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DNA ESTRUCTURA Y FUNCIÓN Dra.PhD. Silvia Llambí Area Genética CURSO BMC – Unidad V AÑO 2008 El Material Genético debe cumplir con: • Codificación de la información genética. • Transmisión fiel de esa información en cada ciclo celular. • Proteínas? 20 aminoácidos • Acidos Nucleicos? sólo 4 bases... • ¿cuál es el material hereditario? 1928: Griffith descubre el fenómeno de “transformación bacteriana” 1944: Avery y colaboradores descubren que el “principio transformante” era el DNA. 1952: Hersey y Chase Experimento de la “batidora” DNA marcado con 32P Proteina marcada con 35S El material hereditario es el DNA • Secuencia de bases codifica la información genética ...AATCGGCATTAACGATCAGTCCATGACT... • Replicación del DNA: transmisión fiel de la información ¿Cómo es su estructura? Ya se sabía que: Fotografía de difracción de rayos X Estructura de la fibra de DNA es helicoidal Rosalind Franklin También se sabía que: Si bien la composición de bases del ADN varía de una especie a otra, la RELACIÓN 1:1 DE PURINAS (A y G) Y PIRIMIDINAS (C y T) se mantiene CONSTANTE (Regla de Chargaff,1949) Regla de Chargaff (1949): Composición del DNA en pares de bases: Especie Adenina Timina Guanina Citosina Humano 30.3 30.3 19.5 19.9 Micobacteria 15.1 14.6 34.9 35.4 Erizo de mar 32.8 32.1 17.7 18.4 1953: primer modelo de la estructura del DNA J. Watson y F. Crick Primer boceto de Crick sobre la estructura del DNA Abril 1953 = revista Nature publica 3 artículos científicos sobre el DNA: 1.- Watson y Crick (sobre estructura del DNA) 2.- Wilkins, Stokes y Wilson (acidos nucleicos formados por desoxipentosas) 3.- Franklin y Gosling (configuración molecular de la sal de DNA). 1962: Nobel en Medicina a Watson , Crick y Wilkins Estructura del DNA: *Doble hélice. *Complementación de bases. *Bases hacia adentro. *Fosfato y desoxiribosa hacia afuera. *Cadenas antiparalelas. Formas alternativas del DNA: Tipo de hélice Pares de bases por vuelta Condiciones en las que ocurre A 11 Humedad 75% Híbridos ADN-ARN 10 Humedad 92% Forma mas común en las células 9.33 Humedad 66% In vitro 12 Alta salinidad Regiones ricas en GC B C Z ASPECTOS A RESALTAR DE LA ESTRUCTURA DEL DNA: *FORMADO POR UNION DE NUCLEOTIDOS DE FORMA REPETITIVA: POLIMERO *NUCLEOTIDOS: TRES COMPONENTES = FOSFATO, DESOXIRIBOSA Y BASE NITROGENADA *COMPLEMENTARIEDAD DE BASES => ENLACES DE HIDROGENO ENTRE: TIMINA = ADENINA y CITOSINA = GUANINA *CADA CADENA PRESENTA UNA POLARIDAD, Y SON ANTIPARALELAS *BASES NITROGENADAS: EN EL INTERIOR DE LA MOLECULA (HIDROFOBICAS) *GRUPOS FOSFATO: PARTE EXTERNA DE LA MOLECULA (HIDROFILICOS) *DNA: CARGA NEGATIVA *CONFORMACIONES ALTERNATIVAS DEL DNA: B, A, ZYC *MAS COMUN: B *B, A Y C SON DEXTROGIRAS; Z ES LEVOGIRA Funciones del DNA: •Almacenar la información genética (secuencia de bases → genes) ...AATCGGCATTAACGAAGTCCATGACT... •Codificar para proteínas y RNAs (código genético) •Transmitir esa información correctamente (mecanismo eficiente de replicación del DNA) Genoma: • El genoma es el conjunto de DNA de una especie. • Todas las células de un organismo presentan el mismo genoma. • Tamaño del genoma y nº de genes: E. coli = 4.6 millones pb; 4200 genes H. sapiens = 3.300 millones pb; 35000 genes (estimación) Genoma eucariota: • Gran variedad de secuencias de DNA • No todas estas secuencias codifican para genes (la gran mayoría no son codificantes!) • Secuencias repetidas, transponibles, etc • Genes: generalmente en copia única GENOMA EUCARIOTICO 3.000.000 Kb GENES Y SECUENCIAS RELACIONADAS ADN CODIFICANTE (MENOS DEL 10%) ADN NO CODIFICANTE (MAS DEL 90%) ADN extragénico (80%-90%) SECUE BAJO 7 Secuencias únicas o PSEUDOGENES INTRONES SECUENCIAS INICIADORAS Y DE TERMINACION en bajo número de copias Secuencias moderada o altamente repetidas Secuencias dispersas (LiNES, SINES) Repeticiones agrupadas ADN satélites Microsatélites Estructura de un gen eucariota: Exones + intrones Regiones reguladoras: potenciadoras, promotoras, silenciadoras, etc. AISLAMIENTO Y OBSERVACION DEL DNA Extracción de DNA de muestra de sangre, pelo, semen, etc. Corrida en gel de agarosa: electroforesis Bancos de DNA: *investigación *conservación Perro Cimarrón Uruguayo Bibliografía: • Conceptos de Genética, Klug y col. • Genética, Grifitths y col. • Genes V, Lewin. BIOINFORMATICA Bancos de Genes (dominio público) National Center for Biotechnology Information, Estados Unidos) Search Nucleotide EMBL (European Bioinformatics Institute) DDBJ (DNA Data Bank of Japan) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/cow/ Bibliografía: • Conceptos de Genética, Klug y col. • Genética, Grifitths y col. • Genes V, Lewin. • E.mail: silvia.llambi@gmail.com