente aislado desde alimentos y plantas procesadoras. Baja prevalencia clínica. IlB Serotipo epidémico oportunista de baja prevalencia clínica. llC Serotipo comúnmente aislado desde alimentos y plantas procesadoras. Causante de casos esporádicos de Listeriosis. lVA Serotipo comúnmente aislado en animales. lVB Serotipo epidémico que posee la mayor probabilidad de causar Listeriosis. Estudio de clonalidad de los distintos aislados de Listeria. El estudio de clonalidad de los aislados de listeria se realizó mediante la secuenciación de varias regiones hipervariables de su ADN y posterior comparación con una base de datos internacional. Este procedimiento, permitió diferenciar cada clon de manera independiente, asignándole su código de acuerdo a las más de 640 variantes distintas de esta bacteria. La relación clonal entre las distintas muestras fue la siguiente: Figura 3: Relación clonal de los aislados de L. monocytogenes. Las muestras analizadas se distribuyeron de acuerdo a su grupo molecular de la siguiente manera: Figura 2: Serogrupos moleculares de los aislados de L. monocytogenes. 22% S e rogru p o I I A S e rogru p o I I B 33% 39% C lo n e s ú n ic o s 44% C lo n e s re p e tid o s S e rogru p o I I C S e rogru p o I VA 3% 3% 56% S e rogru p o I VB En las muestras analizadas se observa una mayor prevalencia del grupo molecular IIB, que presenta una baja incidencia clínica. Sin embargo, el 33% de los aislados de listeria pertenecen al grupo de alto riesgo IVB, serotipo altamente epidémico y responsable de los principales brotes De las 36 muestras analizadas, 20 de ellas presentaron clones únicos que fueron aislados en una única oportunidad. De las 16 muestras restantes, 1 clon se aisló desde 4 muestras distintas, otro clon se aisló desde otras 6 muestras y otro clon desde otras 6 muestras. Caracterización molecular, serotipificación y casos estudio de Listeria monocytogenes en la industria de alimentos chilena KNOWLEDGE CENTER Casos Estudio: 1 CLON TG06 ENCONTRADO EN 4 MUESTRAS DISTINTAS. MISMO PROVEEDOR, MATRICES DISTINTAS. 3 CLON TG09 ENCONTRADO EN 6 MUESTRAS DISTINTAS. DISTINTAS EMPRESAS, ALIMENTOS SIMILARES Este clon se encontró en las instalaciones de un mismo expendedor de Se observó que el clon TG09 fue aislado desde empresas distintas, un alimentos y en la misma fecha. Las muestras donde se encontró este productor y expendedor de alimentos, sin embargo ambas empresas clon fueron las siguientes: venden productos similares. Este clon se encontró en: Un producto elaborado Dos superficies Un equipo de procesamiento. En este caso, es posible asumir que la contaminación del producto elaborado se debe a una contaminación cruzada desde la superficie de trabajo, además de comprobar que el clon de L. monocytogenes ya se encuentra en múltiples lugar dentro de las instalaciones. 2 CLON TG17 ENCONTRADO EN 6 MUESTRAS DISTINTAS. MISMO PROVEEDOR, TIEMPOS DISTINTOS Este clon se encontró en las instalaciones de un mismo expendedor de alimentos pero en tiempos distintos. Las muestras y las fechas donde se encontró este clon fueron las siguientes: Empresa X Materia prima A 1º semana Agosto Empresa X Materia prima B 1º semana Agosto Empresa Y Producto J con materia prima A 3º semana Agosto Empresa Y Producto K con materia prima A 3º semana Agosto Empresa Y Producto K con materia prima A 4º semana Agosto Empresa Y Superficie de contacto con prima A 4º semana Agosto Equipo procesos A 1º semana Agosto Equipo procesos A 2º semana Agosto que uno de ellos sea proveedor del otro y esté propagando la contami- Equipo procesos A 3º semana Agosto nación de L. monocytogenes. Equipo procesos A 4º semana Agosto Equipo procesos A 1º semana Septiembre Equipo procesos A 2º semana Septiembre En este caso existe una contaminación persistente en el equipo de procesos. Está descrito en diversas publicaciones que L. monocytogenes puede persistir por varios años en caso de no tomar las acciones correctivas apropiadas (4). En este caso, es posible que ambos compartan