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Licenciatura de Biología GUÍA DOCENTE DE FUNDAMENTOS DE BIOLOGÍA APLICADA I 1. ASIGNATURA: FUNDAMENTOS DE BIOLOGÍA APLICADA I 2. CÓDIGO: 3.- TIPO DE ASIGNATURA: TRONCAL 4. CICLO EN QUE SE IMPARTE: SEGUNDO CICLO 5. CURSO EN QUE SE IMPARTE: CUARTO 6. CARÁCTER ANUAL O CUATRIMESTRAL: ANUAL 7. NÚMERO DE CRÉDITOS: 16 8. PRERREQUISITOS: Ninguno 9. PROFESORES RESPONSABLES Arias López, Margarita Burgos Poyatos, Miguel Campos Rodríguez, Juan Carrillo Lechuga, Presentación Conde Porcuna, José María Garrido Ramos, Manuel Angel Gómez Reyes, José María Herran Moreno, Roberto De la Jiménez Medina, Rafael Lara Porras, Ana Martín Alganza, Angel Mata Balaguer, Trinidad Oliver Jiménez, José Lutgardo Rico Castro, Nuria Robles Pérez, Aureliano M. Ruiz Rejón, Carmelo Sánchez Borrego, Ismael Zurita Martínez, Federico Área Matemática Aplicada Genética Matemática Aplicada Ecología Ecología Genética Ecología Genética Genética Estadística Genética Genética Genética Estadística Matemática Aplicada Genética Estadística Genética Departamento Matemática Aplicada Genética Matemática Aplicada Biología Animal y Ecología Biología Animal y Ecología Genética Biología Animal y Ecología Genética Genética Estadística e Investigación Operativa Genética Genética Genética Estadística e Investigación Operativa Matemática Aplicada Genética Estadística e Investigación Operativa Genética 10. OBJETIVOS DE LA ASIGNATURA. COMPETENCIAS Y DESTREZAS QUE DEBEN SER DESARROLLADAS Objetivos 1) Introducción a los alumnos en los estudios cuantitativos y en las aproximaciones técnicas necesarias para desarrollarlos. 2) Adquisición de un espíritu crítico en la línea del método científico. 3) Capacidad de análisis y de síntesis, así como de comunicación escrita y oral de resultados científicos. 4) Manejo con soltura de las nociones básicas de contrastes de hipótesis. 5) Conocimiento y diferenciación de los distintos tipos de diseños de experimentos. 6) Conocimiento de las herramientas fundamentales para el tratamiento y el análisis estadístico de datos multivariantes. Comprensión y manejo de los principios básicos de los procesos estocásticos. 7) Conocimiento de algún paquete estadístico. 8) Conocimiento de modelos matemáticos en la biología: identificación, interpretación cualitativa y diseño de alternativas. 9) Conocimiento de técnicas de análisis de campo, laboratorio y estadístico básicas y comunes en la investigación ecológica. Destrezas 1) Habilidades técnicas de manejo básico en laboratorios de citogenética molecular, genética cuantitativa, bioinformática, genómica y genética de poblaciones. 2) Saber analizar e interpretar un conjunto de datos. 3) Utilizar con soltura algún paquete estadístico. 4) Interpretar correctamente los resultados estadísticos. 5) Distinguir ante un supuesto práctico la técnica estadística apropiada. 6) Saber plantear esquemas de resolución estadística antes situaciones reales. 7) Identificación de los modelos matemáticos básicos, así como algunas variantes, con ejemplos reales de la biología. 8) Reconocimiento de las virtudes y las limitaciones de un modelo matemático. 9) Capacidad para proponer mejoras en un modelo y/o diseñar alternativas más adecuadas. 10) Capacidad de diseñar y realizar experimentos ecológicos aplicados. 