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PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TECNICAS PARA EL SUMINISTRO E
INSTALACION
DE
EQUIPAMIENTO
COMPLEMENTARIO
PARA
UN
ULTRASECUENCIADOR/SECUENCIADOR MASIVO DE DNA DESTINADO AL
INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR “ELADIO VIÑUELA”, AL CENTRO
NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA Y AL INSTITUTO DE INVESTIGACIONES
BIOMÉDICAS “ALBERTO SOLS”.
1. OBJETO DEL PLIEGO:
El objeto del presente pliego es definir las características técnicas y funcionales de
diverso equipamiento complementario para un ultrasecuenciador/secuenciador
masivo de DNA. Dicho equipamiento consiste en:
Un sistema de electroforesis en chip microfluídico
Un sistema homogeneizador
Un contador-analizador
Una centrífuga
Un sistema informático para el tratamiento de datos
Un equipo de fragmentación molecular
Un fluorímetro
Código CPA: 26.51.53
Código CPV: 31682210-5
2. PRECIO DE LICITACION:
El precio máximo de licitación, incluidos IVA e impuestos, será de 158.920 Euros,
Importe sin IVA……137.000 €
Importe de IVA…... 21.920 €
3. PLAZO DE EJECUCIÓN:
El plazo máximo para la ejecución del presente contrato será de un mes
4. LUGAR DE ENTREGA E INSTALACION:
El lugar de entrega e instalación será el Centro de Biología Molecular “Severo
Ochoa”
Nicolás Cabrera 1,
28049 MADRID
PLIEGO 37/EQUIPAMIENTO COMPLEMENTARIO PARA UN ULTRASECUENCIADOR/SECUENCIADOR
MASIVO DE DNA. INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR “ELADIO VIÑUELA”, CENTRO NACIONAL DE
BIOTECNOLOGÍA E INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS “ALBERTO SOLS”
1/6
C/ Serrano 117
28006 Madrid
España
Tel. 91.585.50.00
Fax: 91.411.30.77
sgoi@csic.es
5. PARTES Y COMPONENTES DEL SUMINISTRO:
5.1.
5.2.
5.3.
5.4.
5.5.
5.6.
5.7.
5.8.
Un sistema de electroforesis en chip microfluídico
Un sistema homogeneizador
Un contador-analizador
Una centrífuga
Un servidor informático
Un equipo de fragmentación molecular
Un fluorímetro
Manuales de usuario y servicio de los equipos con esquemas eléctricos y
mecánicos
6. ESPECIFICACIONES TÉCNICAS DEL SUMINISTRO:
6.1. Sistema de electroforesis en chip microfluídico
6.1.1. Permitirá el análisis automatizado de RNA, ssDNA y dsDNA
6.1.2. Análisis cualitativo y cuantitativo de ácidos nucleicos.
6.1.3. Disponibilidad de aplicaciones de software específicas para RNA total,
mRNA, RNAs pequeños y DNA.
6.1.4. Disponibilidad de kits específicos para RNAs pequeños (small RNAs).
6.1.5. Indicador numérico de la integridad del RNA.
6.1.6. Formato digital de obtención y análisis de datos.
6.1.7. Obtención de resultados en aproximadamente 30 minutos.
6.2. Sistema homogeneizador
6.2.1. Permitirá la preparación de emulsiones para las reacciones de PCR en
emulsión características del protocolo de ultrasecuenciación.
6.2.2. Homogeneización por fricción con microesferas metálicas
6.2.3. Capacidad para procesar hasta 192 muestras
6.2.4. Accesorio de 2x24 tubos de 2 ml
6.2.5. Velocidad 3-30 Hz (180-1800 oscilaciones por minuto)
6.2.6. Tiempo de homogeneización entre 10 segundos y 99 minutos
6.3. Contador-analizador
6.3.1. Permitirá contar las bolas de sefarosa que contienen los fragmentos de
DNA de la librería en el proceso de amplificación y secuenciación.
