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Laboratorio de Análisis de Virus
Gastroentéricos para
brotes de gastroenteritis en el ISP
Héctor Galeno Araya
Sección Virus Entéricos
Instituto de Salud Pública de Chile
Funciones de apoyo a la vigilancia de brotes de
gastroenteritis en el ISP
• Virología Ambiental (Depto. Salud Ambiental):
– Detección de Norovirus en alimentos y aguas.
• Virología Clínica (Depto. Lab. Biomédicos):
– Confirmación o descarte de la etiología viral en brotes
de gastroenteritis, a solicitud de la autoridad sanitaria.
• Genética Molecular (Depto. Lab. Biomedicos):
– Identificación a nivel de genotipos y variantes de
Norovirus detectados en muestras ambientales y
humanas.
Sección Virus Entéricos, Sub depto.
Enfermedades Virales, Depto. Laboratorios
Biomédicos
• Sección subdividida en 4 Laboratorios (según
prestaciones asignadas):
Laboratorio de Referencia de Enterovirus
Laboratorio Nacional de Poliovirus
Laboratorio Vigilancia Genotipos de Rotavirus
Laboratorio vigilancia Virus Gastroéntericos
Laboratorio de virus Gastroentéricos
• Prestación: “Determinación de Virus gastroentéricos
para Vigilancia” (vigilancia centinela y vigilancia brotes)
• Virus incluidos (los mas comunmente involucrados en
brotes):
Norovirus
Rotavirus
Astrovirus
Adenovirus
Laboratorio de Virus Gastroentéricos
• Muestra para diagnóstico Viral en brotes de
gastroenteritis:
– Compuesta por 5 a 10 especímenes fecales
provenientes de igual número de casos
pertenecientes al brote.
Laboratorio de Virus Gastroentéricos
• Forma de muetra:
– 4 a 6 gr (o mL) de materia fecal recolectada en frasco
tapa rosca apropiado.
• Muestra oportuna:
– Aquella recolectada con 1 a 6 días desde el inicio de
la sintomatología.
• Almacenamiento transitorio:
- Mientras se completa la recolección de los
especímenes fecales, mantener en refrigerador por
hasta 48 hrs, si no, mantener congelado a -20ºC.
- Laboratorio de Virus Gastroentéricos
- Registro de datos para el laboratorio:
- Utilizar plantilla Excel correspondiente (completando
los datos solicitados
•
Formulario muestras para estudio de brotes gastroenteritis.xls
Laboratorio de Virus Gastroentéricos
- Envío de muestra:
- Cumplir con normativa e instructivos para envíos de
material biológico vía terrestre o aéreo (Triple
envase).
- Las muestras deben ser enviadas congeladas o
refrigeradas (4-8°C). Acompañar suficientes unidades
refrigerantes según la demora prevista.
- Destinatario: Sección Recepción de Muestras ISP
- Informar del envío de muestras, adjuntando plantilla
Excel con datos (e-mail hgaleno@ispch.cl)
Laboratorio de Virus Gastroentéricos
• Procesamiento de muestras en brotes:
– Priorización pactada.
• Inicio de procesamiento:
– Inmediato para paquete de muestras de brotes previamente
reportados.
• Resultados preliminares:
– 1 a 2 días hábiles desde la llegada al laboratorio.
Ensayos de laboratorio aplicados
• Adenovirus: Inmunocromatografía, con confirmación de
genotipos 40/41. Cultivo Viral en algunos casos.
• Astrovirus: ELISA, con confirmación por RT-PCR en
algunos casos.
• Rotavirus: Inmunocromatografía, con confirmación por
ELISA en algunos casos.
• Norovirus: RT-PCRrt (protocolo FDA), con posterior
secuenciación para tipificación de casos positivos.
Informe de resultado de estudio de brotes
• Informe consolidado enviado vía e-mail al responsable
del laboratorio que envió las muestras, con copia a la
autoridad sanitaria u otro funcionario previamente
designado.
• Cuando corresponda, informe vía conducto regular al
Depto. Epidemiología del MINSAL
Algunos informes de resultados en brotes de
gastroenteritis
• Resultados Virus Gastroentericos RM
2013-12-05.xls
• Resultados Norovirus Ovalle 2013-1017.xls
Brote gastroenteritis aguda, Ovalle 2013.
Conclusiones
• En 2010 – 2012, se confirmó la presencia de Norovirus en 238
muestras de las 1073 recibidas para su estudio en el ISP
(22,2%).
• 58,4% provino de la Vigilancia, 38,2% de brotes y 3,4%
correspondieron a casos aislados.
• El genogrupo más frecuente fue GII (87,8% de las muestras de
Norovirus).
• GII.4 se identificó en el 80,3% de las muestras estudiadas, y
GII.3 en el 10,6%.
• En el 69,8% de las cepas correspondientes a GII.4 se identificó
la variante New Orleans 2009 y en el 18,9% la nueva variante
Sidney 2012.
Perspectivas de la vigilancia de Virus
gastroentéricos en brotes:
•
Lograr una mayor cobertura en el estudio etiológico de los brotes
reportados.
•
Apoyar la implementación de ensayos para detección de Norovirus en
laboratorios regionales.
•
Realizar mayor difusión y sensibilización sobre estos virus en el Sistema
de Salud, especialmente de Norovirus, por ser el agente viral mas relevante
detectado en ETA a nivel nacional e internacional.
Gracias,
Laboratorio de Virus Gastroentéricos