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Tema 3 Metabolismo y genética bacteriana Diversidad metabólica de microorganismos Fuente de energía (QuimioFoto- ) Oxidación de Fuente de e(Órgano- Lito- ) Brock Microbiología de los Microorganismos. 12ª ed. Fuente de carbono (Auto- Hetero- ) CO2 Autótrofos Compuestos orgánicos Heterótrofos Nutrición procariota Tipos de nutrientes: - Macronutrientes: C, H, O, N P, S, K, Na, Ca, Mg, Fe - Micronutrientes - Factores o elementos traza: (Co, Cu, Mn, Mo, Zn) de crecimiento: vitaminas, aa, purinas, pirimidinas Adquisición de nutrientes: Sistemas de transporte Lactosa, Na+, K+, HPO42-, HSO4- Glucosa, manosa, fructosa Azúcares, a.a., HPO42-, HSO4- BASES DEL CATABOLISMO Quimioorganoheterotrofos Fosforilación a nivel de sustrato Fermentación: Glucólisis y otras fermentaciones Fosforilación oxidativa Respiración aerobia – Ciclo del ácido cítrico – Sistemas de membrana transportadores de e– Fuerza motriz de protones G L U C O L I S I S C A T A B O L I S M O Fermentaciones Tipo CATABOLISMO Productos finales Bacterias Homoláctica Ácido láctico Streptococcus Lactobacillus (algunos) Heteroláctica Ácido láctico, etanol, CO2 Leuconostoc, Lactobacillus (algunos) Ácido mixta Ácidos láctico, acético, fórmico, succínico, 2-3 butanodiol, H2, CO2 Enterobacterias (algunas) Propiónica Ácidos propiónico y acético, CO2 y H2O Propionibacterium, Clostridium propionicum CATABOLISMO Fermentaciones Producción de ácidos y/o alcoholes y/o gases: - Valor diagnóstico - Valor industrial - Implicaciones patológicas (caries) R E S P I R A C I Ó N C A T A B O L I S M O CICLO DE KREBS A E R O B I R E S P I R A C I Ó N A E R O B I T R A N S P O R T E D E e- F U E R Z A M O T R I Z D E H+ • Transporte de electrones en procariotas se realiza en la m. citoplasma (en la mitocondria en eucariotas). • El NADH es la fuente de los e- , que fluyen desde transportadores que tienen potencial de reducción más negativo a otros con un potencial más positivo, y finalmente se combinan con el O2 y H+ para formar agua. • La cadena de transporte de e- fragmenta en pequeños pasos la liberación de la gran cantidad de energía Resultando en la expulsión de H+ (espacio periplásmico en procariotas): - Gradiente de concentración de H+ (energía potencial química) citoplasma más alcalino, (quedan OH-) que espacio periplásmoco. - Gradiente de carga eléctrica (energía potencial eléctrica) citoplasma más negativo que espacio periplásmoco. C A T A B O L I S M O F U E R Z A M O T R I Z D E H+ Fosforilación oxidativa FotoFosforilación R E S P I R A C I Ó N A E R O B I ATPasa CATABOLISMO Estator a – b2 - δ Eje ε-ϒ Rotor C12 http://2.bp.blogspot.com/_xNwYRlNYED0/Swryxd-A7TI/AAAAAAAAAA8/WvdEX9_eCdk/s1600/pp+atpasa.jpg B I O S Í N T E S I S Crecimiento microbiano • Crecimiento microbiano incremento del nº de células. • Multiplican por fisión binaria o bipartición (mayoría) • El Nº se duplica en cada generación • TIEMPO DE GENERACIÓN Fisión binaria o bipartición C I C L O C E L U L A R Replicación Semiconservativa del DNA Procariotas Orígenes de replicación Eucariotas MECANISMO DE REPLICACIÓN DEL ADN EN BACTERIAS 1ª etapa: Desenrrollamiento y apertura de la doble hélice.en el punto ori-c. 2ª etapa: Síntesis de dos nuevas hebras de ADN. 1 1 2 2 2 sentido 5´-3´ 2 1 sentido 5´-3´ 2 2 3ª * ADN polimerasas I y III que cortan el error etapa: Corrección de errores * ADN polimerasa III lo corrige * ADN ligasa une los extremos Cultivo monofásico o sistema cerrado Curva de crecimiento MEDIDA DEL CRECIMIENTO MICROBIANO Medida del nº de células MÉTODOS: Recuento directo cámaras de recuento Contadores electrónicos contador Coulter o el citómetro de flujo Filtración en membrana tinción fluorescente (Naranja de acridina) Recuento de viables: - Siembra por extensión en superficie - Siembra por dilución en agar - Filtración en membrana siembra de m. en agar Medida de la masa celular: - Peso seco microbiano - Espectrofotometría (turbidez) MEDIDA DEL CRECIMIENTO MICROBIANO Siembra por extensión en superficie Siembra por dilución en agar CRECIMIENTO EXPONENCIAL Tiempo de generación bacteriana: ejemplo de 20 minutos Nº bacterias 1 2 4 8 1 hora 16 32 64 2 horas 128 256 512 3 horas 1.028 2.056 4.112 4 horas 8.224 16.448 32.896 5 horas 65.792 131.584 6 horas 263.168 Nº bacterias 526.336 1.052.672 