6.3.2. Análisis de área por pulso electrónico
6.3.3. Rango de medida del orden de 0,7-160 micrómetros
6.3.4. Accesorio capilar de 150 micrómetros para las partículas de 15-25
micrómetros características del protocolo de ultrasecuenciación
6.3.5. Resolución: 0,1 micrómetros
6.3.6. Ratio máximo entre diámetros de la partícula más grande y más pequeña
analizadas simultáneamente: 1:40
PLIEGO 37/EQUIPAMIENTO COMPLEMENTARIO PARA UN ULTRASECUENCIADOR/SECUENCIADOR
MASIVO DE DNA. INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR “ELADIO VIÑUELA”, CENTRO NACIONAL DE
BIOTECNOLOGÍA E INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS “ALBERTO SOLS”
2/6
C/ Serrano 117
28006 Madrid
España
Tel. 91.585.50.00
Fax: 91.411.30.77
sgoi@csic.es
6.3.7. Tiempo de análisis típico de aproximadamente 10 segundos
6.3.8. Admitirá un rango de volumen de muestra del orden de 5-100 microlitros
6.4. Centrífuga y accesorios
6.4.1.
6.4.2.
6.4.3.
6.4.4.
6.4.5.
Permitirá cargar placas PicoTiter.
RCF máxima (rotor basculante) del orden de 3270 x g
Velocidad máxima (rotor basculante) del orden de 3750 x rpm
Capacidad máxima de al menos 4 x 750 ml
Accesorios (contenedores) requeridos para centrifugación de placas
PicoTiter
6.4.6. Accesorios (contenedores) requeridos para centrifugación de tubos de 50
ml de fondo redondo.
6.4.7. Identificación automática de rotor
6.5. Sistema informático para el tratamiento de datos
6.5.1. Realizará archivo y análisis informáticos de los datos generados en el
ultrasecuenciador.
6.5.2. Ordenadores:
6.5.2.1.
6.5.2.2.
6.5.2.3.
6.5.2.4.
6.5.2.5.
6.5.2.6.
6.5.2.7.
6.5.2.8.
Chasis de 1U – 19’’
Doble procesador de 4 núcleos
6GB de memoria RAM
2 discos SATA configurados en RAID 1 para el sistema operativo
Tarjeta de acceso a las cabinas de discos con 8 puertos externos
Fuente de alimentación redundante
Doble conexión Ethernet Gigabit
Lector DVD
6.5.3. Cabinas de discos:
6.5.3.1. Chasis con formato de 19’’
6.5.3.2. Controladora SAS con capacidad para RAID 5 por hardware y
protección por batería.
6.5.3.3. Fuente de alimentación redundante
6.5.4. Expansiones de las cabinas de discos:
6.5.4.1. Chasis con formato de 19’’
6.5.4.2. Fuente de alimentación redundante
6.5.5. Discos:
6.5.5.1. Almacenamiento primario en discos SAS organizados en RAID5 de
no más de 6 discos por RAID con una capacidad útil de 40TB.
6.5.5.2. Copia de seguridad en discos SATA organizados en RAID5 de no
más de 6 discos por RAID con una capacidad útil de 40TB.
PLIEGO 37/EQUIPAMIENTO COMPLEMENTARIO PARA UN ULTRASECUENCIADOR/SECUENCIADOR
MASIVO DE DNA. INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR “ELADIO VIÑUELA”, CENTRO NACIONAL DE
BIOTECNOLOGÍA E INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS “ALBERTO SOLS”
3/6
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Fax: 91.411.30.77
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6.5.6. Armario:
6.5.6.1. Armario estándar de 19’’ y capacidad mínima de 20U
6.5.6.2. Consola con monitor teclado y ratón.
6.5.6.3. Switch KVM de 2 puertos.
6.5.7. Sistema operativo Linux.
6.5.8. Sistema de archivos paralelo distribuido.
6.6. Equipo de fragmentación molecular y accesorios
6.6.1. Permitirán la obtención de fragmentos de DNA del tamaño adecuado para
realizar una librería paired-end para el ordenamiento de contigs.
6.6.2. Fragmentación por aceleración del flujo de muestra
6.6.3. Rango de fragmentación del orden de 0,65-40 Kb
6.6.4. Accesorios requeridos para fragmentar en el rango mencionado
6.6.5. Tamaño de fragmentación independiente de la concentración del DNA.
6.6.6. Rango de volumen de muestra de 40-500 microlitros
6.7. Fluorímetro
6.7.1. Permitirá cuantificar el DNA a bajas concentraciones mediante fluorimetría
con la precisión adecuada para algunas aplicaciones, como es el caso de
las librerías paired-end.
