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20132014 21/06/14 PROGRAMA DE LA ASIGNATURA Página 1 de 4 Vicerrectorado de Ordenación Académica Asignatura: 208 (6017) Bacteriología Titulación: Licenciado en Biología Créditos teóricos: 3 Horas teoría: 30 Proyecto Piloto Créditos prácticos: 1,5 Horas prácticas: 15 Duración: Área: 2º Cuatr. (630A) MICROBIOLOGÍA OBJETIVOS GENERALES: La asignatura de Bacteriología debe abordar el estudio de la diversidad en procariotas y conseguir una visión global de los mismos y sus relaciones evolutivas. Debe también presentar las bases utilizadas para la clasificación de estos microorganismos dando una visión conjunta y actualizada de la taxonomía bateriana. El objetivo general es conocer la diversidad procariótica que existe en los diferentes nichos ecológicos. Debido a la enorme diversidad existente en el mundo microbiano, no se pretende dar una visión sistemática exhaustiva, sino agrupar a los procariotas tratando de establecer un equilibrio lógico entre el rigor taxonómico y la eficacia pedagógica. También es necesaria la transmisión al alumno de una concepción dinámica, abierta y racional de la taxonomía. CONTENIDO: BLOQUE TEMÁTICO: I Evolución y sistemática microbianas Lección 1. Filogenia de los procariotas. Cronómetros evolutivos y construcción de árboles filogenéticos. Árbol filogenético universal: Dominios Archaea, Bacteria y Eukarya; características definitorias. Lección 2. Taxonomía microbiana. Clasificación y concepto de especie; organización jerarquizada de los grupos taxonómicos. Nomenclatura microbiana. Criterios y características empleados en la clasificación. Manuales de Bergey. Lección 3. Identificación bacteriana. Propiedades de los esquemas de identificación bacteriana. Características empleadas en la identificación. Claves y tablas de determinación. Esquema básico para la identificación de un aislado. BLOQUE TEMÁTICO: II Estudio de los principales grupos de bacterias Lección 4. Bacterias fotótrofas. Clasificación y situación filogenética. Características diferenciales de los principales grupos; ecología. Bacterias fotosintéticas anoxigénicas: bacterias púrpuras no del azufre; bacterias púrpuras del azufre; bacterias verdes del azufre; flexibacterias verdes; heliobacterias. Bacterias fotosintéticas oxigénicas: cianobacterias; proclorales. Lección 5. Bacterias quimiolitótrofas. Características generales e importancia ecológica. Bacterias nitrificantes: bioquímica de la nitrificación. Bacterias oxidadoras del azufre: rendimiento energético y metabolismo del carbono. Bacterias oxidadoras de hierro: Thiobacillus ferrooxidans. Bacterias oxidadoras estrictas de hidrógeno. Lección 6. Bacterias Gram-negativas con morfología especial y/o ciclos de vida característicos (I). Bacterias gemantes y/o con apéndices: características generales, clasificación y ecología; ciclos de vida. Bacterias envainadas: características generales y géneros más importantes. Bacterias deslizantes: características generales y motilidad; bacterias deslizantes no formadoras de cuerpos fructíferos; mixobacterias. Lección 7. Bacterias Gram-negativas con morfología especial y/o ciclos de vida característicos (II). Espiroquetas: características generales: estructura y motilidad; clasificación y filogenia; géneros más importantes. Predadoras de otras bacterias Gramnegativas: género Bdellovibrio. Lección 8. Bacterias Gram-negativas aerobias (I). Características generales y clasificación; ecología y potencial biotecnológico. Pseudomonas y xanthomonas: grupos de homología de RNAr; importancia como patógenos de animales y fitopatógenos. Bacterias de vida libre fijadoras de nitrógeno: géneros Azotobacter, Azomonas, Derxia y Beijerinckia; fijación del N2 en aerobiosis. Lección 9. Bacterias Gram-negativas aerobias (II). Rizobios y agrobacterias: características generales y clasificación; interacciones con plantas: nodulación en leguminosas (género Rhizobium) y producción de tumores (género Agrobacterium). Bacterias del ácido acético: características metabólicas diferenciales e interés industrial. Lección 10. Bacterias Gram-negativas aerobias (III). Bacterias metanotrofas: características generales y clasificación; metabolismo de los compuestos C1. Género Legionella. Género Neisseria: factores implicados en la virulencia y/o variación antigénica; síndromes clínicos. Género Bordetella: patogenia y factores de virulencia de B. pertussis. Lección 11. Bacilos Gram-negativos anaerobios facultativos (I). Características generales y clasificación. Familia Enterobacteriaceae: características metabólicas: fermentación ácido-mixta y fermentación butanodiólica; características antigénicas; principales patógenos humanos: