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Agosto 22, 2013 Nombre del paciente: JOHAN CASTAÑO SALAZAR Fecha de nacimiento: Septiembre 29, 1996 Código de la muestra: 2013.0685 Código GMC EM 594 Examen: ANALISIS ELANE, LPIN2, MEFV, MVK, NLRP3, PSTPIP1, TNFRSF1A Diagnóstico clínico: Eritematosis persistente, síndrome autoinflamatorio, artralgia y miocarditis. Antecedentes Genéticos: El síndrome febril periódico hereditario incluye la fiebre familiar mediterránea causada por variantes en el gen MEFV, Síndrome Hiper-IgD causado por variantes en el gen MVK, la fiebre hiberniana familiar (TRAPS) causada por variantes en el gen TNFRSF1A, la neutropenia cíclica y neutropenia congénita severa causada por variantes en el gen ELANE (ELA2), síndrome Majeed causado por variantes en el gen LPIN2, el Síndrome Muckle-Wells (MWS), síndrome autoinflamatorio familiar inducido por frío (FCAS) y la enfermedad inflamatoria multisistémica de inicio neonatal (NOMID) causados por variantes en el gen NLRP3 (CIAS1) y la artritis piogénica estéril, pioderma gangrenoso y síndrome acné (PAPA) causados por variantes en el gen PSTPIP1 (CIAS1). Métodos: Este estudio fue realizado por secuenciación de nueva generación utilizando una plataforma Illumina de todas las regiones codificantes (78 exones) y sitios de splice de los siguientes genes conocidos como asociados con síndrome periódico febril: • MEFV, exons 1-10, ref seq NM_00243.1 • MVK, exons 2-11, ref seq NM_000431.2 • TNFRSF1A, exons 1-10, ref seq NM_001065.2 • ELANE (ELA2), exons 1-5, ref seq NM_001972.1 • LPIN2, exons 2-20, ref seq NM_014646.2 • NLRP3 (CIAS1), exons 1-9, ref seq NM_004895.4 • PSTPIP1, exons 1-15, ref seq NM_003978 La sensibilidad analítica de este estudio es de cerca del 100% para detectar variantes de substitución (variantes de cambio de sentido o sin sentido) en la secuencia analizada. Sin embargo comparada con secuenciación dideoxy, este estudio tiene una sensibilidad reducida para detectar pequeñas inserciones y deleciones de más de 5pb. Al igual que las pruebas de secuenciación tradicional, este estudio tiene muy poca sensibilidad para detectar grandes deleciones, inserciones y otros cambios de número de copias. Genética Molecular de Colombia Ltda. ESTUDIOS DE ADN-CARIOTIPOS-PRUEBAS DE PATERNIDAD-CONSULTA ESPECIALIZADA Calle 119 # 49-26 El Batán, Bogotá-Colombia Tel. 2139201-7559120-7559121 Cel. 3158967774 e-mail:infogeneticamolecular@gmail.com www.geneticamolecular.com.co Resultados: Se identificó una variante heterocigota patogénica NLRP3:c.1711G>A en el exón 3 del gen NLRP3. Esta sustitución es una variante de cambio de sentido que se ha predicho lleva a la sustitución de una glicina por una arginina (NLRP3:p.Gly571Arg). Ésta variante es conocida y se ha descrito previamente en otros pacientes asociada al Síndrome Muckle-Wells (Dode et al. Am J Hum Genet 7: 1498, 2002; Hawkins et al. Arthritis and Rheumatism 50: 2708, 2004). Sin embargo, en Dode et al., la variante se ha presentado en madres sanas de individuos afectados sugiriendo que esta variante presenta una penetrancia incompleta. Ésta variante no se encuentra listada en la base de datos de variantes del exoma NHLBI (~13000 alelos). Predicciones In silico: SIFT: deletérea, Mutation Taster: causante de enfermedad. La variante se encuentra clasificada como una variante patogénica de acuerdo a los criterios de MutaDATABASE. Recomendaciones: 1. El hallazgo de una variante heterocigota patogénica en el gen NLRP3 es compatible con un diagnóstico clínico de Síndrome de Muckle-Wells. 2. El análisis de los padres podría proveer el origen de novo de la variante. Comentarios: Los resultados fueron sub-contratados contando con un consentimiento informado y aprobación aceptados y firmados por el paciente o su representante. Las muestras se enviaron correctamente identificadas y bajo un sistema de cadena de custodia. Los resultados fueron firmados por los doctores Patrick Willems, MD, PhD y Kristel De Boulle. Cordial Saludo, CARLOS M. RESTREPO, MD, PhD. Genética Humana. Genética Molecular de Colombia Ltda. ESTUDIOS DE ADN-CARIOTIPOS-PRUEBAS DE PATERNIDAD-CONSULTA ESPECIALIZADA Calle 119 # 49-26 El Batán, Bogotá-Colombia Tel. 2139201-7559120-7559121 Cel. 3158967774 e-mail:infogeneticamolecular@gmail.com www.geneticamolecular.com.co