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UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE CHIAPAS FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS EXTENSIÓN OCOZOCOAULTA Integrantes: Herrera Sánchez Fátima del Carmen Martínez Hernández Juan Manuel Moreno Entzín Diana Cristina Trabajo: Tarea 2 “Lo que aprendí de la Unidad I” Facilitadora: Dra. Ana Olivia Cañas Urbina Materia: Bioquímica 4to Semestre “C” Fecha: 20 de Febrero de 2015 1.1 Origen de la vida Se conoces muchas teorías sobre el origen de la vida, tenemos la “teoría espontánea” propuesta por Aristóteles la cual fue refutada por Pasteur. También se encuentra la teoría de Oparin-Haldane que nos menciona que antes la atmosfera estaba formada por dióxido de carbono, amoniaco y vapor de agua que al cambiar la atmosfera ultravioleta se generó compuestos orgánicos habían aminoácidos y azucares necesarios para la formación de proteínas, éstos se habían originado en los mares dando así la llamada “sopa primigenia” y de ésta se originó la vida mediante a lo que se conoce como “evolución química del universo”. (Valdéz, 2012) Una de las teorías propuesta es la teoría de la panspermia que trata de que la vida pudo haberse originado con un microorganismo pegado a un meteorito y éste pudo haber sobrevivido a la atmosfera de la tierra. Se podría decir que la vida en la Tierra se originó cuando la primera membrana se cerró para hacerse llamar “célula” y de éste modo se pudo originar también la primera ruta metabólica (Díaz Plascencia, 2012) 1.2 Rutas metabólicas Una ruta metabólica es que aquella que tiene series de reacciones químicas, que suceden en la célula, hacia un sustrato (molécula por la cual actuará la enzima), estas series de reacciones tendrá uno o más productos. Hay diferentes tipos de rutas como son: Catabólicas: Son rutas oxidantes, se liberan energía y sintetiza el ATP. Ejemplos de ésta ruta son la glucólisis y la beta-oxidación. El catabolismo degrada y en ellos actúan los transportadores: NAD y FAD. Anabólicas: Estas son rutas reductoras las cuales consumen ATP. Ejemplos de esta ruta es el ciclo de Calvil y la gluconeogénesis. El anabolismo actúan los transportadores de electrones: NADP Anfibólicas: Estas rutas intervienen las dos rutas (catabólicas y anabólicas). Ejemplo de ello está el ciclo de Krebs y el ciclo de la urea. Tanto la ruta catabólica como la ruta anabólica, son procesos simultáneos lo cual quiere decir que ocurren al mismo tiempo y es necesario recordar que les serán necesarias las enzimas para que éstos ocurran Dichas reacciones tendrán una velocidad de reacción que se verá afectada por factores como el pH y temperatura. Ya que si se altera el pH las estructuras terciarias de las enzimas se verán afectadas y no realizaran su actividad correctamente y el caso de la temperatura afectará lo que es la estructura cuaternaria y terciaria, alterando así mismo la actividad de la enzima (Voet & Pratt, 2007) E: Enzima S: Sustrato P: Producto 1.3 Catálisis enzimática La catálisis enzimática es la que se encarga de estudiar la velocidad de las reacciones químicas que ocurren dentro de la célula al momento que se lleva a cabo la catálisis enzimática, ya que estas tienen una gran importancia en el metabolismo para controlar o inhibir la actividad dentro de esta por diversos factores como los fármacos o venenos. Así que se puede decir que está relacionado la cantidad de producto con el tiempo. La velocidad de la reacción se puede producir a partir de la disponibilidad del sitio activo. Como las reacciones catalizadas por las enzimas son saturables, al tratar de graficar el comportamiento entre sustrato y velocidad, nuestra grafica no nos dará un comportamiento lineal, solo si manejamos cierta cantidad de sustrato con la velocidad en ese caso lo será, pero si manejamos la cantidad de sustrato con respecto a la velocidad la enzima llegará a un punto de saturación, donde nuestra grafica se estancará provocando una curva que después será una línea recta horizontal indicando la velocidad máxima de la reacción y aunque le aumentemos al sustrato se mantendrá a una velocidad constante. Para determinar la Km que es la concentración a la mitad de la velocidad máxima, esta fórmula fue descubierta por Leonor Michaelis y Maund Menten y es famosa por que es la base de la mayoría de las cinéticas enzimáticas. La energía libre de activación, es la energía que hace diferencia entre ser un reactivo a ser un producto, ya que es la diferencia de energía entre ambos. 