un proveedor común o Caracterización molecular, serotipificación y casos estudio de Listeria monocytogenes en la industria de alimentos chilena Conclusiones: La trazabilidad microbiana de L. monocytogenes realizada mediante los estudios de clonalidad, permite identificar potenciales fuentes de contaminación, además de evaluar los procedimientos de prevención y corrección. En este sentido, la alta incidencia de L. monocytogenes en muestras de superficie remarca la necesidad de establecer procedimientos y controles en las líneas de producción y procesos. Adicionalmente, estos resultados reafirman la importancia de complementar estos controles con verificaciones microbiológicas periódicas, que permitan medir la efectividad de las acciones correctivas inmediatas tomadas y también establecer acciones correctivas resolutivas en caso KNOWLEDGE CENTER Los casos estudio ponen en evidencia algunas de las aplicaciones que tiene el análisis de clonalidad, como por ejemplo: a.- Al identificar en los alimentos y las superficies un mismo clon, se puede inferir que quizás la contaminación en el alimento es a través de la transferencia desde la superficie; b.- En el caso de contaminaciones recurrentes con el mismo clon, esto da indicios que las acciones correctivas no han sido efectivas; c.- Al realizar análisis de clonalidad en muestras de proveedores y además en muestras internas de superficies o productos terminados, se puede determinar si la causa de alguna contaminación es producto de un clon proveniente de un proveedor. de contaminaciones. Materiales y métodos: Los serotipos encontrados en mayor proporción fueron los serotipos Desde clientes interesados en participar en el TAAG Knowledge Center, IIA, IIB y IVB, que entre ellos tuvieron una prevalencia de un 94%. Este se tomaron muestras de superficies, materia prima y producto termina- resultado es concordante con otros estudios similares realizados en do; en total 300 muestras. A todas la muestras se les realizó PCR otros países (5). En el caso particular de los productos terminados tiempo real para determinar la presencia de L. monocytogenes. Desde listos para el consumo, el clon IVB fue predominante con cerca del 50% las muestras con resultados positivos (36) se aisló L. monocytogenes de los aislados, lo cual es significativo ya que es el serotipo más utilizando agar aloa cromogénico, confirmando que la colonia seleccio- frecuentemente asociado con listeriosis humana (5). nada es L. monocytogenes mediante un segundo PCR tiempo real. Con respecto al estudio de clonalidad, como era de esperar, la mayoría de los clones fueron distintos entre sí. En el caso de los clones que se encontraron en muestras distintas, en el 100% de los casos fueron muestras relacionadas, lo cual permite determinar el origen o la causa de la contaminación, además de poder determinar la eficacia de acciones correctivas. Cada colonia aislada fue genotipificada mediante la secuenciación de ADN bi-direccional de 7 genes hipervariables. Cada clon fue asignado de acuerdo al código generado por cada uno de los alelos de los 7 genes. Para determinar el serotipo de L. monocytogenes, se utilizó un PCR multiplex que amplifica 6 genes de virulencia en Listeria. REFERENCIAS: 1. http://epi.minsal.cl/epi/html/bolets/reportes/Listeriosis/Listeria_SE442013.pdf 2. Sauders BD, et al. Prevalence and molecular diversity of Listeria monocytogenes in retail establishments. 2009. J Food Prot 72:2337-49. 3. Liu y cols, 2004. Liu, D. (2004). Listeria monocytogenes: comparative interpretation of mouse virulence assay. FEMS Microbiol Lett 233, 159–164. 4. Aarnisalo K, et al. Typing of Listeria monocytogenes isolates originating from the food processing industry with automated ribotyping and pulsed field gel electrophoresis. 2003. J. Food Prot. 66:249-255. 5. Zhang, Y., Yeh, E., Hall, G., Cripe, J., Bhagwat, A. Characterization of Listeria monocytogenes isolated from retail foods. 2007. International Journal of Food Microbiology. 113:47-53.