Download 2014-II Transferencia Genética Horizontal-2014-2

UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS
(Universidad del Perú, Decana de América)
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE GENÉTICA Y BIOTECNOLOGÍA
“Carrera acreditada Internacionalmente”
DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE BIOLOGÍA CELULAR Y GENÉTICA
SYLLABUS
SEMESTRE ACADÉMICO
: 2014-II
I. DATOS GENERALES
1.1. NOMBRE DEL CURSO
1.2. CÓDIGO DEL CURSO
1.3. NÚMERO DE CRÉDITOS
1.4. DURACIÓN DEL SEMESTRE
1.5. AÑO DE ESTUDIOS
1.6. NÚMERO DE HORAS
1.6.1 TEÓRICAS
1.6.2. PRÁCTICAS
1.6.3. SEMINARIOS
1.7. PRE-REQUISITO
: Transferencia Genética Horizontal
: B02061
: 03
: 17 SEMANAS
: 5to. Año
1.8. PROFESOR RESPONSABLE
: Mg. Dan Erick Vivas Ruiz
: 02 horas
: --: 02 horas
: Ingeniería Genética
PROFESORES DE TEORÍA Y SEMINARIO : Mg. Dan Erick Vivas Ruiz
: Mg. Gustavo Adolfo Sandoval Peña
PROFESORES INVITADOS SEMINARIO
: Mg (c). Julio Mendoza Fernández.
: Bach. Jacquelyne Yesenia Zarria Romero
1.9. HORARIO Y AMBIENTE
: Teoría (Lunes 11 am - 01 pm)
Seminario (Miércoles 11 am - 01 pm)
Aula 308
II. SUMILLA:
El curso nos permitirá conocer acerca de la revisión sobre mecanismos de transferencia
génica, la transferencia genética horizontal entre especies no relacionadas o aún entre
reinos. Papel de la transferencia genética horizontal en la evolución de los Procariontes y
Eucariontes. Transferencia entre compartimientos (cloroplastos, mitocondrias y núcleo).
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III. OBJETIVOS
3.1. GENERAL
Dar a conocer al alumno las repercusiones que tiene la transferencia horizontal del
material genético sobre la modificación y la evolución de los genomas
procariontes y eucariontes.
3.2. ESPECÍFICOS
Al término del curso, el alumno estará capacitado para:
Discriminar a los diferentes elementos genéticos móviles presentes en los
procariotas y eucariotas
Comprender los diversos mecanismos por los cuales se da la transferencia
horizontal de genes de procariota a procariota y de procariota a eucariota.
Entender la formación y evolución de vías metabólicas a partir de la
adquisición no vertical de genes.
Manejar las herramientas que permitan evidenciar procesos de transferencia
horizontal de genes.
Determinar el grado de impacto que da la transferencia genética horizontal en
los análisis filogenéticos.
IV. EVALUACIONES:
Teoría: Comprende dos exámenes teóricos cancelatorios y la realización de una
revisión científica literaria acerca de un tópico específico tocado en clase o
relacionado a ella, serán evaluados de la siguiente manera:
Primera Evaluación: Octava Semana
Segunda Evaluación: Decimo Sexta Semana
Examen Sustitutorio: Decimo Sétima Semana
Revisión: Décimo quinta semana
Promedio de Teoría: (Examen 1 + Examen 2+ Revisión científica)/3
Seminario: Comprende 2 exposiciones de artículos científicos de manera individual y
dos exámenes que serán evaluados de la siguiente manera:
Primera Evaluación: Octava Semana
Segunda Evaluación: Decimo Sexta Semana
Examen Sustitutorio: no aplica
2
Promedio de Seminario: (Exp1 + Exp 2/2)x 0.6 +(Exam. 1+ Exam 2/2)x0.4
Promedio Final del Curso:
(Promedio de Teoría + Promedio de Seminario)/2
En la Teoría, el alumno sólo tendrá derecho a sustituir una de las dos evaluaciones
teóricas por el único examen sustitutorio que se tomará, correspondiente a todo el
curso.
La asistencia a las sesiones seminario (clases prácticas) es obligatoria por parte de
alumno.
Las inasistencias que superen el 30% de las clases programadas, hacen que el alumno
desapruebe el curso, correspondiéndole la nota de CERO de acuerdo al reglamento
vigente.
V. METODOLOGÍA.
El desarrollo del curso comprenderá clases teóricas y sesiones de seminario.
Clases teóricas: Serán expositivas, utilizando como material didáctico auxiliar la pizarra
y equipos multimedia. Se abordarán los distintos temas propuestos en el curso,
impulsando la participación activa de los alumnos.
Sesiones de seminario: Se profundizará temas tratados en algunas clases teóricas, así
como otros temas no comprendidos en ellas. Los temas de seminario serán entregados
con la debida anticipación para que el alumno prepare una exposición en donde sintetice
de manera clara y ordenada los tópicos tratados en los artículos; así mismo una semana
después de la exposición el alumno presentará por escrito la síntesis en no más de tres
páginas del seminario dado con las correcciones hechas para que los demás alumnos
puedan prepararse para el examen.
Revisión científica: El alumno motivado por un tema desarrollado en clase o relacionado
a ella realizará una revisión con todas las exigencias dadas en la redacción científica, el
cual estará elaborado con un mínimo de 15 artículos científicos. Si trabajo presenta
aceptación por parte de una revista científica o de tres docentes universitarios
especialistas en el tema equivaldrá a la nota de 20.