11. DESARROLLO EN CRÉDITOS ECTS A Actividad Técnica Teoría Clase magistral C D E Horas Factor de Horas de presenciales trabajo del clase fuera del aula estudiante Horas de trabajo del estudiante Horas totales Créditos ECTS del profesor del alumno Explica los fundamentos teóricos Asimila y toma apuntes. Plantea dudas y cuestiones complementarias 45 - 1.5 67.5 112.5 4.50 Trabaja en grupo. Presenta oralmente el trabajo 11 1 5.5 60.5 72.5 2.90 Experimenta e interpreta los resultados 68 - 0.75 51 119 4.76 Resuelve problemas y recibe orientación 3 personalizada - 18 54 57 2.28 Elaboración de la memoria - - 20 20 0.80 19 0.76 400 16 Seminarios Presenta objetivos, sobre temas Seminarios orienta y tutoriza el de la trabajo asignatura Presenta los objetivos, orienta el trabajo y Campo y realiza el seguimiento. Prácticas laboratorio Colabora en la interpretación de los resultados Presenta objetivos y Ejercicios y plantea ejercicios. clases de Orienta y resuelve debate Otras dudas actividades Elaboració Presenta objetivos y n de una tutoriza el trabajo memoria Exámenes TOTAL B - 19 127 20 253 12. CONTENIDOS 1) Contrastes de hipótesis. 2) Diseños de Experimentos. 3) Análisis de datos cualitativos. 4) Análisis de Regresión. 5) Análisis Cluster. 6) Análisis discriminante. 7) Análisis de Correlación Canónica. 8) Cadenas de Markov. 9) Obtención de complejos sinaptinémicos. 10) Clonación de DNA satélite. 11) Estimación del número de genes en que difieren dos líneas puras. 12) Cálculo de la heredabilidad mediante regresión padres-hijos. 13) Bioinformática. 14) Análisis de secuencias. 15) Genómica funcional. 16) Análisis de la variabilidad isoenzimática en poblaciones naturales. 17) Modelos continuos de crecimiento: Malthus, Logística, Gompertz, Logística inversa, Logística con población mínimo, Sistemas de Lotka-Volterra (orbitas, retratos de fase, puntos de equilibrio). 18) Ecuaciones en diferencias lineales y sistemas de ecuaciones en diferencias. Soluciones constantes, comportamiento asintótico, estabilidad. 19) Ecuaciones en diferencias no lineales. Complejidad dinámica. 20) Ajuste de datos. 21) Diseño y realización de experimentos ecológicos. Hipótesis nula. Contrastes. 22) Interpretación de resultados. Tipos de análisis. 23) Análisis experimental del crecimiento individual, del crecimiento poblaciones, de la competencia, y de la distribución espacial. Interacción entre factores. 13. BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA Allan JD (1995) Stream Ecology. Structure and Function of Running Waters. Chapman & Hall.London: 338 pp. Anton H (1990) Introducción al álgebra lineal. Editorial Limusa. Box GEP, Hunter WG & Hunter JS (1988) Estadística para Investigadores. Reverté. Doucet P & Sloep PB (1992) Mathematical modelling in the live sciences. Ellis Horwood. Elliot JM (1983) Some Methods for the Statistical Analysis of Samples of Benthic Invertebrates. (FBA Scientific Publication 25). Freshwater Biological Association. Ambleside. 159 pp. Falconer DS and Mackay TFC (2001) Introducción a la genética cuantitativa. Editorial Acribia.. 469 pp. García Leal J & Lara Porras AM(1998) Diseño Estadístico de Experimentos. Análisis de la Varianza. Grupo Editorial Universitario. Hastings A (1997) Population Biology. Concepts and Models. Springer-Verlag. Hillis DM and Moritz C (1990) Molecular Systematics. Sinauer Associates, Inc. Sunderland, Massachusetts, USA. Hirsch MW, Smale S (1983) Ecuaciones diferenciales, sistemas dinámicos y álgebra lineal. Alianza Universidad. Izquierdo, M. (1999) Ingeniería genética y transferencia génica. Pirámide, Madrid. Krebs CJ (1989) Ecological Methodology. Harper Collins. Nueva York. 654 pp. Lara Porras AM (2000) Diseño estadístico de experimentos, análisis de la varianza y temas