6.7.2. Fuente de luz: LED de longitud de onda ajustable
6.7.3. Longitudes de onda: UV (Ex. 365, Em. 440-470 nm) y azul (Ex. 460 nm,
Em. 515-575 nm)
6.7.4. Límite de detección: 1 ng/ml dsDNA y RNA, 100 ng/ml proteína
6.7.5. Rango dinámico: 4 logs
6.7.6. Formato de muestra: cubeta de 10x10 mm y vial de 50-250 ul
7. OTRAS CONDICIONES:
Cumplimiento de las obligaciones empresariales que establece la Ley de Prevención
de Riesgos Laborales, así como la normativa y reglamentación que le sea de
aplicación en su caso vr. Gratia (Norma Básica de Edificación NBE-CPI-96, RD
1836/1999 Reglamento sobre Instalaciones Nucleares y Radiactivas, RD 783/2001
Reglamento sobre protección sanitaria contra radiaciones ionizantes, Reglamento
Lugares de Trabajo, etc.) así como evitar o reducir en lo máximo posible, y siempre
dentro de la legalidad, cualquier impacto ambiental (y dentro de él la generación de
residuos) que el desarrollo del trabajo o actividad, objeto del contrato, pudiera
generar.
PLIEGO 37/EQUIPAMIENTO COMPLEMENTARIO PARA UN ULTRASECUENCIADOR/SECUENCIADOR
MASIVO DE DNA. INSTITUTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR “ELADIO VIÑUELA”, CENTRO NACIONAL DE
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Fax: 91.411.30.77
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8. GARANTÍA:
Garantía mínima para todo el equipamiento será de 2 años a todo riesgo.
Se valorará la ampliación de plazo de garantía o periodos de mantenimiento a todo
riesgo gratuitos. Tanto la garantía como los periodos de mantenimiento ofertados,
serán sobre el equipo completo. Garantías condicionadas no se considerarán.
9. ASISTENCIA TÉCNICA:
10.1. Cuando el licitador no incluya en su oferta el documento correspondiente a la
asistencia técnica posterior al periodo de garantía, que se indica en el Anexo
5, apartado 2, del Pliego de Cláusulas Administrativas Particulares que rige
para este procedimiento, o el coste indicado en la oferta no permita una
valoración objetiva, se aplicarán en la valoración de la oferta y posterior
exigencia al adjudicatario; los siguientes costes y tiempos:
Coste hombre/hora: 150 €/h.
Coste de desplazamiento: 150 €.
Tiempo de respuesta: 1 día.
Tiempo de entrega de repuestos: 3 días.
10.2. El adjudicatario prestará asistencia técnica para la reparación y, en su caso,
mantenimiento del suministro durante el periodo de garantía del contrato.
Asimismo, se compromete a prestar asistencia técnica y proporcionar
piezas de recambio del material ofertado durante los cinco años posteriores
a la terminación del plazo de garantía.
El lugar desde el que se prestará la asistencia técnica, salvo que en la oferta
se indique lo contrario, será desde la misma ciudad en que se entrega este
suministro.
10. PUESTA A PUNTO E INSTALACIÓN:
El equipo o sistema se suministrará completo, incluyendo todos aquellos elementos
necesarios para su correcta instalación, puesta a punto y funcionamiento.
11. FORMA DE PAGO:
El pago se hará efectivo en un único plazo, una vez recibida y facturada la totalidad
del suministro. La factura deberá incluir todas las menciones legalmente obligatorias.
Los plazos previstos en el artículo 200 de la LCSP se computarán a partir de la
entrega por el contratista de la respectiva factura y debidamente recepcionado el
objeto del contrato.
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Fax: 91.411.30.77
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12. DOCUMENTACIÓN TÉCNICA:
La documentación Técnica se presentará en la forma exigida en el Pliego de
Cláusulas Administrativas Particulares y debidamente firmada por el representante
de la empresa.
En el sobre de documentación técnica, además de las dos copias solicitadas, se
incluirá una copia de dicha documentación en CD. Los ficheros tendrán el
formato PDF ó WORD. La inclusión de este CD, no exime de la entrega de la
documentación tal como requiere el Pliego de Cláusulas Administrativas
Particulares.
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