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Virología Aplicada Programa Unidad I Biotecnología y salud. Implicancias y usos en profilaxis, diagnóstico y terapia. Agentes virales de origen animal, vegetal y bacteriófagos implicados en desarrollos biotecnológicos: Aspectos virológicos básicos (estructura, multiplicación, genética). Producción de vacunas. Virus como vectores: clonado y expresión de proteínas. Utilización de agentes virales en terapia génica. Producción de sustratos antigénicos y antisueros con fines diagnósticos. Unidad II Metodología general. Aislamiento y caracterización de virus. Microscopía óptica: inmunofluorescencia, inmunohistoquímica, hibridación in situ. Microscopía electrónica e inmunoelectrónica. Cultivo viral. Purificación de viriones: técnicas de precipitación, técnicas de ultracentrifugación y centrifugación diferencial. Aislamiento y caracterización de ácidos nucleicos: Métodos de extracción alternativos considerando el material de partida y la utilización posterior. Hibridación. Amplificación. Análisis de proteínas: métodos electroforéticos, métodos inmunológicos. Producción y purificación de proteínas virales individuales. Unidad III Virus como herramientas en biotecnología. Virus a ADN Virus a ARN Virus como vectores vacunales Virus como vectores en terapia génica Unidad IV Virus como objeto de estudio. Diagnóstico viral. Detección de antígenos, anticuerpos y ácidos nucléicos. Obtención de muestras: selección, colección, transporte y procesamiento. Bioseguridad. Metodologías de uso en virología clínica. Métodos inmunológicos: detección del antígeno viral, detección de la respuesta del huesped. Inmunofluorescencia, Inmunoensayos, western blot, fijación de complemento, seroneutralización, hemaglutinación. Métodos basados en la detección de ácidos nucleicos: métodos de hibridación, métodos de amplificación de target, métodos de amplificación de señal, métodos cuantitativos (carga viral). Diagnóstico virológico rápido. Cultivo rápido (shell vial), detección directa de antígeno sobre material clínico. Pruebas de susceptibilidad a drogas, genotipificación Citometría de flujo Automatización. Unidad V Bases para el diseño de métodos de detección. Consideraciones generales basadas en las características virales (proteínas inmunogénicas, epitopes relevantes, crecimiento en cultivo, etc), características de la muestra y características del paciente (inmunocompetente ó inmunosuprimido, edad, etc) Patógenos importantes en salud humana: estrategias específicas para virus de las hepatitis (A, B, C y D), virus respiratorios (Influenza, parainfluenza, respiratorio sincitial, adenovirus), virus de diarreas (rotavirus), virus del sarampión, Herpesvirus (HSV, CMV, EBV), Papillomavirus, HIV. PROGRAMA PRÁCTICO TRABAJO PRÁCTICO N° 1 TÉCNICAS BÁSICAS 1 Bioseguridad. Discusión de los fundamentos teóricos y los aspectos prácticos del cultivo celular, así como sus aplicaciones en los distintos campos de la Virología. Trabajo en esterilidad. Características de las líneas celulares de mayor uso en diagnóstico. Líneas celulares modificadas genéticamente. TRABAJO PRÁCTICO N° 2 TÉCNICAS BÁSICAS 2 Introducción a los conceptos del cultivo viral y a la preservación de stocks virales. Evaluación de sistemas alternativos en el cultivo viral. Comparación del efecto citopático producido por diferentes agentes virales. Cultivo de virus con efectos líticos sobre la monocapa celular. Cultivo de virus inductores de la formación de sincicios. Curvas de crecimiento viral. TRABAJO PRÁCTICO N° 3 TITULACIÓN VIRAL POR DILUCIÓN TERMINAL Introducción a los ensayos de cuantificación viral. Análisis de las características, aplicaciones y limitaciones de los diferentes métodos de uso corriente. Titulación por dilución terminal del stock viral obtenido en el Trabajo Práctico N° 2. Análisis de los resultados. Cálculos para obtener el título. TRABAJO PRÁCTICO N° 4 TITULACIÓN VIRAL POR PLAQUEO. CLONADO DE VIRUS Titulación por plaqueo del stock viral obtenido en el Trabajo Práctico N° 2. Limitaciones de la técnica. Análisis de los resultados. Evaluación de métodos alternativos de titulación. Cálculo del título. Importancia y utilidad de la purificación viral mediante la obtención de clones. TRABAJO PRÁCTICO N° 5 CONCENTRACIÓN y PURIFICACIÓN VIRAL Concentración de los stocks virales obtenidos y titulados utilizando Polyetilenglycol y mediante ultracentrifugación sobre colchón de sacarosa. Principios de la ultracentrifugación. Purificación de virus en gradientes de densidad de CsCl y Iodixanol. TRABAJO PRÁCTICO N° 6 CARACTERIZACIÓN DE VIRUS 1: SEROTIPIFICACIÓN. Seroneutralización viral. Evaluación de sueros con fines epidemiológicos y diagnósticos. Técnicas de seroneutralización para tipificar virus. Seroneutralización por reducción de focos infecciosos. Caracterización de serotipos