2.105.344 7 horas 4.210.688 8.421.376 16.842.752 8 horas 33.685.504 67.371.008 134.742.016 9 horas 9,04238 E+15 9.042 BILLONES 18 HORAS 269.484.032 538.968.064 1.077.936.128 10 horas 2.155.872.256 4.311.744.512 8.623.489.024 11 horas … Factores que influyen en el crecimiento bacteriano Máxima, mínima, óptima Temperatura Psicrófilas Mesófilas Termófilas Hipertermófilas pH Oxígeno Máximo, mínimo, óptimo Acidófilas, Basófilas Aerobias Microaerofílicas Anaerobias facultativas Anerobios aerotolerntes Anaerobias estrictas Clasificación de los procariotas en relación con el oxígeno Grupo Bacteriano Relación con el oxígeno Tipo de Metabolismo Ejemplo Necesario Respiración aerobia Neisseria Microaerófilos Necesario a [↓] Respiración aerobia Campylobacter AerobiosAnaerobios Facultativos: No necesario, con O2 mejor Fermentación o Resp. aerobia o Resp. Anaerobia E. coli Obligados Dañino o letal Fermentación o Resp. Anaerobia Methanobacterium formicicum [A.] Aerotolerantes No necesario Fermentación Streptococcus pyogenes Aerobios: Obligados Anaerobios: Clasificación de los procariotas en relación con el oxígeno a.- Aerobio estricto b.- Anerobio estricto c.- Aero-/AneroFacultativo d.- Microaerófilos e.- Anerobios aerotolerantes http://vsites.unb.br/ib/cel/microbiologia/crescimento/aeracao.jpg Especies Tóxicas Derivadas del Oxígeno Enzimas destructoras de las Especies Tóxicas Derivadas del Oxígeno Enzimas destructoras de las Especies Tóxicas Derivadas del Oxígeno Prueba de la CATALASA Genética Bacteriana Mutaciones Bacterianas • Mutación: cambio en la secuencia de nucleótidos del genoma de un organismo (estables y heredables) • Pueden ser: – Espontáneas o – Inducidas • Baja frecuencia* (Mutaciones espontáneas) Mutación en un gen 10-6 – 10-7 por generación • Presión selectiva las favorecen Tipos de Mutaciones Bacterianas Tipos de Mutaciones Bacterianas Efectos de las Mutaciones 1) Mutaciones silenciosas (o neutras) no hay efecto fenotípico. 2) Mutaciones que alteran el fenotipo salvaje: A) Letales: muerte o pérdida de viabilidad del microorganismo B) Condicionalmente letales: bajo determinadas condiciones. C) De alteración fenotípica: pérdida o la merma de alguna función no esencial para la viabilidad del organismo. Efectos de las Mutaciones Tipos de modificaciones en las mutaciones no letales: - Alteraciones morfológicas: - cápsula - pared - fimbrias, flagelos… - Alt. Bioquímicas: Mut. auxotróficas (NO síntesis de metabolito esencial) - Alt. de virulencia (cápsula, adhesinas, LPS…) - Alteraciones de Sensibilidad: - Antibióticos - Bacteriófagos - Bacteriocinas Agentes Mutagénicos http://3.bp.blogspot.com/_1zWhg0gVkuI/Sxc7yfqkG9I/AAAAAAAABOA/dPl2awjAMvo/s000/Agentes+mutag%C3%A9nicos.png Transferencia Genética en Bacterias Mecanismos de transferencia genética: 1. Transformación 2. Transducción 3. Conjugación • • • Generación de variabilidad genética … La transferencia genética puede ocurrir: - Intraespecies - Interespecies Unidireccional Donante a receptor Transformación • Transferencia de genes por incorporación de ADN exógeno. • Pasos – Unión a superficie – Penetración del DNA – Unión a prot. específicas – Recombinación • Significado biológico: - Antígenos capsulares - Ag superficie evasión R.I. http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d9/Experimento_de_griffith.jpg Transducción • Transferencia de genes bacterianos a través de un bacteriófago (fago) • Tipos de transducción T. especializada T. generalizada • Importancia – Común en bacterias Gram + – Conversión lisogénica Infección de Célula Huésped por Fagos Adsorción (reversible) – Fibras de cola u otra estructura – Receptores Bacterianos Específicos: Proteínas, LPS( T4), Pili, Lipoproteínas Unión “Irreversible” - Placa base u otras estructuras Contracción de la vaina (cola) Inyección acido nucleico Ciclo Lítico de Multiplicación del Fago • Fase de Adsorción inyección ADN • Fase de Multiplicación (o Eclipse) • Genes tempranos • Síntesis ADN del fago • Genes tardíos • Fase de Maduración y ensamblaje • Fase de Lisis de Liberación Ciclo Lisogénico de Multiplicación del Fago • Adsorción inyección ADN • Integración – Profago – Represor - Inmunidad • Replicación simultánea Corynebacterium diphtheriae Bacteria lisogénica Fago atemperado INDUCCIÓN Transducción Generalizada • • • • • • Infección del donante