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VI. PROGRAMACIÓN CALENDARIZADA DEL CURSO
FECHA
Semana 1
Semana 2
Semana 3
Semana 4
Semana 5
Semana 6
Semana 7
Semana 8
Semana 9
Semana 10
PROFESOR
RESPONSABLE
T1. Clase introductoria. El Mobiloma definición y componentes.
Formas de detección de la HGT. La HGT entre los tres dominios
de la vida.
T2. Los transposones: los retrotransposones LTR,D. Vivas
retrotransposones no LTR y no virales. LINES, SINES
(secuencias Alu), Transposones de DNA. Secuencias de
inserción.
T3. Plásmidos conjugativos. Mecanismos genéticos moleculares
de persistencia: elementos accesorios, estabilidad plasmídica y
D. Vivas/G.
rango de hospederos.
Sandoval
S1.El origen de los genomas de ADN.
S2. El Mobiloma Humano
T4. El sistema integrón/ casetes génicos: el origen de los
casetes génicos. Los sitios attC. Rol en la adquisición de la
resistencia a antibióticos y principales casetes génicos de
resistencia.
G. Sandoval
S3. Potencial emergente de los transposones para la terapia
génica y generación de las células madres pluripotenciales
inducidas.
S4. HGT de transposones en invertebrados y vertebrados
T5. Parásitos moleculares de autoensamble: Intrones del grupo
I y II. Las inteínas. Las endonucleasas Homing.
G. Sandoval
S5. HGT en el tracto gastrointestinal humano. Dispersión
potencial de la resistencia a los antibióticos.
S6. HGT en patógenos humanos.
T6. Bacteriófagos: Tipos Líticos, lisogénicos y profagos. Agentes
de transferencia génica. Fagos filamentosos.
G. Sandoval
S7.Diferencias dinámicas entre inteínas activas e inactivas
S8. El VIH y procesos de HGT en el huésped.
T7: El efecto del “Codon Usage” sobre el éxito de la HGT:
Barreras relacionadas al “Codon Bias”. Asociación bidireccional
entre la HGT y el “Codon Bias”
G. Sandoval
S9: Evidencia de HGT de humano al genoma de HIV-1.
S10:Regulación de la HGT en mamíferos por fragmentación del
ADN
T8. La transferencia horizontal de genes en las vías metabólicas.
Origen de las vías metanogénicas y la vía de shikimato
G. Sandoval
Examen de seminario.
D. Vivas / G.
PRIMER EXAMEN PARCIAL
Sandoval
T9. Transferencia horizontal de genes entre Archea y Bacteria.
Estudio de los transportadores ABC.
G. Sandoval
S11: HGT entre bacterias: mecanismos y barreras
S12: Eventos de transferencia génica inusuales en poblaciones
bacterianas.
T10: Transferencia horizontal de genes entre Bacteria y
Animalia.
G. Sandoval
S13: HGT entre bacterias y células somáticas humanas.
S14: HGT de proteínas anticongelantes
TEMA
4
Semana 11
T11: HGT en plantas: implicancias evolutivas. Adaptaciones
adquiridas por transferencia horizontal: Fotosíntesis C4, Vías
del glicerol. Implicancias filogenéticas de la transferencia
horizontal en plantas.
G. Sandoval
S15: HGT entre bacterias y plantas: modelo de planta de tabaco.
S16: HGT de genomas plastídicos en plantas.
Semana 12
Semana 13
Semana 14
Semana 15
Semana 16
Semana 17
T12: La HGT y la recombinación homóloga en la especiación de
los procariotas. Principios de la adquisición de la resistencia a
antibióticos.
G. Sandoval
S17: HGT de bacterias lácticas en modelos rumiantes.
S18. Progresión del cáncer mediado por HGT
T13. El papel de la transferencia horizontal de genes en el
parasitismo de eucariotas. Mecanismos implicados en los
parásitos procarióticos y eucarióticos.
D. Vivas
S19: Herencia del ADN de transferido de parásitos en
hospederos humanos.
S20: HGT de microRNAs
T14: La transferencia horizontal de genes y la nueva
perspectiva del árbol de la vida. Impacto de la HGT en la
clasificación de los microorganismos procarióticos yD. Vivas
eucarióticos.
Examen de seminario.
T15. Detección y ensayo cuantitativo de HGT. Métodos basados
en composición para identificar HGT. Prueba de Métodos
D. Vivas
Filogenéticos para identificar HGT.
Presentación de revisiones
SEGUNDO EXAMEN PARCIAL
D. Vivas
EXAMEN SUSTITUTORIO
D. Vivas
VII. BIBLIOGRAFÍA
Libros de consulta
Lateral DNA Transfer: Mechanism and consequences. 2002. Cols Spring Harbor
Laboratory Press.
Horizontal Gene Transfer 2002. Academic Press.
Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux.2009. Humana Press
Genes X. 2011. Jones and Bartlett Publishers
Revistas de consulta
Nature review
Cell
Journal of Genetics and Genomics
Journal of Genetics and development
Journal of protein a cell
Journal of molecular genetics
Plasmid
Journal of molecular genetics and metabolism
Journal of molecular evolution
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