de rotavirus por reducción de focos fluiorescentes. TRABAJO PRÁCTICO N° 7 CARACTERIZACIÓN DE VIRUS 2: GENOTIPIFICACIÓN. Genotipificación por hibridación, PCR o secuenciamiento. Genotipificación de Rotavirus por RT-PCR. Genotipos G y P, importancia en la evaluación de la implementación y resultados de planes de vacunación. Epidemiología molecular y evolución de los virus. TRABAJO PRÁCTICO N° 8 DETECCIÓN VIRAL EN MUESTRAS CLÍNICAS Detección por ELISA, Imnunofluorescencia, PCR y RT-PCR de virus en muestras clínicas. El caso de los virus respiratorios y entéricos. Identificación de antígenos virales en cultivo: inmunofluorescencia, inmunoquímica. Técnicas de cultivo rápido, Shell vial. Uso de anticuerpos monoclonales. TRABAJO PRÁCTICO Nº 9 CUANTIFICACIÓN VIRAL Métodos cuantitativos. Métodos de amplificación de target. Métodos de amplificación de señal. Real-time PCR. Uso de la Real Time RT-PCR para la cuantificación de rotavirus en aguas residuales. TRABAJO PRÁCTICO Nº 10 USO DE LA CITOMETRÍA DE FLUJO EN VIROLOGÍA CLÍNICA Detección rápida y sensible de agentes virales viables en muestras ambientales. Detección en muestras clínicas (BAL). Detección de apoptosis. Evaluación de subpoblaciones linfocitarias en pacientes infectados por HIV. SEMINARIO N° 1 Discusión de publicaciones científicas. SEMINARIO N° 2 Discusión de publicaciones científicas. Bibliografía Viral Vectors for Gene Therapy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Medicine). Curtis A. Machida (Editor). Humana Press; 1st ed. 2003. Viral Vectors for Gene Therapy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology). Otto-Wilhelm Merten, Mohamed Al-Rubeai. Humana Press; 1st Edition. 2011. Vaccines. Stanley A. Plotkin MD, Walter Orenstein MD, Paul A. Offit MD. Saunders; 5ta edición. 2008. New Generation Vaccines, Fourth Edition. Myron M. Levine (Editor) Informa Healthcare. 2008. Vaccine Design: Innovative Approaches and Novel Strategies. Rino Rappuoli (Editor), Fabio Bagnoli (Editor). Caister Academic Press; 1 edition. 2011. Principles of Virology (2 Volúmenes). Tercera Edición. S. Jane Flint, L. W. Enquist, Vincent R. Racaniello. ASM Press, Washington, D.C., USA, 2009. Principles of Virology: Molecular Biology, Pathogenesis and Control. Segunda edición. S.J. Flint, L.W. Enquist, R.M., Racaniello, A.M. Skalka. ASM Press, Washington, D.C., USA, 2004. Exploiting Biotechnology. V. Moses, S. Moses. 1995. Harwood Academic Publishers, GmbH. Biotechnology, the science and the bussines. V. Moses, R.E.Cape. 1991 Harwood Academic Publishers, GmbH. Molecular Biotechnology. Principles and Applications of Recombinant DNA. B .R.Glick, J.J. Posternok. 1994. ASM Press, Washington D.C. USA. Virology. J. Levy, H. Fraenkel Conrat, R.A.Owens. 1994 Prentice Hall inc. New Jersey, USA. Recombinant DNA and Biotechnology. H. Krenzer, A. Massey. 1996 ASM Press. Washington D.C., USA. Immunochemistry in Practice. A. Johnstone, R. Thorpe. 1996 Blakwell Science. Oxford, USA. Laboratory Safety Principles and Practices. D. O. Fleming, J. H. Richardson. J.J. Tulis, D. Vesley. 1995 ASM Press. Washington D.C., USA. Methods in Cell Biology. Vol 43. Protein Expression in Animal Cells. M. G. Roth. 1994 Academic Press. California, USA. Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Applications. D. H. Persing , T. F. Smith, F. C. Tenover, T. J. White. 1993 ASM Press. Washington D.C., USA. Viral Pathogenesis. N. Nathanson. 1997 Lippincott – Raven Publishers. Philadelphia, USA. Clinical Virology. D. D. Richman, R. J. Whitley, F. G. Hayden. 1997 Churchill Livingstone Inc. New York, USA. Biopharmaceutical Drug Design and Development. S. Wu – Pong, Y. Rojanasakul. 1999 Humana Press. New Jersey, USA. Advances in Experimental Medicine and Biology, vol 397. Novel Strategies in the Design and Production of Bacines. S. Cohen, A. Shafferman. 1996 Plenum Press. New York, USA. Using Antibodies a Laboratory Manual. E. Harlow, D. Lane. 1999 Cold Spring Harbor Laboratory Press. New York, USA. Methods in Molecular Biology, vol 86. RNA Isolation and Characterization Protocols. R. Rapley, D. L. Manning. 1998 Humana Press Inc. New Jersey, USA. Virology, a laboratory manual, FG Burleson, TM Chambers, DL Wiedbrauk. 1992 Academic Press, San Diego, USA. Methods in Molecular Biology, vol 8. Practical Molecular Virology. MKL Collins. 1991 Humana Press Inc. New Jersey, USA. Principles of Virology. Molecular Biology, Patogénesis, and Control. SJ Flint, LW Enquist, RM Krug, VR Racaniello, AM Skalka. 2000 ASM Press, Washington DC, USA. Virology. BN Fields, DM Knipe, PM Howley. 1996 Lippincott-Raven, Philadelphia, USA. Protein Purification, Principles and Practice. Scopes, RK . 1994 Springer, Germany. Virology Methods Manual. B. Mahy, H Kangro. 1996, Academic Press, London, UK. Clinical Virology Manual. S Specter, R Hodinka, S Young 2000 ASM Press, USA