Escherichia, Shigella, Salmonella, Yersinia y Klebsiella. Lección 12. Bacilos Gram-negativos anaerobios facultativos (II). Familia Vibrionaceae: género Vibrio: características patogénicas; género Photobacterium: mecanismo de bioluminiscencia. Género Aeromonas: importancia del grupo como patógenos de animales acuáticos. Familia Pasteurellaceae: importancia como patógenos humanos y de animales: géneros 20132014 21/06/14 PROGRAMA DE LA ASIGNATURA Página 2 de 4 Vicerrectorado de Ordenación Académica Haemophilus y Pasteurella. Lección 13. Bacterias Gram-negativas anaerobias. Bacterias con metabolismo fermentativo: clasificación y situación filogenética; patrones de fermentación; hábitats; géneros más importantes. Bacterias reductores de sulfatos: grupos metabólicos y ecología. Bacterias reductoras del azufre. Lección 14. Rickettsias y clamidias. Rickettsias: géneros Rickettsia y Coxiella; características fisiológicas y ciclos de vida; importancia médica y/o veterinaria. Clamidias: posición filogenética; características metabólicas y ciclo de vida; importancia como patógenos de animales. Lección 15. Bacterias Gram-positivas con bajo contenido en G+C (I). Filogenia y clasificación taxonómica. Micoplasmas: características generales y aspectos patológicos. Lección 16. Bacterias Gram-positivas con bajo contenido en G+C (II). Género Clostridium: diversidad metabólica; principales patógenos humanos y producción de toxinas. Género Bacillus: utilización como insecticidas bacterianos. Lección 17. Bacterias Gram-positivas con bajo contenido en G+C (III). Género Staphylococcus: producción de toxinas y patología. Bacterias del ácido láctico: homofermentación y heterofermentación; géneros más importantes: Lactobacillus, Leuconostoc, Lactococcus, Enterococcus y Streptococcus; interés industrial. Principales patógenos humanos. Lección 18. Bacterias Gram-positivas con alto contenido en G+C (I). Filogenia y clasificación taxonómica. Grupo coreniforme: características de la división celular; géneros Arthrobacter y Corynebacterium. Bacterias del ácido propiónico: género Propionibacterium. Lección 19. Bacterias Gram-positivas con alto contenido en G+C (II). Micobacterias: características distintivas de la pared celular; patógenos humanos: Mycobacterium tuberculosis y M. bovis. M. leprae. Bifidobacterias. Lección 20. Bacterias Gram-positivas con alto contenido en G+C (III): Actinomicetos. Características generales de los actinomicetos; grupos principales. Género Nocardia: interés clínico. Género Streptomyces: producción de antibióticos. Género Frankia. BLOQUE TEMÁTICO: III Estudio de los principales grupos de arqueas Lección 21. Halobacterias. Ambientes hipersalinos. Taxonomía y filogenia: orden Halobacteriales. Características distintivas: adaptación al halofilismo. Fotofisiología de las halobacterias: rodopsinas arqueanas. Aplicaciones biotecnológicas. Lección 22. Metanógenos. Hábitats y ecología: participación en el ciclo del carbono. Clasificación taxonómica y filogenia. Bioquímica de la metanogénesis: coenzimas metanogénicas; autotrofia y obtención de energía. Aplicaciones de los metanógenos: obtención de biogás. Lección 23. Arqueas termófilas extremas. Ambientes hipertermófilos y adaptaciones a la termofilia. Taxonomía y filogenia. Arqueas sulfato reductoras: género Archaeoglobus. Arqueas carentes de pared celular: género Thermoplasma. Arqueas termófilas extremas dependientes del azufre. BLOQUE TEMÁTICO: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana 1. Características morfológicas: tinción de Gram, de endosporas, y observación de movilidad 2. Características culturales: producción de pigmentos 3. Características fisiológicas: tipo respiratorio. Citocromo-oxidasa. Catalasa. Crecimiento a distintas temperaturas 4. Características metabólicas: 4.1. Metabolismo de carbohidratos: metabolismo de la glucosa y de otros azúcares (O/F). Beta-galactosidasa (ONPG). Agar de Kligler. Pruebas de Rojo Metilo y Voges-Proskauer.Utilización de citrato como única fuente de carbono 4.2. Metabolismo de aminoácidos: Arginina dihidrolasa (ADH). Lisina descarboxilasa (LDC). Triptófano desaminasa (producción de indol). Fenilalanina desaminasa (APP) 4.3. Otras actividades enzimáticas: ureasa. Reducción de nitratos. Amilasa. Gelatinasa. Hidrólisis de la caseína. Lipasa 5. Utilización de tablas diagnósticas para la identificación de un aislado BIBLIOGRAFÍA GENERAL: ATLAS, RM Principles of Microbiology 1995 DAVIS, BD, R DULBECCO, HN EISEN, HS GINSBERG Tratado de Microbiología (4 edición) Masson 1996 20132014 21/06/14 PROGRAMA DE LA ASIGNATURA Página 3 de 4 Vicerrectorado de Ordenación Académica FREEMAN, BA Microbiología de Burrows Interamericana 1986 GARRITY, GM, DJ BRENER, NR KRIEG, JT STALEY Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 2, Ed. 2) Springer-Verlag 2005 GARRITY, GM, DR BOONE, RG CASTENHOLZ Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 1, Ed. 2) Springer-Verlag 2001 HOLT, JG, NR KRIEG, PHA SNEATH, JT STALEY, ST WILLIAMS Bergeys Manual of Determinative Bacteriology (9th edition) Williams & Wilkins Co. 1994 INGRAHAM, JL, CA INGRAHAM Introducción a la Microbiología Reverté 1999 KRIEG, NR, JG HOLT (Eds.) Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 1, Ed. 1) Williams & Wilkins Co. 1984 MADIGAN, MT, JM MARTINKO, J PARKER Brock Biology of Microorganisms (10 ed) Prentice-Hall International 2004 PRESCOTT, LM, JP HARLEY, DA KLEIN Microbiología (5 edición) McGraw-Hill Interamericana 2004 SNEATH, PHA, NS MAIR, ME SHARPE, JG HOLT (Eds.) Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 2, Ed. 1) Williams & Wilkins Co. 1986 STALEY, JT, MP BRYANT, N PFENNIG, JG HOLT (Eds.) Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 3, Ed. 1) Williams & Wilkins Co. 1989 STANIER, RY, JL IINGRAHAM, ML WHEELIS, PR PAINTER Microbiología (2 edición) Reverté 1996 VOS, P, G GARRITY, D JONES, NR KRIEG, W LUDWIG, FA RAINEY, KH SCHLEIFER, WB WHITMAN (ED) Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 3, Ed. 2) Williams & Wilkins Co. 2009 WILLIAMS, ST, ME SHARPE, JG HOLT (Eds.) Bergeys Manual of Systematic Bacteriology (vol. 4, Ed. 1) Williams & Wilkins Co. 1989 BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA: ATLAS, RM Handbook of Microbiological Media (2 ed) CRC Press 2006 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana BLAZEVIC, DJ, GM EDERER Principles of Biochemical Tests in Diagnostic Microbiology John Wiley &Sons 1975 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana CAPPUCINO, JG, N SHERMAN Microbiology: a laboratory manual (3 ed) Benjamin-Cummings Pub. Co 1991 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana COLWELL, RR, R GRIGOROVA (Eds.) Methods in Microbiology (Vol. 19). Current Methods for Classification and Identification of Microorganisms Academic Press 1987 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana COWAN, ST, KJ STEEL Manual para la Identificación de Bacterias de Importancia Médica Continental 1979 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana GERHARDT, P, RGE MURRAY, WA WOOD, NR KRIEG (Eds.) Methods for General and Molecular Bacteriology American Society for Microbiology 1994 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana KONEMAN, EW, SD KONEMAN, WR DOWELL, WM JANDA, HM SOMMERS, WC WINN Introduction to Diagnostic Microbiology (1 ed) Lippincott Williams & Wilkins 1994 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana McFADDIN, JF Biochemical tests for identification of medical bacteria (3 ED) Lippincott Williams & Wilkins 2000 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana NORRIS, JR, DW RIBBONS (Eds.) Methods in Microbiolgy. Vol. 6A Academic Press 1971 Bloques temáticos: IV Programa de prácticas. Identificación bacteriana METODOLOGÍAS Sin docencia presencial, con tutorías personalizadas para alumnos repetidores. EVALUACIONES Evaluación de la asignatura: Se realizará un único examen escrito, con un elevado número de preguntas, en el que se incluirán preguntas cortas (con espacio limitado), de elección múltiple, interpretaciones de resultados experimentales, y tablas o esquemas a completar. También se realizará un examen referente al programa práctico de la asignatura. 20132014 21/06/14 PROGRAMA DE LA ASIGNATURA Vicerrectorado de Ordenación Académica DESCRIPTOR: Taxonomìa y sistemática bacteriana. Caracteristicas generales y estudio de grupos de mayor interés. SITUACIÓN: CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN: 2º CURSO LICENCIATURA BIOLOGÍA. SEGUNDO CUATRIMESTRE SITUACIÓN: RECOMENDACIONES. SIN DOCENCIA TEORICA NI PRACTICA A PARTIR DEL CURSO 2011-12 COMPETENCIAS TRANSVERSALES/GENÉRICAS. Conocimiento de una lengua extranjera Desarrollo de habilidades investigadoras Habilidades para el manejo y búsqueda de información Capacidad para trabajar en grupo Razonamiento crítico y hábito de reflexión COMPETENCIAS ESPECÍFICAS: Cognitivas (Saber). Comprender la diversidad de los microorganismos en la biosfera Saber sistemática y filogenia Saber reconocer la importancia de los microorganismos Conocer las características diferenciales básicas de los principales grupos de microorganismos procariotas COMPETENCIAS ESPECÍFICAS: Procedimentales/instrumentales (Saber hacer). Saber identificar microorganismos Saber realizar el aislamiento y cultivo de microorganismos COMPETENCIAS ESPECÍFICAS: Actitudinales (Saber). Aprendizaje autónomo Capacidad de planificación y organización Capacidad de análisis y síntesis Página 4 de 4