relacionados: Tratamiento informático mediante SPSS. Ed. Proyecto Sur. Lara Porras AM (2000) Estadística para Ciencias Biológicas y Ciencias Ambientales. Problemas y exámenes resueltos. Ed. Proyecto Sur. Li, W-H. (1999) Molecular evolution. Sinauer Associates Inc., Massachusetts, 2nd. Ed. Ludwig JA & Reynolds JF (1988) Statistical Ecology. J. Wiley & Sons. Nueva York. 337 pp. Mason RL, Gunst RF & Hess JL (1989) Statistical Design and Analysis of Experiments. John Wiley & Sons. Moses MJ, Poorman PA (1981) Synaptonemal complex analysis of mouse chromosomal rearrangements. II Synaptic adjustment in a tandem duplication. Chromosoma 81, 519535 Ollero HJ, García Leal J, Lara Porras AM, Martínez A, Rodriguez C & Ramos H (1997) Diseño y Análisis Estadístico de Experimentos.Grupo Editorial Universitario. Rashidi HH, Buehler LK (2000) Bioinformatics Basics. Applications in Biological Science and Medicine. CRC Press, Boca Raton. Rorres C, Anton H (1979). Aplicaciones de álgebra lineal. Editorial Limusa. Sambrook J.; Fritsch, E.F.; Maniatis, T. 1989. Molecular cloning: A Laboratory Manual (2ª edición). Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Sutherland WJ (1996) Ecological Census Techniques. Cambridge University Press. Cambridge. Twizell EH (1988) Numerical Methods, with Applications in the Biomedical Sciences. Ed. John Wiley and Sons. Yeargers EK, Shonkwiler RW, Herod JV (1996) An introduction to the mathematics of biology (with computer algebra models). Birkhauser. Zill DG (1988) Ecuaciones Diferenciales con Aplicaciones. Grupo Editorial Iberoamérica. 14. MÉTODOS DOCENTES - Clases magistrales (pizarra, transparencias, proyecciones) Clases prácticas (campo, laboratorio, ordenadores) Tutorías Seminarios Memoria Ejercicios 15. TIPOS DE EXÁMENES Y EVALUACIONES Se utilizaran los siguientes criterios para evaluar a un alumno por curso: 1) Asistencia, que será computada mediante el control diario de asistencia. Más de 10 horas de faltas sin justificar conllevará que se suspenda la asignatura, y el alumno tendrá que examinarse de la asignatura completa en el Examen Final. Para computar las 10 horas de faltas, se tendrán en cuenta las faltas a cualquiera de las partes de la que consta esta asignatura. 2) Evaluación por curso. Aquellos alumnos que hayan superado el criterio anterior, su calificación global de la asignatura se obtendrá a partir de las dos notas parciales obtenidas al final de cada cuatrimestre. Cada nota parcial será fruto de una prueba escrita de toda la materia impartida en ese período tanto en teoría como en prácticas y una evaluación continua realizada por los profesores que impartan dicho cuatrimestre y que contemplará el aprovechamiento del alumno durante el curso. Cada parcial será calificado entre 0 y 10. Los alumnos que consigan un 5 o más de nota media entre los dos parciales, habrán aprobado la asignatura en la evaluación por curso., 3) Examen Final. Los alumnos que no consigan aprobar por curso deberán recuperar en el examen final el (los) parcial(es) suspenso(s) (aquellos cuya nota sea inferior a 5). Los alumnos que decidan intentar subir nota en alguno de los exámenes parciales, deberán renunciar a la calificación obtenida por curso y, a los efectos de lo consignado en el párrafo siguiente, se entenderá que su calificación definitiva será la obtenida en el Examen Final. La calificación final será incrementada en 1 punto cuando se apruebe en la evaluación por curso, en 0.5 puntos cuando se apruebe en el Examen Final de Junio y en 0 cuando lo sea en Septiembre.