Replicación del fago y degradación del ADN huésped Ensamblaje partículas virales. Alguna con trozo de donante Liberación del fago Infección del receptor por un virus con trozo de donante Recombinación Transducción Especializada-Fago lisogénico • Bacteria lisogénica con Fago atemperado • Indución del profago ciclo lítico • Activación y ensamblaje de fagos. Alguno con ADN bacteriano • Liberación de fagos • Infección por fago con ADN de bacteria donante • Recombinación INDUCCIÓN Transducción – Generalizada: “cualquier gen” del donante tiene la misma probabilidad de ser transferido. Ocurre durante el ciclo lítico de fagos virulentos y atemperados – Especializada: “ciertos genes” tienen mayor probabilidad de ser transferidos. Realizada durante la inducción de ciertos Fagos atemperados, que incorporan ciertos genes bacterianos. Observadas en: - Enterobacterias, Pseudomonas - Estafilococos y Bacillus Conjugación • Transferencia genética entre dos bacterias que requiere contacto celular • Codificado por un PLÁSMIDO Donor • Bacterias que intervienen: – Donante F+ – Receptora F- Recipient Plásmidos • Elemento genético extracromosómico pequeño, capaz de replicación autónoma (replicón) • Son moléculas bicatenarias de ADN * • Nº de copias (1 en grandes y hasta >100 en pequeños) • Tipos de plásmidos: – Conjugativos – No conjugativos Estados fisiológicos del factor F Autónomo F+ Integrado Hfr Autónomo con genes cromosómicos F´ Conjugación Mecanismos de conjugación Cruces F+ F- Puente de conjugación - Transferencia de ADN: – Origen de transferencia – Replicación cadenas ADN – Separación - Bajo nivel de transferencia de genes cromosómicos Mecanismos de conjugación Cruces Hrf F- Puente de conjugación - Transferencia ADN - Recombinación Importancia: - Alto nivel de transferencia de genes cromosómicos Mecanismos de conjugación Cruces F´ F- Puente de conjugación - Transferencia de ADN: – Origen de transferencia – Replicación cadenas ADN – Separación Importancia en G- : •Transferencia de resistencia múltiple a los AB HORIZONTAL Conjugación • IMPORTANCIA: Diseminación rápida Horizontal Bacterias Gram • Resistencia antibióticos • Factores de virulencia (Toxinas, invasinas…) Bacterias Gram + • Resistencia antibióticos • factores de virulencia (adherencia, cápsula, toxinas…) Elementos Genéticos Transponibles • Segmentos móviles de ADN capaces de mudarse de una localización a otra (del genoma u otros ADN) • Propiedades – – – Movimiento al “azar” (Hay sitios preferentes) No poseen autorreplicación Recombinación no homóloga, ilegítima o sitio-específica: • No requiere homología entre moléculas recombinantes • Mediada por Transposasa (codificada por transposón) − Mecanismos: Conservativo y Replicativo • Tipos: 1. Secuencias de Inserción 2. Transposones Tipos de Elementos Transponibles 1. Secuencias de Inserción (IS) – – – – Sólo portan los genes de transposición Denominación - IS1, IS2… Tamaño: ± 1.000 pb Repeticiones invertidas de 15-25 pb GFEDCBA ABCDEFG Transposasa Estructura Gen transposasa – Importancia: • Mutaciones inactivación del gen donde se inserte • Lugar de Inserción de plásmidos en el cromosoma • Expresión de genes flagelares de Salmonella (V. de fase) • Útiles en estudios de epidemiología molecular Tipos de Elementos Transponibles 2. Transposones (Tn) – Elementos que portan otros genes además de los de transposición – Denominación - Tn1, Tn2… – Estructura • Tn complejos – Importancia • Genes de Resistencia a muchos Antibióticos • Salto a plásmidos plásmidos con “multirresistencias” Mecanismos de intercambio genético RECEPTORA DONADORA Transfomación Transducción Requiere: - ADN libre y - estado de competencia Mediado por bacteriófagos Transferencia de uno a pocos genes Generalalizada (transferencia de cualquier gen) Especializada (transferencia de genes concretos) Conjugación Mediado por contacto celular Transferencia de: - plásmidos e - incluso de genes cromosómicos Elementos genéticos móviles Secuencias de inserción Tamaño no superior a 1000 pb, por lo general Transposones Tamaño de varios genes Secuencias idénticas e invertidas en los extremos (secuencias de inserción) Transposasa Útiles en estudios de epidemiología molecular de enfermedades infecciosas y en estudio de mutaciones Transposasa + otros genes (a veces de resistencia a antibióticos) Resistencia AB