1.4 Teoría quimiosmótica Esta teoría es propuesta por Peter Mitchel y en ella explica cono surge la vida a través de los transportadores de electrones (NAD, FAD, NADP) ya que a partir de éstos se genera el ATP. En todas las membranas de nuestras células se encontraran “bombas de protones” éstas transportan iones dentro y fuera de la membrana que a su vez ayudará a la célula a tener un gradiente eléctrico. El proceso del cambio de iones a través de la membrana hará que dentro de la célula (citoplasma) tenga la carga eléctrica negativa y afuera de la célula carga positiva. Hemos de recordar que organelos que tienen membrana también tendrán bombas y estas también procuraran un equilibrio dentro de su interior, como por ejemplo la mitocondria, que buscará expulsar las cargas positivas al citoplasma que a su vez la membrana buscará expulsar igual ésta carga positiva. La carga negativa estará en su mayor parte fuera de las células. Todo esto ayuda a que se forme un gradiente, dentro de cada célula habrá un medio básico y fuera de ella el medio será acido, esto hará que se cree la “Turgidez”, gracias a este proceso nuestras células tengan una atracción y esta a su vez hace que estén conectados nuestros tejidos, órganos, etc (Vázquez Contreras, 2003) 1.5 Transportadores de electrones En el metabolismo existen diferentes coenzimas que actúan como receptores y transportadores de electrones entre los cuales los más importantes se encuentra el ATP que usado para transferir energía en distintas reacciones químicas, asi como también el NAD es una coenzima importante ya que acepta a los protones y como en nuestras células existen deshidrogenas nuestro NAD se transforma en NADH para convertirse en sustrato y actuar en la enzima que necesite reducir un sustrato, pero si el NAD acepta acepta a un ion hidruro se convierte en NADP, también tenemos al FAD que es un grupo prostético que puede donar electrones. Es importante mencionar que estas coenzimas y grupo prostetico actúan tanto en el catabolismo como en el anabolismo, aunque no todas actuan en ambas cosas; por ejemplo el FAD y el NAD están ligadas para llevar acabo la oxidación o degradar eso quiere decir que están trabajando con el catabolismo, mientras el NADP tiene reacción reductivas por lo tanto trabaja con el anabolismo 2 3 4 5 6 FAD oxidado (izquierda) y FAD reducido (derecha) 6.1 Termodinámica La termodinámica es la ciencia que nos ayuda en el estudio de los cambios de energía en un sistema. La termodinámica cuanta con leyes y definiciones que son: Ley cero: Esta ley dice que el calor si el calor se difunde en un cuerpo caliente ésta energía se difundirá hacia las partes más frías hasta que el calor esté difundido y así ninguno de los dos cuerpos buscará la forma de absorber más calor y se podría decir que estarán en equilibrio. Primera Ley: Esta ley es la conocida como “conservación de la energía” nos menciona que cuando se realice un trabajo, éste intercambiará su calor con otro sistema. El sistema también puede variar o cambiar su energía sin necesidad de un trabajo mecánico transformándose en otro tipo de energía como por ejemplo el calor Segunda Ley: Si tenemos dos gases mezclados, nunca seremos capaces de encontrarlos por separados de una forma espontánea. Es imposible que la energía se pierda ya que sólo se transforma. La segunda ley nos proporciona bases para la entropía; es representada con la letra “S” magnitud física que se encarga de describir los procesos irreversibles de los sistemas (reacciones exotérmicas) La entalpía está representada por la letra “H” y ésta describe la cantidad de la energía absorbida (reacciones endotérmicas) Referencias Díaz Plascencia, D. (2012). Lebas. Recuperado el 18 de Febrero de 2015, de Rutas metabolicas: http://lebas.com.mx/files/RUTAS-METABOLICAS.pdf Gonzales Mañas , J. (20 de 02 de 2015). Cursos de Biomoleculas. Obtenido de http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz3.htm Leyva, A. (Dirección). (2012). cadena de transporte de electrones [Película]. UAM. (20 de 02 de 2015). Obtenido de http://docencia.izt.uam.mx/japg/RedVirtualJAP/CursoDRosado/3_Enzimolog iayBioenergetica/2CineticaEnzimatica.pdf Valdéz, R. (2012). Biología. San Cristóbal. Vazquez Contreras , E. (03 de 10 de 2003). biologia y bioquimica molecular en linea. Obtenido de http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/fad.html Vazquez Contreras, E. (3 de 10 de 2003). Obtenido de biología y bioquímica molecular en linea: http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazquez/0403/funcion%20enzima.html Vázquez Contreras, E. (04 de Octubre de 2003). Instituto de Química UNAM. 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